演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF200

zinc finger protein 200

ZNF200 是一種含有多個 C2H2 型鋅指的蛋白質,能與 PRMT3 直接互作,協助其定位至細胞核,並抑制 PRMT3 的蛋白酶體降解。

Homo sapiens16p13.3UniProt P98182
OFFICIAL SYMBOL
ZNF200
CHROMOSOME
16
UNIPROT
P98182
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF200(zinc finger protein 200)是人類的蛋白質編碼基因,其產物為含鋅指結構的蛋白質。蛋白質序列長 395 個胺基酸,具有五個 C2H2 型鋅指,均位於序列後段;另有一段被註解為無序區域。其已知特點包括與 PRMT3 的直接互作,以及參與 PRMT3 的細胞內定位與穩定性調節。

Official symbol
ZNF200
Gene name
zinc finger protein 200
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12993
UniProt
P98182
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegZNF200pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr16:3,222,324–3,236,221
Gene span
13,898 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000414144 ★3,222,325–3,235,1585
ENST000003968683,222,324–3,235,4575
ENST000004315613,222,324–3,235,1865
ENST000008540573,222,324–3,235,9966
ENST000008540583,222,324–3,235,1875
ENST000008540603,222,324–3,235,0705
ENST000008540613,222,324–3,235,1555
ENST000008540623,222,324–3,235,1586
ENST000008540633,222,324–3,235,1265
ENST000009467553,222,324–3,236,0087
ENST000009467563,222,324–3,236,0086
ENST000011338343,222,324–3,235,1585

顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF200 的來源支持功能集中於調節 PRMT3 的細胞內命運:它能將蛋白質精胺酸 N-甲基轉移酶 PRMT3 定位至細胞核。此定位作用與兩者之間的直接互作有關,並非單純描述兩種蛋白質各自所在的位置。

互作具有明確的結構區域關係:ZNF200 透過其 C 端與 PRMT3 的鋅指區域接觸。這項直接互作是 PRMT3 進入細胞核定位所必需的條件,顯示 ZNF200 的作用是藉由與 PRMT3 結合,協助其核內定位。

這種互作也與 PRMT3 的蛋白質穩定性相關。來源指出,ZNF200 和 PRMT3 的直接結合可抑制 PRMT3 的蛋白酶體降解;因此,ZNF200 除了影響 PRMT3 的位置,也會限制其經蛋白酶體途徑被降解。來源未進一步說明這些作用對特定細胞過程或生理結果的影響,故其功能意義可界定為調節 PRMT3 的核定位及避免其蛋白酶體降解。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 3235158 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF200 ENST00000414144 GRCh38 chr16:3235058-3236158 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CGGCCGGTGCGGACAGCAGTGTAGAAGTTAGCAAGCTGGAGTGGGCAATGTCGGTGCCCCATCTCTAACC
TATGGGAGTCACCAGAGCGGGGGCGGAGTCCCATGGCGGCCACACCCTGTCCGCCTCCGCAGTCTTTTTA
CTGGAGAACCGCAGTAAAAGGCGGAAACCGCGGAGGCGTCTTGATTTTCCGGTCGGAGAGATAGCTTGCT
TCCTTTAAGCCTCGGGGTAGGGGGGTGGGGAGGGTAGGGGGGTGGGGAGGGTAGGGGGGTGGGGAGGGTA
GGGGGGTGGGGGGGTGGGGAGGGTAGGGGGTGGGGGGGTGGGGAGAGTAGGGGGGTGGGGAGAGTAGGGG
GGTGGGGAGAGTAGGGGGTGGGGGGGTGGGGAGAGTAGGGGGGTGGGGAGAGTAGGGGGTGGGGAGAGTA
GGGGGGTGGGGAGAGTAGGGGGGTGGGGAGAGTAGGGGGGTGGGGGTTGGGGGGTGGCGCCGTGGGGGGT
GGCGGGGTGGGGGGTGGGGGGTGGGGAGAGTAGGGGGGTGGGGGGTGGGGAGAGTAGGGCGGTGGGGGAG
TGGCGGGGTAGGGGGGTGGCGGGGTGGGGGGTGGGGGGAGCGCGGGCGCTGGGTGGGCGGGGGGTGGGGC
GGTGGGGGGGCCTGCCCCGCCCCAACCGCCGCGCCTGACGGTCGTCCATTGGTTGTTTGCATTCGAACTA
CATTTCCCAGCAGGCCCTGGGGTTAGACTGGCCGCAGCTGGAGAGGTGCCAGCCCGTCGTGGATGACTAG
AGCCAACCACCTGCCTTCCGTCTTCCAGGCAGAACCACAGAGAGGCTACAGCCGTCCTGGCCTCCCTCCG
GCCCTGAGAGCTCCTCTGGCCTGTCTCAAGTCTTAACGTCTCAAGCGCAGACTGCCGGCTCCGAACGGGG
AGACCAGGCTTCTGCACCGGAAACAAGGCACCGGTTGTGACGTCACAGCCGCAGAGCGCCCGACTTCCCA
GAAGGCACCGAGTCCCTGCCGTTCTCCTCAACTGGCGGCGGCGCGAACGAATAGTCGCCGGCGACCTGTG
AGGGCACTCGGAAGGGCGAGGGGAGGGCTCGACCGCTCGCGCCTAGTTTTT
ZNF200 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF200_1 ↗16:3,235,158負股3,235,148–3,235,207

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_BMBZ · enhancer · 3234529–3235059 · regulatory

ENSR16_BMC4 · promoter · 3235060–3235622 · regulatory

ENSR16_939ND · enhancer · 3235894–3236301 · regulatory

· motif · 3234351–3234362 · motif

· motif · 3234849–3234864 · motif

· motif · 3234925–3234941 · motif

· motif · 3235188–3235203 · motif

· motif · 3235200–3235215 · motif

· motif · 3235200–3235215 · motif

· motif · 3235201–3235214 · motif

· motif · 3235201–3235214 · motif

· motif · 3235224–3235233 · motif

· motif · 3235262–3235277 · motif

· motif · 3235388–3235404 · motif

· motif · 3235979–3235992 · motif

· motif · 3236026–3236039 · motif

· motif · 3236062–3236075 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:395 aa

1 aa395 aa功能區域鋅指
依 P98182 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF200 蛋白質長 395 個胺基酸。序列第 252–274、280–302、308–330、336–358 及 364–386 位各有一個 C2H2 型鋅指;第 157–208 位則註解為無序區域。第 246–395 位被註解為與 PRMT3 互作的區域。

鋅指C2H2-type 1252–274 aa
鋅指C2H2-type 2280–302 aa
鋅指C2H2-type 3308–330 aa
鋅指C2H2-type 4336–358 aa
鋅指C2H2-type 5364–386 aa
功能區域Disordered157–208 aa
功能區域Interaction with PRMT3246–395 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P98182…

AlphaFold · P98182

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

現有定位資料未描述條件變化或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF200ZNF200FHL2TASOR2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ZNF200 與 PRMT3 有直接互作:ZNF200 以 C 端區域接觸 PRMT3 的鋅指區域。這項互作具有功能作用,為 PRMT3 定位至細胞核所必需,並抑制其蛋白酶體降解;來源未將兩者描述為特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF200 可將蛋白質精胺酸 N-甲基轉移酶 PRMT3 定位至細胞核。含實驗來源
證據與來源

Localizes protein arginine N-methyltransferase PRMT3 to the nucleus

PMID 39513743 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ZNF200 透過 C 端與 PRMT3 的鋅指區域直接互作;此互作是 PRMT3 定位至細胞核所必需,並可抑制 PRMT3 的蛋白酶體降解。含實驗來源
證據與來源

Interacts (via C-terminus) with PRMT3 (via zinc-finger); the interaction is direct and required to localize protein arginine N-methyltransferase PRMT3 to the nucleus and inhibit its proteasomal degradation

PMID 39513743 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF200 定位於細胞核。含實驗來源
證據與來源

Nucleus

PMID 39513743 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000414144 · 3,008 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GTTCTCCTCAACTGGCGGCGGCGCGAACGAATAGTCGCCG40
41GCGACCTGTGAGGGCACTCGGAAGGGCGAGGGGAGGGCTC80
81GACCGCTCGCGCCTAGTTTTTCTATCTCTCCCGGAGCCTG120
121AGTCTCTGAGCCGTCCCCAGCAAACGCTCAGGGGCTGCAG160
161AGGCCCCGAGAGCTTGGCTCTCTGGCAGATTTCCTCTAGT200
201AAGAGGTGGCTCTGGAGGCCCCGCGAAACGAGTGTGGTGT240
241GTGGTTGCAAGGCATGATGGCTGCAAAAGTGGTTCCTATG280
281CCCCCAAAGCCAAAGCAGTCCTTTATACTGAGAGTTCCGC320
321CAGACTCCAAGCTGGGCCAAGACCTACTTCGAGATGCCAC360
361TAACGGGCCCAAGACCATCCACCAGCTAGTGCTGGAGCAC400
401TTCCTCACCTTCTTGCCCAAGCCAAGCCTGGTCCAGCCCA440
441GTCAGAAAGTCAAGGAGACCTTGGTTATTATGAAAGATGT480
481GAGCTCAAGCCTTCAGAACAGAGTGCATCCTCGTCCCTTG520
521GTGAAGCTTCTGCCCAAAGGAGTCCAAAAGGAACAAGAGA560
561CAGTGTCTCTGTATTTGAAAGCTAACCCTGAGGAGCTGGT600
601GGTCTTTGAGGATTTGAATGTATTTCACTGCCAGGAAGAA640
641TGTGTGAGCTTGGATCCTACTCAACAACTCACGTCAGAGA680
681AGGAAGATGACAGCAGTGTCGGGGAAATGATGTTACTGGC720
721AGTCAATGGCAGTAATCCTGAAGGTGAAGATCCTGAGAGG760
761GAACCTGTAGAAAATGAAGATTATAGAGAAAAGTCTTCAG800
801ATGATGATGAAATGGATTCTTCCTTGGTCTCTCAGCAGCC840
841TCCCGATAACCAGGAAAAGGAACGACTAAATACATCCATT880
881CCACAAAAAAGGAAAATGAGAAATCTGTTAGTTACCATTG920
921AGAATGATACTCCTCTAGAGGAACTCTCAAAATATGTAGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。