基因總覽
ZNF154 是位於人類第 19 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 154。其蛋白質產物屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族,序列包含 KRAB 區域及多個 C2H2 型鋅指,其中部分鋅指被註記為退化型。現有功能描述指出,ZNF154 可能參與轉錄調控;此描述為可能性,未進一步界定其調控對象或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000684351 ★ | 57,696,275–57,709,204 | 3 |
| ENST00001142128 | 57,696,275–57,709,215 | 3 |
| ENST00000512439 | 57,697,367–57,709,215 | 4 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF154 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。這表示其可能與基因轉錄活動的調節有關,但目前提供的資訊未說明它促進或抑制轉錄,也未指出受調控的基因或轉錄因子。因此,不能據此確定其調控方向、作用對象或具體分子機制。
此功能描述以「可能參與」表達,應視為尚未明確界定的功能關聯,而非已確立的特定調控作用。現有資料也沒有提供相關生物過程、實驗系統、條件或功能結果,無法進一步說明 ZNF154 在何種情境下參與轉錄調控,或該作用對細胞活動有何影響。
Promoter 與基因調控
>ZNF154 ENST00000684351 GRCh38 chr19:57709104-57710204 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAATAATTGACTATGCAGGCAAAAGATGTTTTCTGTTGGAATCAGACAGAATTCTACCTTTGTACTACTG TTTCAAGGTGATCTAACATTTCTCTTCTATCTTCTAGAAGCACTATCATGCCACTATCTGAAGTAGTTTT TCACCTGTCCCTGACCAAAAGTGCACAGACTGACTTCAATGCTTCGGAGTGCATACATTTGAAATGTAAT ATGATAGAGGCTGGGTACGGTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCGAGGCGGGCAGATC ACCTGGGGCCAGGAATTTGGGACCACCATAGTGAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAAATTAGCCT GGCGTGGTGGCGCGCGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGAAGGTTGAGGCACGAGAATCGATTAACCCGGGA GGCGGAGGTTGCAGTGATCCCAGATGGCGCCGCTGCACTCCAGCCTGGGGGACAGAGGGAAACTTTGTCT TAAAAAAAAAAAAAAAGGAATAAACTTATATGGTAATGTTTATTAGCTTCCCTACTAGTGGATATATTTC GTGTCTGAATGGCTCTATGGAATGATGTACATATTTGGATTGGCAGCCTTAGGGAGCGTCTGATAATAAT TTTAGCCTCTGGGAGCCTGCTGAACTTTATGAAGTTTGAAATAATATTCCCCAAACACTTGGGTGATCAG TTGCAGATGGCACCTCTAATATGCTGTCTGATTACGACCCATTTAAGAAAGGGCGAAGTCCCTCCACTGC CCTAGGACTTGGATAAGCCATTTCTCATCGCCCAGCGCCCTGGAGCTTCGCTTTTACTCCAAGAGGTTGG TGCAAAGGGTCCCCGGCACCCACCTCGGGATCTATGAAAACTACATTACCTAGAATGCTCTGCGTTGAAC GCCACGCTACTAAGCCAGTAAGAGCTCAGAAAACCGACTTTCCTTGAGAGTCACAAAAAGAAAGGACGGG ACTTTTGGGGGGGCCTCTTCGTGGCGGCCATTTTAGCTTCTCTGAGGTGTGTTCACCGGATCAGAGATAG CAGAGCGCCGAGTTGGGGCCACGAAGGCGTGAGGGGAGTCGTCGTCCCTCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF154_1 ↗ | 19:57,709,204 | 負股 | 57,709,194–57,709,253 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_BFG84 · enhancer · 57708543–57709157 · regulatory
ENSR19_9SWGB · promoter · 57709158–57709663 · regulatory
· motif · 57706368–57706379 · motif
· motif · 57706547–57706561 · motif
· motif · 57706547–57706561 · motif
· motif · 57708594–57708604 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:437 aa
zinc finger protein 154 長 437 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。蛋白質含有位於第 14–88 位的 KRAB 區域,以及 12 個 C2H2 型鋅指;其中前兩個被註記為退化型。第 110–129 位另標示為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF154 的定位資料將其標示於細胞核;來源未提供其他定位條件、變化或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GTGGCGGCCATTTTAGCTTCTCTGAGGTGTGTTCACCGGA40TCAGAGATAGCAGAGCGCCGAGTTGGGGCCACGAAGGCGT80GAGGGGAGTCGTCGTCCCTCCTGCACGAAAGCGTCTAAGC120CTTGGCGACGCCGCCCTGGGGGACCCACGTCAGGCCTGGG160ATAGGGACCGCTGTCCCCGGGTCCCTACCAATGTCGCCCG200TCGCTCCCGGCCCAGCTCTACCCGCAGAGTCTGATGGCAG240CGGCCACTCTGAGGACGCCAACTCAGGGCACTGTGACCTT280TGAAGATGTGGCCGTACACTTCTCCTGGGAGGAATGGGGT320CTCCTTGATGAGGCTCAAAGATGCCTGTACCGTGATGTGA360TGCTGGAGAACTTGGCTCTTTTAACCTCTCTAGATGTTCA400TCATCAGAAGCAGCACCTTGGAGAAAAACATTTCAGAAGC440AATGTGGGCAGAGCCTTGTTTGTGAAGACCTGCACATTCC480ATGTGTCAGGGGAGCCTTCCACCTGCAGAGAAGTTGGGAA520GGACTTCCTGGCCAAGTTGGGATTTCTCCATCAACAGGCT560GCTCACACTGGGGAGCAATCAAATAGCAAAAGCGACGGTG600GGGCCATCAGTCACAGAGGAAAAACTCATTACAACTGTGG640AGAACACACAAAAGCATTCAGCGGTAAACACACACTTGTT680CAGCAGCAGAGAACCCTCACTACAGAAAGATGTTACATAT720GCAGTGAATGTGGGAAATCCTTTAGCAAAAGCTACAGTCT760CAATGACCATTGGAGACTTCACACTGGAGAAAAGCCTTAT800GAATGTCGAGAGTGTGGGAAGTCCTTTAGGCAAAGCTCTA840GTCTCATTCAGCACCGGAGAGTTCACACTGCAGTACGACC880TCATGAATGTGATGAATGTGGAAAATTATTTAGCAACAAG920TCTAACCTCATTAAACATCGGAGAGTTCACACTGGGGAAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。