基因總覽
ZNF202(zinc finger protein 202)是位於人類第 11 號染色體的蛋白質編碼基因。其產物為含有 SCAN box、KRAB 區域及多個 C2H2 型鋅指的蛋白質;來源將其描述為轉錄抑制因子,並指出其結合位點主要出現在參與脂質代謝的基因中。現有資料未提供更多關於其家族關係或其他基本性質的說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000530393 ★ | 123,723,914–123,741,660 | 9 |
| ENST00000336139 | 123,723,043–123,741,689 | 8 |
| ENST00000529691 | 123,723,043–123,741,689 | 7 |
| ENST00000880206 | 123,723,043–123,741,689 | 8 |
| ENST00000880207 | 123,723,043–123,741,689 | 8 |
| ENST00000880209 | 123,723,043–123,741,689 | 7 |
| ENST00000880210 | 123,723,043–123,741,689 | 8 |
| ENST00000880211 | 123,723,043–123,733,643 | 6 |
| ENST00000925721 | 123,723,043–123,742,513 | 8 |
| ENST00000925722 | 123,723,043–123,741,689 | 7 |
| ENST00000925723 | 123,723,043–123,741,689 | 8 |
| ENST00000925724 | 123,723,043–123,741,689 | 8 |
顯示 12/38 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF202 是轉錄抑制因子,會結合調控元件;這些元件主要出現在參與脂質代謝的基因中。其標的涵蓋脂蛋白顆粒的結構成分、脂質處理酵素,以及維持脂質恆定的轉運蛋白,顯示其調控範圍涉及脂質代謝的不同環節。
來源列出的脂蛋白結構成分包括 apolipoproteins AIV、CIII 和 E;脂質處理相關酵素包括 lipoprotein lipase 與 lecithin cholesteryl ester transferase;參與脂質恆定的轉運蛋白則包括 ABCA1 和 ABCG1。這些基因均被列為 ZNF202 的標的,但資料未進一步說明各標的的調控方向或具體分子作用步驟。
此外,ZNF202 的標的還包括若干與能量代謝及血管疾病相關過程有關的基因。這表示其轉錄抑制作用不只涉及脂質代謝基因,也涵蓋來源所述的其他相關生物學過程;然而,現有資料沒有列出這些基因,也未描述其作用如何影響相關過程。
Promoter 與基因調控
>ZNF202 ENST00000530393 GRCh38 chr11:123741560-123742660 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTCACTGAGATAAATGCATATCTGATTGCCTCCTTCCGGAGAGGCTAATCAGCAACTCAATGCAACCATT TGTGTCTTATCTACCTATGACCTGGAAGCCCCCTCCCCGCTTTGAGTTGTCCTGCCTTCTGGGTTCACAC CTATTAGTTCTGTTTCGCTAATACACTGCCACTCCACCAAAAGTAACTAATCCTTTGGTTCAAACCCAGT AAACAGATCCCAGCAATGTGTCCCATGAAAAGGAAGTGGCACATGGCACGTGGAGAGTGGTGACTTACAG GGTAAAAGGGACAGAGAGCAAAGGAAAATGTCAAGTATGGGCAGAAAGGTCACCGAACGGACAAAAATGA ACAAATGAGATCAGGGAAGACAGCCTGAAAGTAAAGAAATACGAAGCAACACTCAAAGGAAAAGAAAGAA CAGTGATACCATAACTATTTTCTTTCTGAGCTTCTGATGTTCCATTCAGTTCATGTGCAATGTATCATTT AGTCCTCAGAGTAACGGTATTATTATGCCCGTTTTATATGATGCACAATAGGGTTCAAAGATGGAGAGAT TCGGCCGAGGCCCTGCTGCTGATGGTGACTGCAAGAGCCAGTATTCAAACCTAACGCTGCCCTTTTCTAC CATGTTGCAGCGGACAATGCAAAGAAAAAAAAATCAAGAAAAACACGTAGAGGTATCCAAATGAAAACAA ACACACAAAAGATCAAAAACAGAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAACCCTTGCAGAAGGTATGCCTG TAAATGAAAGGCCCAAGATGTTAATTTATTCGCTGCAGAGTGGAGTTAGGGGTCGCGGACGGCAGCTGTG GGGTCCGAGGCTTCTTCGCACTGGGTCCTTGGGGAGCACTGAGCCGCAACCCGCGGAGGGCGCATAGAGA GGATCAAACCTCCCACAGCCTAGAAAGGCTCCTACTCGGCGAGAAGGCGGGGCGAGCGATCGCTTCCGGT TCCGGGCGCAAAGGCCCCACGTGTTCCGACCCGCTAGGCCCCGCGCGGCTCGGATCCGGCGGCGCTGTTT CGGTCGGGAGTGGGTGGGAGAGAAGCCGGGGCAGGGGAGGAGCCGCCGGAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF202_1 ↗ | 11:123,741,660 | 負股 | 123,741,650–123,741,709 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_CG9J6 · enhancer · 123740313–123741649 · regulatory
ENSR11_5344SM8 · CTCF_binding_site · 123741260–123741281 · regulatory
ENSR11_799GFK · promoter · 123741650–123741759 · regulatory
ENSR11_CG9J9 · enhancer · 123741760–123743146 · regulatory
· motif · 123740974–123740985 · motif
· motif · 123741007–123741020 · motif
· motif · 123741262–123741278 · motif
· motif · 123741265–123741278 · motif
· motif · 123741352–123741369 · motif
· motif · 123741361–123741369 · motif
· motif · 123741590–123741601 · motif
· motif · 123741593–123741606 · motif
· motif · 123741656–123741665 · motif
· motif · 123741656–123741665 · motif
· motif · 123741679–123741690 · motif
· motif · 123741679–123741690 · motif
· motif · 123741681–123741690 · motif
· motif · 123741705–123741716 · motif
· motif · 123741765–123741780 · motif
· motif · 123741784–123741797 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:648 aa
ZNF202 蛋白質長 648 個胺基酸。其序列含有 SCAN box(第 46–127 位)、KRAB 區域(第 237–308 位),以及第 146–221 位的無序區域。另有 8 個 C2H2 型鋅指,分布於第 397–419、425–447、481–503、509–531、537–559、565–587、593–615 與 621–643 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 ZNF202 定位於細胞核,未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 19 個夥伴
- CARD10Q9BWT7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP70Q8NHQ1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EAF1Q96JC9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- LMO4P61968 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MAD2L1BPQ15013 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MCCP23508 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTIF3Q9H2K0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NAA10P41227 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NAA11Q9BSU3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCAND1P57086 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCNM1Q9BWG6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SEPHS1P49903 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SSX2IPQ9Y2D8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF250P15622-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF438Q7Z4V0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF835Q9Y2P0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF837Q96EG3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
來源記載 ZNF202 與 SDP1 互作,但未說明這是否代表直接實體結合,也未提供複合體或功能關係的細節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF202 是轉錄抑制因子,會結合主要出現在脂質代謝相關基因中的調控元件。其標的包括脂蛋白顆粒結構成分、參與脂質處理的酵素、維持脂質恆定的轉運蛋白,以及若干與能量代謝和血管疾病相關過程有關的基因。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Transcriptional repressor that binds to elements found predominantly in genes that participate in lipid metabolism. Among its targets are structural components of lipoprotein particles (apolipoproteins AIV, CIII, and E), enzymes involved in lipid processing (lipoprotein lipase, lecithin cholesteryl ester transferase), transporters involved in lipid homeostasis (ABCA1, ABCG1), and several genes involved in processes related to energy metabolism and vascular disease |
| 交互作用 | 來源記載 ZNF202 與 SDP1 互作,但未進一步說明此互作是否為直接結合,或是否涉及複合體及特定功能關係。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | 來源將 ZNF202 定位於細胞核,未提供定位變化的條件、異構型差異或其他定位資訊。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GTGTTCCGACCCGCTAGGCCCCGCGCGGCTCGGATCCGGC40GGCGCTGTTTCGGTCGGGAGTGGGTGGGAGAGAAGCCGGG80GCAGGGGAGGAGCCGCCGGAGCTGTCGGAGCCGTGACACC120CAGGGCAGCTACACTCAGAAGCCACAAGGAATGCTAGTGG160AGCCCCTCATCCCTCCCAGCTTCTCTTCCAAGCTGCCCCG200TGGGGCTTGATCCAGGAAGCTACTTCAGAAAGTAGACAAT240CATTCCAAGGGTACAACAAGGTTTACCACAATGTGAGGGA280CTCAGCCATTGCAAATTGTACAGATGAGGGCCCTTGGAAG320AAAATCCTCGCTGTGTCCAGGCTGAGGCGGGGGGCTAATG360ACAGTGTGAGCTCTAGATGGTGTGAGACCACCCCAAAGCC400AAGAAATGGCTACAGCCGTGGAACCAGAGGACCAGGATCT440TTGGGAAGAAGAGGGAATTCTGATGGTGAAACTGGAAGAT480GATTTCACCTGTCGGCCAGAGTCTGTCTTACAGAGGGATG520ACCCGGTGCTGGAAACCTCCCACCAGAACTTCCGACGCTT560CCGCTACCAGGAGGCAGCAAGCCCTAGAGAAGCTCTCATC600AGACTCCGAGAACTTTGTCACCAGTGGCTGAGACCAGAGA640GGCGGACAAAGGAGCAGATCCTAGAGCTGCTTGTGCTGGA680ACAATTTCTTACCGTCCTACCTGGAGAACTACAGAGCTGG720GTGCGGGGCCAACGGCCAGAAAGTGGCGAGGAGGCAGTGA760CGCTGGTGGAGGGTTTGCAGAAACAACCCAGGAGACCAAG800GCGGTGGGTGACTGTCCATGTTCACGGCCAGGAAGTCCTG840TCAGAGGAGACGGTGCATTTAGGAGTGGAGCCTGAGTCAC880CTAATGAGCTGCAGGATCCTGTGCAAAGCTCGACCCCCGA920GCAGTCTCCTGAGGAAACCACACAGAGCCCAGATCTGGGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。