基因總覽
ZNF140 是一個蛋白質編碼基因,其產物為 zinc finger protein 140,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質序列包含 KRAB 區域及多個 C2H2-type zinc finger,呈現此蛋白質家族的結構特徵。現有資料指出,ZNF140 可能參與轉錄調控,並可能以抑制因子的方式發揮作用;相關作用仍以「可能」描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000355557 ★ | 133,080,923–133,107,428 | 5 |
| ENST00000880216 | 133,080,388–133,107,981 | 6 |
| ENST00000880217 | 133,080,388–133,107,981 | 5 |
| ENST00000999038 | 133,080,388–133,107,981 | 5 |
| ENST00000999040 | 133,080,388–133,107,981 | 6 |
| ENST00001127277 | 133,080,388–133,085,586 | 6 |
| ENST00001128293 | 133,080,388–133,084,309 | 5 |
| ENST00000880218 | 133,080,409–133,107,981 | 4 |
| ENST00001029693 | 133,080,409–133,107,981 | 4 |
| ENST00001128294 | 133,080,409–133,084,279 | 4 |
| ENST00000319849 | 133,080,442–133,107,981 | 6 |
| ENST00000440550 | 133,080,442–133,106,866 | 5 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF140 可能參與轉錄調控,並可能以抑制因子的方式作用。這表示它可能有助於降低或限制轉錄活動,但目前資料僅支持其可能具有此類角色,未進一步指出受調控的基因、作用位置或抑制效果如何產生,因此不宜將此描述延伸為已確立的特定調控機制。
這項功能資訊提供了對 ZNF140 生物學角色的概括方向:它可能參與調控基因轉錄,且作用傾向於抑制而非促進。然而,現有內容未說明這種調控發生的細胞或生理條件,也未提供實驗系統、干預方式或觀察指標,無法據此判定其作用對象、範圍與生物學後果。因而,ZNF140 的轉錄調控角色應保留為可能性,而非視為已確認的完整功能機制。
Promoter 與基因調控
>ZNF140 ENST00000355557 GRCh38 chr12:133079923-133081023 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGATCCAAGAACCCTCTCTTAGAGTCTGAGATCCGGACCCCTTTCCAGTAGCAAAAGGTCTTAGACTGAA GTACTGACTCCACAGTCGTTGTTAAGAATCCTAGTTGTTTAATAGAGGCGGTCTTGGGCTCTTGCTGGGC CGCGGTGTGTTCTGGGAAGTGTAGTCACCTGAGTCTCCAGTTCCTTGTCTCTGGGCCGTGTGTGCACGCC AGCGAAGCACTGTGGGAGTCGTAGTAGGGGAGGAAAACCCTATACCCTCTGGCGTGCGGCGCAGGAGTTT GGGGGAATGTAGTCGCCAGAGCTCTGCGTTGTCTTCCGGCTTTGGGCGTGGCCACGATGCACTCTGGGAG TCGTAGTAGGGGAAGAACGTCCTCCGCTCTTTTGCGCACGGTCGCTAGAGGTTCTGGGAAGTGTAGTTGC CTGAAGCTCGTGTTCTTTGTCTTTCGATGATGTGCGCTTGGCCTCAAAGCACCCTGGGAGTTGCAGTGGG GCGGGGAAAGCCATATGCTCTCTCGCGCGGGGTCGCGGTTGTTTCTGGGAAGTGTGGTGGCCTGAGTTCC ACGTTCTTCGTTTCTCCGCTAGTTGTGCGCTTGGCCGCGAGACACTCTGGCAGTTATAGGAACACAAAGG TCTGTGTACTCTTCCGCGGGGGGCCGCGGTTATTTCTGGGAAATGTAGTTGCCTAGGACCCGGGTTCTTT GTTTCTCGGCTCTGGGCGTGGGAGGATAGCCCCTATGCTCTGGCGCACCGGGCCGCGATGGCTCTGGGAA TTGTAGTTGTCGCAGGCCCTCGTTCTTTGTCTCCTGGCGTTCTGGGCACGGCAGCGAGGCGCTCTGGGAG TTCCAGTAGGAACGAAAAGCCCTTGCGCGCAGGGCCGCATTGGTTTCTGGGAATTGTAGTTTCTTGAGGC CGGCGGCCTGGTTGGGGTGACGTCGGCGAGGCTTCTGAAGACGCAATTCCTGCGACGCCCGCGGAGGGGC CCTGGGGGGCGGCGCCGAGCGTCTGGCCTGTGTTGGCTGTAGGCAACGAAAGGAGCCCTCCCGGTCTGCG CCGGATGGCCCCGGGCGGTGACTCGGTCCGGAGCCCTGGAACGCTACGCCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF140_1 ↗ | 12:133,080,932 | 正股 | 133,080,883–133,080,942 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR12_BZF4K · promoter · 133080392–133080942 · regulatory
ENSR12_BZF4N · enhancer · 133080943–133081820 · regulatory
· motif · 133079725–133079740 · motif
· motif · 133080199–133080210 · motif
· motif · 133080233–133080244 · motif
· motif · 133080244–133080254 · motif
· motif · 133080390–133080403 · motif
· motif · 133080409–133080419 · motif
· motif · 133080634–133080644 · motif
· motif · 133080907–133080917 · motif
· motif · 133081160–133081173 · motif
· motif · 133081273–133081283 · motif
· motif · 133081714–133081727 · motif
· motif · 133083364–133083375 · motif
· motif · 133083529–133083542 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:457 aa
zinc finger protein 140 長 457 個胺基酸。其 N 端含 KRAB 區域(第 6–77 位),序列中另有 10 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 161–435 位。這些結構註解描述了蛋白質的區域組成;資料亦將其歸入 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ZNF140 的細胞內定位標示為細胞核;未提供定位隨條件改變的資訊,也未描述異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- ARMC7Q9H6L4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CABP2Q9NPB3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP70Q8NHQ1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GTCTGGCCTGTGTTGGCTGTAGGCAACGAAAGGAGCCCTC40CCGGTCTGCGCCGGATGGCCCCGGGCGGTGACTCGGTCCG80GAGCCCTGGAACGCTACGCCCACCTGGCGGAAAGCACCAC120GGAAACGCATCCTTCTGTGGCCACTGTTAGGTCTGCCATT160TTACACTTTTCTGATCTCCTCCTTCCCTTCTGTGAGCTAT200GTCTCAGGGGTCAGTGACATTCAGAGATGTGGCCATAGAC240TTCTCCCAGGAGGAGTGGAAATGGCTTCAGCCTGCTCAAA280GAGATTTGTACAGATGTGTAATGTTGGAGAACTATGGCCA320TCTGGTCTCACTGGGTCTTTCCATTTCTAAGCCAGATGTG360GTTTCCTTATTGGAGCAAGGGAAAGAACCCTGGCTGGGGA400AAAGGGAAGTGAAAAGAGATCTGTTTTCAGTTTCAGAGTC440AAGTGGTGAGATCAAAGACTTTTCACCAAAAAATGTCATT480TATGATGACTCATCCCAGTATTTGATCATGGAAAGAATTC520TAAGTCAAGGCCCTGTGTATTCCAGTTTTAAAGGAGGCTG560GAAATGCAAGGATCATACTGAGATGCTGCAAGAAAATCAG600GGATGTATTAGGAAAGTAACAGTCTCTCATCAAGAAGCCC640TGGCTCAACATATGAATATCAGTACTGTGGAGAGGCCCTA680TGGATGCCATGAATGTGGAAAAACTTTTGGTCGACGCTTT720TCCCTGGTGTTACACCAGAGGACTCATACTGGAGAGAAAC760CATATGCATGTAAGGAATGTGGCAAAACCTTTAGCCAGAT800TTCAAACCTTGTGAAACACCAAATGATACATACTGGAAAG840AAACCCCATGAGTGTAAGGACTGTAATAAAACATTCAGTT880ACCTTTCATTTCTTATTGAACACCAGAGAACGCACACTGG920GGAGAAACCTTATGAATGTACTGAGTGTGGAAAGGCCTTT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。