演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF175OTK18

zinc finger protein 175

ZNF175(zinc finger protein 175)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 的蛋白質;來源指出它可調節數種趨化因子受體的表現,並抑制 HIV-1 的 Tat 誘導病毒 LTR promoter 活性。

Homo sapiens19q13.41UniProt Q9Y473
OFFICIAL SYMBOL
ZNF175
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9Y473
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF175(zinc finger protein 175)是蛋白質編碼基因,位於人類第 19 號染色體。其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,具有 KRAB domain,並含多個 C2H2-type zinc finger,其中部分被註記為 atypical。蛋白質全長 711 個胺基酸;來源另標示其具有 disordered 區域及 nuclear localization signal。這些特徵界定了 ZNF175 的蛋白質家族歸屬與基本結構。

Official symbol
ZNF175
Gene name
zinc finger protein 175
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12964
UniProt
Q9Y473
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
OTK18

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.41
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF175pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:51,571,250–51,592,510
Gene span
21,261 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000262259 ★51,571,283–51,592,5105
ENST0000054521751,571,250–51,574,2102
ENST0000059650451,571,250–51,581,5463
ENST0000091277151,571,250–51,589,7355
ENST0000095825351,571,250–51,589,7225
ENST0000095825451,571,250–51,589,7225
ENST0000110520451,571,250–51,589,7385
ENST0000114233551,571,250–51,592,5105
ENST0000043651151,573,173–51,589,7384

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF175 的來源功能註記涵蓋趨化因子受體表現調節,以及對 HIV-1 複製的干擾。就受體調節而言,ZNF175 會下調數種趨化因子受體的表現;來源未列出受體名稱,也未說明此調節發生的細胞或分子機制,因此不能據此推定特定受體或下游作用。

在 HIV-1 相關作用中,ZNF175 透過抑制 Tat 誘導的病毒 LTR promoter 活性,干擾病毒複製。這項描述指出其作用與病毒啟動子活性受抑有關,並將結果連結至 HIV-1 複製受到干擾;來源沒有進一步提供實驗系統、作用步驟或其他可能機制,故不宜延伸解讀。

兩項功能註記分別涉及趨化因子受體表現與 HIV-1 病毒轉錄調控。現有資料支持的具體內容限於前者下調數種受體表現,以及後者抑制 Tat 誘導的病毒 LTR promoter 活性並干擾複製;未提供兩者之間的關聯,也未說明這些作用是否依賴相同的分子機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 51571283 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF175 ENST00000262259 GRCh38 chr19:51570283-51571383 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTATTATTCAAATGGACTAAAAATGAGGTATGAAGTAATTAAAAGTAATATGGTGGCTTTAAGTGCAGA
GATGGGGTGGCAGAAGCTGTGAACACAGAATGTAAAATCGGTAACTACAAAATGGCACAAACTACGAAAG
CAATATATTTAAATTACTATTTTTTAAAAAAGAAGGATCATTTCAGATCTTCACCTTCAGATCCTCACTC
AGCCCTGCCTCCTATTTCCCATAATCAGCCATTTTTTTAATTTTATGATTGCTATTACTCACCTTCTAGA
ATATATTTTTGTTTATTTGATTGAACAACCTCTTCCTGAAAATTCTGCCCAGTTGGGCTGGCTGACATTG
ATCTCAGTAATTGTGTTTTTTTCCTTTAACTTGATTATATTTTTTTCATTCGCCTCTCTTTAAATGAAGT
GTCCCAAGAGCCCTAAATTCTCTCTTCAGGTGGTCGCTTGGTAGGTTACTTCATCAATAGGTTCATCCAG
GTATAGAGAGCAATGGTGTAAGGATAACAAAGATACAATTTCTCAGAAAGATAACATTTTCAAAAGTGCT
ATTAAAGACAGTGAGTTGTTCAGCAATTCAGGAAAAAAAAGTCTTTAAATCAGAGGGAAAAATATAGAGA
AAAAGTATTTTTCAGAATACATGTCAGTTTCTCCTAGAAATATATATACACAAGTATTGAATAGGTCCCC
TGCCAATGTAGGACCCAAGACTTTTACTCTGTGACATTCCATTTGTCCTTGGCTGTACGGAATAAAAGCC
CTTTGACGATGGCGGCCTCCAATATCATAATCCGTATGGGTGCGGCCATGCCGTCCTCCCTACCAAGTTT
CTGAAGTTGAATGAACCGCGGAATAAAGGTACGCCGTTATACGCCATGATAACTGTTGGCGGAGCGTAGC
TTCAAAAGTGTTAGTGGGCATGCGCGCGGTTCAACAGCGCCTACGGAAATCCTAACGGGAATGTAACCCA
AACCGGAAGTGGCCTAGAGCGACCATTTAGCTTCTGTTGTTAAGTGGATCTAAGCCTATGTCGCTTACTG
GACGCTGAAGTGATTGGGAATATTAGCAGTGGGGGTTCTGTAGGGTCAGGA
ZNF175 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF175_1 ↗19:51,571,287正股51,571,238–51,571,297
ZNF175_2 ↗19:51,571,433正股51,571,384–51,571,443

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_83HX8Z · enhancer · 51566837–51567076 · regulatory

ENSR19_9QGN6 · enhancer · 51570798–51571185 · regulatory

ENSR19_83HXCG · promoter · 51571186–51571314 · regulatory

ENSR19_BD8C6 · enhancer · 51571315–51572055 · regulatory

ENSR19_9QGNK · enhancer · 51572240–51572689 · regulatory

ENSR19_9QGNR · promoter · 51572928–51573338 · regulatory

· motif · 51571059–51571069 · motif

· motif · 51571207–51571218 · motif

· motif · 51571207–51571218 · motif

· motif · 51571262–51571273 · motif

· motif · 51571262–51571273 · motif

· motif · 51571264–51571273 · motif

· motif · 51572940–51572962 · motif

· motif · 51572940–51572962 · motif

來源將 HIV-1 感染列為與 ZNF175 相關的調控條件,但未說明感染如何影響其表現,也未提供調控方向或作用機制。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:711 aa

1 aa711 aa結構域功能區域基序鋅指
依 Q9Y473 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF175 蛋白質長 711 個胺基酸,N 端含 KRAB domain,並有 15 個 C2H2-type zinc finger;其中前兩個被標示為 atypical。來源另註記第 1–21 位胺基酸為 disordered 區域,並在第 359–362 位標示 nuclear localization signal。其家族歸屬為 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。

結構域KRAB27–98 aa
鋅指C2H2-type 1; atypical279–301 aa
鋅指C2H2-type 2; atypical307–329 aa
鋅指C2H2-type 3335–357 aa
鋅指C2H2-type 4363–385 aa
鋅指C2H2-type 5391–413 aa
鋅指C2H2-type 6419–441 aa
鋅指C2H2-type 7447–469 aa
鋅指C2H2-type 8475–497 aa
鋅指C2H2-type 9503–525 aa
鋅指C2H2-type 10531–553 aa
鋅指C2H2-type 11559–581 aa
鋅指C2H2-type 12587–609 aa
鋅指C2H2-type 13615–637 aa
鋅指C2H2-type 14643–665 aa
鋅指C2H2-type 15671–693 aa
功能區域Disordered1–21 aa
基序Nuclear localization signal359–362 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9Y473…

AlphaFold · Q9Y473

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus

來源將 ZNF175 的定位列為細胞質與細胞核,未提供不同條件下定位改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 6 個夥伴 · 最多顯示 50 個
OTK18ZNF175ALAS1KRTAP10-7PSTPIP1ZNF250ZNF264ZNF264
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF175 會下調數種趨化因子受體的表現;此外,它可藉由抑制 Tat 誘導的 HIV-1 病毒 LTR promoter 活性,干擾 HIV-1 複製。資料未列明受體種類或更詳細的作用機制。含實驗來源
證據與來源

Down-regulates the expression of several chemokine receptors. Interferes with HIV-1 replication by suppressing Tat-induced viral LTR promoter activity

PMID 14688346 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF175 的細胞內定位包括細胞質與細胞核;來源未進一步說明定位所依賴的條件或動態變化。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

調控HIV-1 感染被列為與 ZNF175 調控相關的條件;資料未指出其對 ZNF175 的影響方向或具體調控方式。資料庫紀錄
證據與來源

By HIV-1 infection

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000262259 · 6,552 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GACCATTTAGCTTCTGTTGTTAAGTGGATCTAAGCCTATG40
41TCGCTTACTGGACGCTGAAGTGATTGGGAATATTAGCAGT80
81GGGGGTTCTGTAGGGTCAGGAAGGGGCGGCTGGCTTTGGG120
121GGAGTGATGAGGGGCTTGTTGGGGGTGGGGGTGCGTGATA160
161AAGGGATTTCTCGGCTGAAGACGAGGCTGTGAGGCTTCTG200
201CAGAACCCCCAGGTCAGGCCACATCATTGAGGCTGCAGGA240
241TCTCTCTTCATAGCCCAGTACGACTCTCCGCCGTGTCCCT280
281GGTTGGAAAATCCAAACACCTATCCAGCTTCTGGCTCCTG320
321GGAAAAGTGGAGTTGTCAGCAAGAGAGACCGAGAGTAGAA360
361GCCCAGAGTGGAGATGCCTGCTGATGTGAATTTATCCCAG400
401AAGCCTCAGGTCCTGGGTCCAGAGAAGCAGGATGGATCTT440
441GCGAGGCATCAGTGTCATTTGAGGACGTGACCGTGGACTT480
481CAGCAGGGAGGAGTGGCAGCAACTGGACCCTGCCCAGAGA520
521TGCCTGTACCGGGATGTGATGCTGGAGCTCTATAGCCATC560
561TCTTCGCAGTGGGGTATCACATTCCCAACCCAGAGGTCAT600
601CTTCAGAATGCTAAAAGAAAAGGAGCCGCGTGTGGAGGAG640
641GCTGAAGTCTCACATCAGAGGTGTCAAGAAAGGGAGTTTG680
681GGCTTGAAATCCCACAAAAGGAGATTTCTAAGAAAGCTTC720
721ATTTCAAAAGGATATGGTAGGTGAGTTCACAAGAGATGGT760
761TCATGGTGTTCCATTTTAGAAGAACTGAGGCTGGATGCTG800
801ACCGCACAAAGAAAGATGAGCAAAATCAAATTCAACCCAT840
841GAGTCACAGTGCTTTCTTCAACAAGAAAACATTGAACACA880
881GAAAGCAATTGTGAATATAAGGACCCTGGGAAAATGATTC920
921GCACGAGGCCCCACCTTGCTTCTTCACAGAAACAACCTCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。