基因總覽
ZNF195 的正式名稱為 zinc finger protein 195,屬於蛋白質編碼基因。現有資料將其產物與轉錄調控連結,但未進一步說明其調控對象、作用方式或特定生物學情境。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000399602 ★ | 3,357,927–3,379,146 | 6 |
| ENST00000528796 | 3,339,261–3,379,222 | 4 |
| ENST00001113801 | 3,344,143–3,379,222 | 4 |
| ENST00001113802 | 3,344,273–3,379,222 | 4 |
| ENST00000354599 | 3,357,927–3,379,222 | 4 |
| ENST00001141177 | 3,357,927–3,379,222 | 6 |
| ENST00000343338 | 3,357,928–3,379,222 | 5 |
| ENST00000620374 | 3,357,928–3,379,222 | 7 |
| ENST00000928995 | 3,357,932–3,379,222 | 5 |
| ENST00001030938 | 3,358,386–3,379,222 | 4 |
| ENST00000941946 | 3,358,388–3,379,222 | 6 |
| ENST00000985833 | 3,358,388–3,379,222 | 5 |
顯示 12/28 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有註解指出,ZNF195 的產物可能參與轉錄調控。這項描述代表其可能與調節基因轉錄的過程有關,但資料未提供具體調控的基因、作用方向或分子機制,因此不能據此判定它會促進或抑制轉錄。
目前來源也未說明此作用發生的細胞或生物學條件,或其對特定生物過程的影響。因而可確認的功能資訊僅限於可能參與轉錄調控;更細節的功能角色尚無資料支持。
Promoter 與基因調控
>ZNF195 ENST00000399602 GRCh38 chr11:3379046-3380146 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATAAGTCTGCCTCTAGTCTATTTCCTCCATATCTAAATGTTGGAGGTCAAGGCTATGGACAGATCTGAAG ATGTGTTCTCTCCTCTTAGGGCCCCATTATTGATGGGCAGCAGTCCTCTACCCGTGGATATTTTCTTTTG CTTTCCCCTATGCTCTCTAGGATCACCATCTCGTCCACCCTTCGACCGGAGGAGAGATGTTTGTAGCAAG AGGCTGTTCCCTCACCTCTGGCTGAAAAGGGACTTTCAGACCCTCCACTTCCTGACATAAGGGAGGTTAG ACCTCAGAGCTGCACTTTAGTGTGGCAGCTATTGATCATGTGTGGCTATTGAATAACAGGAATACAGCTG GTCTGAACTGAAATGTGCTGAAAAGGTAAAATACAGAGTGAGCTTCAAAGATTTAGTACCCCAAAATATA TACTTCCTTACCAATTGTATATTGACCATAGAGGAAAATGGTTACATACTGGGTTAAATTATTACAATCA ACTTCACCTGTTTCTTAGTACATTTTAAAACGTGGCTACTAGAAAATTTAAGATTCACACATGGCTTACA TTTTAATTCTTAGAGGCTTGAATCCTTTTTGAAATTTCAGGCTGTCTGTTCAAAGGACCAAAAGCCAGGA AGGCCATAAAATATAAAAATTCAAAATGATTGTCTTTATTTTCTTCTTTCCATTGGTGAATAACATATAT TTATTATTTATAAATAAACATAACCGCAGTCACAAGATGAAATGTAAATATCCTCTAGGTGGGGCCGGAC AGCGCAGGCAGGAAGCCCCGCTCCAAAAGATCGCGGCCAGCACCTGTCCTTGCTGTCTCATTCGGCCCAT TGTCTGATTACAGCTCCTGTCACTCAGGGCCTGAGGGGGCGGGGCGTGATGCCCTATCCAATCAGAGGAG TAGGGGCGGGGACTGTCCAATCAGGCACATGTCTGGAGAGGAGAGGACGGCTTCCGGGATCTAGCGGGGC CTTTGTCCCGACAGAGCTCCACTTCCTGTCCCCGCGGCTCTGTGTCCCCTGCTAGCCGTAGGTCGTGTGA CCCGCAGGCACCGGGAGATCCAGAAGTGAAACGCCAGGCTCTCTGGAGGCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF195_1 ↗ | 11:3,379,139 | 負股 | 3,379,129–3,379,188 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_BN4S · enhancer · 3378356–3379105 · regulatory
ENSR11_84NFK · promoter · 3379106–3379324 · regulatory
ENSR11_93C7T · enhancer · 3379325–3379765 · regulatory
ENSR11_93C88 · promoter · 3380533–3380976 · regulatory
ENSR11_BN56 · enhancer · 3380977–3381515 · regulatory
ENSR11_5RH4C · CTCF_binding_site · 3383055–3383076 · regulatory
· motif · 3378449–3378457 · motif
· motif · 3378449–3378464 · motif
· motif · 3378519–3378532 · motif
· motif · 3378519–3378532 · motif
· motif · 3378551–3378559 · motif
· motif · 3378898–3378908 · motif
· motif · 3379138–3379147 · motif
· motif · 3379177–3379188 · motif
· motif · 3379179–3379188 · motif
· motif · 3379225–3379235 · motif
· motif · 3379262–3379272 · motif
· motif · 3379264–3379277 · motif
· motif · 3379329–3379338 · motif
· motif · 3379409–3379426 · motif
· motif · 3379418–3379426 · motif
· motif · 3380742–3380755 · motif
· motif · 3383057–3383073 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:629 aa
ZNF195 蛋白質長 629 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 N 端有 KRAB 結構域,另有十個 C2H2-type zinc finger 註解,其中第二個標示為退化型;KRAB 與鋅指區之間包含一段 spacer。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF195 的定位資料標示於細胞核;來源未提供定位變動的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ACTTCCTGTCCCCGCGGCTCTGTGTCCCCTGCTAGCCGTA40GGTCGTGTGACCCGCAGGCACCGGGAGATCCAGAAGTGAA80ACGCCAGGCTCTCTGGAGGCCAGGAGATGACTCTGTTGAC120GTTCAGGGATGTGGCCATAGAATTCTCCCTGGAGGAGTGG160AAATGCCTGGACCTCGCTCAGCAGAATTTGTACAGGGATG200TGATGTTGGAGAACTACAGAAACTTGTTCTCCGTTGGTCT240CACTGTCTGTAAGCCAGGCCTGATCACCTGCCTGGAGCAA280CGAAAAGAGCCCTGGAATGTGAAGAGACAGGAGGCAGCAG320ACGGACATCCAGAGATGGGATTTCACCATGCTACTCAGGC360TTGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGATCTGCCTGCCTCA400GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCGTG440CCCAGCCAGGCCTCAATGTTTCTGTGGACAAATTCACTGC480ACTGTGCTCACCTGGGGTGCTGCAAACTGTGAAATGGTTT520TTAGAGTTCAGATGCATCTTCTCACTAGCTATGTCTTCTC560ATTTTACCCAAGACCTTCTGCCAGAGCAGGGCATACAAGA600TGCATTCCCAAAAAGAATACTGAGAGGATATGGAAATTGT640GGCCTTGATAATTTATATTTAAGGAAAGACTGGGAAAGTT680TAGATGAGTGTAAGTTGCAAAAAGATTATAATGGACTTAA720CCAATGTTCATCAACTACCCATAGCAAAATCTTTCAATAT760AATAAATATGTTAAAATCTTTGATAACTTTTCAAATTTAC800ATAGACGTAATATAAGTAATACTGGAGAGAAACCTTTCAA840ATGTCAAGAATGTGGCAAATCCTTTCAAATGCTCTCATTC880CTAACTGAACATCAGAAAATTCACACTGGAAAAAAATTCC920AAAAATGTGGAGAATGTGGCAAAACCTTTATCCAGTGCTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。