演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF155pHZ-96

zinc finger protein 155

ZNF155(zinc finger protein 155)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 的蛋白質,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19q13.31UniProt Q12901
OFFICIAL SYMBOL
ZNF155
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q12901
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF155 是一種由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其序列包含 N 端 KRAB 區域,以及多個 C2H2-type zinc finger;這些結構特徵構成其蛋白質的主要架構。現有資料將其可能角色概述為參與轉錄調控,但未提供更具體的調控對象或作用方式。

Official symbol
ZNF155
Gene name
zinc finger protein 155
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12940
UniProt
Q12901
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
pHZ-96

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.31
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF155pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:43,967,862–43,998,326
Gene span
30,465 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000270014 ★43,984,188–43,998,3265
ENST0000059041143,967,862–43,996,1295
ENST0000061100243,984,170–43,998,3265
ENST0000085120443,984,179–43,998,3266
ENST0000096838143,984,179–43,998,3266
ENST0000096838243,984,179–43,998,3265
ENST0000114082143,984,179–43,998,3265
ENST0000059153243,984,191–43,996,3075
ENST0000040795143,984,194–43,998,3266
ENST0000059061543,984,207–43,998,3265
ENST0000085120343,984,207–43,998,3266
ENST0000093276843,984,213–43,998,3266

顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有資料指出,ZNF155 可能參與轉錄調控。這項描述保留了推測性,表示目前來源僅支持其可能具有調節轉錄的角色,尚未說明它對哪些基因或轉錄過程發揮作用,也沒有指出調控方向。

來源未提供 ZNF155 如何影響轉錄的分子機制、涉及的生物學過程或實驗條件,因此無法進一步判定其作用是直接或間接,也不能據此推演特定細胞效應。可支持的功能概述限於其可能參與轉錄調控。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 43984188 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF155 ENST00000270014 GRCh38 chr19:43983188-43984288 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGTTTTATGGAAGGTAGAATTTGTGAATGATATAATTGTTTATCTGAATTAATTTCTAATCAAAGTGTTG
AAGTTGCTTGAATCATCTTGACTACCCGTAGTGAAAGGCACGAAGTGAGGAATGACTGAAATAATTATTA
ATTAAAAGGGAAACAGAACTAAAATTTTTAAAAGTTTACAGCCTATCTACTTTGGAAAAAAAAAAAAACA
GGAAACCTGAAGAATACAAGGGTATGGTTAAGCAACTAACTAATTCATGAATTTAGTATGGATTGGCCAT
GTCAACTGAAGCCAGGACCTATTGTCCAAGACAATGGAAGAATGACCCCAAAGGCATTTCACAGATTATG
GCAGCTTCTCCTCCCATCACAGGCCCAGAGTGCAAGGACCTGGGGGACAGAAAGGGCCTTTGATGCCAGA
TATACCCTAATATATTAGGCACAGTTTCCTGCCTACTACGATTGAGCGTGTCAATAAATTTTTATCTCTT
GGGAGGGCAGAACAGAGCAAGGATACAGCTGTAACTGGTTTAGAAATAGCAGTCACTCAATTTTCAGAGA
AGTGTTCCTCATACTGTGGTTGGCACAGTCACTTTATCTAAAGAAAACCATGAAAAGTATTCTTTTTTAG
TTTAGAAAAATTGATATAGAACATGAGACTCCATTTTTTTAAAATAAAAATATAGGTTGATAGGCCAGAA
TTCACAGGTCCACCTGCCTGAGCCAAAATTCTCACGCCTCCACAGAGCAAATGGACTCCATTTCCCAAGA
TACCAGCGAAACGCCTGCGGGAGTCTAATTGCCCGGTCGATGCGCAGGAAATTTGGCTCCCGCAGGCGTT
TCGCGAGTAGCTTGGGAGGCGTGGGAATTTTGGCCCAGGCAGGAGGACCTGTGAATTCTGGGAAGTGGAG
TCCATTTGCTCTGTGGAGTCGTGGGAACTTTGGCTCAGGCAGGCGGATTCGGGGGATTCTGGGAAGTGTA
GTCCAGACGCCTGTGGCATCATCGACACTTCCGGTCTCCGAGCAGGACACTGCTACTTAACAAGGTGGTT
TGAGCCAAGTATGTGTCTTGCGGGTCTTTGCGAAAGTGAACCAGTTATTAG
ZNF155 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF155_1 ↗19:43,984,188正股43,984,139–43,984,198

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BBPNF · promoter · 43983680–43984227 · regulatory

ENSR19_BBPNH · enhancer · 43984228–43985022 · regulatory

· motif · 43983860–43983871 · motif

· motif · 43984193–43984202 · motif

· motif · 43984193–43984204 · motif

· motif · 43984193–43984204 · motif

· motif · 43984724–43984735 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:538 aa

1 aa538 aa結構域鋅指
依 Q12901 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF155 蛋白質長 538 個胺基酸,N 端第 8–78 位有 KRAB 結構域。序列中另註解出 12 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 176–506 位;其中第 12 個被標示為 degenerate。蛋白質家族歸屬為 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。

結構域KRAB8–78 aa
鋅指C2H2-type 1176–198 aa
鋅指C2H2-type 2204–226 aa
鋅指C2H2-type 3232–254 aa
鋅指C2H2-type 4260–282 aa
鋅指C2H2-type 5288–310 aa
鋅指C2H2-type 6316–338 aa
鋅指C2H2-type 7344–366 aa
鋅指C2H2-type 8372–394 aa
鋅指C2H2-type 9400–422 aa
鋅指C2H2-type 10428–450 aa
鋅指C2H2-type 11456–478 aa
鋅指C2H2-type 12; degenerate484–506 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q12901…

AlphaFold · Q12901

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

資料將 ZNF155 的細胞內定位標示為細胞核;未提供定位變化條件、異構型差異或動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 6 個夥伴 · 最多顯示 50 個
pHZ-96ZNF155CCNDBP1GOLGA6L9KRTAP10-6MDFIKRTAP10-7KRTAP10-9
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF155 可能參與轉錄調控;來源以可能性描述其功能,未提供具體調控對象、作用方向或分子機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF155 的細胞內定位標示為細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000270014 · 2,612 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATCGACACTTCCGGTCTCCGAGCAGGACACTGCTACTTAA40
41CAAGGTGGTTTGAGCCAAACTGTGGCACGTTTCAGGCAGG80
81ATTCCTCCTTCATTCAAACTGCATCACCCAGGAGTCTGCA120
121AATTCCCCAAAGTAGGAGGAAAAATGACCACATTCAAGGA160
161GGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAG200
201GAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGT240
241ACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTC280
281AGTGGGGCATCAACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTC320
321CTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCC360
361AAAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTT400
401GGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTCC440
441TGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCA480
481GGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGTTCTTTGA520
521AAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCC560
561ACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCCCAGGGTGGGAAGT600
601GTAAACAGTCCATCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCC640
641TCAGCAGTTATACTCAGAAGAGAAGTCTTATACATGTGAT680
681GAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATG720
721TTCATCAGAGAGTCCACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTG760
761TGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTG800
801CAAACTCATCAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCA840
841AATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGC880
881ACTTAATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGAGAAACCT920
921TACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATGATT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。