演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF20KOX13

zinc finger protein 20

ZNF20(zinc finger protein 20)是人類蛋白質編碼基因,其產物屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19p13.2UniProt P17024
OFFICIAL SYMBOL
ZNF20
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P17024
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF20(zinc finger protein 20)是人類的蛋白質編碼基因,產物長532個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其蛋白質具有 N 端 KRAB 結構域,並含有多個 C2H2 型鋅指區域;其中部分鋅指被註記為非典型或退化型。來源所提供的功能描述僅指出它可能參與轉錄調控,未進一步說明特定調控標的或作用方式。

Official symbol
ZNF20
Gene name
zinc finger protein 20
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12992
UniProt
P17024
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KOX13

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.2
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF20pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:12,092,843–12,140,355
Gene span
47,513 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000334213 ★12,131,350–12,140,3504
ENST0000060033512,092,843–12,140,3504
ENST0000112709512,113,479–12,140,3505
ENST0000111484612,130,496–12,140,3504
ENST0000041886612,133,668–12,140,3154

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF20 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。這項描述保留了「可能」的限定,表示目前資訊只支持將其視為潛在的轉錄調控參與者,並未證明它在特定細胞或生理條件下必然執行此作用。

轉錄調控涉及基因轉錄活動的調節,但現有資料未交代 ZNF20 是促進或抑制轉錄,也未提供其辨識的 DNA 序列、調控的基因、作用的分子步驟,或是否透過其他分子協助完成。因此,不能據此推定其調控方向、靶標或具體機制。

來源亦未列出與 ZNF20 相關的生物過程、實驗系統或功能結果,故目前只能將其功能概括為可能參與轉錄調控;其生物學作用範圍及調控效應仍無法由所提供資訊進一步界定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 12140350 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF20 ENST00000334213 GRCh38 chr19:12140250-12141350 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GAAGCAGGTGAATAACCTGCAGGGGGCAGCAGAGACCGACGCCAGGGACGGGACGCTGAGGCTAGTATGG
ATCCTGCCAAGGAGTGAAGTGGAGTTCTGGGTGCTTCCTGGGCAGCCGCCCTCCCCTGCAGGTGGCTTGC
AGCTGCTCAGAGCAGATCCAGAAAGAGTGTGGGTTCTGACATGCTGCAGCGCCCTGGAAAGCAGGAGACC
CACGTGCAGGTGCACTTCAGGAGTTCTGTCCTTTCTGCGGCTGTACATCTGGAATCTGGGGCGGTTTTCG
GGAGCAGTGTTTTGGGTTTGACATGCATAGAGTCCCTGGGGTCAGACTGTAATTTGCATATCTGAAGAAA
ATCCGTAAAGATCAAGTTCAGGGAAATAACTGTTTGGGACCTCTCCTGGAGAAGGGGCTTATGCAGTTGA
CAGTTTATTTAGGTCAGAAGCTTAAAATCACCAAGTGAGAGTTTTCTGCCGATGAAGATGAAGGTCTGGA
AGGAGGGAGAGTTTCCACACTGTGAGGTGGGGTGAGATGTGTGAAAGCCTTGGCCATGTCTCATCCCTAA
TTCCGGGCCCCTGAAGGACAACTGCCTCTCCTTCTTGGTGCAGTCGTGCCTGGCCTGATCTGGGCTCCCC
TTCCTGCTCTGAGGTCAGCACATCGCTCCATTGGACACTCAGTCTGGAATTCCCTGCACACACTTACAAC
CCTGTGCAGGACGAAGAAGCACTGACAGCCCATTGAATGAGGAAGAAGATAGTGCCCTGTGTAAAAATCA
GGAGCAAATTTGGCTGAAAAGAAAATATCCAATGACCAGGGCTCAGGGAAGGAGTTGTCCCTTAGAGAGA
AGCTGTGGCTAGAACCGATCAGTCCGGCTTTGCAGGGCTCGTTACCCAGGGCTTCTGCCGTCACTCAGTT
CTGAGGGGGCGGGGCCTTGTACCTTGTCCAATCAGAAGCGCCGGGGCGGAGCCCGGCCAACGGTCCGTCC
GGAAGGAGGAGGCCCATTCCAGCTTCTACTTTTGTTGCTATGCAGGTTGTTGTCGGGATACCAGATTTCC
TACTCCGAGAGGCCCCGGGTCCCTCTGCCACAACTTCTGTCGCTCTGCCGC
ZNF20 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF20_1 ↗19:12,140,350負股12,140,340–12,140,399

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_96S43 · enhancer · 12137589–12137855 · regulatory

ENSR19_B4F3C · enhancer · 12139376–12140330 · regulatory

ENSR19_96S4W · promoter · 12140331–12140840 · regulatory

ENSR19_54T4ST · CTCF_binding_site · 12141319–12141340 · regulatory

· motif · 12137974–12137989 · motif

· motif · 12140118–12140127 · motif

· motif · 12140426–12140436 · motif

· motif · 12140813–12140825 · motif

· motif · 12141009–12141022 · motif

· motif · 12141027–12141040 · motif

· motif · 12141027–12141040 · motif

· motif · 12141098–12141115 · motif

· motif · 12141127–12141136 · motif

· motif · 12141321–12141337 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:532 aa

1 aa532 aa結構域鋅指
依 P17024 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF20 蛋白長532個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其 N 端 KRAB 結構域位於第7至78個胺基酸;另有15個 C2H2 型鋅指註記,分布於第103至528個胺基酸區間。其中第一個標示為非典型,第二及第三個為退化型。

結構域KRAB7–78 aa
鋅指C2H2-type 1; atypical103–130 aa
鋅指C2H2-type 2; degenerate143–165 aa
鋅指C2H2-type 3; degenerate171–193 aa
鋅指C2H2-type 4199–221 aa
鋅指C2H2-type 5227–249 aa
鋅指C2H2-type 6255–277 aa
鋅指C2H2-type 7283–305 aa
鋅指C2H2-type 8311–333 aa
鋅指C2H2-type 9339–361 aa
鋅指C2H2-type 10367–389 aa
鋅指C2H2-type 11395–417 aa
鋅指C2H2-type 12423–445 aa
鋅指C2H2-type 13451–473 aa
鋅指C2H2-type 14479–500 aa
鋅指C2H2-type 15506–528 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P17024…

AlphaFold · P17024

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF20 的定位資料標示於細胞核;來源未提供其他細胞區室、定位改變條件或不同異構型之間的差異資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 47 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KOX13ZNF20ACTA1AHSPAIRIMATP1A3CARD9CCDC102BCCDC136CCNDBP1CEP70CRACR2ADMWDFSD2GEMGFAPGOLGA6L9GPSM3JPH3KIFC3KRT31KRT38KRT40KRTAP10-5KRTAP10-7KRTAP10-8KRTAP10-9KRTAP12-3KRTAP4-12KRTAP4-2KRTAP9-2LMNALZTS2MTCL2MTUS2NF2PECAM1RAB5ASCNM1SPRED1TEKT4TRAF1TRIM23TXLNBVIMVWC2LVWCEYARS1ZNF417
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 47 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF20 可能參與轉錄調控;此項描述指出的是可能性,未提供特定調控標的、調控方向或作用機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF20 的定位為細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000334213 · 3,004 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCTTCTACTTTTGTTGCTATGCAGGTTGTTGTCGGGATA40
41CCAGATTTCCTACTCCGAGAGGCCCCGGGTCCCTCTGCCA80
81CAACTTCTGTCGCTCTGCCGCCTGCACCGTGACCCGCACT120
121ATTCACGGGAGCCCTAGAGAGGACACCGGGACACCCAGAA160
161GCCGGGAAATGATGTTTCAGGATTCAGTGGCCTTTGAGGA200
201TGTGGCTGTCAGCTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTG240
241GATCCTTCCCAGAAGAATCTCTACAGGGATGTGATGCAGG280
281AAACCTTCAAGAACCTGACCTCTGTAGGAAAAACATGGAA320
321AGTTCAGAACATTGAAGATGAGTACAAAAATCCCAGGAGA360
361AATCTAAGTCTTATGAGAGAGAAACTCTGTGAAAGTAAAG400
401AAAGTCATCACTGTGGAGAAAGCTTCAACCAGATTGCAGA440
441TGACATGCTGAACAGGAAAACTCTTCCTGGAATAACACCA480
481TGTGAAAGCAGTGTGTGTGGAGAAGTTGGCACGGGTCATT520
521CATCTCTTAATACGCATATCAGAGCTGACACTGGACACAA560
561GTCATCTGAGTATCAGGAATATGGAGAGAATCCATATAGA600
601AATAAGGAATGTAAGAAAGCCTTCAGTTATCTTGACTCCT640
641TTCAATCACATGATAAAGCTTGCACTAAAGAGAAACCCTA680
681TGATGGTAAAGAATGTACAGAAACCTTCATTTCCCATTCA720
721TGCATTCAAAGACACAGGGTAATGCACAGTGGAGATGGAC760
761CTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCCTTCTATTTTCT800
801CAATTTATGTCTTATCCATGAACGAATTCACACTGGTGTG840
841AAACCATATAAGTGTAAACAATGTGGTAAGGCCTTTACTC880
881GTTCCACTACCCTTCCAGTACATGAAAGAACTCACACAGG920
921AGTGAATGCCGATGAATGTAAAGAATGTGGGAATGCATTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。