演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF202ZKSCAN10

zinc finger protein 202

ZNF202(zinc finger protein 202)是蛋白質編碼基因,其產物為轉錄抑制因子,主要結合參與脂質代謝基因中的調控元件。

Homo sapiens11q23.3UniProt O95125
OFFICIAL SYMBOL
ZNF202
CHROMOSOME
11
UNIPROT
O95125
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF202(zinc finger protein 202)是位於人類第 11 號染色體的蛋白質編碼基因。其產物為含有 SCAN box、KRAB 區域及多個 C2H2 型鋅指的蛋白質;來源將其描述為轉錄抑制因子,並指出其結合位點主要出現在參與脂質代謝的基因中。現有資料未提供更多關於其家族關係或其他基本性質的說明。

Official symbol
ZNF202
Gene name
zinc finger protein 202
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12994
UniProt
O95125
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZKSCAN10ZSCAN42

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q23.3
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegZNF202pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr11:123,723,043–123,742,513
Gene span
19,471 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000530393 ★123,723,914–123,741,6609
ENST00000336139123,723,043–123,741,6898
ENST00000529691123,723,043–123,741,6897
ENST00000880206123,723,043–123,741,6898
ENST00000880207123,723,043–123,741,6898
ENST00000880209123,723,043–123,741,6897
ENST00000880210123,723,043–123,741,6898
ENST00000880211123,723,043–123,733,6436
ENST00000925721123,723,043–123,742,5138
ENST00000925722123,723,043–123,741,6897
ENST00000925723123,723,043–123,741,6898
ENST00000925724123,723,043–123,741,6898

顯示 12/38 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF202 是轉錄抑制因子,會結合調控元件;這些元件主要出現在參與脂質代謝的基因中。其標的涵蓋脂蛋白顆粒的結構成分、脂質處理酵素,以及維持脂質恆定的轉運蛋白,顯示其調控範圍涉及脂質代謝的不同環節。

來源列出的脂蛋白結構成分包括 apolipoproteins AIV、CIII 和 E;脂質處理相關酵素包括 lipoprotein lipase 與 lecithin cholesteryl ester transferase;參與脂質恆定的轉運蛋白則包括 ABCA1 和 ABCG1。這些基因均被列為 ZNF202 的標的,但資料未進一步說明各標的的調控方向或具體分子作用步驟。

此外,ZNF202 的標的還包括若干與能量代謝及血管疾病相關過程有關的基因。這表示其轉錄抑制作用不只涉及脂質代謝基因,也涵蓋來源所述的其他相關生物學過程;然而,現有資料沒有列出這些基因,也未描述其作用如何影響相關過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 123741660 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF202 ENST00000530393 GRCh38 chr11:123741560-123742660 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTCACTGAGATAAATGCATATCTGATTGCCTCCTTCCGGAGAGGCTAATCAGCAACTCAATGCAACCATT
TGTGTCTTATCTACCTATGACCTGGAAGCCCCCTCCCCGCTTTGAGTTGTCCTGCCTTCTGGGTTCACAC
CTATTAGTTCTGTTTCGCTAATACACTGCCACTCCACCAAAAGTAACTAATCCTTTGGTTCAAACCCAGT
AAACAGATCCCAGCAATGTGTCCCATGAAAAGGAAGTGGCACATGGCACGTGGAGAGTGGTGACTTACAG
GGTAAAAGGGACAGAGAGCAAAGGAAAATGTCAAGTATGGGCAGAAAGGTCACCGAACGGACAAAAATGA
ACAAATGAGATCAGGGAAGACAGCCTGAAAGTAAAGAAATACGAAGCAACACTCAAAGGAAAAGAAAGAA
CAGTGATACCATAACTATTTTCTTTCTGAGCTTCTGATGTTCCATTCAGTTCATGTGCAATGTATCATTT
AGTCCTCAGAGTAACGGTATTATTATGCCCGTTTTATATGATGCACAATAGGGTTCAAAGATGGAGAGAT
TCGGCCGAGGCCCTGCTGCTGATGGTGACTGCAAGAGCCAGTATTCAAACCTAACGCTGCCCTTTTCTAC
CATGTTGCAGCGGACAATGCAAAGAAAAAAAAATCAAGAAAAACACGTAGAGGTATCCAAATGAAAACAA
ACACACAAAAGATCAAAAACAGAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAACCCTTGCAGAAGGTATGCCTG
TAAATGAAAGGCCCAAGATGTTAATTTATTCGCTGCAGAGTGGAGTTAGGGGTCGCGGACGGCAGCTGTG
GGGTCCGAGGCTTCTTCGCACTGGGTCCTTGGGGAGCACTGAGCCGCAACCCGCGGAGGGCGCATAGAGA
GGATCAAACCTCCCACAGCCTAGAAAGGCTCCTACTCGGCGAGAAGGCGGGGCGAGCGATCGCTTCCGGT
TCCGGGCGCAAAGGCCCCACGTGTTCCGACCCGCTAGGCCCCGCGCGGCTCGGATCCGGCGGCGCTGTTT
CGGTCGGGAGTGGGTGGGAGAGAAGCCGGGGCAGGGGAGGAGCCGCCGGAG
ZNF202 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF202_1 ↗11:123,741,660負股123,741,650–123,741,709

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_CG9J6 · enhancer · 123740313–123741649 · regulatory

ENSR11_5344SM8 · CTCF_binding_site · 123741260–123741281 · regulatory

ENSR11_799GFK · promoter · 123741650–123741759 · regulatory

ENSR11_CG9J9 · enhancer · 123741760–123743146 · regulatory

· motif · 123740974–123740985 · motif

· motif · 123741007–123741020 · motif

· motif · 123741262–123741278 · motif

· motif · 123741265–123741278 · motif

· motif · 123741352–123741369 · motif

· motif · 123741361–123741369 · motif

· motif · 123741590–123741601 · motif

· motif · 123741593–123741606 · motif

· motif · 123741656–123741665 · motif

· motif · 123741656–123741665 · motif

· motif · 123741679–123741690 · motif

· motif · 123741679–123741690 · motif

· motif · 123741681–123741690 · motif

· motif · 123741705–123741716 · motif

· motif · 123741765–123741780 · motif

· motif · 123741784–123741797 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:648 aa

1 aa648 aa結構域功能區域鋅指
依 O95125 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF202 蛋白質長 648 個胺基酸。其序列含有 SCAN box(第 46–127 位)、KRAB 區域(第 237–308 位),以及第 146–221 位的無序區域。另有 8 個 C2H2 型鋅指,分布於第 397–419、425–447、481–503、509–531、537–559、565–587、593–615 與 621–643 位。

結構域SCAN box46–127 aa
結構域KRAB237–308 aa
鋅指C2H2-type 1397–419 aa
鋅指C2H2-type 2425–447 aa
鋅指C2H2-type 3481–503 aa
鋅指C2H2-type 4509–531 aa
鋅指C2H2-type 5537–559 aa
鋅指C2H2-type 6565–587 aa
鋅指C2H2-type 7593–615 aa
鋅指C2H2-type 8621–643 aa
功能區域Disordered146–221 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O95125…

AlphaFold · O95125

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

來源將 ZNF202 定位於細胞核,未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 19 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZKSCAN10ZNF202CARD10CEP70EAF1KRT40LMO4MAD2L1BPMCCMEOX2MTIF3NAA10NAA11SCAND1SCNM1SEPHS1SSX2IPZNF250ZNF438ZNF835ZNF837
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 19 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

來源記載 ZNF202 與 SDP1 互作,但未說明這是否代表直接實體結合,也未提供複合體或功能關係的細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF202 是轉錄抑制因子,會結合主要出現在脂質代謝相關基因中的調控元件。其標的包括脂蛋白顆粒結構成分、參與脂質處理的酵素、維持脂質恆定的轉運蛋白,以及若干與能量代謝和血管疾病相關過程有關的基因。資料庫紀錄
證據與來源

Transcriptional repressor that binds to elements found predominantly in genes that participate in lipid metabolism. Among its targets are structural components of lipoprotein particles (apolipoproteins AIV, CIII, and E), enzymes involved in lipid processing (lipoprotein lipase, lecithin cholesteryl ester transferase), transporters involved in lipid homeostasis (ABCA1, ABCG1), and several genes involved in processes related to energy metabolism and vascular disease

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用來源記載 ZNF202 與 SDP1 互作,但未進一步說明此互作是否為直接結合,或是否涉及複合體及特定功能關係。資料庫紀錄
證據與來源

Interacts with SDP1

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位來源將 ZNF202 定位於細胞核,未提供定位變化的條件、異構型差異或其他定位資訊。資料庫紀錄
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000530393 · 4,435 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTGTTCCGACCCGCTAGGCCCCGCGCGGCTCGGATCCGGC40
41GGCGCTGTTTCGGTCGGGAGTGGGTGGGAGAGAAGCCGGG80
81GCAGGGGAGGAGCCGCCGGAGCTGTCGGAGCCGTGACACC120
121CAGGGCAGCTACACTCAGAAGCCACAAGGAATGCTAGTGG160
161AGCCCCTCATCCCTCCCAGCTTCTCTTCCAAGCTGCCCCG200
201TGGGGCTTGATCCAGGAAGCTACTTCAGAAAGTAGACAAT240
241CATTCCAAGGGTACAACAAGGTTTACCACAATGTGAGGGA280
281CTCAGCCATTGCAAATTGTACAGATGAGGGCCCTTGGAAG320
321AAAATCCTCGCTGTGTCCAGGCTGAGGCGGGGGGCTAATG360
361ACAGTGTGAGCTCTAGATGGTGTGAGACCACCCCAAAGCC400
401AAGAAATGGCTACAGCCGTGGAACCAGAGGACCAGGATCT440
441TTGGGAAGAAGAGGGAATTCTGATGGTGAAACTGGAAGAT480
481GATTTCACCTGTCGGCCAGAGTCTGTCTTACAGAGGGATG520
521ACCCGGTGCTGGAAACCTCCCACCAGAACTTCCGACGCTT560
561CCGCTACCAGGAGGCAGCAAGCCCTAGAGAAGCTCTCATC600
601AGACTCCGAGAACTTTGTCACCAGTGGCTGAGACCAGAGA640
641GGCGGACAAAGGAGCAGATCCTAGAGCTGCTTGTGCTGGA680
681ACAATTTCTTACCGTCCTACCTGGAGAACTACAGAGCTGG720
721GTGCGGGGCCAACGGCCAGAAAGTGGCGAGGAGGCAGTGA760
761CGCTGGTGGAGGGTTTGCAGAAACAACCCAGGAGACCAAG800
801GCGGTGGGTGACTGTCCATGTTCACGGCCAGGAAGTCCTG840
841TCAGAGGAGACGGTGCATTTAGGAGTGGAGCCTGAGTCAC880
881CTAATGAGCTGCAGGATCCTGTGCAAAGCTCGACCCCCGA920
921GCAGTCTCCTGAGGAAACCACACAGAGCCCAGATCTGGGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。