基因總覽
ZNF197 是位於人類第 3 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 197。其蛋白質產物屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,長 1029 個胺基酸。序列中包含 SCAN box、KRAB 區域與多個 C2H2-type zinc finger,呈現由不同功能區域組成的結構特色。現有資料將其主要角色概述為可能參與轉錄調控;具體分子作用方式及其調控對象則未由這些資料說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000344387 ★ | 44,625,036–44,648,471 | 6 |
| ENST00001086219 | 44,584,832–44,647,641 | 7 |
| ENST00000412641 | 44,584,888–44,629,390 | 3 |
| ENST00000383744 | 44,625,006–44,648,471 | 6 |
| ENST00000383745 | 44,625,006–44,648,471 | 6 |
| ENST00000894446 | 44,625,006–44,644,889 | 6 |
| ENST00000934426 | 44,625,006–44,648,471 | 6 |
| ENST00000988944 | 44,625,006–44,648,471 | 5 |
| ENST00001046241 | 44,625,006–44,648,471 | 5 |
| ENST00001046244 | 44,625,006–44,647,142 | 5 |
| ENST00001086221 | 44,625,006–44,644,903 | 5 |
| ENST00001144264 | 44,625,006–44,648,471 | 6 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF197 的功能註解指出,它可能參與轉錄調控。這項描述保留了「可能」的限定,表示目前資料僅支持其與轉錄調控相關的推測,並未具體說明它會促進或抑制轉錄,也沒有指出受到調控的基因或轉錄過程中的作用步驟。
因此,依現有資訊可將 ZNF197 的功能範圍概括為轉錄調控相關,但不能進一步判定其作用方向、調控機制、參與的細胞過程或生物學結果。資料也未提供實驗條件或其他功能證據,故其在不同情境中的作用仍無法由此說明。
Promoter 與基因調控
>ZNF197 ENST00000344387 GRCh38 chr3:44624036-44625136 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AAACCCCGTCTCTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCAGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAAT CCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCCAAG ATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAGACATAA ACAGAATAACATGAACCTTGCTCATTGAATAAACATTCATCTACAACCTATATGGCTTCAGCTTTGTACT AGGTGCTAAATACATGGGATCCATGCAGACATGGCCTTTGCCCTTTTGGAGACTTGTTTCAGCCATAGTC CCATATAGGGGTGTCAGTTCCAGAAGTCCAAACTTAAGAGACTGAAGACCAAAGAGAGGATCAGAGTGCC AGTTTCCTTTATATACACCTGACTTTACCCAGGGCGATGGACAGCTAGAATAACCTCTTCTTTCAGGGGA GAGATGTCCCTACCATTTGCACATTACCTTGCACCATCAACTTGATTATTATTTAATATCATAGCTCCAA TATGTCATCATGTGGGCAAGAGATACACCACAGTAAGCGAATTCACAAGAGGGTGATTTATAAGTCATGT TATTATTTATAGTGAGAATTGCATAAGTTCAAGAAGAGACCAGAAAAGTCACCTACCAGGTCATTCAGAC GTGAAGGTCACTCCCTATCAACCTCAATTGAAATGCAAATCAAAATAGAAATGTCCAACTCTCTTAGGAG GCAACAGGCATCCTGAGACCCTGGGTCCTGTCTTTCATCTCTGCACCCTTCCGGTCTGAAACAGCGGCCA GTTCTTGTTCGATGTAAGGAACACTAGTACCCAAGGGCTCAGGAGTTCCGCCTCTCTTCCCCAGTTCTGG GAAAAGAAACGAACCATAGAGATGTGGCTTCCTAGAGATCCGGGATGAGGGGCGGGGTGCAACCGGAAGT CGCAGTATTCTCGGCTCGGCCATTATTCTGTGCCTCGGCTGCCGGAAGGGCTCGTTCCTGTGTCATCTCC TAGCGGCCTGGCGCCGAGGCGGCGGTACGCAAGGCTGGAGCCGCAGCGGGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF197_2 ↗ | 3:44,584,888 | 正股 | 44,584,839–44,584,898 |
| ZNF197_1 ↗ | 3:44,625,036 | 正股 | 44,624,987–44,625,046 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR3_BBT55 · enhancer · 44624340–44624941 · regulatory
ENSR3_5DHDNK · CTCF_binding_site · 44624634–44624655 · regulatory
ENSR3_5DHDPJ · CTCF_binding_site · 44624843–44624864 · regulatory
ENSR3_74LSXB · promoter · 44624942–44625059 · regulatory
ENSR3_BBT58 · enhancer · 44625060–44626041 · regulatory
· motif · 44624315–44624327 · motif
· motif · 44624636–44624652 · motif
· motif · 44624765–44624778 · motif
· motif · 44624845–44624861 · motif
· motif · 44624851–44624860 · motif
· motif · 44625005–44625016 · motif
· motif · 44625005–44625016 · motif
· motif · 44625007–44625016 · motif
· motif · 44625030–44625040 · motif
· motif · 44625056–44625065 · motif
· motif · 44625653–44625670 · motif
· motif · 44626066–44626077 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1029 aa
ZNF197 蛋白長 1029 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白序列註解包含 SCAN box(第 42–124 位)、KRAB 區域(第 217–289 位),以及 22 個 C2H2-type zinc finger(第 370–980 位)。另有一段第 262–290 位區域被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF197 蛋白的定位註解為細胞核;資料未提供定位隨條件改變或異構型差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CATTATTCTGTGCCTCGGCTGCCGGAAGGGCTCGTTCCTG40TGTCATCTCCTAGCGGCCTGGCGCCGAGGCGGCGGTACGC80AAGGCTGGAGCCGCAGCGGGAGCCCCCGATGATACTCTCC120AAGCTGTAAGGAAGAAGTCAAGGATTAAGGAGACCTGGAC160TGGAGAGGAGCCTTTTTCAAAAAACAACAATGACAAGAGA200AAATGTAGCCCACAATGCTCTGAGACAAGAGGGCCTTGTG240AAGGGGAAGGATGATACCTGGAAATGGGGAACCAGCTTCC280AAGGAAGTAGCTCCTCTGTTTGGGAGACCTCCCACCTACA320CTTTAGACAATTACGTTACCATGAGACATCTGGACCCCAG360GAAGCCCTGAGCCGGCTCAGGGAACTCTGTCGCCGGTGGC400TGAGACCAGAAGCACGCACCAAGGCACAGATCCTGGAGCT440GCTGGTGCTGGAGCAGTTTCTGAGCATCCTGCCTGGGGAG480ATTCGGACCTGGGTACAGCTCCATCACCCTGGAAGTGGCG520AGGAGGCTGTGGCCCTGGTAGAGGAGCTGCAGAAAGACCT560TGATGGACCAGCAATACAAGTTCCAGTCCTTGTCAAGGAT600CAGGACACTCTCCAGAAGGTGGTGAGTGCCCCAGGAACAA640CACTTCCTCCTGTACTTCCTGGCAGCCACATAGCAGCTGA680AATTTGCCCGCATCCTCCTACTGACCTAGTGGCATTCAAC720CTCCAGGATCCTCAGCATGATTCTCCTGCCCCTGAAGCTT760CTGCCCTTTCCCAGGAAGAGAACCCAAGAAATCAATTAAT800GGCACTTATGCTCCTAACAGCCCAGCCCCAGGAGTTGGTG840ATGTTCGAGGAGGTGTCAGTATGCTTCACTTCAGAGGAAT880GGGCATGTCTGGGCCCAATCCAGAGGGCCTTGTACTGGGA920TGTGATGCTGGAGAATTATGGAAATGTGACCTCCCTAGAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。