演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF142KIAA0236

zinc finger protein 142

ZNF142(zinc finger protein 142)是 Krüppel C2H2 型鋅指蛋白家族成員,可能參與轉錄調控,蛋白質包含多個鋅指區域。

Homo sapiens2q35UniProt P52746
OFFICIAL SYMBOL
ZNF142
CHROMOSOME
2
UNIPROT
P52746
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF142 是蛋白質編碼基因,產物為 zinc finger protein 142,屬於 Krüppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其蛋白質長 1,687 個胺基酸,具有大量鋅指區域,這些結構特徵是辨識此蛋白質的重要線索。現有資料將它的主要角色概括為可能參與轉錄調控;但未提供更詳細的分子作用方式或調控對象,因此不宜據此推定特定靶基因或作用機制。

Official symbol
ZNF142
Gene name
zinc finger protein 142
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12927
UniProt
P52746
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KIAA0236pHZ-49

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q35
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegZNF142pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr2:218,633,329–218,659,655
Gene span
26,327 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000411696 ★218,633,329–218,659,62311
ENST00000449707218,633,329–218,659,64110
ENST00000906832218,633,329–218,659,64110
ENST00000906833218,633,329–218,659,6239
ENST00000906834218,633,329–218,659,64111
ENST00000906835218,633,329–218,659,64110
ENST00000906836218,633,329–218,659,6238
ENST00000440934218,643,920–218,659,5398
ENST00001108606218,655,469–218,659,4422
ENST00001113819218,655,469–218,659,6414
ENST00000450560218,656,350–218,659,4763

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有註釋指出,zinc finger protein 142 可能參與轉錄調控。這表示它可能與控制基因轉錄的過程相關,但資料並未說明它在此過程中的確切位置,也沒有指出它是促進或抑制轉錄。因此,不能將其角色進一步限定為特定方向的調控因子。

來源未提供可能的作用靶點、分子互作、調控條件或實驗系統等細節,也未說明這項功能涉及哪些細胞或生物學過程。故目前能支持的功能描述僅限於「可能參與轉錄調控」;更具體的作用方式與生物學意義仍無法由這筆註釋判定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 218659623 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF142 ENST00000411696 GRCh38 chr2:218659523-218660623 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGGGTCCATTGGCTGCAGTCAGCAAGGGAGAAGCGTCCGTTGACTTGTCAGTAACCCTATGTCTTGTTA
TGAGTAATGTCCTTCAAATATCCTCCCCCTTACGTCCCCAATATTTAACGTCTTGTTTAGACCTTTATTA
CCTCCCACCTAAACTGTCTTTAAAATCGTAGTTCTTGAAATGGCATTTTAATAGGTCTTCACCTCCTGCT
TCACGGAACATCTACACAAGGGTCCAGATCTTTCATCATAGGGATCAGCTCCAATACCATATCTCTCTCT
GCTCCAGCACCTTCAATGGCTGGCTCCCAGCAGACCCCTGAATTGGGTATAAACTCAGCCTGGTACTCAA
GGCTCTCTACAATACGGCGCCCACCTACCTTTCATGGATTAGCTCCTAACACTACCTGTTTAGCAAATAT
GCAAATACGCAACAAATATGTTCAACAAGTAAGCAACCTCCCAACTCCTTGCTCATGCAGTGCTCTTGGC
TCGGAATGCCCGTTCTTTTCTCCCTCATTCTCCCCAAATGAAAATCTGCCCATCTGCTACTTTCTCCACG
GATCGTCACATCGTAGACAATAAGATCCTGAGGGACAAGAGCAAAGTTGTTTCTAGTACACCTCTCCTCC
AACCCCGAACCCCGGCCACTTTGCCCTGCGCCTGGCATGCAGGGAGGTGAGCTGACAGCAGTGACCTCGG
CTGAGCCTCAGAACTGGGATCCAGAATTCCAAAACACCTATGCATGGAAGGCCACAGACAAAGCTCTCCC
GTCCCCGGCCCCTCCGCGACACCCAGGAACCCCCTCCTGAACCTCGCCCACACCCCAGCTCGCGCCTCCA
GCCACATGGTTTGGGGTAACCCGTCACTCAGCCCTCTCACCGCCGTGACTCTCTGGCCCTCCGTCTCGAT
GGTTTCACCGCGCCTGCACCTTGGGGAAGCTGCGTTCGGCCCCGCCCCGGGTCCTTTCATCTACTTCCCG
CCACACCCACAGAGAAGCCCACGCCACTCTACCCCAGAGCTCTCGATGGTGCTTCTCCGGCTTCAGGGCT
GGAGTGGGGGTGGAGGGCGGGAAAAACCACAGAGACAAAACATAGAGTACC
ZNF142 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF142_1 ↗2:218,659,608負股218,659,598–218,659,657

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_B3LDMN · enhancer · 218658521–218659513 · regulatory

ENSR2_957RBK · promoter · 218659514–218659782 · regulatory

ENSR2_B3LDMT · enhancer · 218659783–218660411 · regulatory

· motif · 218659533–218659550 · motif

· motif · 218659542–218659550 · motif

· motif · 218659560–218659573 · motif

· motif · 218659617–218659630 · motif

· motif · 218659632–218659649 · motif

· motif · 218659639–218659650 · motif

· motif · 218659765–218659780 · motif

· motif · 218659798–218659811 · motif

· motif · 218660195–218660208 · motif

· motif · 218660546–218660554 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1687 aa

1 aa1687 aa功能區域鋅指
依 P52746 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 142 長 1,687 個胺基酸,屬於 Krüppel C2H2 型鋅指蛋白家族。蛋白質註釋列出 31 個 C2H2 型鋅指,其中第 4 個標示為非典型型態。序列中另有多段註釋為無序區域,分布於蛋白質不同位置。

鋅指C2H2-type 1163–185 aa
鋅指C2H2-type 2219–242 aa
鋅指C2H2-type 3253–275 aa
鋅指C2H2-type 4; atypical286–311 aa
鋅指C2H2-type 5316–340 aa
鋅指C2H2-type 6343–366 aa
鋅指C2H2-type 7372–395 aa
鋅指C2H2-type 8401–423 aa
鋅指C2H2-type 9429–451 aa
鋅指C2H2-type 10457–479 aa
鋅指C2H2-type 11485–507 aa
鋅指C2H2-type 12512–536 aa
鋅指C2H2-type 13544–567 aa
鋅指C2H2-type 14573–596 aa
鋅指C2H2-type 151135–1158 aa
鋅指C2H2-type 161171–1194 aa
鋅指C2H2-type 171200–1222 aa
鋅指C2H2-type 181228–1251 aa
鋅指C2H2-type 191257–1280 aa
鋅指C2H2-type 201286–1309 aa
鋅指C2H2-type 211328–1351 aa
鋅指C2H2-type 221354–1377 aa
鋅指C2H2-type 231380–1403 aa
鋅指C2H2-type 241424–1446 aa
鋅指C2H2-type 251452–1474 aa
鋅指C2H2-type 261480–1502 aa
鋅指C2H2-type 271508–1530 aa
鋅指C2H2-type 281536–1559 aa
鋅指C2H2-type 291565–1587 aa
鋅指C2H2-type 301593–1615 aa
鋅指C2H2-type 311621–1643 aa
功能區域Disordered1–23 aa
功能區域Disordered83–150 aa
功能區域Disordered613–690 aa
功能區域Disordered704–798 aa
功能區域Disordered897–935 aa
功能區域Disordered947–1014 aa
功能區域Disordered1052–1092 aa
功能區域Disordered1638–1687 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P52746…

AlphaFold · P52746

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

zinc finger protein 142 的定位註釋為細胞核;來源未提供定位改變條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KIAA0236ZNF142
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

ZNF142 相關變異被指出會造成一種自體隱性神經發育疾病,特徵包括整體發展遲緩、智力發展受損、延遲學會行走、言語不佳或缺失,以及伴隨肌張力不全、顫抖、共濟失調或舞蹈症的過度動作障礙。部分患者會出現癲癇。資料描述的是影響該基因的變異與此疾病的關係。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF142 的蛋白質產物可能參與轉錄調控;此註釋未進一步說明調控方向、作用對象或具體分子機制。推論支持
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位zinc finger protein 142 的細胞內定位註釋為細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 ZNF142 的變異與一種自體隱性神經發育疾病有關。患者可有整體發展遲緩、智力發展受損、延遲行走、言語不佳或缺失,以及伴隨肌張力不全、顫抖、共濟失調或舞蹈症的過度動作障礙;部分患者也會發生癲癇。含實驗來源
證據與來源

Neurodevelopmental disorder with impaired speech and hyperkinetic movements NEDISHM An autosomal recessive disorder characterized by global developmental delay, impaired intellectual development, delayed walking, poor or absent speech, and a hyperkinetic movement disorder with dystonia, tremor, ataxia, or chorea. Some patients develop seizures. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618425

PMID 31036918 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000411696 · 11,290 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACGCCACTCTACCCCAGAGCTCTCGATGGTGCTTCTCCGG40
41CTTCAGGGCTGGAGTGGGGGTGGAGGGCGGGAAAAACCAC80
81AGAGACAAAACATAGAGTACCCCGGCAGCCGGCAAGAGGA120
121AGAGAGAGTGGCTTCCACATCCCCAATATCCTAGAGGCGG160
161CTGAGCCGGAGGCGGTCGCACAAAGCGGGCCCCGGGGGCC200
201GTTCCAGCCGCGGCCGACCATAGAGATGCGGCTCCCGCCG240
241GCTCTGGGTCTGGAGCCTTCCAGGTTACAAACCGCCTTTC280
281CAGTTCGCTGGCTCTTATGATCCAGCTCCTGCCCGACGAT320
321GTGGACACTGTCATCACCTCCATTTTACAGATAGGAAAGC360
361TGAGGCCCAGAGAAGCGAAGCGACTGTGTCTGTCCAAGAC400
401CACGCGCCCTCCTGCCCGGAAGATAAGCGTATTTCTTCTC440
441TGGTGCCCACCTGTCTCCTACCTCACCCTGCCCTCCCGCA480
481GGTGAAGGTTCTTAATCTTGACGGCTCAGCGTCCTCCTTG520
521GCTCCCCCCGGAGGCCATGTATGGTCAAGCTTGAAGATTC560
561CCCAGAACAGCGATAATATTCACATTTAAGAAGCCAAAAC600
601ACACAAGTCGGTGGTGATGACAGACCCCCTTTTGGACTCA640
641CAGCCAGCCAGTAGCACCGGGGAGATGGATGGACTGTGCC680
681CTGAGCTATTGCTGATCCCCCCGCCTCTCTCTAACCGTGG720
721AATCCTGGGGCCTGTCCAGAGCCCCTGTCCTTCCCGGGAC760
761CCTGCACCTATACCTACTGAGCCAGGCTGCCTGCTGGTAG800
801AGGCCACAGCAACTGAAGAGGGACCAGGGAACATGGAGAT840
841CATTGTGGAGACAGTAGCTGGAACCCTGACCCCAGGTGCT880
881CCTGGAGAGACCCCAGGTGTCCTGGTAAAGGTGGTGGAGG920
921TGTACTTCTGTGAGCGCTGTGAACAGAGCTTCGCAGAGCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。