演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF185SCELL

zinc finger protein 185 with LIM domain

ZNF185 是蛋白質編碼基因,產物可能參與調節細胞增殖及/或分化。

Homo sapiensXq28UniProt O15231
OFFICIAL SYMBOL
ZNF185
CHROMOSOME
X
UNIPROT
O15231
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF185(zinc finger protein 185 with LIM domain)是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因。其產物 Zinc finger protein 185 長 689 個胺基酸,帶有 LIM zinc-binding 結構域;蛋白質序列另有多段被註解為無序區域。現有資料將它描述為可能參與細胞增殖及/或分化調節,但未提供更具體的分子作用方式。

Official symbol
ZNF185
Gene name
zinc finger protein 185 with LIM domain
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12976
UniProt
O15231
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SCELL

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXq28
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegZNF185pq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chrX:152,896,695–152,973,511
Gene span
76,817 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000695776 ★152,898,067–152,973,47425
ENST00000892522152,896,695–152,973,51123
ENST00000892523152,897,929–152,973,51124
ENST00000892524152,897,929–152,973,51123
ENST00000892525152,897,929–152,973,51123
ENST00000892526152,897,929–152,973,51124
ENST00000892527152,897,929–152,973,51124
ENST00000892528152,897,929–152,973,51124
ENST00000892529152,897,929–152,973,51123
ENST00000892530152,897,929–152,973,51123
ENST00000892531152,897,929–152,973,51123
ENST00000892532152,897,929–152,973,51122

顯示 12/39 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前資料指出,ZNF185 可能參與細胞增殖及/或分化的調節。這項描述涵蓋兩類細胞層級的過程,但沒有進一步說明它對增殖或分化的影響方向,也未界定兩者是否都受其調節。因此,ZNF185 的功能應保留為可能參與調節,而不能據此認定其作用已獲確證,或推定它在特定細胞情境中的效果。

現有註解沒有提供 ZNF185 如何影響細胞增殖或分化的機制,也未交代相關分子作用、參與的生物學路徑或實驗條件。其功能意義目前只能概括為可能與這些細胞過程的調節有關;無法從此資料進一步判斷它如何改變細胞行為。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 152898067 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF185 ENST00000695776 GRCh38 chrX:152897067-152898167 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGCAGGGGGACACCAGCAAGGAGGCTGGTCTTCGGGGCCAGGTCTGGACTAGGGTGGTGGCAGCAGGCA
CAGGGAGAAGTGGGTGGACTGGAGGGCCATGGAAACACCACATTGGCAGGCCTTGATGAAGGAGAAGCAG
CTGGTCCATTCTTTTGAGCCTACCACCCTGGTAGGCCAACTCCTGGCCAAGTCCATGCCATTTCTTGGGC
TGGCTTAATTGTCTCCCTGTTTGGGAGGCCGTGGGGTGAGGGGTCTTTCCTCCATGCTCTCTCCATCCTT
AGCCCCAGCCCAGGGCCTTGCACACAATAAAGCACTCGGTGAGCACCAACGCGTGACACAGGTACATCAA
ACCGCATTGGCTCTGGGAGTCTGGCTGTATCTCGTCGCCCAGCCTGGGAGATAGCCCCGTTTGCTGTGCC
TTGTGAGCCCCGGGTCCGTCCCAGGATGGCCTTCCACGATGAGCGGCTCCCTCACTCTTCTCCTCCTTTC
CTGCCTGCAGGACTTCCTGGATGATCTCAGCCGCCAGCCCCCCGCCCCCCTCCCCGCCCCTGTCTGGGAT
CTCCATCTGTAAAATGGATCTAGGAACGGTAGTTCTCGACTGAATTAACCCGACAGCATCTGTGGAAGTC
GTTGGCCCTGTGCCGGGGCCAGATCGCGCAACTAGGAGCGGGGGCCCTTCACGTGGCGGAGGCTTCCCGG
CCTGGGGGCCACGGGCCCGGAGGAATTTGCCTGGAAGTTTTCCATCACGGCAGAGCCTTCTGGAGCTCGC
CCCGTGCTCGACAAGGGGAGCCCCAGACTTGATTTCTCCAGCAGCCCCGCGGGGCGGGGCCGAGAAGGGG
CGGGCGGGCGGAGGACGCTGGCGGGAGAATGTGCGGAATGTGCCAGGCGCCTCTACCTACCCCAGGAGGG
GCAGAGGAAGGGGCCGGCCGAGGGGAGGGGCGAGGGGCGAGGCTCCGGGCGGCCGGAGAAAACCTGTTTG
TTCTCCTGCGGGCGGAGCCCAGTCCGCGCCTCCTCGCCTCCCTGCGCGCTCCCCGCTGTGCACCGCGCCC
CGCGCCCCGCGCCTGCCTCCCCGGCCCGGCCCGGCCCGGCCGGGCGCCGTC
ZNF185 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF185_1 ↗X:152,898,067正股152,898,018–152,898,077
ZNF185_2 ↗X:152,914,406正股152,914,357–152,914,416
ZNF185_3 ↗X:152,918,116正股152,918,067–152,918,126

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_86HD3K · enhancer · 152894345–152894522 · regulatory

ENSRX_CK6M7 · enhancer · 152895301–152897019 · regulatory

ENSRX_948NK9 · promoter · 152897577–152898077 · regulatory

ENSRX_948NKD · enhancer · 152898078–152898503 · regulatory

ENSRX_7BZQG5 · enhancer · 152902123–152902239 · regulatory

· motif · 152897939–152897948 · motif

· motif · 152901066–152901077 · motif

· motif · 152901116–152901127 · motif

· motif · 152901120–152901134 · motif

· motif · 152901120–152901134 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:689 aa

1 aa689 aa結構域功能區域
依 O15231 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Zinc finger protein 185 長 689 個胺基酸,其 C 端第 627–689 位胺基酸區段為 LIM zinc-binding 結構域。另有兩段序列被註解為無序區域,分別位於第 1–253 位及第 298–534 位胺基酸。

結構域LIM zinc-binding627–689 aa
功能區域Disordered1–253 aa
功能區域Disordered298–534 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O15231…

AlphaFold · O15231

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton;Cell junction, focal adhesion

ZNF185 的定位註解包括細胞質、細胞骨架、細胞連接處及黏著斑。 現有資料未指出這些定位是否隨細胞狀態或條件改變。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Cell junction, focal adhesion。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 7 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SCELLZNF185AARSD1CBX8CEP76HSF2BPLMO2PIH1D2PRR23B
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF185 可能參與調節細胞增殖及/或分化;現有敘述未說明其影響方向,也未指出兩種細胞過程是否都受到調節。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in the regulation of cellular proliferation and/or differentiation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF185 的定位註解涵蓋細胞質、細胞骨架、細胞連接處及黏著斑;資料未描述定位變化的條件。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton; Cell junction, focal adhesion

PMID 16799630 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000695776 · 4,587 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCCGCGCCTCCTCGCCTCCCTGCGCGCTCCCCGCTGTG40
41CACCGCGCCCCGCGCCCCGCGCCTGCCTCCCCGGCCCGGC80
81CCGGCCCGGCCGGGCGCCGTCCACCCGAGGGAGCCCGCGC120
121CCTGCGACTGCCCGACCCTCCACCCGCCCCACGAGCCGGG160
161CACCGGTGCCAGAAGCCCTGCTGAATCAAGTGAGAGGAGA200
201GCTGCGGAGCAATCACCATGAGTATCTCAGCTCTTGGAGG240
241CCGCACCAAAGGGAAGCCTCTGCCACCAGGCGAGGAGGAG280
281CGCAATAACGTTCTCAAGCAGATGAAAGTGCGAACCACGC320
321TGAAGGGGGACAAGAGCTGGATTACCAAGCAGGATGAATC360
361GGAGGGTCGCACCATAGAGCTGCCCTCAGGCCGGAGTCGC400
401GCCACATCCTTTTCATCAGCTGGGGAGGTTCCGAAGCCTA440
441GGCCTCCGAGCACAAGGGCTCCCACTGGCTACATCATCCG480
481GGGAGTGTTCACCAAGCCCATAGACAGCTCTTCCCAGCCC520
521CAGCAGCAGTTCCCCAAGGCCAACGGGACTCCAAAAAGTG560
561CTGCCAGTCTGGTGAGAACAGCTAACGCTGGTCCTCCCCG600
601CCCCTCCTCCTCTGGCTACAAGATGACCACTGAGGATTAC640
641AAGAAGCTGGCACCCTACAATATCAGGCGCAGCTCTACAT680
681CAGGGGACACCGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGTGGTGCC720
721ATTCTCCTCAGATGAACAGAAACGGAGGTCAGAGGCTGCA760
761AGCGGTGTTCTGAGGAGGACAGCTCCCCGGGAGCACTCCT800
801ACGTCCTGTCAGCGGCCAAGAAGAGCACTGGCAGTCCTAC840
841CCAGGAGACACAGGCACCGTTTATCGCGAAGAGGGTGGAG880
881GTGGTGGAAGAGGACGGGCCTTCTGAGAAGAGCCAGGACC920
921CACCTGCTCTGGCAAGATCCACTCCTGGCTCAAACAGTGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。