基因總覽
zinc finger protein 157 是 ZNF157 所編碼的蛋白質。基因位於 X 染色體 Xp11.3 區域;目前提供的資料僅指出其產物可能參與轉錄調控,未進一步說明其調控對象或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000377073 ★ | 47,370,578–47,414,498 | 4 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF157 的蛋白質產物可能參與轉錄調控。現有資料未說明它如何影響轉錄,也未指出特定調控基因、細胞過程或實驗條件,因此目前只能將其功能描述為可能涉及轉錄調控,不能據此進一步判定調控方向或作用機制。
Promoter 與基因調控
>ZNF157 ENST00000377073 GRCh38 chrX:47369578-47370678 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTTAGCATGGTGTTTCAGAGTTATGTTTCATAATTGATTTTTGTGGCACTTAAGTTATTTACTTTTTCCA TGATTTTAGTTTGAGCTTATATTAGTAATGGCTGCTGAATTGCGTTGGATGCTTTTTTGGTGTAAGTTAA CAGCAGAGTGTTTCCCTCTGTAATTTGTTGATGTAATACATAACATTAGGCCTGGTGCAGTGGCTCACAC CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGAGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTG ACCAACATAGTGAAAACCCGTCTCTACTAAAAATACAAACATTAGCTGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTA ATCCCAGCCACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCTGTGAGCTG AGATCGCACCATTCCACTGCAGCCTGGGTGACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA AGAAAAAATACATAACATTATTAAGATTGAACCATTTTTTTCTGGAAAGAAGAGGCTAAAAGCTTCCCAG TAAAAGAATTTAAGAGGGATATTTCATCTAAGAGTGGAAAAAAACAAAAGACGGCAGAAGAAAGGACCAG CCGATTTCCTTTCATTTAGATTATCAGCTTTCCAGGTTTCCTGCCCTCACAGTCACCCACCAGGTCCCCT TGAACCTGCCCACCCCATGGGCCTTAAGCACCCTTAAGCACTGCCCCAGTTCTACTTCTCCTAAACCCAG ATCTGCCTTGAACTTGAACTGAGGTGTAGGCTGGCTGAGTAGCGAGTGAAGCACCTGGTAGAGCCACTCA AGAAGGGACCCCAAGCTCATTAATTTGGCCCCAAATTTGATCATTTTGTAATCCACCTTGACTCATGCTC TGGGGATGCTGAACATTGTGGCGTGAATGTGGGATGACACTGATGATATGGATACTGTCCTTTTAGGATT TCTTGGTGTCTCTGTGGAGCCATTGAGCCTTACCCCTTACTGGAGGCTGCAGGACCCTCTACACACAGAC AGCTGTCCAGCACGGAAGGTGGGCTGAGGCCCAGGGTGAACATGCCAGCTA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF157_1 ↗ | X:47,366,457 | 正股 | 47,366,408–47,366,467 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSRX_BCDRQ · enhancer · 47365913–47366839 · regulatory
· motif · 47366350–47366363 · motif
· motif · 47366398–47366408 · motif
· motif · 47366578–47366598 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:506 aa
zinc finger protein 157 屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,長 506 個胺基酸。序列含有位於第 27–98 位的 KRAB domain,以及 12 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 162–492 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
zinc finger protein 157 位於細胞核。 現有資料未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CATTGAGCCTTACCCCTTACTGGAGGCTGCAGGACCCTCT40ACACACAGACAGCTGTCCAGCACGGAAGGTGGGCTGAGGC80CCAGGGTGAACATGCCAGCTAATGGGACATCACCCCAGAG120ATTCCCTGCCCTGATTCCAGGAGAACCTGGCAGATCTTTT160GAGGGGTCCGTGTCATTCGAGGATGTGGCTGTGGATTTCA200CCCGACAGGAGTGGCACAGACTGGACCCTGCTCAGAGGAC240CATGCACAAGGATGTGATGCTGGAGACCTACAGCAACCTG280GCATCTGTGGGCCTCTGCGTGGCCAAACCAGAGATGATCT320TCAAGTTGGAGCGAGGAGAAGAGCTGTGGATATTAGAGGA360GGAATCCTCAGGCCATGGTTACTCAGGATCTCTCTCACTG400CTGTGTGGCAATGGTTCTGTTGGGGATAATGCCCTCAGGC440ATGATAATGACCTTCTTCACCATCAGAAGATTCAAACATT480GGATCAAAATGTTGAATATAATGGATGCAGGAAAGCCTTC520CATGAGAAAACAGGCTTTGTTAGACGTAAAAGAACACCCA560GAGGAGATAAAAACTTTGAATGTCATGAATGTGGGAAAGC600TTACTGTAGGAAGTCAAACCTTGTTGAACATCTGAGAATA640CACACAGGAGAGAGACCCTATGAATGCGGTGAATGTGCAA680AAACCTTCAGTGCAAGATCATACCTCATTGCTCATCAGAA720AACTCACACAGGGGAGAGGCCCTTTGAATGTAATGAATGT760GGGAAATCTTTTGGCAGGAAGTCACAACTCATCCTACATA800CAAGAACACACACTGGAGAGAGACCCTATGAATGTACTGA840ATGTGGGAAAACCTTTTCTGAGAAGGCAACCCTCACGATT880CATCAGAGAACTCACACAGGGGAGAAACCCTATGAATGTA920GTGAATGTGGGAAAACATTTCGTGTAAAGATATCCCTTAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。