演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF14KOX6

zinc finger protein 14

ZNF14(zinc finger protein 14)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 成員,含 KRAB 與多個 C2H2-type zinc finger 區域;可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19p13.11UniProt P17017
OFFICIAL SYMBOL
ZNF14
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P17017
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF14 是一種蛋白質編碼基因,其產物 zinc finger protein 14 屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質長642個胺基酸,結構包含位於 N 端的 KRAB 區域,以及一系列 C2H2-type zinc finger 區域。這些序列註解呈現其具有多個鋅指結構的蛋白質特徵;來源將其主要角色描述為可能參與轉錄調控,但未提供更具體的作用對象或機制。

Official symbol
ZNF14
Gene name
zinc finger protein 14
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12924
UniProt
P17017
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KOX6GIOT-4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.11
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF14pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:19,708,130–19,733,119
Gene span
24,990 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000344099 ★19,710,472–19,733,1124
ENST0000113594519,708,130–19,733,1194

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有資料指出,zinc finger protein 14 可能參與轉錄調控。這項描述表示其可能與基因轉錄活動的調節有關,但來源未說明它是促進或抑制轉錄,也未指出受調控的基因、細胞情境或調節條件。因此,不能據此將其作用方向或特定生物學效應視為已確立。

其蛋白質結構具有 KRAB 區域與多個 C2H2-type zinc finger 區域,這些是已註解的結構特徵;然而目前資料沒有說明這些區域如何介入轉錄調控,也沒有提供直接分子作用方式、靶序列或相關複合體資訊。故對 ZNF14 功能的理解,應限於「可能參與轉錄調控」這一層級,不宜進一步推定其結合對象、作用機制或下游生物學結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 19733112 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF14 ENST00000344099 GRCh38 chr19:19733012-19734112 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GACACACATCTCTACCAAAAATTAAAATTAAAATTAAAACAATTAGCCAGGCCTGGTAGTGCGTGCGTGT
AGTCCCAGATACTTAGGAGGCTCAGGTTGGAGGCTTGCTTGAATCCAGGAGTTGAAGCCTGCAGTGAGCA
ATGATCACACCACTGCACTTCAGCCTGGGCTACAGAGCAAAACCCTGTCTCTTAAAAAAAAAAAAAAGAA
GAAGAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACGCTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCAGATCACG
AGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGACTAACACAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAAATACAAAAAAT
TAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTATTCCCAGCTACTCGTGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAA
CCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACT
CCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAATAAATCCTAACACATACTACAAGGTGAAGCTCGAGGACA
TTATGCTAAGTGAAATAAGCACGTCAGGAAAGGACAAATACTTTATGACGCCATTTACATGAGATTCCCA
CAGTCAAATTCACGAACTCAGACAATGGAATGGAGGTTGCAAAAGACCCTGAGGGAAGGAGGTGCACGGG
GAGTTGTGCAACGAGACAGATTTCAGTGTTGCAAGATGAAAACAATTCTGGAAATTGGCTTCACAATGTG
AATGTATTTAACAGTACTGAAGAGAACACTTAAAATGGATGGGAGGCAAAGAACACATTCGGTTTAAACG
CAAACGTCCTGGCGGGGACAAGCCGGACTGAAGCCAGGCCAGCTCAACCACGCCCCTTCCTGCTCCGCTG
TCACTCAGTGATAAAGAGGCGGGGCCATTGGATCTGTCCAATCAGGACCTCAGCTGAAAAGATGTGAGCG
GCGCCACGCTGGGCCTGCGCAGTGCGGACGTCGCCATTCCTGGCCCATGGGAAGATTGCGTTTCACCTGC
TCCTGAAGGCCGAAGGTGGCTCTAGCGCATCCTTTGTCGCGCCGTGACCTG
ZNF14 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF14_1 ↗19:19,733,109負股19,733,099–19,733,158

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_B5WPS · enhancer · 19732306–19733101 · regulatory

ENSR19_99SGT · promoter · 19733102–19733602 · regulatory

· motif · 19733112–19733123 · motif

· motif · 19733112–19733123 · motif

· motif · 19733401–19733410 · motif

· motif · 19733401–19733410 · motif

· motif · 19733497–19733510 · motif

· motif · 19733497–19733510 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:642 aa

1 aa642 aa結構域鋅指
依 P17017 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 14 長642個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質 N 端含 KRAB 區域(第4至76位),其後註解有19個 C2H2-type zinc finger 區域;其中第2個標記為退化型,第4個標記為非典型,其餘列為 C2H2-type。

結構域KRAB4–76 aa
鋅指C2H2-type 1103–125 aa
鋅指C2H2-type 2; degenerate141–163 aa
鋅指C2H2-type 3169–191 aa
鋅指C2H2-type 4; atypical197–217 aa
鋅指C2H2-type 5223–245 aa
鋅指C2H2-type 6251–273 aa
鋅指C2H2-type 7279–301 aa
鋅指C2H2-type 8307–329 aa
鋅指C2H2-type 9335–357 aa
鋅指C2H2-type 10363–385 aa
鋅指C2H2-type 11391–413 aa
鋅指C2H2-type 12419–441 aa
鋅指C2H2-type 13447–469 aa
鋅指C2H2-type 14475–497 aa
鋅指C2H2-type 15503–525 aa
鋅指C2H2-type 16531–553 aa
鋅指C2H2-type 17559–581 aa
鋅指C2H2-type 18587–609 aa
鋅指C2H2-type 19615–637 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P17017…

AlphaFold · P17017

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

zinc finger protein 14 定位於細胞核。 現有資料未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KOX6ZNF14
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能zinc finger protein 14 可能參與轉錄調控;此描述未指出作用是促進或抑制轉錄,也沒有提供特定靶基因、作用機制或相關生物學情境。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位zinc finger protein 14 位於細胞核;資料未進一步描述其定位條件、動態或異構型差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000344099 · 2,963 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTGCGGACGTCGCCATTCCTGGCCCATGGGAAGATTGCG40
41TTTCACCTGCTCCTGAAGGCCGAAGGTGGCTCTAGCGCAT80
81CCTTTGTCGCGCCGTGACCTGCAGGTACTGACAGATCCGT120
121AGGGAGGACACCGTGACTTCCCGGACGCTGGGAAATGGAC160
161TCAGTCTCCTTTGAGGATGTGGCCGTGAACTTCACCCTGG200
201AGGAGTGGGCTTTGCTGGATTCTTCACAGAAAAAGCTCTA240
241TGAAGATGTGATGCAGGAGACCTTCAAAAACCTGGTTTGT280
281CTAGGAAAAAAGTGGGAAGACCAGGACATTGAAGATGACC320
321ACAGAAACCAGGGGAAAAATCGAAGATGTCATATGGTTGA360
361GAGACTCTGTGAAAGTAGAAGAGGTAGCAAATGTGGAGAA400
401ACCACTAGCCAGATGCCAAATGTTAATATCAACAAGGAAA440
441CTTTTACTGGAGCAAAACCACATGAATGCAGCTTTTGTGG480
481AAGAGACTTCATTCATCATTCGTCCCTTAATAGGCACATG520
521AGATCTCACACTGGACAGAAACCAAATGAGTATCAGGAAT560
561ATGAAAAGCAACCATGTAAATGTAAAGCAGTTGGGAAAAC600
601CTTCAGTTATCACCACTGCTTTCGCAAACATGAAAGAACT640
641CACACTGGAGTGAAGCCCTATGAATGTAAACAGTGTGGGA680
681AAGCCTTTATATATTACCAGCCATTTCAAAGACATGAAAG720
721GACTCATGCTGGACAGAAACCCTATGAATGTAAGCAATGT760
761GGAAAAACCTTTATATATTACCAGTCTTTTCAAAAACATG800
801CTCATACTGGAAAGAAACCCTATGAATGTAAACAGTGTGG840
841GAAAGCCTTTATATGTTACCAATCTTTTCAAAGACACAAA880
881AGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAAGCAAT920
921GTGGTAAGGCTTTCAGTTGTCCCACATACTTTCGAACTCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。