基因總覽
ZNF155 是一種由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其序列包含 N 端 KRAB 區域,以及多個 C2H2-type zinc finger;這些結構特徵構成其蛋白質的主要架構。現有資料將其可能角色概述為參與轉錄調控,但未提供更具體的調控對象或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000270014 ★ | 43,984,188–43,998,326 | 5 |
| ENST00000590411 | 43,967,862–43,996,129 | 5 |
| ENST00000611002 | 43,984,170–43,998,326 | 5 |
| ENST00000851204 | 43,984,179–43,998,326 | 6 |
| ENST00000968381 | 43,984,179–43,998,326 | 6 |
| ENST00000968382 | 43,984,179–43,998,326 | 5 |
| ENST00001140821 | 43,984,179–43,998,326 | 5 |
| ENST00000591532 | 43,984,191–43,996,307 | 5 |
| ENST00000407951 | 43,984,194–43,998,326 | 6 |
| ENST00000590615 | 43,984,207–43,998,326 | 5 |
| ENST00000851203 | 43,984,207–43,998,326 | 6 |
| ENST00000932768 | 43,984,213–43,998,326 | 6 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料指出,ZNF155 可能參與轉錄調控。這項描述保留了推測性,表示目前來源僅支持其可能具有調節轉錄的角色,尚未說明它對哪些基因或轉錄過程發揮作用,也沒有指出調控方向。
來源未提供 ZNF155 如何影響轉錄的分子機制、涉及的生物學過程或實驗條件,因此無法進一步判定其作用是直接或間接,也不能據此推演特定細胞效應。可支持的功能概述限於其可能參與轉錄調控。
Promoter 與基因調控
>ZNF155 ENST00000270014 GRCh38 chr19:43983188-43984288 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGTTTTATGGAAGGTAGAATTTGTGAATGATATAATTGTTTATCTGAATTAATTTCTAATCAAAGTGTTG AAGTTGCTTGAATCATCTTGACTACCCGTAGTGAAAGGCACGAAGTGAGGAATGACTGAAATAATTATTA ATTAAAAGGGAAACAGAACTAAAATTTTTAAAAGTTTACAGCCTATCTACTTTGGAAAAAAAAAAAAACA GGAAACCTGAAGAATACAAGGGTATGGTTAAGCAACTAACTAATTCATGAATTTAGTATGGATTGGCCAT GTCAACTGAAGCCAGGACCTATTGTCCAAGACAATGGAAGAATGACCCCAAAGGCATTTCACAGATTATG GCAGCTTCTCCTCCCATCACAGGCCCAGAGTGCAAGGACCTGGGGGACAGAAAGGGCCTTTGATGCCAGA TATACCCTAATATATTAGGCACAGTTTCCTGCCTACTACGATTGAGCGTGTCAATAAATTTTTATCTCTT GGGAGGGCAGAACAGAGCAAGGATACAGCTGTAACTGGTTTAGAAATAGCAGTCACTCAATTTTCAGAGA AGTGTTCCTCATACTGTGGTTGGCACAGTCACTTTATCTAAAGAAAACCATGAAAAGTATTCTTTTTTAG TTTAGAAAAATTGATATAGAACATGAGACTCCATTTTTTTAAAATAAAAATATAGGTTGATAGGCCAGAA TTCACAGGTCCACCTGCCTGAGCCAAAATTCTCACGCCTCCACAGAGCAAATGGACTCCATTTCCCAAGA TACCAGCGAAACGCCTGCGGGAGTCTAATTGCCCGGTCGATGCGCAGGAAATTTGGCTCCCGCAGGCGTT TCGCGAGTAGCTTGGGAGGCGTGGGAATTTTGGCCCAGGCAGGAGGACCTGTGAATTCTGGGAAGTGGAG TCCATTTGCTCTGTGGAGTCGTGGGAACTTTGGCTCAGGCAGGCGGATTCGGGGGATTCTGGGAAGTGTA GTCCAGACGCCTGTGGCATCATCGACACTTCCGGTCTCCGAGCAGGACACTGCTACTTAACAAGGTGGTT TGAGCCAAGTATGTGTCTTGCGGGTCTTTGCGAAAGTGAACCAGTTATTAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF155_1 ↗ | 19:43,984,188 | 正股 | 43,984,139–43,984,198 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_BBPNF · promoter · 43983680–43984227 · regulatory
ENSR19_BBPNH · enhancer · 43984228–43985022 · regulatory
· motif · 43983860–43983871 · motif
· motif · 43984193–43984202 · motif
· motif · 43984193–43984204 · motif
· motif · 43984193–43984204 · motif
· motif · 43984724–43984735 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:538 aa
ZNF155 蛋白質長 538 個胺基酸,N 端第 8–78 位有 KRAB 結構域。序列中另註解出 12 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 176–506 位;其中第 12 個被標示為 degenerate。蛋白質家族歸屬為 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ZNF155 的細胞內定位標示為細胞核;未提供定位變化條件、異構型差異或動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- CCNDBP1O95273 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-6P60371 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MDFIQ99750 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-9P60411 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ATCGACACTTCCGGTCTCCGAGCAGGACACTGCTACTTAA40CAAGGTGGTTTGAGCCAAACTGTGGCACGTTTCAGGCAGG80ATTCCTCCTTCATTCAAACTGCATCACCCAGGAGTCTGCA120AATTCCCCAAAGTAGGAGGAAAAATGACCACATTCAAGGA160GGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAG200GAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGT240ACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTC280AGTGGGGCATCAACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTC320CTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCC360AAAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTT400GGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTCC440TGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCA480GGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGTTCTTTGA520AAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCC560ACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCCCAGGGTGGGAAGT600GTAAACAGTCCATCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCC640TCAGCAGTTATACTCAGAAGAGAAGTCTTATACATGTGAT680GAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATG720TTCATCAGAGAGTCCACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTG760TGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTG800CAAACTCATCAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCA840AATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGC880ACTTAATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGAGAAACCT920TACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATGATT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。