演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF19KOX12

zinc finger protein 19

ZNF19 編碼 zinc finger protein 19,屬於 Krüppel C2H2 型鋅指蛋白家族,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens16q22.2UniProt P17023
OFFICIAL SYMBOL
ZNF19
CHROMOSOME
16
UNIPROT
P17023
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF19 是人類的蛋白質編碼基因,其產物 zinc finger protein 19 屬於 Krüppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質長 458 個胺基酸,具有位於 N 端的 KRAB 結構域,以及排列於後段的多個 C2H2 型鋅指區域;其中第十個鋅指被註記為非典型。這些家族與結構特徵提供辨識其蛋白質類型的基本資訊;至於其可能參與的調控作用,則僅有來源所述的概括性描述。

Official symbol
ZNF19
Gene name
zinc finger protein 19
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12981
UniProt
P17023
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KOX12MGC51021

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616q22.2
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegZNF19pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr16:71,464,555–71,565,502
Gene span
100,948 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000288177 ★71,473,583–71,489,3246
ENST0000056722571,464,555–71,482,1604
ENST0000056563771,474,379–71,489,3145
ENST0000056510071,474,384–71,484,6104
ENST0000086631771,474,748–71,484,5795
ENST0000086631871,474,748–71,482,1604
ENST0000094855871,474,749–71,565,5028
ENST0000086631671,474,750–71,565,0858
ENST0000056423071,474,810–71,489,3146
ENST0000056881571,476,194–71,487,1106
ENST0000056146971,477,886–71,478,9992
ENST0000056422571,478,283–71,546,3356

顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

zinc finger protein 19 可能參與轉錄調控。這項描述指出其與基因轉錄調控有關的可能性,但沒有進一步說明調控方向、作用對象或分子機制,因此不能據此判定它會促進或抑制特定基因的表現。

目前提供的功能資訊未交代其作用所需的細胞或實驗條件,也沒有指出參與哪些特定生物學過程、是否透過直接結合 DNA 發揮作用,或是否需要其他分子協助。因而,ZNF19 的功能可概括為可能涉入轉錄調控;更具體的調控方式與生物學意義,則無法由現有資料進一步確定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 71489324 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF19 ENST00000288177 GRCh38 chr16:71489224-71490324 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTGTAATAATTACTAATATCTAGTGAGTGTTTAGTATGTGCTAGACATTGTACTGATTTACATGTACTAA
CATCTAATCCTCACAACAATCCGGGGAATAAATACTATTATTATCCTAGTTTTAGAAATAAATGTGACAC
TTACAGGTTAAGTAATGCACCAAAGGTCACAGAGTGGTCCTTTGGCCTTTGAAACAAAGCATCCTGATGC
CAGGCTGTGCTCCTTACCACTATGTCATACTGTTGTAAAGGAGATGGGACTAAGAAGCTCTAAGTCCCCA
GTTTGTTTTGTAATTCTGTGACAGTGATCACAAACGTTTTGACAGTCCAGCAAAATCCTGGCCAGAGTTC
TCTTTTGTGGACCCAGAAAGCCACAGGCACTAACACTTTAGAGCTATCTCTCTTAGCCCATATGCCCTGC
GCTTTTGGCATTTTCTTTATCATTTAGAGGGGAAGGAGGGCAAGGGTCTGAGGAGCCTTGAATGGTGACT
TGGACTCCAGGGGTAGTGGCAAACCATTGGAGGTTACAGTGCATGGAATTAAAGACAGCTTGAATGGTAT
AATCTGACTGGCTCATTTTACAGAAGACAAAAGCTGCTCAGAGACACAAGGGTCTTCCTCAATGGCCCGT
GAGTGGCAGAGCTTGTGAAAGGAAGTTGATTCACTGCGAGTGAACCAGAACTCAGAAAGACCAGTAAGCA
ACCAGGAAACACCGGCCACCATCTAGGCCTGTGGTGATGGCGGTTTTATCACGAATTCCTTCCTGACAAT
CAACTGCTCCCGGGCAGAAGCGATCGCTTTCTTGACCCACCCAAATGGACAATGACCCAGGCGTGAGGTT
CCTGAGGAGAGAAAAAAGTGTGTACAAGGAAAGGAAGAGGATGTCTCCCAATCGGAAACACCGAGATGCG
GAAAAGTTGCACCGTAGAAAGAGCAGCCGTGCTCATGACGCACTTCTGGCCTCCAAGCGCCCCACAAGCG
TGACGCACTTCCGGCCTCCTAACCGTTCTCGCTAGCGGTGCGCTTCTGGCCTGTTTTGAGTCCGCGCTCA
AAGGTGCCAAAGTGCAAGGACCCACAGTTGGGCGGAGCTTGGGTTGGGAGT
ZNF19 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF19_1 ↗16:71,484,618負股71,484,608–71,484,667
ZNF19_2 ↗16:71,489,324負股71,489,314–71,489,373

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_BJ733 · enhancer · 71483937–71484599 · regulatory

ENSR16_933D49 · promoter · 71484600–71485083 · regulatory

ENSR16_844QCZ · open_chromatin_region · 71494178–71494355 · regulatory

ENSR16_5LS2XW · CTCF_binding_site · 71494244–71494265 · regulatory

· motif · 71484314–71484331 · motif

· motif · 71484566–71484581 · motif

· motif · 71484614–71484625 · motif

· motif · 71484616–71484625 · motif

· motif · 71484700–71484708 · motif

· motif · 71491719–71491725 · motif

· motif · 71492207–71492213 · motif

· motif · 71492235–71492246 · motif

· motif · 71492239–71492253 · motif

· motif · 71492242–71492250 · motif

· motif · 71492694–71492709 · motif

· motif · 71492701–71492723 · motif

· motif · 71492701–71492723 · motif

· motif · 71494246–71494262 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:458 aa

1 aa458 aa結構域鋅指
依 P17023 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 19 長 458 個胺基酸,屬於 Krüppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其第 14–85 位胺基酸區段為 KRAB 結構域;第 161–433 位包含十個 C2H2 型鋅指區域,其中第十個被標示為非典型。

結構域KRAB14–85 aa
鋅指C2H2-type 1161–183 aa
鋅指C2H2-type 2189–211 aa
鋅指C2H2-type 3217–239 aa
鋅指C2H2-type 4245–267 aa
鋅指C2H2-type 5273–295 aa
鋅指C2H2-type 6301–323 aa
鋅指C2H2-type 7329–351 aa
鋅指C2H2-type 8357–379 aa
鋅指C2H2-type 9385–407 aa
鋅指C2H2-type 10; atypical413–433 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P17023…

AlphaFold · P17023

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

zinc finger protein 19 定位於細胞核。 來源未提供定位隨條件改變或異構型差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 26 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KOX12ZNF19AP1M1ATPAF2BCCIPBEX2CARD9CDR2LCIB3CINPCSNK2BCTNNA3FAM72DGFAPHOMER3HTTJPH3LMO1LMO2MAGOHBNDUFAB1NDUFV2NUDT22RFC5SCNM1SPANXN2STX11ZNF417
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 26 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能zinc finger protein 19 可能參與轉錄調控;此描述未指出調控方向、作用對象或具體機制,因此其參與方式仍不確定。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位zinc finger protein 19 位於細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000288177 · 3,206 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AACCGTTCTCGCTAGCGGTGCGCTTCTGGCCTGTTTTGAG40
41TCCGCGCTCAAAGGTCTCTGAGGATCCCCGGGTGGAAACT80
81CCTCCCGGGAGTAAAACCACACAACCACTGAGAAGACCGC120
121TCCGGCATCCTAGAGAGTACGCGTGTGAGCCTGGGTGCAA160
161GGCCAAAGTAGTGACGCACTTCCGTTCACGCACCGCTTTC200
201TGTTTTTCCTGAGCCTTTGCCTGCTAAGAGGGAGACCAGG240
241TCATGGCAGCCATGCCTCTGAAAGCTCAATACCAGGAGAT280
281GGTGACCTTCGAGGATGTGGCTGTGCACTTCACCAAGACA320
321GAATGGACTGGCCTTTCTCCTGCCCAGAGGGCCCTGTACA360
361GAAGTGTGATGTTGGAGAATTTTGGGAACCTGACTGCTTT400
401GGGGTACCCAGTTCCCAAACCTGCACTGATCTCACTTTTG440
441GAGAGAGGGGACATGGCTTGGGGCCTGGAAGCACAGGATG480
481ATCCCCCAGCAGAGAGGACCAAAAACGTCTGTAAAGATGT520
521TGAGACCAACATTGACAGTGAGTCCACATTAATCCAGGGA560
561ATTTCTGAAGAAAGAGATGGGATGATGTCACATGGTCAGC600
601TGAAGAGTGTCCCTCAGAGAACTGACTTCCCAGAAACACG640
641TAATGTGGAAAAGCACCAGGACATCCCCACAGTGAAAAAT680
681ATCCAAGGAAAGGTTCCAAGAATCCCCTGTGCAAGGAAAC720
721CTTTCATATGTGAGGAGTGTGGGAAATCCTTCAGCTACTT760
761TTCTTACTATGCTAGACACCAGAGAATCCACACTGGGGAG800
801AAACCTTTTGAGTGTAGTGAGTGTGGAAAAGCCTTTAATG840
841GTAATTCTTCGTTAATTCGGCACCAGAGGATTCACACTGG880
881AGAGAGACCCTATCAGTGTGAGGAGTGTGGGCGAGCCTTT920
921AATGATAATGCAAATCTGATCAGGCATCAGAGAATCCACA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。