演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF140pHZ-39

zinc finger protein 140

ZNF140(zinc finger protein 140)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族的蛋白質,可能以抑制因子身分參與轉錄調控。

Homo sapiens12q24.33UniProt P52738
OFFICIAL SYMBOL
ZNF140
CHROMOSOME
12
UNIPROT
P52738
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF140 是一個蛋白質編碼基因,其產物為 zinc finger protein 140,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質序列包含 KRAB 區域及多個 C2H2-type zinc finger,呈現此蛋白質家族的結構特徵。現有資料指出,ZNF140 可能參與轉錄調控,並可能以抑制因子的方式發揮作用;相關作用仍以「可能」描述。

Official symbol
ZNF140
Gene name
zinc finger protein 140
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12925
UniProt
P52738
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
pHZ-39

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212q24.33
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegZNF140pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr12:133,080,388–133,107,981
Gene span
27,594 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000355557 ★133,080,923–133,107,4285
ENST00000880216133,080,388–133,107,9816
ENST00000880217133,080,388–133,107,9815
ENST00000999038133,080,388–133,107,9815
ENST00000999040133,080,388–133,107,9816
ENST00001127277133,080,388–133,085,5866
ENST00001128293133,080,388–133,084,3095
ENST00000880218133,080,409–133,107,9814
ENST00001029693133,080,409–133,107,9814
ENST00001128294133,080,409–133,084,2794
ENST00000319849133,080,442–133,107,9816
ENST00000440550133,080,442–133,106,8665

顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF140 可能參與轉錄調控,並可能以抑制因子的方式作用。這表示它可能有助於降低或限制轉錄活動,但目前資料僅支持其可能具有此類角色,未進一步指出受調控的基因、作用位置或抑制效果如何產生,因此不宜將此描述延伸為已確立的特定調控機制。

這項功能資訊提供了對 ZNF140 生物學角色的概括方向:它可能參與調控基因轉錄,且作用傾向於抑制而非促進。然而,現有內容未說明這種調控發生的細胞或生理條件,也未提供實驗系統、干預方式或觀察指標,無法據此判定其作用對象、範圍與生物學後果。因而,ZNF140 的轉錄調控角色應保留為可能性,而非視為已確認的完整功能機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 133080923 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF140 ENST00000355557 GRCh38 chr12:133079923-133081023 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGATCCAAGAACCCTCTCTTAGAGTCTGAGATCCGGACCCCTTTCCAGTAGCAAAAGGTCTTAGACTGAA
GTACTGACTCCACAGTCGTTGTTAAGAATCCTAGTTGTTTAATAGAGGCGGTCTTGGGCTCTTGCTGGGC
CGCGGTGTGTTCTGGGAAGTGTAGTCACCTGAGTCTCCAGTTCCTTGTCTCTGGGCCGTGTGTGCACGCC
AGCGAAGCACTGTGGGAGTCGTAGTAGGGGAGGAAAACCCTATACCCTCTGGCGTGCGGCGCAGGAGTTT
GGGGGAATGTAGTCGCCAGAGCTCTGCGTTGTCTTCCGGCTTTGGGCGTGGCCACGATGCACTCTGGGAG
TCGTAGTAGGGGAAGAACGTCCTCCGCTCTTTTGCGCACGGTCGCTAGAGGTTCTGGGAAGTGTAGTTGC
CTGAAGCTCGTGTTCTTTGTCTTTCGATGATGTGCGCTTGGCCTCAAAGCACCCTGGGAGTTGCAGTGGG
GCGGGGAAAGCCATATGCTCTCTCGCGCGGGGTCGCGGTTGTTTCTGGGAAGTGTGGTGGCCTGAGTTCC
ACGTTCTTCGTTTCTCCGCTAGTTGTGCGCTTGGCCGCGAGACACTCTGGCAGTTATAGGAACACAAAGG
TCTGTGTACTCTTCCGCGGGGGGCCGCGGTTATTTCTGGGAAATGTAGTTGCCTAGGACCCGGGTTCTTT
GTTTCTCGGCTCTGGGCGTGGGAGGATAGCCCCTATGCTCTGGCGCACCGGGCCGCGATGGCTCTGGGAA
TTGTAGTTGTCGCAGGCCCTCGTTCTTTGTCTCCTGGCGTTCTGGGCACGGCAGCGAGGCGCTCTGGGAG
TTCCAGTAGGAACGAAAAGCCCTTGCGCGCAGGGCCGCATTGGTTTCTGGGAATTGTAGTTTCTTGAGGC
CGGCGGCCTGGTTGGGGTGACGTCGGCGAGGCTTCTGAAGACGCAATTCCTGCGACGCCCGCGGAGGGGC
CCTGGGGGGCGGCGCCGAGCGTCTGGCCTGTGTTGGCTGTAGGCAACGAAAGGAGCCCTCCCGGTCTGCG
CCGGATGGCCCCGGGCGGTGACTCGGTCCGGAGCCCTGGAACGCTACGCCC
ZNF140 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF140_1 ↗12:133,080,932正股133,080,883–133,080,942

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_BZF4K · promoter · 133080392–133080942 · regulatory

ENSR12_BZF4N · enhancer · 133080943–133081820 · regulatory

· motif · 133079725–133079740 · motif

· motif · 133080199–133080210 · motif

· motif · 133080233–133080244 · motif

· motif · 133080244–133080254 · motif

· motif · 133080390–133080403 · motif

· motif · 133080409–133080419 · motif

· motif · 133080634–133080644 · motif

· motif · 133080907–133080917 · motif

· motif · 133081160–133081173 · motif

· motif · 133081273–133081283 · motif

· motif · 133081714–133081727 · motif

· motif · 133083364–133083375 · motif

· motif · 133083529–133083542 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:457 aa

1 aa457 aa結構域鋅指
依 P52738 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 140 長 457 個胺基酸。其 N 端含 KRAB 區域(第 6–77 位),序列中另有 10 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 161–435 位。這些結構註解描述了蛋白質的區域組成;資料亦將其歸入 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。

結構域KRAB6–77 aa
鋅指C2H2-type 1161–183 aa
鋅指C2H2-type 2189–211 aa
鋅指C2H2-type 3217–239 aa
鋅指C2H2-type 4245–267 aa
鋅指C2H2-type 5273–295 aa
鋅指C2H2-type 6301–323 aa
鋅指C2H2-type 7329–351 aa
鋅指C2H2-type 8357–379 aa
鋅指C2H2-type 9385–407 aa
鋅指C2H2-type 10413–435 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P52738…

AlphaFold · P52738

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

資料將 ZNF140 的細胞內定位標示為細胞核;未提供定位隨條件改變的資訊,也未描述異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
pHZ-39ZNF140ARMC7CABP2CEP70
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF140 可能參與轉錄調控,並可能以抑制因子的身分發揮作用;目前的描述保留可能性,未指出特定調控對象或已確立的作用機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation as a repressor

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF140 定位於細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000355557 · 2,349 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GTCTGGCCTGTGTTGGCTGTAGGCAACGAAAGGAGCCCTC40
41CCGGTCTGCGCCGGATGGCCCCGGGCGGTGACTCGGTCCG80
81GAGCCCTGGAACGCTACGCCCACCTGGCGGAAAGCACCAC120
121GGAAACGCATCCTTCTGTGGCCACTGTTAGGTCTGCCATT160
161TTACACTTTTCTGATCTCCTCCTTCCCTTCTGTGAGCTAT200
201GTCTCAGGGGTCAGTGACATTCAGAGATGTGGCCATAGAC240
241TTCTCCCAGGAGGAGTGGAAATGGCTTCAGCCTGCTCAAA280
281GAGATTTGTACAGATGTGTAATGTTGGAGAACTATGGCCA320
321TCTGGTCTCACTGGGTCTTTCCATTTCTAAGCCAGATGTG360
361GTTTCCTTATTGGAGCAAGGGAAAGAACCCTGGCTGGGGA400
401AAAGGGAAGTGAAAAGAGATCTGTTTTCAGTTTCAGAGTC440
441AAGTGGTGAGATCAAAGACTTTTCACCAAAAAATGTCATT480
481TATGATGACTCATCCCAGTATTTGATCATGGAAAGAATTC520
521TAAGTCAAGGCCCTGTGTATTCCAGTTTTAAAGGAGGCTG560
561GAAATGCAAGGATCATACTGAGATGCTGCAAGAAAATCAG600
601GGATGTATTAGGAAAGTAACAGTCTCTCATCAAGAAGCCC640
641TGGCTCAACATATGAATATCAGTACTGTGGAGAGGCCCTA680
681TGGATGCCATGAATGTGGAAAAACTTTTGGTCGACGCTTT720
721TCCCTGGTGTTACACCAGAGGACTCATACTGGAGAGAAAC760
761CATATGCATGTAAGGAATGTGGCAAAACCTTTAGCCAGAT800
801TTCAAACCTTGTGAAACACCAAATGATACATACTGGAAAG840
841AAACCCCATGAGTGTAAGGACTGTAATAAAACATTCAGTT880
881ACCTTTCATTTCTTATTGAACACCAGAGAACGCACACTGG920
921GGAGAAACCTTATGAATGTACTGAGTGTGGAAAGGCCTTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。