演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF160HZF5

zinc finger protein 160

ZNF160(zinc finger protein 160)是蛋白質編碼基因,其產物可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19q13.42UniProt Q9HCG1
OFFICIAL SYMBOL
ZNF160
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9HCG1
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF160 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 160。其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。現有資料指出,該蛋白可能參與轉錄調控;可用來源未提供更詳細的生化特性或作用方式。

Official symbol
ZNF160
Gene name
zinc finger protein 160
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12948
UniProt
Q9HCG1
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HZF5F11KR18HKr18FLJ00032KIAA1611

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.42
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF160pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:53,064,884–53,103,464
Gene span
38,581 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000683776 ★53,066,614–53,103,4226
ENST0000059905653,064,884–53,103,4647
ENST0000041887153,064,884–53,103,4646
ENST0000042960453,064,884–53,103,4647
ENST0000060142153,064,884–53,075,9673
ENST0000089679553,064,884–53,103,4646
ENST0000089679653,064,884–53,103,4647
ENST0000089679753,064,884–53,086,6334
ENST0000097182753,064,884–53,103,4647
ENST0000097182853,064,884–53,103,4646
ENST0000097182953,064,884–53,103,4647
ENST0000097183053,064,884–53,087,0225

顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF160 的蛋白質產物可能參與轉錄調控。這項描述指出其可能涉及調節轉錄,但目前提供的資料沒有說明它如何作用,也未指出受調控的基因、轉錄過程中的具體步驟或其作用方向。因此,不能據此判定 ZNF160 是促進或抑制轉錄,亦無法推定其影響哪些特定生物學過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 53103422 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF160 ENST00000683776 GRCh38 chr19:53103322-53104422 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAATTCGAGACCAGCCTAGGCAACATG
GTGAAACTTCATCTCCGCTAAAGAACGTGGTGGCGGGCGCCTGTAATCCTAGCTACTCGGGAGGCTGAGG
CAGGAGCATTGCTTGAACCCGGGAGGCCGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGCCACTGCACCCCAGCCT
GGACGACAGAGCGTGACTCCGGCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATAGGCGTTTGAGGTTGTCATCTCGC
ACGGAATAGAATAGTAAGTATAAAAAAGGACAATGCAATTTATATCTATTTTTTAAAAGTTACTGCTAAT
TTCAGGGCTTTTAAATTACTTAATTTTAATCGCAGAAACTTTTCCAGCATGCCATCACCGCTCCGTGTCA
ACCCATGTTCCCAGACTCCTGGGCTGCTTCAGCGTCAATAACATTACTGGGTAAACGCGCTAGCAAAAAA
TGCTTTCAACATAAACCGCCTCCATTCTAAGAGGAAAGCAGTTTGGTTTCCAAAATAACCTACACAACTG
TGCTTTTAACTTGAAACCGTTTGAAACATCTACGCCGTTCCACAAGACACTACAGATGGCTCTGGGCGCT
GGGCTGTGGGCATCACACGAAATCGCAGACCCTAACGTGTCCCGTCCAGCCCCGCCTCTCCCCCGGGTCC
CTTCCTGGCGGTCCCTCTGCCTCCCTCCCCCGCGGTCCCTTCGCCTTCCTCCCCCGCGGTCCCTTCCCGC
GGTTCCTCCCCGCCCTTCCCCGGCGGCTCCTCCCCGGCCCGCCCCCGGGTCCCTCCACTTGGTCACTCCC
CACCCCTCCCCGGTGGCTCCTCCCCGTTCCTTCCCTGGGGTCCCTGCCTGGCGGCCCCTGCTTCAGCCCG
GCTCTCTCAACGCCCCGCCCTTTTCCGGTTCCGCCCATCTCGGACCCCGCCCCGGGCCGCTCGGTCGCTT
TCCTTCGCGCAGTTGCCCACAGACCCGGAAGTGGATCGTGCGGAGCAAGCATCACACCATGGCGTATGAG
TGTTCCTCTGTGTAGACTCAACCTGCGCCTCGCCGTCCCCCATTCGCACAC
ZNF160 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF160_1 ↗19:53,103,422負股53,103,412–53,103,471

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_83K666 · enhancer · 53101602–53101806 · regulatory

ENSR19_C799C · enhancer · 53102247–53103340 · regulatory

ENSR19_5GH8FC · CTCF_binding_site · 53102799–53102820 · regulatory

ENSR19_BDJJS · promoter · 53103341–53103924 · regulatory

· motif · 53100930–53100942 · motif

· motif · 53101061–53101073 · motif

· motif · 53101063–53101070 · motif

· motif · 53101063–53101078 · motif

· motif · 53101071–53101078 · motif

· motif · 53101554–53101565 · motif

· motif · 53102640–53102660 · motif

· motif · 53102801–53102817 · motif

· motif · 53103410–53103419 · motif

· motif · 53103410–53103421 · motif

· motif · 53103410–53103421 · motif

· motif · 53103540–53103553 · motif

· motif · 53103576–53103586 · motif

· motif · 53103602–53103615 · motif

· motif · 53103607–53103617 · motif

· motif · 53103663–53103676 · motif

· motif · 53103687–53103700 · motif

· motif · 53103758–53103773 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:818 aa

1 aa818 aa結構域鋅指
依 Q9HCG1 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF160 蛋白長 818 個胺基酸,具有位於第 8–79 位的 KRAB 結構域,以及 20 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 257–811 位。資料將其歸入 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。

結構域KRAB8–79 aa
鋅指C2H2-type 1257–279 aa
鋅指C2H2-type 2285–307 aa
鋅指C2H2-type 3313–335 aa
鋅指C2H2-type 4341–363 aa
鋅指C2H2-type 5369–391 aa
鋅指C2H2-type 6397–419 aa
鋅指C2H2-type 7425–447 aa
鋅指C2H2-type 8453–475 aa
鋅指C2H2-type 9481–503 aa
鋅指C2H2-type 10509–531 aa
鋅指C2H2-type 11537–559 aa
鋅指C2H2-type 12565–587 aa
鋅指C2H2-type 13593–615 aa
鋅指C2H2-type 14621–643 aa
鋅指C2H2-type 15649–671 aa
鋅指C2H2-type 16677–699 aa
鋅指C2H2-type 17705–727 aa
鋅指C2H2-type 18733–755 aa
鋅指C2H2-type 19761–783 aa
鋅指C2H2-type 20789–811 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9HCG1…

AlphaFold · Q9HCG1

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

資料將 ZNF160 定位於細胞核;未提供定位變化的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HZF5ZNF160
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF160 可能參與轉錄調控;此描述僅指出可能的功能關聯,未提供其作用方式、調控方向、特定標的或實驗情境。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF160 的定位資料為細胞核;此項資訊未進一步說明定位所依賴的條件、細胞情境或異構型差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000683776 · 4,431 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACCCGGAAGTGGATCGTGCGGAGCAAGCATCACACCAT40
41GGCGTATGAGTGTTCCTCTGTGTAGACTCAACCTGCGCCT80
81CGCCGTCCCCCATTCGCACACCCGATGCCCGGGGGTCGCT120
121ACGGACTTAAAATCTCCGCACCGCACCCTCCACCTCAGAA160
161ACGTTCCTGGATCCGAACACTGCCCCCTGACGACCTAGAG200
201AGATCCCGGCTCCCAGCCCACTGAGTGGCTTCAGCCTCGC240
241TGGTAGGTCTCTCCTCCAAAGCTCTGGAAACAGACTCCTG280
281GGAGTGAGAGGGAGGGGAGCGCAGGCACCGCCCCCTTTCC320
321CCAAGTCCCCCGCCCACTTCATCCCTCAGGCACCTCCCAA360
361CTCCTGGCCTCTCTGCACGAGGCGCCTGCCCCGGGCCCCG400
401CCTACAGGGGACCCAGCTCTTCTTGCAGCCACTGGAAGCT440
441GATCACCTGGAGTGAAGACCTCACACGAAGAAGTCTGGAA480
481GAAGAGGAAGAGGAAAGAAAAGGAGTCAGGGATGGCCCTT520
521ACTCAGGTACGGTTGACATTTAGGGATGTGGCCATAGAAT560
561TCTCTCAGGAGGAGTGGAAATGCCTGGACCCTGCTCAGAG600
601GATCTTATACAGGGACGTGATGTTGGAGAACTACTGGAAC640
641CTTGTTTCTCTGGGACTGTGTCATTTTGATATGAATATTA680
681TCTCCATGTTGGAGGAAGGGAAAGAGCCCTGGACTGTGAA720
721GAGCTGTGTGAAAATAGCAAGAAAACCAAGAACGCCGGAA760
761TGTGTCAAAGGCGTGGTCACAGATATCCCTCCTAAATGTA800
801CAATCAAGGATTTGCTACCAAAAGAGAAGAGCAGTACAGA840
841AGCAGTATTCCACACAGTGGTGTTGGAAAGACACGAAAGC880
881CCTGACATTGAAGACTTTTCCTTCAAGGAACCCCAGAAAA920
921ATGTGCATGATTTTGAGTGTCAATGGAGAGATGACACAGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。