基因總覽
ZNF137P 的正式名稱為 zinc finger protein 137, pseudogene,基因類型標示為 pseudogene,位於人類第 19 號染色體的 19q13.41。這項分類說明它是偽基因位點;現有來源未提供其 RNA 或蛋白質產物的性質、結構特徵或家族資訊,因此不能據此描述其產物,也不應將預測性功能註釋視為已確認的蛋白質功能。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000456718 ★ | 52,588,551–52,597,413 | 3 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
現有資料將 ZNF137P 的功能描述為預測結果,而非已確立的實驗結論。預測此位點可能具備 DNA 結合型轉錄因子活性,並可能具有對 RNA polymerase II 特異的活性,以及辨識 RNA polymerase II 順式調控區域序列的 DNA 結合活性。這些註釋描述的是可能的分子功能,來源未提供支持它們的實驗細節。
此外,資料預測 ZNF137P 可能參與 RNA polymerase II 介導的轉錄調控,並可能在細胞核中具有活性。來源未進一步說明其調控方向、作用條件或具體生物學過程;由於 ZNF137P 被分類為 pseudogene,這些預測也不足以證明它會產生具上述活性的蛋白質。
Promoter 與基因調控
>ZNF137P ENST00000456718 GRCh38 chr19:52587551-52588651 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CACTTGACATTGCAGCGCCACCTTCACCCCCACCTCTGGTCCATGTTGCCTGTTCTGTGTGATTCTTTTA GCTCCTTCACCGTTCACTGGATCCTGGTGAGAACAAGTCCGTAAGCGGAGAGCAGAATCAGAAGGTGGGG CTGTGCTGGGCTGGCGCCATCTGAGTGGAGCTCAACCCTGACTTCACATTACAGTTTTCAGGCATTTTGC AAATATATCTTTTGTTCTGTTTTATCAAAGATTGCTATTATCATAGGATGGGACACACCCTCAATAATAC AATGGCACTGGTGATTCTCATCTGTGTCCAGCATTGAACATCAAGGCAGTTTCCTCCATATTGAGAACTG AGATCAGCCTGTGATCCACAGGGAGGTGAGGGGGCTGTGCTCTGCATGGGGTTTGGTTAGGGCCAGATCT GTGTCCTGAAGATCTGTGTCTTGCTGCATCGTGTGCGTGGACTTTTCCATCAGGGGAGCAAAATCCAAAA ACAAGTCAAAATTACCCTTGTAGGTCTTCCTGTGGGATGTCCTTATGTCTGCATAATCTCTGGTGCAGTG GGCAGCAGAGGACCATCTTTGTCCCTGGTGAGGTCTCCCCTGTGTGTGTGTTTTGTCACAGGAAAGGAGG GAGTGATTTCTAAACACTAAATCTCAGCTGGGTGCAGTGGCTCACATCTGGAATCCCAGCTCTTTGGGAG GGTTGGGTGGGCAGATCTCAAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTAAAACCCCATCTCT AGTAAAAATAGAAAAATTAGCTGGGCCTGGCAGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTAAGAGGCTGAGG CAGGAGAATCACTAGAACCAGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGGTCATGCCACTGAACCACATTCT TGTGACAGAGCTAGACACCATCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAAATTAAATCTCATATTTTTTTACACACA GGATTGATTTCCAAAGACTCATGCTATGTAAGGAAGCCACCAAGAAGGGCAAAGAAAAGGAGCCAGGGAC GGCTCTTCCTCAGGTAAAGTGATATTCCTCGGTGGATTCTTCTGTCTCCTT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_BDFQR · enhancer · 52584777–52585477 · regulatory
基因座與轉錄註解
ZNF137P 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000456718 ★ | transcribed_unprocessed_pseudogene | 1,987 nt | 3 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 預測 ZNF137P 可能具有 DNA 結合型轉錄因子活性、RNA polymerase II 特異活性,以及辨識其順式調控區域序列的 DNA 結合活性;也預測可能參與 RNA polymerase II 轉錄調控並在細胞核中活躍。這些均屬預測性註釋。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to be active in nucleus. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
ATGCTATGTAAGGAAGCCACCAAGAAGGGCAAAGAAAAGG40AGCCAGGGACGGCTCTTCCTCAGGGACACTAGACTTTCAG80GGATGTGGCTATAGATTTCTCTTTGGAGGAGTGGAAATGC120CTGAACCCTGCACAGAGGGCTTTATACAGGGAAGTGATGT160TGGAGAACTACAGGAACCTGGAGTTTGTGGATAGCTCTTT200AAAATCCATGATGGAGTTCTCATCAACTGGGCACGGTAAT240ACAGGAGAAGTGATTCACACAGGGACGTTGCAAATACATG280AAAGTCATCACACTGGAGATTTTTGCTTCCCAGAAATCAA320GAAAGATATTCATCACTTTGAGTTTCAGTGGCAAGAAATT360TAAAGAAATGGCCATGAAGCACCCATGACAGAAACCAAAG400AGTTGACAGGTAGTACAGACTGACGTGATCAAAGACATGC440TGGAAACAAGCCTATTAAAGATCAGCTTGGATCAAGCTTT480CATTCGCATCTGCCTGAACTCCACATGTTTCAGACCCAAG520GGAAAATTGGTAATCAAGTGGAGAAGTCTATCAATGATGC560TTCCTCAGCTTCAACATCCCAAATAATTTGTAGGCTCAAA600ACCCATATTTCTATTAAGTATGGGAAGAATTTCCTCTATT640CTTCATTATTCACACAAATACAAGAAGTACACATGAGGGA680AAAACCTTTCCAATGTAATGAGTGTGGCAAAGCCTTTAAT720CATAGCTCATGTTTAAGGAGACATCACGTAACCCATTCAG760GAGAGAAACAGTATAAATGTGATGTATGTGGCAAAGTCTT800TCATCAGAAGCAATACCTTGCATGGCACCATAGTGTTCAT840ACTGGAGAAAAACCTTACAAGTGTAATGAGTGTTCCAAGA880CCTTCAATCAGAAGTCATCCCTTCAGTGTCATCATAGACT920TCATACTGTACAGAAACATTACAAATGTGAAGAATGCAAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。