基因總覽
zinc finger protein 17 是由 ZNF17 編碼的蛋白質,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質全長 662 個胺基酸,結構包含位於 N 端的 KRAB domain,以及多個 C2H2-type zinc finger。這些結構特徵界定了它的蛋白質家族歸屬;現有資料並未提供其特定 DNA 標的或更細部的分子作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000307658 ★ | 57,411,161–57,421,934 | 4 |
| ENST00000964805 | 57,410,723–57,422,156 | 4 |
| ENST00000601808 | 57,411,154–57,422,156 | 3 |
| ENST00000964806 | 57,411,161–57,422,156 | 4 |
| ENST00001138473 | 57,411,161–57,422,156 | 4 |
| ENST00001127702 | 57,411,170–57,422,156 | 4 |
| ENST00000878542 | 57,411,173–57,422,156 | 4 |
| ENST00000597350 | 57,413,373–57,418,038 | 2 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有註解指出,zinc finger protein 17 可能參與轉錄調控。這項描述表示它可能與基因轉錄的調節有關,但資料沒有說明其作用方向,也未指出它是促進或抑制轉錄,因此不宜進一步推定其調控效果。
目前提供的資料未列出特定受調控基因、DNA 結合序列、作用夥伴或細胞與生理情境,也沒有描述相關實驗或其他生物過程。因而,能確認的功能範圍僅限於「可能參與轉錄調控」;其具體分子機制與生物學影響仍無法由這筆註解判定。
Promoter 與基因調控
>ZNF17 ENST00000307658 GRCh38 chr19:57410161-57411261 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGTTCCAGGACAACCTTAGCTTTTTTCCTCCTATCACAAATATGTTTCTCTATAACTATTTTTGCCACTT TCTTTGGATATCTACATAATCGTCATTAATAGTTTCAGTAATAGCCATTTCACAAGAGTTATTCAGAGAC AATTTCAACTCCCTGTGCAGACACTGTTGATACAATTTCAGGCGAAATGATAAATCACTTTCCACTAATG AGATGAGATCATGCATTCCCAAACCTTTATCTCAGGAGTAAGATGCTTTCTTTGCACAAGGGCTTTGACT GGTGGAAGGCCACACTATTCTGGCAGATAATGGTAGATAAGTCGCTTTTCCTTTTCAGTTAGGTTTCAGT CTCTTAAAATAAGTGGAAAATATCTCAGATATAAAGTAATAAGTATCATGTGAATAAAGTGTTGCTGGGT AGGCTGAAAGACAATAACTGATTATTCAGAAAGGAAAGATATTACTCCTCAAACTCCCCATCATGCCATG TCTGGGTCTTTTCAATGTGCCCAGCAGAGCACATTGAAGATCATAAAACAGTCTCCAGAGCTTCGTTCTG TGTGTATTTGGCAAGCACAAAAGAGCTGACCGCTATGCGTGGAAGACCAGTTCTTTATGGTTGGCCATGT TCCTTCGGATGTTCGTCTTTTGGGAACTTGCTGTGCTTTACAGAATCTGAAAGGACAGGTCTCTGAAACA TTTCTCTGACTTGTTCTAGACTGCCTTCCGGGAAAATCTGGATGCTTGCCGTTTAAAAGCCAATGAAGCC CCTCCACGTCCTTGGAGCCCCGCAACTGCATTTCTCAAAGCCTCAGGAGGATCCTCCTGGCTTTCATCCT GAACGCGAGTTAACTTAAGTTCAGAAGCGGGGCAGGCAGTGGCCTGGGAACTACATTACCCAAAAGACAC AGCGGCGGACACAAGCAGCGAGTGTAGCCAATGAAGGCCTAGCAGAGCGGCGTCTACGGGGGTTCGCAAT GCGTGTGGGCGGGACTTCCTGCAACGCCTCCTGGGGTTGTCAATATGGCTGCGTTGGGATCTGTTCACCT TCAGGCTGAGTCGAGACTGAGGTGAAAAAGCGGAAAAACGCGAGAAAAGGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_9SR7P · enhancer · 57406415–57406925 · regulatory
ENSR19_5HHKDW · CTCF_binding_site · 57406720–57406741 · regulatory
ENSR19_BFDLZ · promoter · 57410671–57411189 · regulatory
ENSR19_BFDM3 · enhancer · 57411190–57411870 · regulatory
· motif · 57406687–57406704 · motif
· motif · 57406722–57406738 · motif
· motif · 57406833–57406842 · motif
· motif · 57406833–57406842 · motif
· motif · 57406840–57406853 · motif
· motif · 57406840–57406853 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:662 aa
zinc finger protein 17 全長為 662 個胺基酸。其 N 端具有 KRAB domain,後段則註解出多個 C2H2-type zinc finger;資料列出的 finger 編號為 1–5 與 7–17,未列出第 6 個。蛋白質家族歸屬為 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
zinc finger protein 17 的定位註解為細胞核;資料沒有描述其定位隨條件改變或異構型不同的情形。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 12 個夥伴
- AIRIMQ9NX04 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP70Q8NHQ1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTUS2Q5JR59-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OPTNQ96CV9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PICK1Q9NRD5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SETQ01105-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YJU2BP13994 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF438Q7Z4V0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF837Q96EG3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZRANB1Q9UGI0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCAACGCCTCCTGGGGTTGTCAATATGGCTGCGTTGGGAT40CTGTTCACCTTCAGGCTGAGTCGAGACTGAGGTGAAAAAG80CGGAAAAACGCGAGAAAAGGTTTCCCCGTTGTACAGAGGC120TAGAGTGAGGCTCGGTTGAATCGGTTGCAGGCGTTGGTGC160CTCTGTCAGCGTCCAGGTCACTGCCGCTCCCGCCCCGCTC200TTCCCTGGCTGTGCTGGCGGAGGCTGCGCCGATGAACCTG240ACTGAGGGTTCATAGCAGTGGCAGCAATGCTTATGGATGC280TGGACAGGATTATATGGTTTTTGAGGACGTGGCCATACAT320TTCTCCCAGGAGGAGTGGGGAATTCTTAATGACGTTCAGA360GACACCTGCACAGCGATGTGATGCTGGAGAACTTTGCACT400TTTGTCCTCAGTAGGTTGTTGGCATGGAGCCAAGGATGAG440GAGGCACCTTCCAAGCAATGTGTTTCTGTAGGAGTGTCAC480AGGTCACAACTTTAAAGCCAGCTTTGTCCACCCAGAAGGC520CCAGCCCTGTGAGACATGTAGCTCACTTCTGAAGGACATT560CTACACCTGGCTGAGCATGACGGAACACACCCCAAGCGTA600CAGCCAAGCTTTACCTGCACCAAAAGGAGCATCTTAGAGA640GAAGCTCACCAGAAGTGATGAAGGGAGGCCTTCGTTTGTG680AATGACAGTGTTCACCTGGCAAAGAGGAACCTCACATGCA720TGCAGGGTGGCAAGGATTTTACTGGTGATTCAGATCTTCA760ACAACAGGCTCTTCACAGTGGGTGGAAGCCACACAGGGAC800ACTCATGGTGTGGAGGCCTTTCAAAGTGGACAGAATAATT840ACAGCTGCACCCAATGTGGGAAAGACTTTTGCCACCAACA880TACACTGTTTGAGCACCAGAAAATCCACACAGAGGAAAGG920CCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGCAAATTGTTTAGGTACA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。