演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF195

zinc finger protein 195

ZNF195(zinc finger protein 195)是蛋白質編碼基因,其產物可能參與轉錄調控。

Homo sapiens11p15.5UniProt O14628
OFFICIAL SYMBOL
ZNF195
CHROMOSOME
11
UNIPROT
O14628
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF195 的正式名稱為 zinc finger protein 195,屬於蛋白質編碼基因。現有資料將其產物與轉錄調控連結,但未進一步說明其調控對象、作用方式或特定生物學情境。

Official symbol
ZNF195
Gene name
zinc finger protein 195
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12986
UniProt
O14628
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111p15.5
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegZNF195pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr11:3,339,261–3,379,222
Gene span
39,962 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000399602 ★3,357,927–3,379,1466
ENST000005287963,339,261–3,379,2224
ENST000011138013,344,143–3,379,2224
ENST000011138023,344,273–3,379,2224
ENST000003545993,357,927–3,379,2224
ENST000011411773,357,927–3,379,2226
ENST000003433383,357,928–3,379,2225
ENST000006203743,357,928–3,379,2227
ENST000009289953,357,932–3,379,2225
ENST000010309383,358,386–3,379,2224
ENST000009419463,358,388–3,379,2226
ENST000009858333,358,388–3,379,2225

顯示 12/28 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有註解指出,ZNF195 的產物可能參與轉錄調控。這項描述代表其可能與調節基因轉錄的過程有關,但資料未提供具體調控的基因、作用方向或分子機制,因此不能據此判定它會促進或抑制轉錄。

目前來源也未說明此作用發生的細胞或生物學條件,或其對特定生物過程的影響。因而可確認的功能資訊僅限於可能參與轉錄調控;更細節的功能角色尚無資料支持。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 3379146 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF195 ENST00000399602 GRCh38 chr11:3379046-3380146 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATAAGTCTGCCTCTAGTCTATTTCCTCCATATCTAAATGTTGGAGGTCAAGGCTATGGACAGATCTGAAG
ATGTGTTCTCTCCTCTTAGGGCCCCATTATTGATGGGCAGCAGTCCTCTACCCGTGGATATTTTCTTTTG
CTTTCCCCTATGCTCTCTAGGATCACCATCTCGTCCACCCTTCGACCGGAGGAGAGATGTTTGTAGCAAG
AGGCTGTTCCCTCACCTCTGGCTGAAAAGGGACTTTCAGACCCTCCACTTCCTGACATAAGGGAGGTTAG
ACCTCAGAGCTGCACTTTAGTGTGGCAGCTATTGATCATGTGTGGCTATTGAATAACAGGAATACAGCTG
GTCTGAACTGAAATGTGCTGAAAAGGTAAAATACAGAGTGAGCTTCAAAGATTTAGTACCCCAAAATATA
TACTTCCTTACCAATTGTATATTGACCATAGAGGAAAATGGTTACATACTGGGTTAAATTATTACAATCA
ACTTCACCTGTTTCTTAGTACATTTTAAAACGTGGCTACTAGAAAATTTAAGATTCACACATGGCTTACA
TTTTAATTCTTAGAGGCTTGAATCCTTTTTGAAATTTCAGGCTGTCTGTTCAAAGGACCAAAAGCCAGGA
AGGCCATAAAATATAAAAATTCAAAATGATTGTCTTTATTTTCTTCTTTCCATTGGTGAATAACATATAT
TTATTATTTATAAATAAACATAACCGCAGTCACAAGATGAAATGTAAATATCCTCTAGGTGGGGCCGGAC
AGCGCAGGCAGGAAGCCCCGCTCCAAAAGATCGCGGCCAGCACCTGTCCTTGCTGTCTCATTCGGCCCAT
TGTCTGATTACAGCTCCTGTCACTCAGGGCCTGAGGGGGCGGGGCGTGATGCCCTATCCAATCAGAGGAG
TAGGGGCGGGGACTGTCCAATCAGGCACATGTCTGGAGAGGAGAGGACGGCTTCCGGGATCTAGCGGGGC
CTTTGTCCCGACAGAGCTCCACTTCCTGTCCCCGCGGCTCTGTGTCCCCTGCTAGCCGTAGGTCGTGTGA
CCCGCAGGCACCGGGAGATCCAGAAGTGAAACGCCAGGCTCTCTGGAGGCC
ZNF195 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF195_1 ↗11:3,379,139負股3,379,129–3,379,188

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_BN4S · enhancer · 3378356–3379105 · regulatory

ENSR11_84NFK · promoter · 3379106–3379324 · regulatory

ENSR11_93C7T · enhancer · 3379325–3379765 · regulatory

ENSR11_93C88 · promoter · 3380533–3380976 · regulatory

ENSR11_BN56 · enhancer · 3380977–3381515 · regulatory

ENSR11_5RH4C · CTCF_binding_site · 3383055–3383076 · regulatory

· motif · 3378449–3378457 · motif

· motif · 3378449–3378464 · motif

· motif · 3378519–3378532 · motif

· motif · 3378519–3378532 · motif

· motif · 3378551–3378559 · motif

· motif · 3378898–3378908 · motif

· motif · 3379138–3379147 · motif

· motif · 3379177–3379188 · motif

· motif · 3379179–3379188 · motif

· motif · 3379225–3379235 · motif

· motif · 3379262–3379272 · motif

· motif · 3379264–3379277 · motif

· motif · 3379329–3379338 · motif

· motif · 3379409–3379426 · motif

· motif · 3379418–3379426 · motif

· motif · 3380742–3380755 · motif

· motif · 3383057–3383073 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:629 aa

1 aa629 aa結構域功能區域鋅指
依 O14628 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF195 蛋白質長 629 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 N 端有 KRAB 結構域,另有十個 C2H2-type zinc finger 註解,其中第二個標示為退化型;KRAB 與鋅指區之間包含一段 spacer。

結構域KRAB4–75 aa
鋅指C2H2-type 1244–266 aa
鋅指C2H2-type 2; degenerate272–294 aa
鋅指C2H2-type 3410–432 aa
鋅指C2H2-type 4438–460 aa
鋅指C2H2-type 5466–488 aa
鋅指C2H2-type 6494–516 aa
鋅指C2H2-type 7522–544 aa
鋅指C2H2-type 8550–572 aa
鋅指C2H2-type 9578–600 aa
鋅指C2H2-type 10606–628 aa
功能區域Spacer76–243 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O14628…

AlphaFold · O14628

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF195 的定位資料標示於細胞核;來源未提供定位變動的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF195ZNF195
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF195 的產物可能參與轉錄調控。此註解未指出受調控的基因或轉錄變化方向,也沒有提供作用機制與發生情境,因此只能保留「可能參與」這項概括性描述。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF195 的細胞內定位標示為細胞核;此項資料未進一步說明定位的條件、動態變化或異構型差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000399602 · 3,187 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTTCCTGTCCCCGCGGCTCTGTGTCCCCTGCTAGCCGTA40
41GGTCGTGTGACCCGCAGGCACCGGGAGATCCAGAAGTGAA80
81ACGCCAGGCTCTCTGGAGGCCAGGAGATGACTCTGTTGAC120
121GTTCAGGGATGTGGCCATAGAATTCTCCCTGGAGGAGTGG160
161AAATGCCTGGACCTCGCTCAGCAGAATTTGTACAGGGATG200
201TGATGTTGGAGAACTACAGAAACTTGTTCTCCGTTGGTCT240
241CACTGTCTGTAAGCCAGGCCTGATCACCTGCCTGGAGCAA280
281CGAAAAGAGCCCTGGAATGTGAAGAGACAGGAGGCAGCAG320
321ACGGACATCCAGAGATGGGATTTCACCATGCTACTCAGGC360
361TTGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGATCTGCCTGCCTCA400
401GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGTG440
441CCCAGCCAGGCCTCAATGTTTCTGTGGACAAATTCACTGC480
481ACTGTGCTCACCTGGGGTGCTGCAAACTGTGAAATGGTTT520
521TTAGAGTTCAGATGCATCTTCTCACTAGCTATGTCTTCTC560
561ATTTTACCCAAGACCTTCTGCCAGAGCAGGGCATACAAGA600
601TGCATTCCCAAAAAGAATACTGAGAGGATATGGAAATTGT640
641GGCCTTGATAATTTATATTTAAGGAAAGACTGGGAAAGTT680
681TAGATGAGTGTAAGTTGCAAAAAGATTATAATGGACTTAA720
721CCAATGTTCATCAACTACCCATAGCAAAATCTTTCAATAT760
761AATAAATATGTTAAAATCTTTGATAACTTTTCAAATTTAC800
801ATAGACGTAATATAAGTAATACTGGAGAGAAACCTTTCAA840
841ATGTCAAGAATGTGGCAAATCCTTTCAAATGCTCTCATTC880
881CTAACTGAACATCAGAAAATTCACACTGGAAAAAAATTCC920
921AAAAATGTGGAGAATGTGGCAAAACCTTTATCCAGTGCTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。