基因總覽
ZNF14 是一種蛋白質編碼基因,其產物 zinc finger protein 14 屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質長642個胺基酸,結構包含位於 N 端的 KRAB 區域,以及一系列 C2H2-type zinc finger 區域。這些序列註解呈現其具有多個鋅指結構的蛋白質特徵;來源將其主要角色描述為可能參與轉錄調控,但未提供更具體的作用對象或機制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000344099 ★ | 19,710,472–19,733,112 | 4 |
| ENST00001135945 | 19,708,130–19,733,119 | 4 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料指出,zinc finger protein 14 可能參與轉錄調控。這項描述表示其可能與基因轉錄活動的調節有關,但來源未說明它是促進或抑制轉錄,也未指出受調控的基因、細胞情境或調節條件。因此,不能據此將其作用方向或特定生物學效應視為已確立。
其蛋白質結構具有 KRAB 區域與多個 C2H2-type zinc finger 區域,這些是已註解的結構特徵;然而目前資料沒有說明這些區域如何介入轉錄調控,也沒有提供直接分子作用方式、靶序列或相關複合體資訊。故對 ZNF14 功能的理解,應限於「可能參與轉錄調控」這一層級,不宜進一步推定其結合對象、作用機制或下游生物學結果。
Promoter 與基因調控
>ZNF14 ENST00000344099 GRCh38 chr19:19733012-19734112 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GACACACATCTCTACCAAAAATTAAAATTAAAATTAAAACAATTAGCCAGGCCTGGTAGTGCGTGCGTGT AGTCCCAGATACTTAGGAGGCTCAGGTTGGAGGCTTGCTTGAATCCAGGAGTTGAAGCCTGCAGTGAGCA ATGATCACACCACTGCACTTCAGCCTGGGCTACAGAGCAAAACCCTGTCTCTTAAAAAAAAAAAAAAGAA GAAGAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACGCTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCAGATCACG AGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGACTAACACAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAAATACAAAAAAT TAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTATTCCCAGCTACTCGTGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAA CCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACT CCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAATAAATCCTAACACATACTACAAGGTGAAGCTCGAGGACA TTATGCTAAGTGAAATAAGCACGTCAGGAAAGGACAAATACTTTATGACGCCATTTACATGAGATTCCCA CAGTCAAATTCACGAACTCAGACAATGGAATGGAGGTTGCAAAAGACCCTGAGGGAAGGAGGTGCACGGG GAGTTGTGCAACGAGACAGATTTCAGTGTTGCAAGATGAAAACAATTCTGGAAATTGGCTTCACAATGTG AATGTATTTAACAGTACTGAAGAGAACACTTAAAATGGATGGGAGGCAAAGAACACATTCGGTTTAAACG CAAACGTCCTGGCGGGGACAAGCCGGACTGAAGCCAGGCCAGCTCAACCACGCCCCTTCCTGCTCCGCTG TCACTCAGTGATAAAGAGGCGGGGCCATTGGATCTGTCCAATCAGGACCTCAGCTGAAAAGATGTGAGCG GCGCCACGCTGGGCCTGCGCAGTGCGGACGTCGCCATTCCTGGCCCATGGGAAGATTGCGTTTCACCTGC TCCTGAAGGCCGAAGGTGGCTCTAGCGCATCCTTTGTCGCGCCGTGACCTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF14_1 ↗ | 19:19,733,109 | 負股 | 19,733,099–19,733,158 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_B5WPS · enhancer · 19732306–19733101 · regulatory
ENSR19_99SGT · promoter · 19733102–19733602 · regulatory
· motif · 19733112–19733123 · motif
· motif · 19733112–19733123 · motif
· motif · 19733401–19733410 · motif
· motif · 19733401–19733410 · motif
· motif · 19733497–19733510 · motif
· motif · 19733497–19733510 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:642 aa
zinc finger protein 14 長642個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質 N 端含 KRAB 區域(第4至76位),其後註解有19個 C2H2-type zinc finger 區域;其中第2個標記為退化型,第4個標記為非典型,其餘列為 C2H2-type。
蛋白質三維結構
細胞內定位
zinc finger protein 14 定位於細胞核。 現有資料未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGTGCGGACGTCGCCATTCCTGGCCCATGGGAAGATTGCG40TTTCACCTGCTCCTGAAGGCCGAAGGTGGCTCTAGCGCAT80CCTTTGTCGCGCCGTGACCTGCAGGTACTGACAGATCCGT120AGGGAGGACACCGTGACTTCCCGGACGCTGGGAAATGGAC160TCAGTCTCCTTTGAGGATGTGGCCGTGAACTTCACCCTGG200AGGAGTGGGCTTTGCTGGATTCTTCACAGAAAAAGCTCTA240TGAAGATGTGATGCAGGAGACCTTCAAAAACCTGGTTTGT280CTAGGAAAAAAGTGGGAAGACCAGGACATTGAAGATGACC320ACAGAAACCAGGGGAAAAATCGAAGATGTCATATGGTTGA360GAGACTCTGTGAAAGTAGAAGAGGTAGCAAATGTGGAGAA400ACCACTAGCCAGATGCCAAATGTTAATATCAACAAGGAAA440CTTTTACTGGAGCAAAACCACATGAATGCAGCTTTTGTGG480AAGAGACTTCATTCATCATTCGTCCCTTAATAGGCACATG520AGATCTCACACTGGACAGAAACCAAATGAGTATCAGGAAT560ATGAAAAGCAACCATGTAAATGTAAAGCAGTTGGGAAAAC600CTTCAGTTATCACCACTGCTTTCGCAAACATGAAAGAACT640CACACTGGAGTGAAGCCCTATGAATGTAAACAGTGTGGGA680AAGCCTTTATATATTACCAGCCATTTCAAAGACATGAAAG720GACTCATGCTGGACAGAAACCCTATGAATGTAAGCAATGT760GGAAAAACCTTTATATATTACCAGTCTTTTCAAAAACATG800CTCATACTGGAAAGAAACCCTATGAATGTAAACAGTGTGG840GAAAGCCTTTATATGTTACCAATCTTTTCAAAGACACAAA880AGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAAGCAAT920GTGGTAAGGCTTTCAGTTGTCCCACATACTTTCGAACTCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。