基因總覽
ZNF2(zinc finger protein 2)是人類的蛋白質編碼基因,其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質全長 425 個胺基酸,具有 N 端 KRAB domain,以及多個 C2H2-type zinc finger;其中最末端的一個被註記為退化型。序列中另有兩段被預測為無序區。這些特徵構成 ZNF2 的基本分子架構;現有資料對其主要角色僅指出可能參與轉錄調控,未提供更具體的調控對象或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000614034 ★ | 95,165,809–95,184,317 | 5 |
| ENST00000617923 | 95,165,432–95,184,317 | 4 |
| ENST00000622059 | 95,165,432–95,184,317 | 4 |
| ENST00000611147 | 95,165,432–95,182,171 | 5 |
| ENST00000876804 | 95,165,432–95,184,317 | 5 |
| ENST00001140121 | 95,165,432–95,184,317 | 5 |
| ENST00000611463 | 95,165,466–95,184,317 | 3 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有註解指出,ZNF2 可能參與轉錄調控。這項描述限定為可能的功能,並未說明它促進或抑制轉錄,也沒有提供特定目標基因、細胞條件或實驗系統,因此不宜進一步推定其調控方向或作用範圍。
ZNF2 的蛋白質家族歸屬與序列特徵提供了分子層面的基本背景:它屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,並含有 KRAB domain 與多個 C2H2-type zinc finger。不過,現有功能資料沒有指出這些結構區域如何參與轉錄調控,也未描述 DNA 辨識、蛋白質互作或其他具體機制;不能僅依家族或結構特徵補寫未經來源支持的作用細節。
因此,目前可支持的生物學功能結論有限:ZNF2 被註記為可能與轉錄調控有關,但其調控對象、分子途徑及對細胞生物學過程的具體影響尚未由提供的資料界定。
Promoter 與基因調控
>ZNF2 ENST00000614034 GRCh38 chr2:95164809-95165909 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACAGCCAATAATATTGTATATTTTAAAGTAACTAAAAGAATATAACTGGATCGTTTGTAACACAAAGGAC AAATGCTTGAGGTGATGGATATCCCATTTGTCCTGATGAGATTATTACTTATTGCATGCCTGTGTCAAAA TATCTCAGGTGGCCCATAAATGTTCACACCTACTGTGTACCCACAAAAACTTAAAAAAAACCCAAACCAC TAATAAATTAACCTGGAAAAACGTAGCTTTGTTCCTGAAGTAAGATTTTATCATATTCTTTGTAATTTTC AGTCTTCCCTGAGATGTAGCTCAGTGGTTCCTAGCTTTAGCTGCACATTAGAGTCACCTGCAGCTCTTTT CAAACTGTCGCTCCACAGCTGGGCCTCAGGCATCAATGTCGAAAGCTCTCCGGGTGATTCCAGCTTGCAG CCAGGGCCGTTCCAGCAACTCCAAGGCTGGCTGGTGTGCGCTGAAGCTGTCGGGAGTCGGACCAGCTGCA CAGTTAATACATATGTGTCCTAGGCTCCTCTCTCCTTCCAACGCAAATATGTGTACAAACCCTGCCTGGA ACCGCAGCCCTGCTCTCAGAATCAAATTCCTGAAAGTGGGCAAGCGGAAGCGGAAATAAGCCCTCTCCCA ACGCCAGCTGACTCGATTTCGTCTCGGTCTTCCCCAGAGCTGGACACGAGGCACCATGATCAGAGAGACA CATTCCCTGCGGACGGCGCTCCCATCGGATACTGGAGGGACGCGACACTAGAGGCAGGCAGTACTTCAGG GTGACCATAAGTCTCCCAAACAGCCACAACGGCTCGCTCTCCCAGCTAAGGCGACAGCGCTGCCATTTTG GATCCTGTTCAGCCACGGGAAGCCGGCGTTTGCACACATTTTCGGACGTCATATTAAAGCGCACCGGACG CCGAGACTTCTGGGAGATGAAGTCCTTGCGAAGGCCCCGCATTGATTGGGAGCGCAGTCGCCAGGACCCT GTGCGCAGGCGCGTTGGTTTCCCGACCTGAAGAGGCGCCGTCTTCCCGGGTCCCGAGCACTCTGTGCCGG AGGTGAGGGTTGTGGGTGTGTGTCTTCAAGGAGCGGAGTGAGCGCAGCAGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF2_1 ↗ | 2:95,165,420 | 正股 | 95,165,371–95,165,430 |
| ZNF2_2 ↗ | 2:95,165,809 | 正股 | 95,165,760–95,165,819 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_93DQT8 · promoter · 95165060–95165476 · regulatory
ENSR2_84RJPM · enhancer · 95165477–95165657 · regulatory
ENSR2_84RJPQ · promoter · 95165658–95165827 · regulatory
ENSR2_BNTX8 · enhancer · 95165828–95166522 · regulatory
· motif · 95165409–95165420 · motif
· motif · 95165415–95165426 · motif
· motif · 95165415–95165426 · motif
· motif · 95165417–95165426 · motif
· motif · 95165790–95165801 · motif
· motif · 95165790–95165801 · motif
· motif · 95165854–95165863 · motif
· motif · 95166029–95166042 · motif
· motif · 95166495–95166507 · motif
· motif · 95166720–95166731 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:425 aa
zinc finger protein 2 全長 425 個胺基酸,包含位於第 14–85 位的 KRAB domain,以及 9 個串聯的 C2H2-type zinc finger,分布於第 173–419 位;第 9 個 zinc finger 註記為退化型。第 86–110 位與第 122–163 位另被標示為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ZNF2 定位於細胞核,未提供定位變化的條件、異構型差異或細胞內動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- DVL3Q92997 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPANXN2Q5MJ10 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM41Q8WV44 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TSGA10Q9BZW7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CCCGACCTGAAGAGGCGCCGTCTTCCCGGGTCCCGAGCAC40TCTGTGCCGGAGGACTCTGCCCTTGTCCACAAGGAGAGCA80CACAGGAGAGAATGGCTGCTGTGTCTCCGACCACCAGATG120CCAGGAATCAGTGACATTCGAAGACGTTGCCGTGGTTTTC160ACAGATGAAGAGTGGAGTCGTCTGGTCCCCATACAGAGGG200ACCTCTACAAGGAGGTGATGCTGGAGAACTATAACAGCAT240TGTGTCATTGGGCCTTCCAGTTCCTCAACCTGATGTGATT280TTCCAATTGAAGAGAGGGGACAAGCCGTGGATGGTAGATC320TTCATGGGTCTGAGGAGAGAGAATGGCCAGAGAGTGTCTC360TCTAGACTGGGAAACTAAGCCTGAGATTCACGATGCTTCA400GACAAAAAATCAGAAGGATCATTGAGGGAATGCCTTGGAA440GGCAAAGTCCTCTGTGTCCTAAATTTGAAGTTCATACACC480CAATGGCAGGATGGGAACAGAAAAGCAAAGCCCTTCAGGG520GAGACTCGTAAGAAATCCCTCTCCCGGGACAAAGGCTTGC560GGCGACGGTCAGCCCTGTCCAGGGAAATTCTCACTAAAGA600GAGACACCAGGAATGCAGTGACTGTGGGAAGACCTTTTTT640GACCACTCATCCCTCACCCGCCATCAGAGGACTCACACTG680GGGAGAAGCCCTACGACTGCCGCGAGTGTGGGAAAGCCTT720CAGCCACAGGAGCAGCCTCAGCAGACATCTGATGTCACAC760ACTGGGGAGAGCCCCTACGAGTGCAGTGTGTGCTCAAAAG800CCTTCTTTGACCGTTCGTCCCTAACTGTCCATCAGCGAAT840TCACACTGGAGAGAAACCCTTTCAGTGCAACGAGTGTGGA880AAAGCCTTTTTTGACCGTTCATCCCTTACTCGACACCAGA920GAATTCACACTGGAGAAAGTCCTTATGAATGTCATCAGTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。