演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF17HPF3

zinc finger protein 17

ZNF17 編碼 zinc finger protein 17,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family;它可能參與轉錄調控,並定位於細胞核。

Homo sapiens19q13.43UniProt P17021
OFFICIAL SYMBOL
ZNF17
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P17021
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

zinc finger protein 17 是由 ZNF17 編碼的蛋白質,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質全長 662 個胺基酸,結構包含位於 N 端的 KRAB domain,以及多個 C2H2-type zinc finger。這些結構特徵界定了它的蛋白質家族歸屬;現有資料並未提供其特定 DNA 標的或更細部的分子作用方式。

Official symbol
ZNF17
Gene name
zinc finger protein 17
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12958
UniProt
P17021
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HPF3KOX10KIAA1947FLJ40864FLJ46058FLJ46615

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.43
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF17pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:57,410,723–57,422,156
Gene span
11,434 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000307658 ★57,411,161–57,421,9344
ENST0000096480557,410,723–57,422,1564
ENST0000060180857,411,154–57,422,1563
ENST0000096480657,411,161–57,422,1564
ENST0000113847357,411,161–57,422,1564
ENST0000112770257,411,170–57,422,1564
ENST0000087854257,411,173–57,422,1564
ENST0000059735057,413,373–57,418,0382

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有註解指出,zinc finger protein 17 可能參與轉錄調控。這項描述表示它可能與基因轉錄的調節有關,但資料沒有說明其作用方向,也未指出它是促進或抑制轉錄,因此不宜進一步推定其調控效果。

目前提供的資料未列出特定受調控基因、DNA 結合序列、作用夥伴或細胞與生理情境,也沒有描述相關實驗或其他生物過程。因而,能確認的功能範圍僅限於「可能參與轉錄調控」;其具體分子機制與生物學影響仍無法由這筆註解判定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 57411161 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF17 ENST00000307658 GRCh38 chr19:57410161-57411261 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGTTCCAGGACAACCTTAGCTTTTTTCCTCCTATCACAAATATGTTTCTCTATAACTATTTTTGCCACTT
TCTTTGGATATCTACATAATCGTCATTAATAGTTTCAGTAATAGCCATTTCACAAGAGTTATTCAGAGAC
AATTTCAACTCCCTGTGCAGACACTGTTGATACAATTTCAGGCGAAATGATAAATCACTTTCCACTAATG
AGATGAGATCATGCATTCCCAAACCTTTATCTCAGGAGTAAGATGCTTTCTTTGCACAAGGGCTTTGACT
GGTGGAAGGCCACACTATTCTGGCAGATAATGGTAGATAAGTCGCTTTTCCTTTTCAGTTAGGTTTCAGT
CTCTTAAAATAAGTGGAAAATATCTCAGATATAAAGTAATAAGTATCATGTGAATAAAGTGTTGCTGGGT
AGGCTGAAAGACAATAACTGATTATTCAGAAAGGAAAGATATTACTCCTCAAACTCCCCATCATGCCATG
TCTGGGTCTTTTCAATGTGCCCAGCAGAGCACATTGAAGATCATAAAACAGTCTCCAGAGCTTCGTTCTG
TGTGTATTTGGCAAGCACAAAAGAGCTGACCGCTATGCGTGGAAGACCAGTTCTTTATGGTTGGCCATGT
TCCTTCGGATGTTCGTCTTTTGGGAACTTGCTGTGCTTTACAGAATCTGAAAGGACAGGTCTCTGAAACA
TTTCTCTGACTTGTTCTAGACTGCCTTCCGGGAAAATCTGGATGCTTGCCGTTTAAAAGCCAATGAAGCC
CCTCCACGTCCTTGGAGCCCCGCAACTGCATTTCTCAAAGCCTCAGGAGGATCCTCCTGGCTTTCATCCT
GAACGCGAGTTAACTTAAGTTCAGAAGCGGGGCAGGCAGTGGCCTGGGAACTACATTACCCAAAAGACAC
AGCGGCGGACACAAGCAGCGAGTGTAGCCAATGAAGGCCTAGCAGAGCGGCGTCTACGGGGGTTCGCAAT
GCGTGTGGGCGGGACTTCCTGCAACGCCTCCTGGGGTTGTCAATATGGCTGCGTTGGGATCTGTTCACCT
TCAGGCTGAGTCGAGACTGAGGTGAAAAAGCGGAAAAACGCGAGAAAAGGT
ZNF17 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9SR7P · enhancer · 57406415–57406925 · regulatory

ENSR19_5HHKDW · CTCF_binding_site · 57406720–57406741 · regulatory

ENSR19_BFDLZ · promoter · 57410671–57411189 · regulatory

ENSR19_BFDM3 · enhancer · 57411190–57411870 · regulatory

· motif · 57406687–57406704 · motif

· motif · 57406722–57406738 · motif

· motif · 57406833–57406842 · motif

· motif · 57406833–57406842 · motif

· motif · 57406840–57406853 · motif

· motif · 57406840–57406853 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:662 aa

1 aa662 aa結構域鋅指
依 P17021 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 17 全長為 662 個胺基酸。其 N 端具有 KRAB domain,後段則註解出多個 C2H2-type zinc finger;資料列出的 finger 編號為 1–5 與 7–17,未列出第 6 個。蛋白質家族歸屬為 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。

結構域KRAB8–101 aa
鋅指C2H2-type 1190–212 aa
鋅指C2H2-type 2218–240 aa
鋅指C2H2-type 3246–268 aa
鋅指C2H2-type 4274–296 aa
鋅指C2H2-type 5302–324 aa
鋅指C2H2-type 7358–380 aa
鋅指C2H2-type 8386–408 aa
鋅指C2H2-type 9414–436 aa
鋅指C2H2-type 10442–464 aa
鋅指C2H2-type 11470–492 aa
鋅指C2H2-type 12498–520 aa
鋅指C2H2-type 13526–548 aa
鋅指C2H2-type 14554–576 aa
鋅指C2H2-type 15582–604 aa
鋅指C2H2-type 16610–632 aa
鋅指C2H2-type 17638–660 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P17021…

AlphaFold · P17021

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

zinc finger protein 17 的定位註解為細胞核;資料沒有描述其定位隨條件改變或異構型不同的情形。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 12 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HPF3ZNF17AIRIMCEP70GOLGA6L9KRT40MTUS2OPTNPICK1SETYJU2BZNF438ZNF837ZRANB1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 12 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能zinc finger protein 17 可能參與轉錄調控。這項敘述指出其可能與轉錄調節有關,但未提供調控方向、作用標的或具體機制,因此不能據此判定它會促進或抑制轉錄。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位zinc finger protein 17 的定位為細胞核;此項註解未進一步說明定位發生的條件或動態。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000307658 · 2,714 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCAACGCCTCCTGGGGTTGTCAATATGGCTGCGTTGGGAT40
41CTGTTCACCTTCAGGCTGAGTCGAGACTGAGGTGAAAAAG80
81CGGAAAAACGCGAGAAAAGGTTTCCCCGTTGTACAGAGGC120
121TAGAGTGAGGCTCGGTTGAATCGGTTGCAGGCGTTGGTGC160
161CTCTGTCAGCGTCCAGGTCACTGCCGCTCCCGCCCCGCTC200
201TTCCCTGGCTGTGCTGGCGGAGGCTGCGCCGATGAACCTG240
241ACTGAGGGTTCATAGCAGTGGCAGCAATGCTTATGGATGC280
281TGGACAGGATTATATGGTTTTTGAGGACGTGGCCATACAT320
321TTCTCCCAGGAGGAGTGGGGAATTCTTAATGACGTTCAGA360
361GACACCTGCACAGCGATGTGATGCTGGAGAACTTTGCACT400
401TTTGTCCTCAGTAGGTTGTTGGCATGGAGCCAAGGATGAG440
441GAGGCACCTTCCAAGCAATGTGTTTCTGTAGGAGTGTCAC480
481AGGTCACAACTTTAAAGCCAGCTTTGTCCACCCAGAAGGC520
521CCAGCCCTGTGAGACATGTAGCTCACTTCTGAAGGACATT560
561CTACACCTGGCTGAGCATGACGGAACACACCCCAAGCGTA600
601CAGCCAAGCTTTACCTGCACCAAAAGGAGCATCTTAGAGA640
641GAAGCTCACCAGAAGTGATGAAGGGAGGCCTTCGTTTGTG680
681AATGACAGTGTTCACCTGGCAAAGAGGAACCTCACATGCA720
721TGCAGGGTGGCAAGGATTTTACTGGTGATTCAGATCTTCA760
761ACAACAGGCTCTTCACAGTGGGTGGAAGCCACACAGGGAC800
801ACTCATGGTGTGGAGGCCTTTCAAAGTGGACAGAATAATT840
841ACAGCTGCACCCAATGTGGGAAAGACTTTTGCCACCAACA880
881TACACTGTTTGAGCACCAGAAAATCCACACAGAGGAAAGG920
921CCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGCAAATTGTTTAGGTACA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。