演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF189

zinc finger protein 189

ZNF189 編碼 zinc finger protein 189,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens9q31.1UniProt O75820
OFFICIAL SYMBOL
ZNF189
CHROMOSOME
9
UNIPROT
O75820
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF189 是蛋白質編碼基因,其產物 zinc finger protein 189 屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質長 626 個胺基酸,具有位於 N 端的 KRAB domain,以及多個 C2H2-type zinc finger。這些序列特徵構成其家族辨識特色;現有功能註解僅指出它可能參與轉錄調控,未提供更具體的調控對象或作用機制。

Official symbol
ZNF189
Gene name
zinc finger protein 189
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12980
UniProt
O75820
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99q31.1
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegZNF189pq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr9:101,398,842–101,414,176
Gene span
15,335 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000339664 ★101,398,851–101,410,6543
ENST00000374861101,398,842–101,414,1763
ENST00000615466101,398,842–101,414,1764
ENST00001001192101,398,842–101,414,1763
ENST00001141032101,398,842–101,414,1763
ENST00000259395101,399,028–101,414,1764

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前資料將 zinc finger protein 189 的功能描述為可能參與轉錄調控。這項註解表示其可能與基因轉錄活動的調節有關,但未指出它促進或抑制轉錄,也沒有說明作用於哪些基因或細胞過程。因此,不能據此推定特定調控方向、靶標或分子機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 101398851 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF189 ENST00000339664 GRCh38 chr9:101397851-101398951 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACATGGTGCAGCCGTGCAGCAGAAAAAGCAGTAGATGGGGAGTTAGGAGACATATGTTCTAGATCCAGCT
TTGCAATTAACTTGCTTTGTGACTTTGGGAAAATCACTTCCCTCCTGTGGGCCTGTTTCCTCATATGTTG
GAGTACCTCGAGGATGAGAATGGATTTTGTTTTTCCTGCTGTATCCTAGGCGCTTAGAGTAATGCTGGCC
CTAAGAAATCTGTTGAATGACTGAATGAATGAACAAACAAAAGGAGGAGGCAGTACTTCATTACTGAACC
TTGCTTGTGAAGAAACACAGCCGGCAAATGAGTTTAGTTTACCAAGCGCTTTCATGTGTTTGCAGACAAC
ACACTCGGTGTCTCGCACACGAGGTTAATCCTGCTTGCTTAATAAATAAATGAATGAGTGAAGTGAAAAG
GAAAGGGGGTGGTATTTCCGTTATAAAATGAGAAAACTAAGGCCGAGAGTGGAAGAGACTGGGTCCCACC
ACTCAATGAGTGCTTCTCAACTCGGGACCCTAACCGGACCTCCTTGTCCTTGCTCTGATCAGGCGCGGGA
CCACGATGGCGTAACACTCTATTTTGAATTCGTCCCTAATCCTCCTTAACTTTCCTTGAACATGACCCAC
CGTCCACCATAAAGCTTTACCTGAATCGAGACCAAAATTCTCTACATGGTGTCCCTGAGACTGTCCACAT
GAAGACTCTTCTGGTAATGCCCGACACAGATCGCGCCGCCATCTTCGATGAGATCCACGGGCCTGAGCGC
AGCCTTCAGCCAGCAGTGACGCGCCCAGACCAGCCAATCGGATACAATCCCAGTGGCAAGAGCTTTCTTT
TTCCTGTAGGCTCCCTCGCCCTTTGCACGCTGGGAAATGTAGTCCAGTAGCTGTTGCTGGCGGCGTCTGG
ACCGCGGCGCTCTTTCCGAGCATGACGGGAGTTGTAGTTGAGGGGGCCTCGGGAAGAATCTGGGTGACGC
CTTCTGGTCCGGGGGCGGGCGGTCATAGCGTTACTTGGCTGCAAGGAGGAGGAACTGGCAGCGGGGAGGA
GGCTCTAGCGAGGCCTGAAAGGCTGCGTAACCAGGCAGGAGTAGGGGTTGG
ZNF189 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF189_1 ↗9:101,398,890正股101,398,841–101,398,900

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_BQ5BT · enhancer · 101397609–101398607 · regulatory

ENSR9_93H8MX · promoter · 101398608–101399099 · regulatory

ENSR9_5TSXM2 · CTCF_binding_site · 101398821–101398842 · regulatory

ENSR9_93H8ND · enhancer · 101400185–101400472 · regulatory

· motif · 101394853–101394868 · motif

· motif · 101394853–101394868 · motif

· motif · 101394873–101394887 · motif

· motif · 101398584–101398594 · motif

· motif · 101398625–101398641 · motif

· motif · 101398771–101398787 · motif

· motif · 101398823–101398839 · motif

· motif · 101398948–101398963 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:626 aa

1 aa626 aa結構域鋅指
依 O75820 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 189 長 626 個胺基酸,N 端含 KRAB domain(第 14–89 位)。蛋白質另有 16 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 148–422 位、第 456–590 位,以及第 599–621 位;其中第 423–455 位區段未列出此類特徵。

結構域KRAB14–89 aa
鋅指C2H2-type 1148–170 aa
鋅指C2H2-type 2176–198 aa
鋅指C2H2-type 3204–226 aa
鋅指C2H2-type 4232–254 aa
鋅指C2H2-type 5260–282 aa
鋅指C2H2-type 6288–310 aa
鋅指C2H2-type 7316–338 aa
鋅指C2H2-type 8344–366 aa
鋅指C2H2-type 9372–394 aa
鋅指C2H2-type 10400–422 aa
鋅指C2H2-type 11456–478 aa
鋅指C2H2-type 12484–506 aa
鋅指C2H2-type 13512–534 aa
鋅指C2H2-type 14540–562 aa
鋅指C2H2-type 15568–590 aa
鋅指C2H2-type 16599–621 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O75820…

AlphaFold · O75820

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

zinc finger protein 189 的定位註解為細胞核。 資料未提供條件性定位變化、不同異構型差異或細胞內動態的說明。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF189ZNF189
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能zinc finger protein 189 可能參與轉錄調控;此註解未說明調控方向、作用標的或具體機制,因此不能據此判定其促進或抑制轉錄。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位zinc finger protein 189 定位於細胞核;此註解未提供定位所依據的條件、異構型差異或動態變化。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000339664 · 3,192 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGTCATAGCGTTACTTGGCTGCAAGGAGGAGGAACTGGCA40
41GCGGGGAGGAGGCTCTAGCGAGGCCTGAAAGGCTGCGTAA80
81CCAGGCAGGAGTAGGGGTTGGGGTTCGGGGTTGGGGGACA120
121GCCAGGGATCGCGTCTGATATGCTGTTGGGGTCGTGACCG160
161TCTGGGGGCCGAGGCAGGCACTGGCCAGACCCAGCCAGGG200
201ATCCTCGTATTCGTCGAGCCTAATTTCCAGCAGCCGGGTA240
241GGCCTCACCAGAGGCTCCTTTCCGTGAGGCCGCCCCCAAT280
281TCCTGCCCCTATTCTCTGCCTGGGAGATGGCTTCCCCGAG320
321CCCCCCGCCGGAGTCGAAGGGGTTGCTGACATTTGAGGAT360
361GTGGCTGTGTTTTTTACCCAGGAGGAGTGGGATTATCTGG400
401ACCCAGCTCAGAGAAGCCTGTATAAAGATGTCATGATGGA440
441GAATTATGGAAACCTGGTCTCACTGGATGTTTTGAACAGA480
481GATAAGGATGAGGAGCCAACTGTAAAACAAGAGATTGAAG520
521AAATTGAGGAAGAAGTGGAACCACAGGGTGTAATAGTTAC560
561AAGAATCAAAAGTGAAATTGACCAGGATCCTATGGGTAGA600
601GAAACATTTGAACTTGTTGGTAGGTTAGATAAACAAAGAG640
641GGATCTTCCTATGGGAAATACCAAGGGAATCTTTGACCCA680
681GGAACAGAGAATGTTCAGAGAAAACACTAACATTATCCGT720
721AAAAGACCAAACTCAGAAGAGAAATGCCATAAATGTGAAG760
761AATGTGGAAAGGGTTTTGTCCGCAAGGCCCATTTCATTCA800
801ACATCAAAGGGTCCATACTGGTGAGAAACCTTTTCAGTGC840
841AATGAATGTGGGAAAAGTTTTAGTCGCAGTTCATTTGTTA880
881TTGAACATCAGAGAATTCACACTGGGGAAAGGCCCTATGA920
921GTGTAATTACTGTGGAAAAACCTTTAGTGTGAGCTCAACC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。