演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF169MGC51961

zinc finger protein 169

ZNF169(zinc finger protein 169)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族的蛋白質,可能參與轉錄調控;其蛋白質定位於細胞核。

Homo sapiens9q22.32UniProt Q14929
OFFICIAL SYMBOL
ZNF169
CHROMOSOME
9
UNIPROT
Q14929
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF169 的正式名稱為 zinc finger protein 169,屬於蛋白質編碼基因,其產物歸入 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質長 603 個胺基酸,具有 N 端 KRAB 結構域,以及多個 C2H2-type zinc finger 區域;其中部分區域被註記為退化型。序列中另有兩段被預測為無序區。現有功能資料僅指出它可能參與轉錄調控,尚未提供更具體的作用對象或機制。

Official symbol
ZNF169
Gene name
zinc finger protein 169
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12957
UniProt
Q14929
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MGC51961

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99q22.32
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegZNF169pq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr9:94,259,280–94,324,660
Gene span
65,381 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000395395 ★94,259,298–94,301,8295
ENST0000034091194,259,280–94,301,4545
ENST0000071845994,259,280–94,303,9675
ENST0000109094394,259,280–94,295,8475
ENST0000112770894,259,280–94,314,6995
ENST0000112770994,259,280–94,314,6994
ENST0000112771094,259,280–94,294,4545
ENST0000112771194,259,280–94,294,4545
ENST0000112829994,259,280–94,302,9975
ENST0000113986594,259,280–94,301,8295
ENST0000087335494,259,328–94,303,0325
ENST0000087335594,259,328–94,303,0236

顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有資料指出,ZNF169 可能參與轉錄調控。這項描述表示其功能與調節基因轉錄有關,但資料沒有說明它會促進或抑制轉錄,也未指出受調控的基因、特定細胞過程或作用條件,因此不宜將其功能延伸解讀為已確立的調控機制。

ZNF169 的家族分類與蛋白質序列特徵提供了其分子身分的基本背景,但來源並未證實這些結構特徵如何參與轉錄調控,也沒有提供 DNA 結合、調控複合體或其他分子互作的實驗描述。因此,目前可支持的功能結論僅限於「可能參與轉錄調控」;具體分子作用方式及其生物學影響仍未由所提供的資料界定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 94259298 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF169 ENST00000395395 GRCh38 chr9:94258298-94259398 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCAGTTGGAATTTGAGTTACTGCCAATCTCACCACCTCTGGCTAGAGGGCCCTAAATAAACTCGAAAGGC
AGCCTGGGCCACAAGGACGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGCCTGAAGTGGGAAAATTGCT
TGAGGCCAGGAGTTCCAGACCAGCCTGGTCAACATAGCGAGACCCAGATTCTTTTTTTTTTTTTTCCCCC
TTGAGAAGGAATCTCACTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCC
ACCTCCCGAGTTCAAAGTGATTCTCCTGCCTCACCCTCCTGAGTAGCCGGGACTACAGGCGCCCATCACG
ACGCCCAGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTACCACATTGGCCAGGCTGCTCTCGAACT
CCTGACCTCTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGG
CCGCGAGACCCAGATTCTAAAAAACAAAACAAAAAATTAGCCCGGTGTGGTGCTATGCACCTGTATTCCC
AGCTACTCAGAAAGTTGAGGTGAGAGGATTGCTTGGCCAGGGGTTTGAGGCTGCAGTGAGCTATGATCAC
ACCATTGTACTGCAGCCTGGCCGACAGAGCAAGACCCCTTCTCAAAAAATAAGTAAGTAGATAAAGTTCA
GGGGTGTACAATCACAGGTGTGAATTTGCAGGATGGAGGACATGTAACATCTTTTTAAAAAAAAAAAAAA
TTAGAAGGACCGTATAAAAAGTTAAAGAAGACTTACTGCTCACCTGACCACCCTTCTCATAGACCCGAAA
GTTAGATTTTACTTTCTGATTTTTCACAATTTCTCCTGGATGCTGCGGTCCCGCCCCTCGCAGCATTCTG
GATGTTGTAGTCCCTCGCTCCAGGGCATCCACGGTAGGGTAGTTGCGCGCCCCGTGGCAGTCTGGGTAGT
GTAGTTCCGTGCCCAGGGGCAGTCCGGCTCGCGTACTTCCGCGTTCCGGCATCGTCGCCTGGTGCGTGGT
GAGTGTCCTTTCACAGTTCTGGTGAGCTAGCCCGGAGGTGGTCCCCGCTTT
ZNF169 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF169_1 ↗9:94,259,318正股94,259,269–94,259,328

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_93DF62 · enhancer · 94258789–94259273 · regulatory

ENSR9_77JMLF · promoter · 94259274–94259351 · regulatory

ENSR9_BNP44 · enhancer · 94259352–94259910 · regulatory

· motif · 94258862–94258884 · motif

· motif · 94258920–94258932 · motif

· motif · 94259000–94259015 · motif

· motif · 94259012–94259024 · motif

· motif · 94259311–94259320 · motif

· motif · 94259311–94259322 · motif

· motif · 94259311–94259322 · motif

· motif · 94259349–94259364 · motif

· motif · 94259356–94259378 · motif

· motif · 94259356–94259378 · motif

· motif · 94259378–94259387 · motif

· motif · 94259754–94259776 · motif

· motif · 94259754–94259776 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:603 aa

1 aa603 aa結構域功能區域鋅指
依 Q14929 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF169 為 603 個胺基酸的蛋白質,N 端含 KRAB 結構域,後段排列多個 C2H2-type zinc finger 區域。第 11 與第 13 個 zinc finger 被註記為退化型。序列另有兩段預測的無序區,分別位於胺基酸 121–181 與 583–603。

結構域KRAB14–85 aa
鋅指C2H2-type 1234–256 aa
鋅指C2H2-type 2262–284 aa
鋅指C2H2-type 3290–312 aa
鋅指C2H2-type 4318–340 aa
鋅指C2H2-type 5346–368 aa
鋅指C2H2-type 6374–396 aa
鋅指C2H2-type 7402–424 aa
鋅指C2H2-type 8430–452 aa
鋅指C2H2-type 9458–480 aa
鋅指C2H2-type 10486–508 aa
鋅指C2H2-type 11; degenerate514–536 aa
鋅指C2H2-type 12542–564 aa
鋅指C2H2-type 13; degenerate570–592 aa
功能區域Disordered121–181 aa
功能區域Disordered583–603 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q14929…

AlphaFold · Q14929

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF169 的定位資料指向細胞核。 來源未提供定位隨條件改變的資訊,也未描述異構型之間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MGC51961ZNF169CABP5CCNDBP1CEP70KRTAP10-6KRTAP10-7
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF169 可能參與轉錄調控,但現有敘述未指出調控方向、作用對象、發生條件或具體分子機制,因此此功能仍應保留為可能性。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF169 定位於細胞核;此項定位資料未提供條件依賴性、定位變化或異構型差異等資訊。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000395395 · 2,374 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCCGGCTCGCGTACTTCCGCGTTCCGGCATCGTCGCCT40
41GGTGCGTGATTTGCCTCTGCAACTTGACTCTCCTCTAGGA80
81AGAGTACTCCAGAGAGCAGGGATATGTCACCAGGACTCCT120
121GACAACCAGGAAGGAGGCATTGATGGCCTTCCGGGATGTG160
161GCTGTGGCCTTCACCCAGAAGGAGTGGAAGCTATTGAGTT200
201CTGCTCAGAGGACCCTGTACAGGGAGGTGATGCTGGAGAA240
241CTACAGCCATCTGGTCTCCCTGGGAATTGCATTTTCCAAA280
281CCAAAACTCATCGAACAGCTGGAGCAAGGCGACGAACCTT320
321GGAGAGAGGAGAACGAACATCTTCTGGACCTTTGTCCAGA360
361GCCTAGAACAGAATTCCAGCCAAGTTTTCCCCACCTGGTG400
401GCCTTTTCTAGCTCGCAGCTCCTCAGACAATATGCGCTAA440
441GTGGCCATCCCACACAGATCTTCCCAAGCTCATCTGCAGG480
481AGGTGACTTCCAACTAGAAGCTCCAAGATGCTCTAGTGAA520
521AAAGGAGAAAGTGGAGAGACAGAAGGCCCCGACAGCTCAT560
561TAAGAAAGAGGCCAAGCAGAATTTCTAGGACATTCTTCAG600
601CCCACATCAAGGTGACCCAGTAGAATGGGTAGAAGGGAAC640
641AGAGAAGGAGGAACAGACCTTCGCCTGGCCCAAAGGATGA680
681GTCTTGGGGGGTCAGACACAATGTTGAAGGGAGCAGACAC720
721TTCAGAATCTGGAGCAGTCATACGTGGAAACTATAGACTG760
761GGACTTAGCAAAAAGTCAAGCCTGTTCAGCCACCAGAAGC800
801ATCATGTGTGCCCTGAATGCGGGAGAGGCTTTTGCCAGAG840
841ATCAGACCTTATCAAGCACCAGAGGACACACACCGGGGAG880
881AAGCCATACCTGTGTCCTGAGTGTGGGCGTCGGTTTAGCC920
921AGAAGGCCTCCCTCTCCATACACCAGAGGAAGCACTCGGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。