基因總覽
ZNF174 的正式名稱為 zinc finger protein 174,屬於蛋白質編碼基因;其蛋白質屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。來源將它註解為轉錄抑制因子。蛋白質序列包含 SCAN box 與三個 C2H2 型 zinc finger,並有兩段被註解為無序的區域。現有資料未提供更詳細的轉錄調控機制或目標資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000268655 ★ | 3,401,215–3,409,364 | 3 |
| ENST00000344823 | 3,401,204–3,405,079 | 3 |
| ENST00000572544 | 3,401,204–3,404,994 | 2 |
| ENST00000959344 | 3,401,204–3,409,478 | 3 |
| ENST00001117500 | 3,401,204–3,409,478 | 2 |
| ENST00001122995 | 3,401,204–3,406,038 | 3 |
| ENST00001134453 | 3,401,204–3,409,478 | 3 |
| ENST00000575752 | 3,401,235–3,405,043 | 4 |
| ENST00000571936 | 3,401,235–3,409,478 | 4 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF174 被註解為轉錄抑制因子,表示其功能與抑制轉錄有關。現有來源未說明它作用的基因或轉錄靶標,也未提供抑制作用的分子機制、發生條件或相關生物學過程,因此無法據此進一步描述其調控範圍或功能後果。
Promoter 與基因調控
>ZNF174 ENST00000268655 GRCh38 chr16:3400215-3401315 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGAGATAGAGAAATCAAGGGCATTATTATTGTTAGCACTGCTTTCTAGCCAAAAAGAAACTGAGAGCGAT GAAGTATCTTGCCTAAAGCATCACACAGCACAGCTCCTAGGCAGCAAGGCCAGGACTAGAACCAGCACCC CTTGCCTTCATTATGTTCATCCTGTGCCTTACCTGGCTGAAGAAGAATTTAATAAAAGCTCTTCTAACTT CATGCAGAAGGCGGAACCTGCACCCTTCTTGACCCCTTTTGACCCCTTACCTCCCACTCATCGTTAAATT TTAAAATGCTGTTCTCTGAAAATTTTACTTCACTCTAGCGATGGCCCAAACACTCGGAAAAAAATGTAGC ATGAGGATGGGGAGCCAGGTTGATAGGTTTTTCACTTAGTTAACTATTTATTGAGTACTCAGAACGCACT CGGTGCCAGGGCTAGGCACTGTGGATGAGTAGGGAGTGGGCGAGACAGGGACGAGATGAGCAGGGTCAAG GCCAGGGGGTCCCGGGGCGCCGGCGCTCAGGCTCGGGGTGATCCGCACGGTGGGAGCGGGGCACGGTGAT CGCGGCGCGTCTGGGGACGCCCGGCCTGAGGGAGGCTGCCTGTCCCAAGGAGACGCCCATCGGGGCCGGA CCCGAACGCCTCGGAGAAGACTCCCAGCGGGGAGGGGCTCCTCGGCCGTCGCAGGGCCCAGCGGCTAATC CCGCCGGCCGCAAGGAAGCGGAGAACTCACCGGACACCAGCACTCGCGACTCCACAAACTCCCTCAGCCT CCGGGCCGGAAGTCAGCGGCGCGATTCGCTCCGCCCATTACGCACGCCCCTGCGCAGGCCCGCAAGCCGA ATTGCCGGACTGCAGCTCCCGGGATGCACTGCGACGGTATTGACAGGCGCAGCAACCAATAGACGGTAGA GAATGCCCTTGGCAGGAGGCGGGCCCTGTCAGTAGTTGTCCTCAGCAGCTAGTGGGCGTCTCCGCAGCGA GTGGCATCGGCCCCGCCCCCAGCCCGTGCTCGCCGGTGTCGGGTCCTAAGTCCCTCGGTCTTGGGTTCCC GGAGAGGTGAGTCGGCTGCAGGTGGGTGCGGGGCGCCGGGCTGTTCGGGGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF174_1 ↗ | 16:3,401,251 | 正股 | 3,401,202–3,401,261 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR16_BN7Z · enhancer · 3400250–3400978 · regulatory
ENSR16_93CG5 · promoter · 3400979–3401254 · regulatory
ENSR16_5RL77 · CTCF_binding_site · 3401166–3401187 · regulatory
ENSR16_93CGB · promoter · 3401484–3401984 · regulatory
· motif · 3400450–3400462 · motif
· motif · 3400453–3400460 · motif
· motif · 3400455–3400470 · motif
· motif · 3400460–3400472 · motif
· motif · 3400463–3400470 · motif
· motif · 3400463–3400478 · motif
· motif · 3400464–3400477 · motif
· motif · 3400696–3400703 · motif
· motif · 3400989–3400998 · motif
· motif · 3401023–3401034 · motif
· motif · 3401025–3401035 · motif
· motif · 3401035–3401046 · motif
· motif · 3401035–3401046 · motif
· motif · 3401041–3401056 · motif
· motif · 3401168–3401184 · motif
· motif · 3401204–3401214 · motif
· motif · 3401235–3401250 · motif
· motif · 3401281–3401290 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:407 aa
ZNF174 蛋白質長 407 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其序列含有位於第 59–124 個胺基酸的 SCAN box,以及三個 C2H2 型 zinc finger,分別位於第 326–348、354–376 與 382–405 個胺基酸。第 1–20 與 150–270 個胺基酸區段被註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF174 被註解定位於細胞核。 來源未提供定位變化的條件、不同異構型的差異或定位動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- ZSCAN32Q9NX65 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- SCAND1P57086 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF24P17028 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ZSCAN18Q8TBC5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZSCAN22P10073 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
來源將 ZNF174 註解為同源二聚體,表示其可形成由相同蛋白質組成的二聚體;資料未提供其他互作夥伴或複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF174 被註解為轉錄抑制因子,表示其功能與抑制轉錄有關;來源未提供其作用靶標、分子機制或發生條件,因此不進一步推定其調控的基因或生物學過程。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | Homodimer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ZNF174 的定位註解為細胞核。來源沒有說明這項定位是否會隨條件改變,也未提供異構型差異或定位動態,因此不延伸推論其在其他情境中的分布。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGCCCGTGCTCGCCGGTGTCGGGTCCTAAGTCCCTCGGTC40TTGGGTTCCCGGAGAGGTGAGTCGGCTGCAGGTGGGTGCG80GGGCGCCGGGCTGTTCGGGGTACCGGTGTCGCAGTCGCCA120GTCCGAGCTCACACCGGGCGTGGAGTTCAGCTGCGCATCG160GGTTGCGGCAGCTTCGCCAGGCCTGGGGCTGGCTGGGCCG200CGGGGCCGCCCTGGAGGCCGGAGCCACTGGGCCTGCGGCG240CCTCGGCAGCGAGCAGCCGCTTTGCTCGCGTGCAGGAGGC280TGTTCGCTACCTCACACCCCCGGCTGGCGCTGTGGCCTCG320CTTAGCTCTACCGTTTAGCACCCGGCGACATGCACCCGGT360CGGTTTCCGCCAGGATGCGGGAGAGTTGGGGCAAGCTACC400TGCGACAGCTTGAACTTTTCCTAGGGATTCCGCTCCACCC440GCCGGTTAGAGCGTATTGCTCATTAAATCCGAGACCTGTG480TGCTTGCTACTGAAATAAAAGAAGTATTTTTTCCCCAGAG520TCCTTTTAGGACGTTATGACTTTTCTCCTTTGCAAGACTG560CAAAAAACTGACAAGAAGACAAAACTCTTCCCACTCCCAG600GGACCGCGTTGTCTTGAGTTTGGCTAGTAAAGGCTAGCAA640GTGAGGCTTTGTCTCTGCATCCCGTTCCCCCTAACATCCT680CAGAGAACCTTCGTTTCTAGAATCTTTCTAGTATTCAGAG720ACTTCTCCAGGGTCATGATCCCAAAGGCTTAACCCGTTTA760CAAGGAGAGAGTTGTCTCCTGACGCCCAAAATGGCAGCTA800AAATGGAGATAACTTTAAGCTCCAACACTGAAGCTTCCTC840CAAGCAAGAGAGACACATAATAGCCAAACTAGAAGAGAAA880CGGGGCCCTCCTCTGCAAAAAAACTGCCCAGATCCTGAGC920TCTGCCGCCAGAGCTTCAGACGCTTTTGTTATCAAGAGGT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。