基因總覽
ZNF185(zinc finger protein 185 with LIM domain)是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因。其產物 Zinc finger protein 185 長 689 個胺基酸,帶有 LIM zinc-binding 結構域;蛋白質序列另有多段被註解為無序區域。現有資料將它描述為可能參與細胞增殖及/或分化調節,但未提供更具體的分子作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000695776 ★ | 152,898,067–152,973,474 | 25 |
| ENST00000892522 | 152,896,695–152,973,511 | 23 |
| ENST00000892523 | 152,897,929–152,973,511 | 24 |
| ENST00000892524 | 152,897,929–152,973,511 | 23 |
| ENST00000892525 | 152,897,929–152,973,511 | 23 |
| ENST00000892526 | 152,897,929–152,973,511 | 24 |
| ENST00000892527 | 152,897,929–152,973,511 | 24 |
| ENST00000892528 | 152,897,929–152,973,511 | 24 |
| ENST00000892529 | 152,897,929–152,973,511 | 23 |
| ENST00000892530 | 152,897,929–152,973,511 | 23 |
| ENST00000892531 | 152,897,929–152,973,511 | 23 |
| ENST00000892532 | 152,897,929–152,973,511 | 22 |
顯示 12/39 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料指出,ZNF185 可能參與細胞增殖及/或分化的調節。這項描述涵蓋兩類細胞層級的過程,但沒有進一步說明它對增殖或分化的影響方向,也未界定兩者是否都受其調節。因此,ZNF185 的功能應保留為可能參與調節,而不能據此認定其作用已獲確證,或推定它在特定細胞情境中的效果。
現有註解沒有提供 ZNF185 如何影響細胞增殖或分化的機制,也未交代相關分子作用、參與的生物學路徑或實驗條件。其功能意義目前只能概括為可能與這些細胞過程的調節有關;無法從此資料進一步判斷它如何改變細胞行為。
Promoter 與基因調控
>ZNF185 ENST00000695776 GRCh38 chrX:152897067-152898167 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGGCAGGGGGACACCAGCAAGGAGGCTGGTCTTCGGGGCCAGGTCTGGACTAGGGTGGTGGCAGCAGGCA CAGGGAGAAGTGGGTGGACTGGAGGGCCATGGAAACACCACATTGGCAGGCCTTGATGAAGGAGAAGCAG CTGGTCCATTCTTTTGAGCCTACCACCCTGGTAGGCCAACTCCTGGCCAAGTCCATGCCATTTCTTGGGC TGGCTTAATTGTCTCCCTGTTTGGGAGGCCGTGGGGTGAGGGGTCTTTCCTCCATGCTCTCTCCATCCTT AGCCCCAGCCCAGGGCCTTGCACACAATAAAGCACTCGGTGAGCACCAACGCGTGACACAGGTACATCAA ACCGCATTGGCTCTGGGAGTCTGGCTGTATCTCGTCGCCCAGCCTGGGAGATAGCCCCGTTTGCTGTGCC TTGTGAGCCCCGGGTCCGTCCCAGGATGGCCTTCCACGATGAGCGGCTCCCTCACTCTTCTCCTCCTTTC CTGCCTGCAGGACTTCCTGGATGATCTCAGCCGCCAGCCCCCCGCCCCCCTCCCCGCCCCTGTCTGGGAT CTCCATCTGTAAAATGGATCTAGGAACGGTAGTTCTCGACTGAATTAACCCGACAGCATCTGTGGAAGTC GTTGGCCCTGTGCCGGGGCCAGATCGCGCAACTAGGAGCGGGGGCCCTTCACGTGGCGGAGGCTTCCCGG CCTGGGGGCCACGGGCCCGGAGGAATTTGCCTGGAAGTTTTCCATCACGGCAGAGCCTTCTGGAGCTCGC CCCGTGCTCGACAAGGGGAGCCCCAGACTTGATTTCTCCAGCAGCCCCGCGGGGCGGGGCCGAGAAGGGG CGGGCGGGCGGAGGACGCTGGCGGGAGAATGTGCGGAATGTGCCAGGCGCCTCTACCTACCCCAGGAGGG GCAGAGGAAGGGGCCGGCCGAGGGGAGGGGCGAGGGGCGAGGCTCCGGGCGGCCGGAGAAAACCTGTTTG TTCTCCTGCGGGCGGAGCCCAGTCCGCGCCTCCTCGCCTCCCTGCGCGCTCCCCGCTGTGCACCGCGCCC CGCGCCCCGCGCCTGCCTCCCCGGCCCGGCCCGGCCCGGCCGGGCGCCGTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF185_1 ↗ | X:152,898,067 | 正股 | 152,898,018–152,898,077 |
| ZNF185_2 ↗ | X:152,914,406 | 正股 | 152,914,357–152,914,416 |
| ZNF185_3 ↗ | X:152,918,116 | 正股 | 152,918,067–152,918,126 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSRX_86HD3K · enhancer · 152894345–152894522 · regulatory
ENSRX_CK6M7 · enhancer · 152895301–152897019 · regulatory
ENSRX_948NK9 · promoter · 152897577–152898077 · regulatory
ENSRX_948NKD · enhancer · 152898078–152898503 · regulatory
ENSRX_7BZQG5 · enhancer · 152902123–152902239 · regulatory
· motif · 152897939–152897948 · motif
· motif · 152901066–152901077 · motif
· motif · 152901116–152901127 · motif
· motif · 152901120–152901134 · motif
· motif · 152901120–152901134 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:689 aa
Zinc finger protein 185 長 689 個胺基酸,其 C 端第 627–689 位胺基酸區段為 LIM zinc-binding 結構域。另有兩段序列被註解為無序區域,分別位於第 1–253 位及第 298–534 位胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF185 的定位註解包括細胞質、細胞骨架、細胞連接處及黏著斑。 現有資料未指出這些定位是否隨細胞狀態或條件改變。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Cell junction, focal adhesion。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- AARSD1Q9BTE6-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CBX8Q9HC52 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP76Q8TAP6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSF2BPO75031 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO2P25791-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PIH1D2Q8WWB5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRR23BQ6ZRT6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF185 可能參與調節細胞增殖及/或分化;現有敘述未說明其影響方向,也未指出兩種細胞過程是否都受到調節。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | ZNF185 的定位註解涵蓋細胞質、細胞骨架、細胞連接處及黏著斑;資料未描述定位變化的條件。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGTCCGCGCCTCCTCGCCTCCCTGCGCGCTCCCCGCTGTG40CACCGCGCCCCGCGCCCCGCGCCTGCCTCCCCGGCCCGGC80CCGGCCCGGCCGGGCGCCGTCCACCCGAGGGAGCCCGCGC120CCTGCGACTGCCCGACCCTCCACCCGCCCCACGAGCCGGG160CACCGGTGCCAGAAGCCCTGCTGAATCAAGTGAGAGGAGA200GCTGCGGAGCAATCACCATGAGTATCTCAGCTCTTGGAGG240CCGCACCAAAGGGAAGCCTCTGCCACCAGGCGAGGAGGAG280CGCAATAACGTTCTCAAGCAGATGAAAGTGCGAACCACGC320TGAAGGGGGACAAGAGCTGGATTACCAAGCAGGATGAATC360GGAGGGTCGCACCATAGAGCTGCCCTCAGGCCGGAGTCGC400GCCACATCCTTTTCATCAGCTGGGGAGGTTCCGAAGCCTA440GGCCTCCGAGCACAAGGGCTCCCACTGGCTACATCATCCG480GGGAGTGTTCACCAAGCCCATAGACAGCTCTTCCCAGCCC520CAGCAGCAGTTCCCCAAGGCCAACGGGACTCCAAAAAGTG560CTGCCAGTCTGGTGAGAACAGCTAACGCTGGTCCTCCCCG600CCCCTCCTCCTCTGGCTACAAGATGACCACTGAGGATTAC640AAGAAGCTGGCACCCTACAATATCAGGCGCAGCTCTACAT680CAGGGGACACCGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGTGGTGCC720ATTCTCCTCAGATGAACAGAAACGGAGGTCAGAGGCTGCA760AGCGGTGTTCTGAGGAGGACAGCTCCCCGGGAGCACTCCT800ACGTCCTGTCAGCGGCCAAGAAGAGCACTGGCAGTCCTAC840CCAGGAGACACAGGCACCGTTTATCGCGAAGAGGGTGGAG880GTGGTGGAAGAGGACGGGCCTTCTGAGAAGAGCCAGGACC920CACCTGCTCTGGCAAGATCCACTCCTGGCTCAAACAGTGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。