演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF165ZSCAN7

zinc finger protein 165

ZNF165(zinc finger protein 165)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 的蛋白質編碼基因,其產物可能參與轉錄調控。

Homo sapiens6p22.1UniProt P49910
OFFICIAL SYMBOL
ZNF165
CHROMOSOME
6
UNIPROT
P49910
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF165 是位於人類第 6 號染色體 6p22.1 的蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 165。其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,蛋白質全長 485 個胺基酸。序列包含一個 SCAN box,以及多個 C2H2-type zinc finger,其中第一個鋅指區域被註記為退化型。這些結構特徵界定了它的蛋白質家族歸屬;其可能的主要角色與轉錄調控相關。

Official symbol
ZNF165
Gene name
zinc finger protein 165
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12953
UniProt
P49910
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZSCAN7CT53

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p22.1
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegZNF165pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr6:28,080,276–28,089,563
Gene span
9,288 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000683778 ★28,080,568–28,089,5634
ENST0000107411828,080,276–28,089,5634
ENST0000111701328,080,276–28,089,5633
ENST0000113458728,080,276–28,089,5634
ENST0000037732528,080,568–28,089,5634
ENST0000089330828,081,199–28,089,5634
ENST0000089330928,081,229–28,089,5634

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF165 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。這項描述表示其可能與基因轉錄活動的調節有關,但資料並未說明它在此過程中的具體作用方式,也未指出它會促進或抑制轉錄,因此不宜將其功能方向或調控結果說得更確定。

目前可支持的功能主張僅限於上述可能性;來源沒有提供特定的靶基因、作用序列、分子互作、細胞或生理情境,也沒有交代該功能如何影響下游生物學過程。因此,ZNF165 的轉錄調控角色應保留為可能參與,而非已確認的具體機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 28080568 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF165 ENST00000683778 GRCh38 chr6:28079568-28080668 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AATAGAAACATAGTTTACTCTGGCACGTCTATTCTTATTGCAATTTCCTATTCCCGAATAAACTTTTTTT
TTTTTTTTTGAGATGGATCCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGC
AACCTTCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGTCTTAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCC
ACCACCACACCCAGCTAATTTTTATATTTTTAGTACAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGCCT
TGAACTCCTTGTTAAATACAGTGAGTTCTAAATTTCTCTTCAAAGAATCAGTATGTCAGTATGTTCAATT
CTTTGTTCTCCATTTTAAACTTTAACTTCCTCATTTTCCTCGTCTCCTTGCCTCTAGTTTCAGTAAACAA
CCTTTTCCACCAGTTCTAATCAGTAGTTCACATCTGTTCCCCTGGTGACCTGCTCCGTCCTGAGTCACCC
CTGGTCACCTGCTCTGACCTGAGTCACCTTTAGTCACCTGTTCCGTAACCGTCCTTCCCACTGAAACTGC
TCACCCTACCACTCCGGCTCATACCCCTGCTCTCTTTAAAATAGCCAATCGGAATTAACTTAGACTGTGC
GGTCCAACCCTAGCCAGTAGGGGAACGACACAGCACTAGGGACTACCTGCGTCAGGGATAAGAACCCCTT
CCCCTCCCTTGTTCAGGTGTGCTCTCGCCATTGCTCCATCCGTGAGACGCACCCTTCTATAGAAGTAAAT
TGCTTTGCTGAGAAAATGTGTGCTCGAGTGTGTATCTTTTTCTTCTTCTTCTTTTTCTGAGACTGAGTCT
CACTCTGTCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGGCGCGGTCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCA
AGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGCACCTGGAACTACAGGCGCGTGCCACCACGCCCGGCAATTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGACACAGGGTGTCACCGCGTAAACCAGGATAGTCTCGAT
CTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTGC
ZNF165 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF165_2 ↗6:28,080,569正股28,080,520–28,080,579
ZNF165_1 ↗6:28,080,936正股28,080,887–28,080,946

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR6_9F5X4 · promoter · 28080078–28080578 · regulatory

ENSR6_58LBWP · CTCF_binding_site · 28080576–28080597 · regulatory

ENSR6_8S9TD · enhancer · 28080579–28080745 · regulatory

ENSR6_9F5X9 · promoter · 28080746–28081246 · regulatory

· motif · 28078770–28078782 · motif

· motif · 28079933–28079946 · motif

· motif · 28080022–28080037 · motif

· motif · 28080022–28080037 · motif

· motif · 28080024–28080039 · motif

· motif · 28080578–28080594 · motif

· motif · 28080613–28080628 · motif

· motif · 28080618–28080630 · motif

· motif · 28080621–28080628 · motif

· motif · 28080621–28080636 · motif

· motif · 28080797–28080808 · motif

· motif · 28080931–28080942 · motif

· motif · 28080933–28080942 · motif

· motif · 28081128–28081139 · motif

· motif · 28081128–28081139 · motif

· motif · 28081152–28081169 · motif

· motif · 28081165–28081180 · motif

· motif · 28081165–28081180 · motif

· motif · 28081180–28081196 · motif

· motif · 28081189–28081202 · motif

· motif · 28081189–28081202 · motif

· motif · 28081258–28081270 · motif

· motif · 28081260–28081267 · motif

· motif · 28081467–28081476 · motif

· motif · 28081503–28081510 · motif

· motif · 28081503–28081518 · motif

· motif · 28081573–28081588 · motif

· motif · 28081580–28081588 · motif

· motif · 28081693–28081706 · motif

· motif · 28081752–28081767 · motif

· motif · 28081757–28081769 · motif

· motif · 28083179–28083192 · motif

· motif · 28083329–28083344 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:485 aa

1 aa485 aa結構域鋅指
依 P49910 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF165 蛋白長 485 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列含有位於第 62–127 位的 SCAN box,以及六個 C2H2-type zinc finger;其中第一個鋅指區域為退化型,其餘五個為 C2H2-type。

結構域SCAN box62–127 aa
鋅指C2H2-type 1; degenerate290–314 aa
鋅指C2H2-type 2344–366 aa
鋅指C2H2-type 3372–394 aa
鋅指C2H2-type 4400–422 aa
鋅指C2H2-type 5428–450 aa
鋅指C2H2-type 6456–478 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P49910…

AlphaFold · P49910

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF165 的定位資料將其標示於細胞核;來源未提供定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 35 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZSCAN7ZNF165AHCYL1CARD10CCDC125CEP70CYSRT1DMWDDVL2DVL3EMDEWSR1GOLGA6L9IL16KRTAP10-8KRTAP10-9KRTAP2-4MAB21L3MID2NTAQ1PICK1PLEKHF2PPLRNPS1SCAND1SPRED1TRIM41YJU2BZNF24ZNF250ZNF263ZNF417ZNF446ZNF572ZNF668ZNF774ZNF837
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 35 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF165 可能參與轉錄調控;現有描述未指出調控方向、具體作用方式或相關的細胞與生理情境,因此此功能應保留為可能性。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF165 的細胞內定位標示為細胞核;此項資料未提供其他定位條件或動態資訊。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000683778 · 1,954 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1TATTTTTAGTAGACACAGGGTGTCACCGCGTAAACCAGGA40
41TAGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGTCTCGGC80
81CTCCCAAAGTGCTGGGACTGCAGGCGTGAGCCACCGCGCC120
121CGGCCAACGTCATTTTCTTTTCAGGAGTCCCTTCTGTTAT160
161TTAGCAAGACACACTACTACAATGGAGAAAAAAGATGCCC200
201CCTCCTTCAAGCCCTGAGATCTTCAGGACTTTGGCGAAAA240
241GTCTGCGCCCGAAGAGACCCAGGAAGGATTCTTGGAATTG280
281TAGTCCAAAGGCATCCCGCCTTCTGCGCAGACTCACAAGT320
321CCCTGTGGACGGAATTCTTGAAGTGTAGCGCCGCTCAGTC360
361CTTCCACCGGAAGTGTCCGATCGGAATCAGCCCTGTCCGA400
401GAGATGGCTACAGAACCAAAGAAAGCTGCAGCCCAGAACT440
441CTCCAGAGGATGAAGGACTTCTGATAGTGAAGATAGAAGA480
481GGAAGAATTTATCCATGGGCAGGACACTTGCTTACAGAGA520
521AGTGAACTCCTTAAGCAGGAGCTCTGCAGGCAGCTTTTTA560
561GGCAGTTCTGCTACCAGGATTCTCCTGGACCTCGCGAGGC600
601ACTGAGCCGCCTCCGGGAGCTCTGCTGTCAGTGGCTGAAG640
641CCAGAGATCCATACCAAGGAACAGATTCTGGAACTGCTGG680
681TGCTAGAGCAGTTCCTGACCATCCTGCCAGGAGATTTGCA720
721GGCCTGGGTACATGAACATTACCCAGAGAGTGGAGAGGAG760
761GCAGTGACCATACTAGAAGATTTGGAGAGAGGCACTGATG800
801AAGCAGTACTCCAGGTTCAAGCCCATGAACATGGACAAGA840
841AATATTCCAGAAAAAAGTGTCACCTCCTGGACCAGCACTT880
881AATGTCAAGTTACAGCCAGTGGAGACCAAGGCCCATTTTG920
921ATTCATCAGAACCCCAGCTCCTATGGGACTGTGATAATGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。