演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF2A1-5

zinc finger protein 2

ZNF2(zinc finger protein 2)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族的蛋白質;資料指出它可能參與轉錄調控,並定位於細胞核。

Homo sapiens2q11.1UniProt Q9BSG1
OFFICIAL SYMBOL
ZNF2
CHROMOSOME
2
UNIPROT
Q9BSG1
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF2(zinc finger protein 2)是人類的蛋白質編碼基因,其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質全長 425 個胺基酸,具有 N 端 KRAB domain,以及多個 C2H2-type zinc finger;其中最末端的一個被註記為退化型。序列中另有兩段被預測為無序區。這些特徵構成 ZNF2 的基本分子架構;現有資料對其主要角色僅指出可能參與轉錄調控,未提供更具體的調控對象或作用方式。

Official symbol
ZNF2
Gene name
zinc finger protein 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12991
UniProt
Q9BSG1
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
A1-5ZNF661Zfp661

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q11.1
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegZNF2pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr2:95,165,432–95,184,317
Gene span
18,886 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000614034 ★95,165,809–95,184,3175
ENST0000061792395,165,432–95,184,3174
ENST0000062205995,165,432–95,184,3174
ENST0000061114795,165,432–95,182,1715
ENST0000087680495,165,432–95,184,3175
ENST0000114012195,165,432–95,184,3175
ENST0000061146395,165,466–95,184,3173

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有註解指出,ZNF2 可能參與轉錄調控。這項描述限定為可能的功能,並未說明它促進或抑制轉錄,也沒有提供特定目標基因、細胞條件或實驗系統,因此不宜進一步推定其調控方向或作用範圍。

ZNF2 的蛋白質家族歸屬與序列特徵提供了分子層面的基本背景:它屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,並含有 KRAB domain 與多個 C2H2-type zinc finger。不過,現有功能資料沒有指出這些結構區域如何參與轉錄調控,也未描述 DNA 辨識、蛋白質互作或其他具體機制;不能僅依家族或結構特徵補寫未經來源支持的作用細節。

因此,目前可支持的生物學功能結論有限:ZNF2 被註記為可能與轉錄調控有關,但其調控對象、分子途徑及對細胞生物學過程的具體影響尚未由提供的資料界定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 95165809 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF2 ENST00000614034 GRCh38 chr2:95164809-95165909 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACAGCCAATAATATTGTATATTTTAAAGTAACTAAAAGAATATAACTGGATCGTTTGTAACACAAAGGAC
AAATGCTTGAGGTGATGGATATCCCATTTGTCCTGATGAGATTATTACTTATTGCATGCCTGTGTCAAAA
TATCTCAGGTGGCCCATAAATGTTCACACCTACTGTGTACCCACAAAAACTTAAAAAAAACCCAAACCAC
TAATAAATTAACCTGGAAAAACGTAGCTTTGTTCCTGAAGTAAGATTTTATCATATTCTTTGTAATTTTC
AGTCTTCCCTGAGATGTAGCTCAGTGGTTCCTAGCTTTAGCTGCACATTAGAGTCACCTGCAGCTCTTTT
CAAACTGTCGCTCCACAGCTGGGCCTCAGGCATCAATGTCGAAAGCTCTCCGGGTGATTCCAGCTTGCAG
CCAGGGCCGTTCCAGCAACTCCAAGGCTGGCTGGTGTGCGCTGAAGCTGTCGGGAGTCGGACCAGCTGCA
CAGTTAATACATATGTGTCCTAGGCTCCTCTCTCCTTCCAACGCAAATATGTGTACAAACCCTGCCTGGA
ACCGCAGCCCTGCTCTCAGAATCAAATTCCTGAAAGTGGGCAAGCGGAAGCGGAAATAAGCCCTCTCCCA
ACGCCAGCTGACTCGATTTCGTCTCGGTCTTCCCCAGAGCTGGACACGAGGCACCATGATCAGAGAGACA
CATTCCCTGCGGACGGCGCTCCCATCGGATACTGGAGGGACGCGACACTAGAGGCAGGCAGTACTTCAGG
GTGACCATAAGTCTCCCAAACAGCCACAACGGCTCGCTCTCCCAGCTAAGGCGACAGCGCTGCCATTTTG
GATCCTGTTCAGCCACGGGAAGCCGGCGTTTGCACACATTTTCGGACGTCATATTAAAGCGCACCGGACG
CCGAGACTTCTGGGAGATGAAGTCCTTGCGAAGGCCCCGCATTGATTGGGAGCGCAGTCGCCAGGACCCT
GTGCGCAGGCGCGTTGGTTTCCCGACCTGAAGAGGCGCCGTCTTCCCGGGTCCCGAGCACTCTGTGCCGG
AGGTGAGGGTTGTGGGTGTGTGTCTTCAAGGAGCGGAGTGAGCGCAGCAGC
ZNF2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF2_1 ↗2:95,165,420正股95,165,371–95,165,430
ZNF2_2 ↗2:95,165,809正股95,165,760–95,165,819

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_93DQT8 · promoter · 95165060–95165476 · regulatory

ENSR2_84RJPM · enhancer · 95165477–95165657 · regulatory

ENSR2_84RJPQ · promoter · 95165658–95165827 · regulatory

ENSR2_BNTX8 · enhancer · 95165828–95166522 · regulatory

· motif · 95165409–95165420 · motif

· motif · 95165415–95165426 · motif

· motif · 95165415–95165426 · motif

· motif · 95165417–95165426 · motif

· motif · 95165790–95165801 · motif

· motif · 95165790–95165801 · motif

· motif · 95165854–95165863 · motif

· motif · 95166029–95166042 · motif

· motif · 95166495–95166507 · motif

· motif · 95166720–95166731 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:425 aa

1 aa425 aa結構域功能區域鋅指
依 Q9BSG1 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 2 全長 425 個胺基酸,包含位於第 14–85 位的 KRAB domain,以及 9 個串聯的 C2H2-type zinc finger,分布於第 173–419 位;第 9 個 zinc finger 註記為退化型。第 86–110 位與第 122–163 位另被標示為無序區。

結構域KRAB14–85 aa
鋅指C2H2-type 1173–195 aa
鋅指C2H2-type 2201–223 aa
鋅指C2H2-type 3229–251 aa
鋅指C2H2-type 4257–279 aa
鋅指C2H2-type 5285–307 aa
鋅指C2H2-type 6313–335 aa
鋅指C2H2-type 7341–363 aa
鋅指C2H2-type 8369–391 aa
鋅指C2H2-type 9; degenerate397–419 aa
功能區域Disordered86–110 aa
功能區域Disordered122–163 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9BSG1…

AlphaFold · Q9BSG1

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

資料將 ZNF2 定位於細胞核,未提供定位變化的條件、異構型差異或細胞內動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 6 個夥伴 · 最多顯示 50 個
A1-5ZNF2DVL3HTTSPANXN2TRIM41KRTAP10-7TSGA10
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF2 可能參與轉錄調控;此註解以可能性描述其功能,未指出調控方向、目標基因、作用機制或發生條件。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF2 定位於細胞核;此項定位註解未提供其他條件或細胞情境。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000614034 · 3,580 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCCGACCTGAAGAGGCGCCGTCTTCCCGGGTCCCGAGCAC40
41TCTGTGCCGGAGGACTCTGCCCTTGTCCACAAGGAGAGCA80
81CACAGGAGAGAATGGCTGCTGTGTCTCCGACCACCAGATG120
121CCAGGAATCAGTGACATTCGAAGACGTTGCCGTGGTTTTC160
161ACAGATGAAGAGTGGAGTCGTCTGGTCCCCATACAGAGGG200
201ACCTCTACAAGGAGGTGATGCTGGAGAACTATAACAGCAT240
241TGTGTCATTGGGCCTTCCAGTTCCTCAACCTGATGTGATT280
281TTCCAATTGAAGAGAGGGGACAAGCCGTGGATGGTAGATC320
321TTCATGGGTCTGAGGAGAGAGAATGGCCAGAGAGTGTCTC360
361TCTAGACTGGGAAACTAAGCCTGAGATTCACGATGCTTCA400
401GACAAAAAATCAGAAGGATCATTGAGGGAATGCCTTGGAA440
441GGCAAAGTCCTCTGTGTCCTAAATTTGAAGTTCATACACC480
481CAATGGCAGGATGGGAACAGAAAAGCAAAGCCCTTCAGGG520
521GAGACTCGTAAGAAATCCCTCTCCCGGGACAAAGGCTTGC560
561GGCGACGGTCAGCCCTGTCCAGGGAAATTCTCACTAAAGA600
601GAGACACCAGGAATGCAGTGACTGTGGGAAGACCTTTTTT640
641GACCACTCATCCCTCACCCGCCATCAGAGGACTCACACTG680
681GGGAGAAGCCCTACGACTGCCGCGAGTGTGGGAAAGCCTT720
721CAGCCACAGGAGCAGCCTCAGCAGACATCTGATGTCACAC760
761ACTGGGGAGAGCCCCTACGAGTGCAGTGTGTGCTCAAAAG800
801CCTTCTTTGACCGTTCGTCCCTAACTGTCCATCAGCGAAT840
841TCACACTGGAGAGAAACCCTTTCAGTGCAACGAGTGTGGA880
881AAAGCCTTTTTTGACCGTTCATCCCTTACTCGACACCAGA920
921GAATTCACACTGGAGAAAGTCCTTATGAATGTCATCAGTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。