基因總覽
ZNF182 是一個蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 182,位於 X 染色體 Xp11.23。其蛋白質屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,長 639 個胺基酸。結構上,蛋白質 N 端具有 KRAB domain,後續區域排列多個 C2H2 型 zinc finger;最末端另有一段註解為無序區域。現有功能註解僅指出它可能參與轉錄調控,尚未提供更具體的作用對象或機制,因此不宜據此推定其調控方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000376943 ★ | 47,974,851–48,003,989 | 6 |
| ENST00000396965 | 47,974,851–48,003,978 | 7 |
| ENST00000897864 | 47,974,851–48,004,375 | 5 |
| ENST00000897865 | 47,974,851–48,004,080 | 6 |
| ENST00000934376 | 47,974,851–48,004,080 | 6 |
| ENST00000934377 | 47,974,851–48,004,041 | 6 |
| ENST00000960814 | 47,974,851–48,003,417 | 4 |
| ENST00001133045 | 47,974,851–48,004,041 | 6 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前可用的功能註解指出,ZNF182 可能參與轉錄調控。這項描述屬於可能性陳述,僅支持其與基因轉錄調節相關,並未說明它促進或抑制轉錄,也未指出受調控的基因、細胞條件或具體分子過程。
因此,現有資料足以將轉錄調控列為 ZNF182 的可能功能方向,但不足以界定其分子作用方式、調控結果或生物學情境。不能僅由這項概括性註解進一步推論它直接結合特定 DNA 序列、招募其他因子,或在特定生理過程中發揮作用。
Promoter 與基因調控
>ZNF182 ENST00000376943 GRCh38 chrX:48003889-48004989 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCGTGCTACCAAGCCCGGCTAATT TTTGGTGTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGT GATCCGCCTACCTTGGCGTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGCACGCCACCGTACCCAGCCCAATATAT GTGTATTTTTAACGTTACTATATAATGCTAGATTGCTTCAGACTGGTCTTTACAGATCGGATCCTTCTTA TGGTTTCCCATATGTCCAGAATGAAATATGAGCTCCCTGGCCAAGGAGGCCCTACAGCACCTGGCCCCAG CCTACACCCCCTACACTCCCAACACACTGACACTGTCTACTCATCCAGAAAAAGCAACCTGTTAGCCACC ACTTAATATACCCCTTCACCCCCGGTGTGTGTGTCCCACATCGCCGTTTATTTTTCAGCTTGTTTGTCTG CATACCGACCCACCGTCCTTCAAACGCTACAACGTAAACTCCCAGTCCTGGCCACTGGATGAAGCCAGTG GCTTTTCCCTACCTCCTACTCTTTGTGCACGCAGAGCAATTTAGCCACGCATCCCGCCTTCCCGTTATTT TACACCTGCAACCCTGTTGCTGCCCTCCAAGTTCAAAGTGCGAAATTGCCGCCTGCTAGAATCTTTTCCT TAGTTGGGCACTTCCCCTCCCCGCCCTGCCGTAAGAAAATTGGTGTCTGAAGTCTTAGGAGTGCCTGCCT CTGCATAACTAAGTAAACAACCGCTTTGCGACGCAGCCCCAGCAGCAAAAGGACACGGTGGGCACGGCCA TCTGGCCTGGAGCAGTGACGTCACCGGCAAGGCTACCTTCCCTCTGCGCCTGCGCTGCGGCCCCATGTTG ACTATTGGCGGACGGGGTCTCAAAGGCGCCACTGAGCGTGCGCAGAACCGACCCCTGCAGCCCTTTAGGC TGCGGTGCCAAAGAGTCGGTCCCGAAGCGGAAGTGCTTGTTGGGGCCAGGCTTTGTAACGGTCTCCTGAG CAGCGAGCAGAAAATCTGTTATCGAGAGAGAGTGAGGTTGAGGGGGCAAGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF182_1 ↗ | X:48,003,989 | 負股 | 48,003,979–48,004,038 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSRX_BCJ7Z · enhancer · 48003428–48003967 · regulatory
ENSRX_9P3G4 · promoter · 48003968–48004346 · regulatory
ENSRX_83F4WC · enhancer · 48004347–48004592 · regulatory
· motif · 48003531–48003542 · motif
· motif · 48003617–48003630 · motif
· motif · 48003717–48003730 · motif
· motif · 48003797–48003809 · motif
· motif · 48003800–48003807 · motif
· motif · 48003800–48003815 · motif
· motif · 48003891–48003906 · motif
· motif · 48003975–48003984 · motif
· motif · 48003975–48003986 · motif
· motif · 48003975–48003986 · motif
· motif · 48003975–48003988 · motif
· motif · 48004036–48004047 · motif
· motif · 48004036–48004047 · motif
· motif · 48004067–48004077 · motif
· motif · 48004094–48004105 · motif
· motif · 48004094–48004105 · motif
· motif · 48004124–48004137 · motif
· motif · 48004124–48004137 · motif
· motif · 48004280–48004295 · motif
· motif · 48004313–48004325 · motif
· motif · 48004354–48004369 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:639 aa
ZNF182 蛋白質長 639 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列註解顯示,胺基酸 27–98 為 KRAB domain;胺基酸 206–620 間排列 15 個 C2H2 型 zinc finger,其中第一個標註為退化型。胺基酸 619–639 則註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF182 的細胞內定位註解為細胞核。 現有資料未提供定位隨條件改變的資訊,也未指出異構型之間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CCCGAAGCGGAAGTGCTTGTTGGGGCCAGGCTTTGTAACG40GTCTCCTGAGCAGCGAGCAGAAAATCTGTTATCGAGAGAG80ACACAGTGACCTGCCCCTAAAGGTTCATGCGCATCCCTCA120GACCCCTCTTTAGACGCGCCCCGCTTCTCCCTCTGCCCTC160TCCCCTTGCCCAAGCCCCGAGGTGGGGGCCTGGTGTGAAT200GCTCCGGCCGAAGTGAACCTGCACCCCCGCACCCGAAGGC240CTCTTTCCGGCTTCTGGGCAAGGCGGCCCCGGTGAGCTCG280GCCGTCACACATCTCTGCTTTTTCCCAAGAAGAGCAGGAA320ATGGCCAAACCCCAGGGGCTAGTGACATTTGAAGATGTAG360CTGTGGATTTCACCCAGGAGGAGTGGCAGTACCTGAACCC400ACCACAGAGGACCCTGTACAGAGACGTGATGCTGGAGACC440TACAGCAACTTGGTCTTTGTGGGGCAGCAGGTTACCAAAC480CAAACCTCATCCTCAAGTTGGAGGTAGAAGAATGCCCGGC520AGAAGGAAAAATCCCATTTTGGAACTTTCCAGAAGTCTGT560CAAGTTGATGAACAGATTGAGAGGCAACATCAGGATGACC600AAGATAAATGTCTGCTGATGCAAGTTGGATTTTCTGACAA640GAAAACAATTATCACCAAGAGTGCTCGTGACTGTCATGAG680TTTGGAAACATACTTCATCTGAGTACAAACCTTGTTGCTT720CAATACAAAGACCCGATAAACACGAATCATTTGGAAATAA760TATGGTAGATAATTTAGACTTATTTAGTAGAAGTTCTGCA800GAAAATAAATATGATAATGGATGTGCAAAATTGTTCTTCC840ATACTGAGTATGAGAAAACAAATCCTGGAATGAAGCCCTA880TGGCTATAAAGAGTGTGGGAAAGGTCTTAGGCGAAAGAAA920GGCCTTAGTCTACATCAGAGAATTAAAAATGGAGAGAAAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。