演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF197P18

zinc finger protein 197

ZNF197(zinc finger protein 197)是蛋白質編碼基因,產物屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens3p21.31UniProt O14709
OFFICIAL SYMBOL
ZNF197
CHROMOSOME
3
UNIPROT
O14709
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF197 是位於人類第 3 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 197。其蛋白質產物屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,長 1029 個胺基酸。序列中包含 SCAN box、KRAB 區域與多個 C2H2-type zinc finger,呈現由不同功能區域組成的結構特色。現有資料將其主要角色概述為可能參與轉錄調控;具體分子作用方式及其調控對象則未由這些資料說明。

Official symbol
ZNF197
Gene name
zinc finger protein 197
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12988
UniProt
O14709
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
P18D3S1363EZKSCAN9ZSCAN41ZNF166

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33p21.31
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegZNF197pq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr3:44,584,832–44,648,471
Gene span
63,640 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000344387 ★44,625,036–44,648,4716
ENST0000108621944,584,832–44,647,6417
ENST0000041264144,584,888–44,629,3903
ENST0000038374444,625,006–44,648,4716
ENST0000038374544,625,006–44,648,4716
ENST0000089444644,625,006–44,644,8896
ENST0000093442644,625,006–44,648,4716
ENST0000098894444,625,006–44,648,4715
ENST0000104624144,625,006–44,648,4715
ENST0000104624444,625,006–44,647,1425
ENST0000108622144,625,006–44,644,9035
ENST0000114426444,625,006–44,648,4716

顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF197 的功能註解指出,它可能參與轉錄調控。這項描述保留了「可能」的限定,表示目前資料僅支持其與轉錄調控相關的推測,並未具體說明它會促進或抑制轉錄,也沒有指出受到調控的基因或轉錄過程中的作用步驟。

因此,依現有資訊可將 ZNF197 的功能範圍概括為轉錄調控相關,但不能進一步判定其作用方向、調控機制、參與的細胞過程或生物學結果。資料也未提供實驗條件或其他功能證據,故其在不同情境中的作用仍無法由此說明。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 44625036 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF197 ENST00000344387 GRCh38 chr3:44624036-44625136 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAACCCCGTCTCTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCAGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAAT
CCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCCAAG
ATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAGACATAA
ACAGAATAACATGAACCTTGCTCATTGAATAAACATTCATCTACAACCTATATGGCTTCAGCTTTGTACT
AGGTGCTAAATACATGGGATCCATGCAGACATGGCCTTTGCCCTTTTGGAGACTTGTTTCAGCCATAGTC
CCATATAGGGGTGTCAGTTCCAGAAGTCCAAACTTAAGAGACTGAAGACCAAAGAGAGGATCAGAGTGCC
AGTTTCCTTTATATACACCTGACTTTACCCAGGGCGATGGACAGCTAGAATAACCTCTTCTTTCAGGGGA
GAGATGTCCCTACCATTTGCACATTACCTTGCACCATCAACTTGATTATTATTTAATATCATAGCTCCAA
TATGTCATCATGTGGGCAAGAGATACACCACAGTAAGCGAATTCACAAGAGGGTGATTTATAAGTCATGT
TATTATTTATAGTGAGAATTGCATAAGTTCAAGAAGAGACCAGAAAAGTCACCTACCAGGTCATTCAGAC
GTGAAGGTCACTCCCTATCAACCTCAATTGAAATGCAAATCAAAATAGAAATGTCCAACTCTCTTAGGAG
GCAACAGGCATCCTGAGACCCTGGGTCCTGTCTTTCATCTCTGCACCCTTCCGGTCTGAAACAGCGGCCA
GTTCTTGTTCGATGTAAGGAACACTAGTACCCAAGGGCTCAGGAGTTCCGCCTCTCTTCCCCAGTTCTGG
GAAAAGAAACGAACCATAGAGATGTGGCTTCCTAGAGATCCGGGATGAGGGGCGGGGTGCAACCGGAAGT
CGCAGTATTCTCGGCTCGGCCATTATTCTGTGCCTCGGCTGCCGGAAGGGCTCGTTCCTGTGTCATCTCC
TAGCGGCCTGGCGCCGAGGCGGCGGTACGCAAGGCTGGAGCCGCAGCGGGA
ZNF197 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF197_2 ↗3:44,584,888正股44,584,839–44,584,898
ZNF197_1 ↗3:44,625,036正股44,624,987–44,625,046

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR3_BBT55 · enhancer · 44624340–44624941 · regulatory

ENSR3_5DHDNK · CTCF_binding_site · 44624634–44624655 · regulatory

ENSR3_5DHDPJ · CTCF_binding_site · 44624843–44624864 · regulatory

ENSR3_74LSXB · promoter · 44624942–44625059 · regulatory

ENSR3_BBT58 · enhancer · 44625060–44626041 · regulatory

· motif · 44624315–44624327 · motif

· motif · 44624636–44624652 · motif

· motif · 44624765–44624778 · motif

· motif · 44624845–44624861 · motif

· motif · 44624851–44624860 · motif

· motif · 44625005–44625016 · motif

· motif · 44625005–44625016 · motif

· motif · 44625007–44625016 · motif

· motif · 44625030–44625040 · motif

· motif · 44625056–44625065 · motif

· motif · 44625653–44625670 · motif

· motif · 44626066–44626077 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1029 aa

1 aa1029 aa結構域功能區域鋅指
依 O14709 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF197 蛋白長 1029 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白序列註解包含 SCAN box(第 42–124 位)、KRAB 區域(第 217–289 位),以及 22 個 C2H2-type zinc finger(第 370–980 位)。另有一段第 262–290 位區域被註記為無序區。

結構域SCAN box42–124 aa
結構域KRAB217–289 aa
鋅指C2H2-type 1370–392 aa
鋅指C2H2-type 2398–420 aa
鋅指C2H2-type 3426–448 aa
鋅指C2H2-type 4454–476 aa
鋅指C2H2-type 5482–504 aa
鋅指C2H2-type 6510–532 aa
鋅指C2H2-type 7538–560 aa
鋅指C2H2-type 8566–588 aa
鋅指C2H2-type 9594–616 aa
鋅指C2H2-type 10622–644 aa
鋅指C2H2-type 11650–672 aa
鋅指C2H2-type 12678–700 aa
鋅指C2H2-type 13706–728 aa
鋅指C2H2-type 14734–756 aa
鋅指C2H2-type 15762–784 aa
鋅指C2H2-type 16790–812 aa
鋅指C2H2-type 17818–840 aa
鋅指C2H2-type 18846–868 aa
鋅指C2H2-type 19874–896 aa
鋅指C2H2-type 20902–924 aa
鋅指C2H2-type 21930–952 aa
鋅指C2H2-type 22958–980 aa
功能區域Disordered262–290 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O14709…

AlphaFold · O14709

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF197 蛋白的定位註解為細胞核;資料未提供定位隨條件改變或異構型差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
P18ZNF197
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF197 可能參與轉錄調控;此註解未說明其調控方向、作用機制或所影響的轉錄目標。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF197 的定位註解為細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000344387 · 7,530 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CATTATTCTGTGCCTCGGCTGCCGGAAGGGCTCGTTCCTG40
41TGTCATCTCCTAGCGGCCTGGCGCCGAGGCGGCGGTACGC80
81AAGGCTGGAGCCGCAGCGGGAGCCCCCGATGATACTCTCC120
121AAGCTGTAAGGAAGAAGTCAAGGATTAAGGAGACCTGGAC160
161TGGAGAGGAGCCTTTTTCAAAAAACAACAATGACAAGAGA200
201AAATGTAGCCCACAATGCTCTGAGACAAGAGGGCCTTGTG240
241AAGGGGAAGGATGATACCTGGAAATGGGGAACCAGCTTCC280
281AAGGAAGTAGCTCCTCTGTTTGGGAGACCTCCCACCTACA320
321CTTTAGACAATTACGTTACCATGAGACATCTGGACCCCAG360
361GAAGCCCTGAGCCGGCTCAGGGAACTCTGTCGCCGGTGGC400
401TGAGACCAGAAGCACGCACCAAGGCACAGATCCTGGAGCT440
441GCTGGTGCTGGAGCAGTTTCTGAGCATCCTGCCTGGGGAG480
481ATTCGGACCTGGGTACAGCTCCATCACCCTGGAAGTGGCG520
521AGGAGGCTGTGGCCCTGGTAGAGGAGCTGCAGAAAGACCT560
561TGATGGACCAGCAATACAAGTTCCAGTCCTTGTCAAGGAT600
601CAGGACACTCTCCAGAAGGTGGTGAGTGCCCCAGGAACAA640
641CACTTCCTCCTGTACTTCCTGGCAGCCACATAGCAGCTGA680
681AATTTGCCCGCATCCTCCTACTGACCTAGTGGCATTCAAC720
721CTCCAGGATCCTCAGCATGATTCTCCTGCCCCTGAAGCTT760
761CTGCCCTTTCCCAGGAAGAGAACCCAAGAAATCAATTAAT800
801GGCACTTATGCTCCTAACAGCCCAGCCCCAGGAGTTGGTG840
841ATGTTCGAGGAGGTGTCAGTATGCTTCACTTCAGAGGAAT880
881GGGCATGTCTGGGCCCAATCCAGAGGGCCTTGTACTGGGA920
921TGTGATGCTGGAGAATTATGGAAATGTGACCTCCCTAGAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。