基因總覽
ZNF143（zinc finger protein 143）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 GLI C2H2-type zinc-finger protein family。這類蛋白質具有鋅指結構；ZNF143 的蛋白質序列中包含多個 C2H2-type zinc finger，與其辨識 DNA 的特性相符。ZNF143 的主要角色是轉錄調控，可作用於 RNA polymerase II 與 RNA polymerase III 所轉錄的基因。其調控範圍包括不同類型的 RNA 與蛋白質編碼基因，並涉及粒線體相關基因的表現。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000396602 ★ | 9,461,012–9,528,524 | 16 |
| ENST00000531943 | 9,460,319–9,478,424 | 6 |
| ENST00000396604 | 9,460,522–9,529,155 | 16 |
| ENST00000396597 | 9,460,975–9,529,155 | 15 |
| ENST00000299606 | 9,460,975–9,529,155 | 15 |
| ENST00000871182 | 9,460,975–9,529,155 | 15 |
| ENST00000871185 | 9,460,975–9,529,155 | 15 |
| ENST00000871186 | 9,460,975–9,529,155 | 16 |
| ENST00000871187 | 9,460,975–9,529,155 | 15 |
| ENST00000871188 | 9,460,975–9,529,155 | 14 |
| ENST00000934537 | 9,460,975–9,529,155 | 15 |
| ENST00000934538 | 9,460,975–9,529,155 | 16 |
顯示 12/48 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF143 是轉錄因子，能辨識並結合 Staf-binding site（SBS），這是一種存在於數千個啟動子中的共識 DNA 結合基序。藉由辨識此序列，ZNF143 可活化 RNA polymerase II 與 RNA polymerase III 所轉錄基因的表現。
其調控對象包含多種 RNA。ZNF143 可活化 selenocysteine tRNA（tRNAsec）基因，也能促進由 RNA polymerase II 或 III 轉錄的小核 RNA（snRNA）表現；此外，來源亦指出它可活化 mRNA 的表現。
依相似性註記，ZNF143 會特定促進一部分由細胞核編碼的粒線體基因表現，藉此調控粒線體功能。來源並指出，ZNF143 對維持粒線體活性是必要的；其促進細胞增殖與分化的調控角色，與上述粒線體基因表現有關。
依相似性註記，ZNF143 也參與胚胎幹細胞的維持，可能透過促進 POU5F1/OCT4 與啟動子的結合，進而帶動 NANOG 表現。此處的胚胎幹細胞相關作用屬於相似性推論。
Promoter 與基因調控
>ZNF143 ENST00000396602 GRCh38 chr11:9460012-9461112 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAAAGGGCTGGGTTAAGAGCTACAAGAAGCATTAACCGCAACGGCCACAACTAATTTGTATCCATTCTTA GTAACTTTAGGGAACCAGACTGAATGCTTCTCCCACCCTTTTGACTTTCCTTTATTAGTTCGCAACACAA GAACATACAAAAGACCGTAGCGACAACCATTTCTGACGCCTTCAACTTTTAAATCCAAATTACGTGAAAC CACAAAGCATCAGTGGTGTCTCCCCGAGGAATCCAAGACCCCCCGGCCGGTTGCCAAGCCGCCGGAATTT CAGCAGGAGAGGAAGGCTCACCCTCCCACCGCATGGCGATGCCCGGGAGACTGGAGAAGCTCAGGCAGGC TTGGAAGCCAATCCCCGGCATACAGCAGCTCTCGGGAATGCAGAGCCCTAGAGCAAGACCAAGGGCCTCG GCCGACACTGAGAGCCTCCAGGGAGAGGTCAGGTCTCTCTTTCTGTCCTATTTCTCCCTTCGACTTCCCT CCCAGCAGGCTGCTATTGAGCATTCAGCAATCGCCAGACAAAGCCCTTCTGGTCTGCAGAACGCACTCCG GCAAGCCCACCGGGAGAACCAAAGCCGCCTCCTCGCCCCTGTGGGGAAAATGGCGCTCGTCACCCCGGCT CCCTCCCGGGTAATCACAAGGACCAGCCTCCCTCCCTCGCTACAAAATGGCGCCTCCCGCTGGGGCCCCA GAATCGGTATGACTCGCTAGTCAGTGAGGCGGGGTCCGTCTGGGATAAGCGGTTATGTCAACCAGTCAGA CACAGGAGCTTTGATTCTGCACTTTGCGCGAGCCACTCAGGGGCGGGCTGTAAAGTCAGGCTTGGCTGAC GTCAGTTGAGTGGGCGCGGCTAGGGCGGTTTTCTTTCGCGTCGACCAAACGTGGGCCAATGGAAAACCGG AAGCGTCCTGTGAGTGATGTAATGACAGCCCAATGGAAGCTGGGGGCGGGCCTCAGACACACTATGCGGG TTGCGGGGCCTGGGGGCCGGACGGCTGTTTCCTGTCCTGGTGCATGGTGGTCGGACGAAGGAATTGTTGG AAAATTTTCTCGGAGGTTCGTATATAAATGTGTTTTTACCCAGTGTGCATT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF143_1 ↗ | 11:9,461,012 | 正股 | 9,460,963–9,461,022 |
| ZNF143_2 ↗ | 11:9,461,113 | 正股 | 9,461,064–9,461,123 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_95QDC · promoter · 9460032–9460532 · regulatory
ENSR11_89HQW · enhancer · 9460533–9460691 · regulatory
ENSR11_95QDH · promoter · 9460692–9461033 · regulatory
ENSR11_CXCG · enhancer · 9461034–9462565 · regulatory
ENSR11_5484B8 · CTCF_binding_site · 9461274–9461295 · regulatory
ENSR11_95QF8 · enhancer · 9463123–9463485 · regulatory
· motif · 9459639–9459648 · motif
· motif · 9460044–9460052 · motif
· motif · 9460044–9460061 · motif
· motif · 9460218–9460226 · motif
· motif · 9460218–9460233 · motif
· motif · 9460240–9460253 · motif
· motif · 9460444–9460457 · motif
· motif · 9460444–9460457 · motif
· motif · 9460619–9460629 · motif
· motif · 9460686–9460696 · motif
· motif · 9460749–9460766 · motif
· motif · 9460820–9460830 · motif
· motif · 9460845–9460858 · motif
· motif · 9460845–9460858 · motif
· motif · 9460861–9460871 · motif
· motif · 9460865–9460882 · motif
· motif · 9460915–9460926 · motif
· motif · 9460915–9460926 · motif
· motif · 9460917–9460926 · motif
· motif · 9460963–9460973 · motif
· motif · 9460985–9461000 · motif
· motif · 9461255–9461266 · motif
· motif · 9461276–9461292 · motif
· motif · 9461311–9461321 · motif
· motif · 9461434–9461441 · motif
· motif · 9461589–9461605 · motif
· motif · 9461651–9461668 · motif
· motif · 9462337–9462359 · motif
· motif · 9462337–9462359 · motif
· motif · 9462464–9462479 · motif
· motif · 9462546–9462559 · motif
· motif · 9462597–9462612 · motif
· motif · 9462656–9462668 · motif
· motif · 9462658–9462665 · motif
· motif · 9462658–9462673 · motif
· motif · 9463116–9463127 · motif
· motif · 9463276–9463289 · motif
· motif · 9463276–9463289 · motif
· motif · 9463305–9463316 · motif
· motif · 9463309–9463323 · motif
· motif · 9463312–9463320 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：638 aa
ZNF143 蛋白質長 638 個胺基酸，屬於 GLI C2H2-type zinc-finger protein family。序列中註記有七個 C2H2-type zinc finger，位置依序為第 237–261、267–291、297–321、327–351、357–381、387–411 與 417–440 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF143 位於細胞核，並可定位於染色質及染色體。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 21 個夥伴
- EAF1Q96JC9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ENKD1Q9H0I2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EXOSC1Q9Y3B2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM90A1Q86YD7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FHL2Q14192 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- GFAPP14136 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- IL16Q14005-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IQUBQ8NA54 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LIN54Q6MZP7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO1P25800 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO3Q8TAP4-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NUDT22Q9BRQ3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- POGZQ7Z3K3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SNRPBP14678-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPANXN3Q5MJ09 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SUOXP51687 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TAB2Q9NYJ8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TCAF1Q9Y4C2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YJU2Q9BW85 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF438Q7Z4V0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF512BQ96KM6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ZNF143 與 CHD8 有互作，並可與 HCFC1、THAP11 形成複合體。依相似性註記，ZNF143 也與 POU5F1/OCT4 互作；此功能關係涉及促進 POU5F1/OCT4 結合至啟動子。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF143 是轉錄因子，可活化 RNA polymerase II 與 III 所轉錄基因，並辨識存在於許多啟動子中的 Staf-binding site（SBS）。其調控對象包括 tRNAsec、snRNA、mRNA，以及一部分細胞核編碼的粒線體基因；後者與粒線體功能、細胞增殖及分化相關。依相似性註記，它也參與胚胎幹細胞維持，可能促進 POU5F1/OCT4 結合啟動子並帶動 NANOG 表現。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription factor that activates expression of genes transcribed by both RNA polymerases II and III, and which is required to safeguard mitochondrial activity. Specifically recognizes and binds the Staf-binding site (SBS), a consensus DNA-binding motif present in thousands of promoters. Activates the gene for selenocysteine tRNA (tRNAsec). Activates expression of small nuclear RNA (snRNA) transcribed by RNA polymerases II and III. Also activates expression of mRNAs and acts as a key regulator of cell proliferation and differentiation by specifically activating expression of a subset of nuclear-encoded mitochondrial genes, thereby controlling mitochondrial function (By similarity). Involved in the maintenance of embryonic stem cells by promoting association of POU5F1/OCT4 to promoters, leading to NANOG expression (By similarity) PMID 10893243 ↗ · PMID 14702349 ↗ · PMID 17092945 ↗ · PMID 17938208 ↗ · PMID 21177654 ↗ · PMID 23152058 ↗ · PMID 23408857 ↗ · PMID 26416877 ↗ · PMID 39708803 ↗ · PMID 9705341 ↗ · PMID 9776743 ↗ |
| 交互作用 | ZNF143 與 CHD8 互作，並與 HCFC1、THAP11 形成複合體。依相似性註記，ZNF143 也與 POU5F1/OCT4 互作，並促進 POU5F1/OCT4 結合至啟動子。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with CHD8. Forms a complex with HCFC1 and THAP11. Interacts with POU5F1/OCT4; promoting POU5F1/OCT4-binding to promoters (By similarity) PMID 17938208 ↗ · PMID 26416877 ↗ |
| 細胞定位 | ZNF143 定位於細胞核、染色體，並位於染色質。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACGGCTGTTTCCTGTCCTGGTGCATGGTGGTCGGACGAAG40GAATTGTTGGAAAATTTTCTCGGAGGTAGAAGATGTTGTT80AGCCCAAATAAATCGAGATTCTCAGGGAATGACAGAGTTT120CCTGGAGGAGGGATGGAGGCGCAACATGTTACGCTGTGCT160TGACAGAGGCAGTCACCGTGGCAGATGGTGACAACTTAGA200AAATATGGAAGGCGTAAGCTTGCAAGCAGTAACACTTGCA240GATGGTTCTACTGCTTACATACAACACAATTCTAAAGATG280CAAAACTCATAGATGGCCAGGTCATTCAGTTGGAAGATGG320TTCTGCGGCCTATGTTCAACATGTACCCATACCTAAAAGT360ACAGGGGACAGTTTGCGTCTAGAGGATGGTCAAGCAGTAC400AGTTAGAAGATGGTACCACAGCATTTATTCACCACACCTC440CAAAGATAGTTATGACCAGAGTGCATTACAGGCGGTTCAG480CTGGAAGATGGTACCACAGCTTATATCCACCATGCAGTGC520AAGTCCCGCAGTCTGACACCATCTTGGCAATTCAGGCTGA560TGGGACAGTGGCAGGTCTGCACACTGGGGATGCTACAATT600GACCCTGACACCATCAGTGCTTTGGAACAGTATGCAGCAA640AGGTGTCCATTGATGGAAGTGAAAGTGTAGCAGGTACTGG680AATGATTGGAGAAAATGAGCAAGAGAAAAAAATGCAGATT720GTTTTACAAGGACATGCTACAAGAGTAACTGCTAAATCTC760AACAGAGTGGAGAGAAGGCATTTCGATGTGAATATGATGG800ATGTGGAAAATTATATACAACAGCTCATCATCTCAAGGTC840CATGAGAGGTCACACACAGGAGATCGGCCTTATCAGTGTG880AGCATGCAGGCTGTGGGAAGGCATTTGCAACAGGTTATGG920ATTAAAAAGTCACGTCAGAACTCATACAGGAGAAAAGCCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。