基因總覽
ZNF181 是位於人類第 19 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 181。其產物屬於 Krüppel C2H2 型鋅指蛋白家族,長度為 571 個胺基酸。蛋白質具有位於 N 端的 KRAB 結構域,並在後段排列 11 個 C2H2 型鋅指區域,構成其主要結構特色。現有功能註解指出,ZNF181 可能參與轉錄調控;此描述保留其推測性,未進一步界定具體調控對象或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000492450 ★ | 34,734,243–34,745,378 | 4 |
| ENST00000599244 | 34,734,155–34,739,620 | 4 |
| ENST00000392232 | 34,734,156–34,742,872 | 6 |
| ENST00000459757 | 34,734,174–34,742,186 | 4 |
| ENST00000903975 | 34,734,174–34,742,872 | 4 |
| ENST00000903976 | 34,734,174–34,742,872 | 4 |
| ENST00000951028 | 34,734,174–34,745,386 | 5 |
| ENST00001130370 | 34,734,174–34,750,437 | 5 |
| ENST00001141233 | 34,734,174–34,745,378 | 4 |
| ENST00000595708 | 34,734,246–34,740,818 | 5 |
| ENST00000593781 | 34,734,263–34,740,725 | 5 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF181 的功能註解指出,它可能參與轉錄調控。這項描述表示其產物可能與基因轉錄活動的調節有關,但目前提供的資料沒有說明調控的標的基因、作用方向或發生條件,因此不能據此判定它會促進或抑制特定基因的轉錄。
來源亦未提供 ZNF181 如何介入轉錄調控的分子細節,例如是否直接作用於 DNA、涉及哪些調控步驟,或是否需要其他分子共同參與。KRAB 結構域與多個 C2H2 型鋅指區域是其蛋白質結構註解的一部分,但單憑這些結構資訊,無法補足該功能描述未涵蓋的作用機制。因而,現有證據支持的功能範圍仍限於「可能參與轉錄調控」這一概括性說法。
在生物學意義上,轉錄調控涉及基因表現活動的控制;不過,現有資料沒有指出 ZNF181 在何種細胞或生物學過程中發揮作用,也沒有提供特定實驗系統或功能結果。解讀其功能時,應保留「可能」所代表的不確定性,不將其擴寫為已確認的調控角色或特定生理作用。
Promoter 與基因調控
>ZNF181 ENST00000492450 GRCh38 chr19:34733243-34734343 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCCCGCAGGGCCCCCACTCCAGGCCTCCCCCATCTCTCCCTGTCTCTCTCAGAGGTAGAGGCAGCATTAA ATTAAAATTTAATTAAAATATTAAAAATAAAGTAAAAAATTCAAATATACAACAGTAGACTGTCTGGCTT GCATACAAAGAAGGCCATTGCCCCTTTGGGTGAGCCGGGCAAGGTCAGGGTCTAAGAAGCGCCTCTGGTG AGAAGCGGTTGTCAGGCTCTGATGGCTGCGGGAGGAGTGACTCCTCCCAGGATGAGGGTCTGTGTCCTCT CAGTGCTCACTCAAGTTCCGTATTTCCAAGTCCTTCCAGGGGGCGTAACGCACGTGAGAACTGCCATTTC TGTCACAGATACGTGGCCGCATGCATTTCCAGGAAATGTCCTTGGTTCGCGAACTACAGCTGGCACAATC CAGCCCAGGGCGTTCTGTGAGCTGTAGTCTCCAGCAAGTGAATTCCAAAAAAACCTCAAAGACCTCAAAG ACCATACAGGGTGGACAGCGTAGTAGCAGGGTTTGGGAAGAGAGGAGCTCTTTTGCTAGCAAAGGCGAGA GCTCGCCTGGTACAAGGTCTGCCCACGTCCCGGGAGATAAACATTAGTGTGAGCGCACGCTAGACCCAGA AGAGTTTGCCACGGCCGCACGGTTTTCTGGGAAGTGTAGTTTCTTGGTCCCGGCGCCATTGTCCTTAAAA GTAGAGGGTGGCCCTTGGTTCCGAGGTGTATCTTTCACCTCATCAGTATGACTATATGCCCCAGGACACT TCCCGCATGGTCCTAACTGCCGGGCTCTGGGACGACAGCCCCAGGCGGTTTAGTTTTTTAGGAAACCGAG ATCTGTTTGCCCGCGGCGCCCCAGGTCCGCGCGGCCGCAGAGACTCCTGGGAAGTGTGGTCTTCCGGTAC CTGCGGTTCGTTGCGCCTGGAATTTTGTCCCCTGCGCGGATGATTCTGGGAAATGTCGATCGGCTGTGGG CGGCGCACTGGGTCCGCCCCGCTGTAGCCTCAGGCCTGACGGCGACTCCCAGGCTCCGGGACGATTCTGG GCAGTGTCGTCCCCAGAGGTCGGCGGCCGTTGCCCGCTCACCAGCGACGCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF181_1 ↗ | 19:34,734,246 | 正股 | 34,734,197–34,734,256 |
| ZNF181_2 ↗ | 19:34,734,584 | 正股 | 34,734,535–34,734,594 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_9HR83 · enhancer · 34732812–34733146 · regulatory
ENSR19_B8W56 · promoter · 34733666–34734253 · regulatory
ENSR19_9HR8G · enhancer · 34734254–34734536 · regulatory
ENSR19_6649X4 · promoter · 34734537–34734585 · regulatory
ENSR19_B8W5B · enhancer · 34734586–34735178 · regulatory
· motif · 34729698–34729709 · motif
· motif · 34732731–34732744 · motif
· motif · 34732731–34732744 · motif
· motif · 34733535–34733546 · motif
· motif · 34733619–34733630 · motif
· motif · 34733713–34733730 · motif
· motif · 34733722–34733739 · motif
· motif · 34733810–34733825 · motif
· motif · 34733848–34733863 · motif
· motif · 34733848–34733863 · motif
· motif · 34734144–34734161 · motif
· motif · 34734332–34734348 · motif
· motif · 34734441–34734448 · motif
· motif · 34734512–34734527 · motif
· motif · 34734582–34734595 · motif
· motif · 34734582–34734595 · motif
· motif · 34734611–34734620 · motif
· motif · 34734688–34734703 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:571 aa
ZNF181 蛋白質長 571 個胺基酸。其 N 端第 4–76 位具有 KRAB 結構域;第 237–539 位依序排列 11 個 C2H2 型鋅指區域,各區段長 23 個胺基酸。這些是序列特徵註解;來源將該蛋白質歸入 Krüppel C2H2 型鋅指蛋白家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF181 蛋白質的定位註解為細胞核。 現有資料未提供定位隨條件變化的資訊,也未區分異構型的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCTGTAGCCTCAGGCCTGACGGCGACTCCCAGGCTCCGGG40ACGATTCTGGGCAGTGTCGTCCCCAGAGGTCGGCGGCCGT80TGCCCGCTCACCAGCGACGCGGGGCGCCTGCGGGGACGGT120GAGGCCCTGCTGAGGACTCCGGCCAGTATGAGTCCCGGGG160GCGGCGGCGGGGCTCAGGCCCTGGGTCTGCCCCGCGGTGT200GACCCCGGCCGGTGCCTTGGTTTTCCTGGCCTTCATGTCC240TCCTATGTAAACGCGGGGTGATGACGGCGCCGACCTCTTG280GCGCTGTTGTGAGAGTGAAGTGGGCGCGTGGTTAGACGCC320AGCCACAGTTGTCTTTGGGTTATGTCGTCATGAAGCCGGC360GCTCTACAGTTGTGTAACCTTGAACAAATGGGTTCAGTAT400CTTGGAATTTCAGTTTTGTCATCGTTTAAAAAATAGATCT440GGAAAAATGTGAACGCACACCGTGCATAGTGGTGAAGACT480GAACGAGCTGATAAAGTTTTTACCATTGTTTTATGAGGAT520TTTATTTACAGAGTAATTGATTTTCCTCGCAGGTGGCACC560TGGTAAATGGTTAGCCCTTGCGGAGAAACACCCTGTTAGT600TCCCAGGGAGAGATTGGCGCCCTGGAGAGTGATTACCAGT640GTGCCTTTCCATTATGGTGTGTCACAGGTGCCGCAAGATA680AGCCTGATTTTTCATGACTGCTTTTTCCTGCCCTTCTGTG720CCCTCAGGACACTGCCCATCTCTAAGATAAGAGCCTGGAA760AGAGGACTCTGTTGGCTGTTGGAAATTGCAGAGTAATGCC800TCAGGTGACATTTAATGATGTGGCTATAGACTTCACTCAT840GAAGAGTGGGGATGGCTCAGTTCTGCTCAGAGGGACTTAT880ACAAGGATGTGATGGTCCAGAATTATGAGAACCTGGTCTC920TGTAGCAGGTCTTTCTGTAACTAAGCCATATGTGATCACG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。