基因總覽
ZNF16 的正式名稱為 zinc finger protein 16，屬於 protein-coding 基因，其產物是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 的成員。蛋白質長 682 個胺基酸，含有多個 C2H2-type zinc finger；其中部分被註記為退化型。其序列另有一段無序區，以及與轉錄活化和核定位相關的區域。這些結構註解提供了認識 ZNF16 蛋白質組成與特徵的基礎。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000394909 ★ | 144,930,358–144,950,880 | 3 |
| ENST00000276816 | 144,929,355–144,950,888 | 4 |
| ENST00000611477 | 144,929,355–144,950,888 | 3 |
| ENST00000871992 | 144,929,355–144,950,888 | 4 |
| ENST00000871993 | 144,929,355–144,950,654 | 4 |
| ENST00000871994 | 144,929,355–144,947,411 | 2 |
| ENST00000957674 | 144,929,355–144,950,622 | 3 |
| ENST00000532351 | 144,932,123–144,950,819 | 3 |
| ENST00000527811 | 144,932,415–144,950,595 | 3 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF16 具有轉錄活化作用，並與細胞增殖及細胞週期進程相關。來源指出，它可促進細胞由 S 期轉換至 G2/M 期，進而促進細胞增殖；此處描述的是其對細胞週期階段轉換的作用，未進一步提供所調控的特定基因或分子機制。
在分化方面，ZNF16 參與 hemin 誘導的紅血球系分化，也參與 phorbol myristate acetate（PMA）誘導的巨核細胞分化。兩種誘導條件分別對應不同的分化方向，來源未提供更細節的實驗系統或作用途徑，因此不宜將其延伸為其他細胞類型或未提及的分化機制。
此外，ZNF16 也被描述具有抑制細胞凋亡的作用。現有資訊支持其與轉錄活化、細胞週期推進、上述兩類誘導分化及細胞凋亡抑制相關，但未說明這些作用彼此之間的因果關係，也未界定其在不同細胞情境中的相對重要性。
Promoter 與基因調控
>ZNF16 ENST00000394909 GRCh38 chr8:144950780-144951880 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATGTCACCAATCTCTTTGCTAAAGCATAGCAAGAGTGACCTTTACTCCAGCTTCCAATAAGTTCCTCATC TCCAACTGAGAGCACCTCAGCCTGAACTAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGTTATCTAGACAGTGTTTCTTAA ATTCCAATAGAGTTTGTCATGCATTTTTTATTATGTATTCCTGATTTTGATAGTTTAATCTGCCTGCAAA ATGAACGTCAAAATATTTGTGAGGTTTTTTTTGGTTGTTGTTGTTTGTTTCTTTTTTTTGAGACAGGGTC TCACTCTCTCATCAGTGCAACATGTGATCCCGGCTCACTGCAGCCGCACATTCCCCGGCTCAAGCAATCC GCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCATCACACCTGGCTAACTTTTGTATTT TTTGTAGAGATGGAGTCTCCCTATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGCCTCAAGCCATCCGCCCG CCTCGGCCTCCCAAGTGCTGGAATTACAGGCGTGGGCCACCGCACCCAGCCTTATTTGTATTCTTTATGT CCAAGTGTACAATTCATTTCCGTATTAGAAACGATCCATGCACAATCTCACGAAAACATGTTATCTACTG AAGGAATCTGAATTCTTCCATTTATCTATCTAATCACTTACTGATTGAATGATTCAGTTCTTCCAAAAAA CGTATCCTTAGGTTTTTATCAAACTACCGTCTGTTCCGATTCTGGGGGCCTGTATATTAAAATCTCCCAC TACACGAGTATATCTCATTATCTCTGCATTTCTATTAGTGTCCCCTTTTCTTCAGTTGCCGCCTTGTTCA GTGCACGGGTCAACTCTGAAAAAAAGGGGAACAGAAGGGTCTCTGGCCTCAGGGCTAGTGGGACCAGGTC TGGGGCTGAACCACAGAGTCGCCCCGGCCTCCCGCCATCTAGAGAGGCTACGCTGCCCCAGATAGAACGA GCGGCGGGCCGGAATTCGGGGCGGGACTTCCGGGGGTCAGCCGGCGTTGGCTGAGACGTCTTCGTGCCAC GGTGCTGCCTCCTTTCCAAGCGCGACCCGTTGAGGTTAGTTCCGCGAAGCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF16_1 ↗ | 8:144,950,819 | 負股 | 144,950,809–144,950,868 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_B33QNS · enhancer · 144950094–144950869 · regulatory
ENSR8_5394JC5 · CTCF_binding_site · 144950490–144950511 · regulatory
ENSR8_945JDT · promoter · 144950870–144951292 · regulatory
· motif · 144950435–144950450 · motif
· motif · 144950437–144950450 · motif
· motif · 144950492–144950508 · motif
· motif · 144950594–144950601 · motif
· motif · 144950615–144950628 · motif
· motif · 144950626–144950639 · motif
· motif · 144950629–144950642 · motif
· motif · 144950663–144950676 · motif
· motif · 144950858–144950870 · motif
· motif · 144950861–144950868 · motif
· motif · 144950865–144950876 · motif
· motif · 144950867–144950876 · motif
· motif · 144950931–144950941 · motif
· motif · 144951007–144951020 · motif
· motif · 144951477–144951489 · motif
在紅血球系分化期間，hemin 會上調 ZNF16；在巨核細胞分化期間，phorbol myristate acetate（PMA）也會使其上調。此外，轉錄活化因子 MEF2A 可上調 ZNF16。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：682 aa
ZNF16 蛋白質長 682 個胺基酸，屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列含 17 個 C2H2-type zinc finger，其中前兩個被註記為退化型；N 端另有一段無序區。蛋白質特徵註解指出，胺基酸 62–210 為轉錄活化所需區域，並標示數段與核定位相關的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供定位隨條件改變的情形或不同異構型間的差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- AQP1P29972 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAIMQ9NVQ4-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- INCA1Q0VD86 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ZBTB47Q9UFB7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZCCHC17Q9NP64 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF101Q8IZC7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ZNF16 與 INCA1 互作；此互作會抑制 INCA1 的活性，並誘導細胞週期進程。來源描述的是互作及其功能結果，未進一步說明兩者是否形成特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF16 具有轉錄活化作用，並可促進細胞增殖；來源將此增殖效果與細胞週期由 S 期轉換至 G2/M 期相連結。此外，ZNF16 參與 hemin 誘導的紅血球系分化及 PMA 誘導的巨核細胞分化，並具有抑制細胞凋亡的作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as a transcriptional activator. Promotes cell proliferation by facilitating the cell cycle phase transition from the S to G2/M phase. Involved in both the hemin- and phorbol myristate acetate (PMA)-induced erythroid and megakaryocytic differentiation, respectively. Also plays a role as an inhibitor of cell apoptosis PMID 16628192 ↗ · PMID 19763908 ↗ · PMID 21874239 ↗ |
| 交互作用 | ZNF16 與 INCA1 互作；這項互作會抑制 INCA1 活性，並誘導細胞週期進程。來源未進一步說明互作的分子方式或實驗條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with INCA1; the interaction inhibits INCA1 activity and induces the cell cycle process PMID 21874239 ↗ |
| 細胞定位 | 來源將 ZNF16 的細胞內定位描述為細胞核，未提供其他定位或條件相關的定位變化資訊。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 在紅血球系分化期間，hemin 會上調 ZNF16；在巨核細胞分化期間，PMA 也會上調 ZNF16。此外，轉錄活化因子 MEF2A 可上調 ZNF16。 | 含實驗來源 | 證據與來源Up-regulated by hemin during erythroid differentiation. Up-regulated by phorbol myristate acetate (PMA) during megakaryocytic differentiation. Up-regulated by the transcriptional activator MEF2A PMID 16628192 ↗ · PMID 21468593 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCGGGACTTCCGGGGGTCAGCCGGCGTTGGCTGAGACGTC40TTCGTGCCACGGTGCTGCCTCCTTTCCAAGCGCGACCCGT80TGAGGTCCTTGTCATGCCCAGCCTCAGAACTCGCCGTGAG120GAGGCAGAGATGGAGCTCTCAGTTCCAGGACCATCCCCCT160GGACCCCTGCAGCCCAGGCCCGTGTGAGAGATGCTCCTGC200TGTGACCCACCCTGGATCTGCAGCCTGTGGTACCCCCTGC240TGTAGTGATACTGAGCTGGAAGCCATCTGCCCTCACTATC280AGCAGCCAGATTGTGACACCAGGACTGAAGACAAGGAGTT320TCTTCACAAGGAAGACATTCATGAAGATTTGGAATCACAG360GCAGAAATATCAGAAAACTATGCTGGTGATGTTTCCCAGG400TACCCGAGCTTGGAGATCTGTGTGATGATGTATCAGAAAG440AGACTGGGGAGTCCCCGAAGGCAGGAGGCTGCCACAGTCC480CTCTCCCAGGAGGGGGACTTCACACCAGCTGCCATGGGGC520TCCTTAGGGGCCCCTTAGGGGAGAAAGATCTGGACTGTAA560TGGTTTTGACAGTCGCTTCAGTCTGAGCCCAAACCTGATG600GCATGTCAGGAAATCCCTACAGAAGAGAGGCCACATCCAT640ATGACATGGGTGGCCAGAGTTTCCAGCACAGTGTGGACCT680AACTGGTCATGAGGGGGTTCCCACAGCTGAAAGTCCACTC720ATATGTAATGAGTGTGGGAAAACCTTCCAAGGAAATCCTG760ACCTTATTCAGCGTCAAATAGTCCACACTGGGGAGGCTTC800CTTTATGTGTGATGATTGTGGGAAAACCTTCAGCCAGAAC840TCAGTTCTTAAAAACCGTCATCGATCTCATATGAGTGAGA880AAGCTTACCAGTGCAGCGAATGTGGGAAAGCCTTCCGAGG920GCACTCAGACTTTTCTAGGCATCAGAGTCACCACAGCAGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。