基因總覽
ZNF20(zinc finger protein 20)是人類的蛋白質編碼基因,產物長532個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其蛋白質具有 N 端 KRAB 結構域,並含有多個 C2H2 型鋅指區域;其中部分鋅指被註記為非典型或退化型。來源所提供的功能描述僅指出它可能參與轉錄調控,未進一步說明特定調控標的或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000334213 ★ | 12,131,350–12,140,350 | 4 |
| ENST00000600335 | 12,092,843–12,140,350 | 4 |
| ENST00001127095 | 12,113,479–12,140,350 | 5 |
| ENST00001114846 | 12,130,496–12,140,350 | 4 |
| ENST00000418866 | 12,133,668–12,140,315 | 4 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF20 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。這項描述保留了「可能」的限定,表示目前資訊只支持將其視為潛在的轉錄調控參與者,並未證明它在特定細胞或生理條件下必然執行此作用。
轉錄調控涉及基因轉錄活動的調節,但現有資料未交代 ZNF20 是促進或抑制轉錄,也未提供其辨識的 DNA 序列、調控的基因、作用的分子步驟,或是否透過其他分子協助完成。因此,不能據此推定其調控方向、靶標或具體機制。
來源亦未列出與 ZNF20 相關的生物過程、實驗系統或功能結果,故目前只能將其功能概括為可能參與轉錄調控;其生物學作用範圍及調控效應仍無法由所提供資訊進一步界定。
Promoter 與基因調控
>ZNF20 ENST00000334213 GRCh38 chr19:12140250-12141350 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GAAGCAGGTGAATAACCTGCAGGGGGCAGCAGAGACCGACGCCAGGGACGGGACGCTGAGGCTAGTATGG ATCCTGCCAAGGAGTGAAGTGGAGTTCTGGGTGCTTCCTGGGCAGCCGCCCTCCCCTGCAGGTGGCTTGC AGCTGCTCAGAGCAGATCCAGAAAGAGTGTGGGTTCTGACATGCTGCAGCGCCCTGGAAAGCAGGAGACC CACGTGCAGGTGCACTTCAGGAGTTCTGTCCTTTCTGCGGCTGTACATCTGGAATCTGGGGCGGTTTTCG GGAGCAGTGTTTTGGGTTTGACATGCATAGAGTCCCTGGGGTCAGACTGTAATTTGCATATCTGAAGAAA ATCCGTAAAGATCAAGTTCAGGGAAATAACTGTTTGGGACCTCTCCTGGAGAAGGGGCTTATGCAGTTGA CAGTTTATTTAGGTCAGAAGCTTAAAATCACCAAGTGAGAGTTTTCTGCCGATGAAGATGAAGGTCTGGA AGGAGGGAGAGTTTCCACACTGTGAGGTGGGGTGAGATGTGTGAAAGCCTTGGCCATGTCTCATCCCTAA TTCCGGGCCCCTGAAGGACAACTGCCTCTCCTTCTTGGTGCAGTCGTGCCTGGCCTGATCTGGGCTCCCC TTCCTGCTCTGAGGTCAGCACATCGCTCCATTGGACACTCAGTCTGGAATTCCCTGCACACACTTACAAC CCTGTGCAGGACGAAGAAGCACTGACAGCCCATTGAATGAGGAAGAAGATAGTGCCCTGTGTAAAAATCA GGAGCAAATTTGGCTGAAAAGAAAATATCCAATGACCAGGGCTCAGGGAAGGAGTTGTCCCTTAGAGAGA AGCTGTGGCTAGAACCGATCAGTCCGGCTTTGCAGGGCTCGTTACCCAGGGCTTCTGCCGTCACTCAGTT CTGAGGGGGCGGGGCCTTGTACCTTGTCCAATCAGAAGCGCCGGGGCGGAGCCCGGCCAACGGTCCGTCC GGAAGGAGGAGGCCCATTCCAGCTTCTACTTTTGTTGCTATGCAGGTTGTTGTCGGGATACCAGATTTCC TACTCCGAGAGGCCCCGGGTCCCTCTGCCACAACTTCTGTCGCTCTGCCGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF20_1 ↗ | 19:12,140,350 | 負股 | 12,140,340–12,140,399 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_96S43 · enhancer · 12137589–12137855 · regulatory
ENSR19_B4F3C · enhancer · 12139376–12140330 · regulatory
ENSR19_96S4W · promoter · 12140331–12140840 · regulatory
ENSR19_54T4ST · CTCF_binding_site · 12141319–12141340 · regulatory
· motif · 12137974–12137989 · motif
· motif · 12140118–12140127 · motif
· motif · 12140426–12140436 · motif
· motif · 12140813–12140825 · motif
· motif · 12141009–12141022 · motif
· motif · 12141027–12141040 · motif
· motif · 12141027–12141040 · motif
· motif · 12141098–12141115 · motif
· motif · 12141127–12141136 · motif
· motif · 12141321–12141337 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:532 aa
ZNF20 蛋白長532個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其 N 端 KRAB 結構域位於第7至78個胺基酸;另有15個 C2H2 型鋅指註記,分布於第103至528個胺基酸區間。其中第一個標示為非典型,第二及第三個為退化型。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF20 的定位資料標示於細胞核;來源未提供其他細胞區室、定位改變條件或不同異構型之間的差異資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 47 個夥伴
- ACTA1P68133 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AHSPQ9NZD4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AIRIMQ9NX04 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATP1A3P13637 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CARD9Q9H257-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC102BQ68D86 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CCDC136Q96JN2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCNDBP1O95273 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CEP70Q8NHQ1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRACR2AQ9BSW2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DMWDG5E9A7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FSD2A1L4K1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GEMP55040 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GFAPP14136 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPSM3Q9Y4H4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- JPH3Q8WXH2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KIFC3Q9BVG8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- KRT31Q15323 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT38O76015 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-5P60370 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- KRTAP10-9P60411 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGCTTCTACTTTTGTTGCTATGCAGGTTGTTGTCGGGATA40CCAGATTTCCTACTCCGAGAGGCCCCGGGTCCCTCTGCCA80CAACTTCTGTCGCTCTGCCGCCTGCACCGTGACCCGCACT120ATTCACGGGAGCCCTAGAGAGGACACCGGGACACCCAGAA160GCCGGGAAATGATGTTTCAGGATTCAGTGGCCTTTGAGGA200TGTGGCTGTCAGCTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTG240GATCCTTCCCAGAAGAATCTCTACAGGGATGTGATGCAGG280AAACCTTCAAGAACCTGACCTCTGTAGGAAAAACATGGAA320AGTTCAGAACATTGAAGATGAGTACAAAAATCCCAGGAGA360AATCTAAGTCTTATGAGAGAGAAACTCTGTGAAAGTAAAG400AAAGTCATCACTGTGGAGAAAGCTTCAACCAGATTGCAGA440TGACATGCTGAACAGGAAAACTCTTCCTGGAATAACACCA480TGTGAAAGCAGTGTGTGTGGAGAAGTTGGCACGGGTCATT520CATCTCTTAATACGCATATCAGAGCTGACACTGGACACAA560GTCATCTGAGTATCAGGAATATGGAGAGAATCCATATAGA600AATAAGGAATGTAAGAAAGCCTTCAGTTATCTTGACTCCT640TTCAATCACATGATAAAGCTTGCACTAAAGAGAAACCCTA680TGATGGTAAAGAATGTACAGAAACCTTCATTTCCCATTCA720TGCATTCAAAGACACAGGGTAATGCACAGTGGAGATGGAC760CTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCCTTCTATTTTCT800CAATTTATGTCTTATCCATGAACGAATTCACACTGGTGTG840AAACCATATAAGTGTAAACAATGTGGTAAGGCCTTTACTC880GTTCCACTACCCTTCCAGTACATGAAAGAACTCACACAGG920AGTGAATGCCGATGAATGTAAAGAATGTGGGAATGCATTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。