基因總覽
ZNF184 是一個蛋白質編碼基因,產物 zinc finger protein 184 歸屬於 Krüppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其蛋白質序列包含 N 端 KRAB 結構域,並在後段排列多個 C2H2 型鋅指區域;另有一段被註記為無序區。這些結構註解構成此蛋白質的基本特徵。現有資料將其可能角色概述為參與轉錄調控,但未提供更具體的靶標或調控方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000683788 ★ | 27,450,747–27,473,105 | 6 |
| ENST00000211936 | 27,449,021–27,473,133 | 6 |
| ENST00000377419 | 27,449,021–27,472,726 | 6 |
| ENST00000881542 | 27,449,021–27,473,141 | 5 |
| ENST00000974029 | 27,449,021–27,473,133 | 6 |
| ENST00001021398 | 27,449,021–27,473,105 | 6 |
| ENST00001141630 | 27,449,021–27,473,105 | 6 |
| ENST00001021396 | 27,450,748–27,473,133 | 6 |
| ENST00000974030 | 27,450,823–27,473,105 | 6 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有功能註解指出,zinc finger protein 184 可能參與轉錄調控。這表示它可能與細胞調整基因轉錄活動的過程有關,但「可能參與」並不等同於已確立其作用,也未說明調控方向或影響範圍。
目前提供的資料沒有指出 ZNF184 作用於哪些基因或 DNA 區域,也未描述它如何影響轉錄、是否需要其他分子協同,或其作用發生於何種細胞與生理條件。因此,不能據此推定特定的轉錄靶標、分子互作或下游生物學效應。
就可支持的功能範圍而言,ZNF184 的主要功能線索僅是可能參與轉錄調控;相關具體機制與生物學意義仍未由此處資料界定。
Promoter 與基因調控
>ZNF184 ENST00000683788 GRCh38 chr6:27473005-27474105 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGACCCCCTCGTCTCTACTAAAAA TACAAAAATTAGCCGGGGATGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA TCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGCGAGCCGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGAGCAACA GAGCTAGATTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTGGTCGCCACTCATTTGAGAGTCGTGA AAACAATTTTAATGGGTAACTACCAGTATTTTCAAAACGACAAAAGAGTAGAACAGAAAATAGAAGGTAG AACATGTAATAAAGGTAACGATTGTTTGCGTTTTAAAACTGTGTGTAGACGTGTATTTCTTTTTTTTCTT TTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTGTTGTTTTGTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGCCGCCCAGGC TGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTGACTGCAACCTCTTCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTC TGCCTCCTGAGTAGCTACAGGCGCGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGG TGTCACCATATTGGCCAGGCTGAGTCTCGAACTCCTGACCTAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAG TGCTCAGATTACAGACGTGAGCCACTGCGCTCGGTCAGTAGACGTGCATTTCTTATAATCAGTTCAGTCA GACAAGTTTACAATGCACACGCATACCTGAAACAGGAGCAAAAGACTGGCGGCGAAAATGTGCGGCCCAT CGCAGGGCGAAAGTACACGTTAGCTAAAGCCTCTGGGAAATGAAGTTCAGGAACACCTTCGCGGAGTGTT CTGGGAACGCTGGTCCAGTGTGCCCGCCCGGCGCCGGCGTGCGGGGCGGGGCTCGCTCGTAACGACCGGA AGTGACCGTTGAAGCCGGTTGTAGGCGTGGAAAGAGGTTGGCGCGCTGGAAGTCCAGTTGCTTCGGCTCC CTGCGTTAGGTCTGGTGGCGGTCAATGCGCTTCCGGACCCGGGATCAGAGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF184_2 ↗ | 6:27,472,410 | 負股 | 27,472,400–27,472,459 |
| ZNF184_1 ↗ | 6:27,473,105 | 負股 | 27,473,095–27,473,154 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_C4PL9 · enhancer · 27471429–27472670 · regulatory
ENSR6_58GGLP · CTCF_binding_site · 27472324–27472345 · regulatory
ENSR6_58GGM8 · CTCF_binding_site · 27472437–27472458 · regulatory
ENSR6_B7G7N · promoter · 27472671–27473258 · regulatory
ENSR6_B7G7Q · enhancer · 27473259–27473958 · regulatory
ENSR6_9DWFP · enhancer · 27474069–27474339 · regulatory
ENSR6_D3CRW · enhancer · 27477956–27480213 · regulatory
· motif · 27468497–27468511 · motif
· motif · 27468504–27468515 · motif
· motif · 27472234–27472247 · motif
· motif · 27472326–27472342 · motif
· motif · 27472439–27472455 · motif
· motif · 27472927–27472940 · motif
· motif · 27472927–27472940 · motif
· motif · 27472979–27472989 · motif
· motif · 27473017–27473028 · motif
· motif · 27473019–27473028 · motif
· motif · 27473023–27473040 · motif
· motif · 27473095–27473105 · motif
· motif · 27473110–27473124 · motif
· motif · 27473122–27473131 · motif
· motif · 27473122–27473133 · motif
· motif · 27473122–27473133 · motif
· motif · 27473144–27473154 · motif
· motif · 27473155–27473166 · motif
· motif · 27473247–27473262 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:751 aa
zinc finger protein 184 長 751 個胺基酸,屬於 Krüppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其 KRAB 結構域位於第 28–99 位;第 191–212 位註記為無序區。蛋白質後段包含 19 個 C2H2 型鋅指區域,依序分布於第 222–748 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 zinc finger protein 184 定位於細胞核;未提供定位變化條件、異構型差異或動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GTAGGCGTGGAAAGAGGTTGGCGCGCTGGAAGTCCAGTTG40CTTCGGCTCCCTGCGTTAGGTCTGGTGGCGGTCAATGCGC80TTCCGGACCCGGGATCAGAGTGTGTGGATCGCTATAGGGG120GAGGGGAGCTCAGGTATCACCATGGCAACAGCCAGCCCTC160CGGACTCGTGACGTCACCCTTCTGATTTCGCGCTTAGAGG200CCTCTGCAGGAGAAAGCTGGGGAGTCCTCGAAGGGGGCGC240ACCTCGCCTCCTTCTGTGCGGGGCGGTCCCGCCCTGATCC280CTTGGAGGGCTTTGTTCTTTTGTTCTGGCCTAAGGGGAAG320TCGGGTGCCGGGCCCCGCCCTGTTTGTCCACCTTCCAGCT360TTAACGCTCTGCAACAGGGTAGACAACCTCAGCGTGTTGC400AGATTCCCTGCAAGGGGAGTTAGACATCTGAGTCCTAGAC440CGAGATACCAGCTGAAGGAACGCTGCCTGGCGAACCCTGG480TGTTCAAGTTCCAGAGGAACGGGATGAGCTCCTGAGATGG520AAGATCTGTCCTCTCCAGACTCCACCCTTCTCCAAGGGGG560ACATAATCTACTCTCATCAGCCAGTTTTCAGGAAGCGGTG600ACTTTCAAGGATGTGATAGTGGACTTTACCCAGGAAGAAT640GGAAACAGCTGGACCCTGGCCAGAGAGATTTGTTCAGGGA680TGTGACATTGGAAAATTATACACACCTGGTCTCTATAGGA720CTCCAAGTTTCTAAACCTGATGTGATTTCCCAGTTAGAGC760AAGGGACAGAGCCATGGATCATGGAGCCAAGCATTCCAGT800AGGTACCTGTGCAGACTGGGAGACAAGACTTGAAAATAGT840GTGTCAGCCCCAGAGCCTGACATTTCTGAAGAAGAGCTAT880CTCCAGAGGTAATAGTGGAAAAACACAAAAGAGATGATTC920TTGGAGTTCCAACTTGCTAGAAAGTTGGGAATATGAAGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。