演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN GENE LOCUS

ZNF137PpHZ-30

zinc finger protein 137, pseudogene

ZNF137P 是位於人類第 19 號染色體的 pseudogene;現有功能註釋僅提供預測性描述。

Homo sapiens19q13.41
OFFICIAL SYMBOL
ZNF137P
CHROMOSOME
19
LOCUS TYPE
transcribed_unprocessed_pseudogene
TRANSCRIPTS
1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF137P 的正式名稱為 zinc finger protein 137, pseudogene,基因類型標示為 pseudogene,位於人類第 19 號染色體的 19q13.41。這項分類說明它是偽基因位點;現有來源未提供其 RNA 或蛋白質產物的性質、結構特徵或家族資訊,因此不能據此描述其產物,也不應將預測性功能註釋視為已確認的蛋白質功能。

Official symbol
ZNF137P
Gene name
zinc finger protein 137, pseudogene
Organism
Homo sapiens
Gene type
pseudogene
HGNC ID
HGNC:12921
Locus type
pseudogene
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
pHZ-30ZNF137

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.41
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF137Ppq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:52,588,551–52,597,413
Gene span
8,863 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000456718 ★52,588,551–52,597,4133

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

已知功能與來源註解

現有資料將 ZNF137P 的功能描述為預測結果,而非已確立的實驗結論。預測此位點可能具備 DNA 結合型轉錄因子活性,並可能具有對 RNA polymerase II 特異的活性,以及辨識 RNA polymerase II 順式調控區域序列的 DNA 結合活性。這些註釋描述的是可能的分子功能,來源未提供支持它們的實驗細節。

此外,資料預測 ZNF137P 可能參與 RNA polymerase II 介導的轉錄調控,並可能在細胞核中具有活性。來源未進一步說明其調控方向、作用條件或具體生物學過程;由於 ZNF137P 被分類為 pseudogene,這些預測也不足以證明它會產生具上述活性的蛋白質。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 52588551 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF137P ENST00000456718 GRCh38 chr19:52587551-52588651 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CACTTGACATTGCAGCGCCACCTTCACCCCCACCTCTGGTCCATGTTGCCTGTTCTGTGTGATTCTTTTA
GCTCCTTCACCGTTCACTGGATCCTGGTGAGAACAAGTCCGTAAGCGGAGAGCAGAATCAGAAGGTGGGG
CTGTGCTGGGCTGGCGCCATCTGAGTGGAGCTCAACCCTGACTTCACATTACAGTTTTCAGGCATTTTGC
AAATATATCTTTTGTTCTGTTTTATCAAAGATTGCTATTATCATAGGATGGGACACACCCTCAATAATAC
AATGGCACTGGTGATTCTCATCTGTGTCCAGCATTGAACATCAAGGCAGTTTCCTCCATATTGAGAACTG
AGATCAGCCTGTGATCCACAGGGAGGTGAGGGGGCTGTGCTCTGCATGGGGTTTGGTTAGGGCCAGATCT
GTGTCCTGAAGATCTGTGTCTTGCTGCATCGTGTGCGTGGACTTTTCCATCAGGGGAGCAAAATCCAAAA
ACAAGTCAAAATTACCCTTGTAGGTCTTCCTGTGGGATGTCCTTATGTCTGCATAATCTCTGGTGCAGTG
GGCAGCAGAGGACCATCTTTGTCCCTGGTGAGGTCTCCCCTGTGTGTGTGTTTTGTCACAGGAAAGGAGG
GAGTGATTTCTAAACACTAAATCTCAGCTGGGTGCAGTGGCTCACATCTGGAATCCCAGCTCTTTGGGAG
GGTTGGGTGGGCAGATCTCAAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTAAAACCCCATCTCT
AGTAAAAATAGAAAAATTAGCTGGGCCTGGCAGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTAAGAGGCTGAGG
CAGGAGAATCACTAGAACCAGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGGTCATGCCACTGAACCACATTCT
TGTGACAGAGCTAGACACCATCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAAATTAAATCTCATATTTTTTTACACACA
GGATTGATTTCCAAAGACTCATGCTATGTAAGGAAGCCACCAAGAAGGGCAAAGAAAAGGAGCCAGGGAC
GGCTCTTCCTCAGGTAAAGTGATATTCCTCGGTGGATTCTTCTGTCTCCTT
ZNF137P 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BDFQR · enhancer · 52584777–52585477 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / GENE ANATOMY

基因座與轉錄註解

pseudogene

ZNF137P 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000456718 ★transcribed_unprocessed_pseudogene1,987 nt3

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與基因產物定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能預測 ZNF137P 可能具有 DNA 結合型轉錄因子活性、RNA polymerase II 特異活性,以及辨識其順式調控區域序列的 DNA 結合活性;也預測可能參與 RNA polymerase II 轉錄調控並在細胞核中活躍。這些均屬預測性註釋。推論支持
證據與來源

Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to be active in nucleus.

開啟資料庫紀錄 ↗

· CC BY 4.0
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000456718 · 1,987 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATGCTATGTAAGGAAGCCACCAAGAAGGGCAAAGAAAAGG40
41AGCCAGGGACGGCTCTTCCTCAGGGACACTAGACTTTCAG80
81GGATGTGGCTATAGATTTCTCTTTGGAGGAGTGGAAATGC120
121CTGAACCCTGCACAGAGGGCTTTATACAGGGAAGTGATGT160
161TGGAGAACTACAGGAACCTGGAGTTTGTGGATAGCTCTTT200
201AAAATCCATGATGGAGTTCTCATCAACTGGGCACGGTAAT240
241ACAGGAGAAGTGATTCACACAGGGACGTTGCAAATACATG280
281AAAGTCATCACACTGGAGATTTTTGCTTCCCAGAAATCAA320
321GAAAGATATTCATCACTTTGAGTTTCAGTGGCAAGAAATT360
361TAAAGAAATGGCCATGAAGCACCCATGACAGAAACCAAAG400
401AGTTGACAGGTAGTACAGACTGACGTGATCAAAGACATGC440
441TGGAAACAAGCCTATTAAAGATCAGCTTGGATCAAGCTTT480
481CATTCGCATCTGCCTGAACTCCACATGTTTCAGACCCAAG520
521GGAAAATTGGTAATCAAGTGGAGAAGTCTATCAATGATGC560
561TTCCTCAGCTTCAACATCCCAAATAATTTGTAGGCTCAAA600
601ACCCATATTTCTATTAAGTATGGGAAGAATTTCCTCTATT640
641CTTCATTATTCACACAAATACAAGAAGTACACATGAGGGA680
681AAAACCTTTCCAATGTAATGAGTGTGGCAAAGCCTTTAAT720
721CATAGCTCATGTTTAAGGAGACATCACGTAACCCATTCAG760
761GAGAGAAACAGTATAAATGTGATGTATGTGGCAAAGTCTT800
801TCATCAGAAGCAATACCTTGCATGGCACCATAGTGTTCAT840
841ACTGGAGAAAAACCTTACAAGTGTAATGAGTGTTCCAAGA880
881CCTTCAATCAGAAGTCATCCCTTCAGTGTCATCATAGACT920
921TCATACTGTACAGAAACATTACAAATGTGAAGAATGCAAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。