演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF174ZSCAN8

zinc finger protein 174

ZNF174(zinc finger protein 174)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 的蛋白質,來源將其註解為轉錄抑制因子。

Homo sapiens16p13.3UniProt Q15697
OFFICIAL SYMBOL
ZNF174
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q15697
PDB / ALPHAFOLD
1Y7Q
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF174 的正式名稱為 zinc finger protein 174,屬於蛋白質編碼基因;其蛋白質屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。來源將它註解為轉錄抑制因子。蛋白質序列包含 SCAN box 與三個 C2H2 型 zinc finger,並有兩段被註解為無序的區域。現有資料未提供更詳細的轉錄調控機制或目標資訊。

Official symbol
ZNF174
Gene name
zinc finger protein 174
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12963
UniProt
Q15697
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZSCAN8

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegZNF174pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:3,401,194–3,409,478
Gene span
8,285 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000268655 ★3,401,215–3,409,3643
ENST000003448233,401,204–3,405,0793
ENST000005725443,401,204–3,404,9942
ENST000009593443,401,204–3,409,4783
ENST000011175003,401,204–3,409,4782
ENST000011229953,401,204–3,406,0383
ENST000011344533,401,204–3,409,4783
ENST000005757523,401,235–3,405,0434
ENST000005719363,401,235–3,409,4784

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF174 被註解為轉錄抑制因子,表示其功能與抑制轉錄有關。現有來源未說明它作用的基因或轉錄靶標,也未提供抑制作用的分子機制、發生條件或相關生物學過程,因此無法據此進一步描述其調控範圍或功能後果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 3401215 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF174 ENST00000268655 GRCh38 chr16:3400215-3401315 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGAGATAGAGAAATCAAGGGCATTATTATTGTTAGCACTGCTTTCTAGCCAAAAAGAAACTGAGAGCGAT
GAAGTATCTTGCCTAAAGCATCACACAGCACAGCTCCTAGGCAGCAAGGCCAGGACTAGAACCAGCACCC
CTTGCCTTCATTATGTTCATCCTGTGCCTTACCTGGCTGAAGAAGAATTTAATAAAAGCTCTTCTAACTT
CATGCAGAAGGCGGAACCTGCACCCTTCTTGACCCCTTTTGACCCCTTACCTCCCACTCATCGTTAAATT
TTAAAATGCTGTTCTCTGAAAATTTTACTTCACTCTAGCGATGGCCCAAACACTCGGAAAAAAATGTAGC
ATGAGGATGGGGAGCCAGGTTGATAGGTTTTTCACTTAGTTAACTATTTATTGAGTACTCAGAACGCACT
CGGTGCCAGGGCTAGGCACTGTGGATGAGTAGGGAGTGGGCGAGACAGGGACGAGATGAGCAGGGTCAAG
GCCAGGGGGTCCCGGGGCGCCGGCGCTCAGGCTCGGGGTGATCCGCACGGTGGGAGCGGGGCACGGTGAT
CGCGGCGCGTCTGGGGACGCCCGGCCTGAGGGAGGCTGCCTGTCCCAAGGAGACGCCCATCGGGGCCGGA
CCCGAACGCCTCGGAGAAGACTCCCAGCGGGGAGGGGCTCCTCGGCCGTCGCAGGGCCCAGCGGCTAATC
CCGCCGGCCGCAAGGAAGCGGAGAACTCACCGGACACCAGCACTCGCGACTCCACAAACTCCCTCAGCCT
CCGGGCCGGAAGTCAGCGGCGCGATTCGCTCCGCCCATTACGCACGCCCCTGCGCAGGCCCGCAAGCCGA
ATTGCCGGACTGCAGCTCCCGGGATGCACTGCGACGGTATTGACAGGCGCAGCAACCAATAGACGGTAGA
GAATGCCCTTGGCAGGAGGCGGGCCCTGTCAGTAGTTGTCCTCAGCAGCTAGTGGGCGTCTCCGCAGCGA
GTGGCATCGGCCCCGCCCCCAGCCCGTGCTCGCCGGTGTCGGGTCCTAAGTCCCTCGGTCTTGGGTTCCC
GGAGAGGTGAGTCGGCTGCAGGTGGGTGCGGGGCGCCGGGCTGTTCGGGGT
ZNF174 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF174_1 ↗16:3,401,251正股3,401,202–3,401,261

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_BN7Z · enhancer · 3400250–3400978 · regulatory

ENSR16_93CG5 · promoter · 3400979–3401254 · regulatory

ENSR16_5RL77 · CTCF_binding_site · 3401166–3401187 · regulatory

ENSR16_93CGB · promoter · 3401484–3401984 · regulatory

· motif · 3400450–3400462 · motif

· motif · 3400453–3400460 · motif

· motif · 3400455–3400470 · motif

· motif · 3400460–3400472 · motif

· motif · 3400463–3400470 · motif

· motif · 3400463–3400478 · motif

· motif · 3400464–3400477 · motif

· motif · 3400696–3400703 · motif

· motif · 3400989–3400998 · motif

· motif · 3401023–3401034 · motif

· motif · 3401025–3401035 · motif

· motif · 3401035–3401046 · motif

· motif · 3401035–3401046 · motif

· motif · 3401041–3401056 · motif

· motif · 3401168–3401184 · motif

· motif · 3401204–3401214 · motif

· motif · 3401235–3401250 · motif

· motif · 3401281–3401290 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:407 aa

1 aa407 aa結構域功能區域鋅指
依 Q15697 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF174 蛋白質長 407 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其序列含有位於第 59–124 個胺基酸的 SCAN box,以及三個 C2H2 型 zinc finger,分別位於第 326–348、354–376 與 382–405 個胺基酸。第 1–20 與 150–270 個胺基酸區段被註解為無序區域。

結構域SCAN box59–124 aa
鋅指C2H2-type 1326–348 aa
鋅指C2H2-type 2354–376 aa
鋅指C2H2-type 3382–405 aa
功能區域Disordered1–20 aa
功能區域Disordered150–270 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1Y7Q…

PDB · 1Y7Q

NMR · - · A/B=37-132

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF174 被註解定位於細胞核。 來源未提供定位變化的條件、不同異構型的差異或定位動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZSCAN8ZNF174ZSCAN32SCAND1ZNF24ZSCAN18ZSCAN22
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

來源將 ZNF174 註解為同源二聚體,表示其可形成由相同蛋白質組成的二聚體;資料未提供其他互作夥伴或複合體資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF174 被註解為轉錄抑制因子,表示其功能與抑制轉錄有關;來源未提供其作用靶標、分子機制或發生條件,因此不進一步推定其調控的基因或生物學過程。含實驗來源
證據與來源

Transcriptional repressor

PMID 7673192 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Homodimer含實驗來源
證據與來源

Homodimer

PMID 15629724 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF174 的定位註解為細胞核。來源沒有說明這項定位是否會隨條件改變,也未提供異構型差異或定位動態,因此不延伸推論其在其他情境中的分布。資料庫紀錄
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000268655 · 2,459 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCCCGTGCTCGCCGGTGTCGGGTCCTAAGTCCCTCGGTC40
41TTGGGTTCCCGGAGAGGTGAGTCGGCTGCAGGTGGGTGCG80
81GGGCGCCGGGCTGTTCGGGGTACCGGTGTCGCAGTCGCCA120
121GTCCGAGCTCACACCGGGCGTGGAGTTCAGCTGCGCATCG160
161GGTTGCGGCAGCTTCGCCAGGCCTGGGGCTGGCTGGGCCG200
201CGGGGCCGCCCTGGAGGCCGGAGCCACTGGGCCTGCGGCG240
241CCTCGGCAGCGAGCAGCCGCTTTGCTCGCGTGCAGGAGGC280
281TGTTCGCTACCTCACACCCCCGGCTGGCGCTGTGGCCTCG320
321CTTAGCTCTACCGTTTAGCACCCGGCGACATGCACCCGGT360
361CGGTTTCCGCCAGGATGCGGGAGAGTTGGGGCAAGCTACC400
401TGCGACAGCTTGAACTTTTCCTAGGGATTCCGCTCCACCC440
441GCCGGTTAGAGCGTATTGCTCATTAAATCCGAGACCTGTG480
481TGCTTGCTACTGAAATAAAAGAAGTATTTTTTCCCCAGAG520
521TCCTTTTAGGACGTTATGACTTTTCTCCTTTGCAAGACTG560
561CAAAAAACTGACAAGAAGACAAAACTCTTCCCACTCCCAG600
601GGACCGCGTTGTCTTGAGTTTGGCTAGTAAAGGCTAGCAA640
641GTGAGGCTTTGTCTCTGCATCCCGTTCCCCCTAACATCCT680
681CAGAGAACCTTCGTTTCTAGAATCTTTCTAGTATTCAGAG720
721ACTTCTCCAGGGTCATGATCCCAAAGGCTTAACCCGTTTA760
761CAAGGAGAGAGTTGTCTCCTGACGCCCAAAATGGCAGCTA800
801AAATGGAGATAACTTTAAGCTCCAACACTGAAGCTTCCTC840
841CAAGCAAGAGAGACACATAATAGCCAAACTAGAAGAGAAA880
881CGGGGCCCTCCTCTGCAAAAAAACTGCCCAGATCCTGAGC920
921TCTGCCGCCAGAGCTTCAGACGCTTTTGTTATCAAGAGGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。