演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF136pHZ-20

zinc finger protein 136

ZNF136(zinc finger protein 136)是 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 成員,帶有 KRAB 區域與多個鋅指,可能參與轉錄調控;其抑制作用取決於是否融合含 KRAB B-domain 的異源蛋白。

Homo sapiens19p13.2UniProt P52737
OFFICIAL SYMBOL
ZNF136
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P52737
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF136(zinc finger protein 136)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質全長 540 個胺基酸,序列包含位於 N 端的 KRAB 區域,以及排列於後段的 14 個 C2H2-type zinc finger,其中第一個被註記為退化型。這些結構註解構成其蛋白質的主要特徵;現有資料並未提供更進一步的家族分類或其他結構資訊。

Official symbol
ZNF136
Gene name
zinc finger protein 136
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12920
UniProt
P52737
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
pHZ-20

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.2
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF136pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:12,163,052–12,189,871
Gene span
26,820 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000343979 ★12,163,096–12,189,8714
ENST0000089274512,163,052–12,188,3014
ENST0000114113812,163,052–12,189,8714
ENST0000042582712,163,064–12,186,6025
ENST0000043999512,163,064–12,186,8433
ENST0000065258012,163,070–12,189,8715
ENST0000041833812,163,116–12,186,1575

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF136 可能參與轉錄調控,其抑制轉錄的能力會隨蛋白質所處的組合情境而不同。單獨存在時,它可能是較弱的抑制因子;若與含有 KRAB B-domain 的異源蛋白融合,則可能成為較強的抑制因子。這表示其抑制作用並非在所有情況下都相同,而與是否具有該融合形式相關。

目前提供的資料僅指出這種條件差異,未說明受調控的特定基因或轉錄標的,也沒有交代融合蛋白如何增強抑制作用。因此,ZNF136 的轉錄調控角色可描述為可能參與、且效力依融合情境而變化;不宜據此延伸推定具體的分子機制或生物學過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 12163096 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF136 ENST00000343979 GRCh38 chr19:12162096-12163196 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTGCTTATCTGAGCTAGTTCAAATTTTCGCTTTACTTCCCTTTTGATTTCTTTACAGATTACGGAAATAG
AACTTGTTTTTCCATGTATTTAATAATTTTATTCACTTGTTGGCAGTTTTTTATTTTCTTGGGTGAAAAT
GAGTAGATTGATTTGGGAGGCGAAAGTGGGAGGTTCACTTGAGGCTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGACA
ACAAACGAAATCCCGTCTCTACAAAAAATTAAAGAATTTGCCGGGCTTGGTGGCATGTACCTGTAGTCTC
TACTACTCAGGGGACTGAAGCGGAAGGTTCGCTTGAACCCAGGAGATGGAGGCTGCAGTGAGCTATGATC
ATGCCATTGCACTCTAACCTGGGTGGCAGAGCTAGACCCTGTCTCAAATAAATAAATAAAGTAATAAATA
AGTAAATAAAGTAATAAATAAGTAAATAAAGTAAAAAATAGAGAGAGATAAAGAGGTATGGTATGAGAAA
GCCTTGGGCACGCTTCCCATATCCTCATCCCAAATTTCCGATCCCTGGGAATATCACGCCCTTTCTTCTG
TTCCAGTCCTGCCTGGAACTCCCTGCGCACACCTGTGACTCCTCATGCAAGAGGTAGATGAAGAAATGAC
CCACTGAGTACAGGAAGTATCTCCTTTGGTAAACCCGGATTAAGTTCTGCTAAAATGCAAGTATCTCCCA
TCTCCCCATCCCCCGCAGACCAAGTACAGTGAAGGGGACGAGGGGAAGAAGTCCACCCTGCGTTTGAGGG
CTGGGGCCAAGACCCCTCATTCCCGCTTCACTCATCTATGCTTCACATCTCCTGTCATTCACATCTGTCA
AGATGCAGGGGGCAGAGCCCGAAGCTGTACCCAATCAGGGGCACCGGGGAGGAGCTCTGCGATCGGTCCA
ATCAGGCGCGCCGTCGGGGACGCAGCTGCAGACGTTCAACCTTCTCGCGGGATTTTCATTTCTCGCGTCT
GCCGTACTTGGTTTCGCTTCGCTAGTCCCAGAGGCCCAGAGTGGCTCGCCTGGAGTCTCTGTGGCGCGGT
TTCCTGTACCTGCCTTGGGATCCGGAGGGAGGAAGCTGGGACACCCGGGAG
ZNF136 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF136_1 ↗19:12,163,099正股12,163,050–12,163,109

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_96SCC · promoter · 12162610–12163106 · regulatory

ENSR19_B4F6R · enhancer · 12163107–12164129 · regulatory

· motif · 12162923–12162936 · motif

· motif · 12162923–12162936 · motif

· motif · 12163084–12163094 · motif

· motif · 12163260–12163269 · motif

· motif · 12163475–12163487 · motif

· motif · 12163477–12163490 · motif

· motif · 12163477–12163492 · motif

· motif · 12163521–12163538 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:540 aa

1 aa540 aa結構域鋅指
依 P52737 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF136 蛋白長 540 個胺基酸,N 端第 4–90 位為 KRAB domain。其後有 14 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 140–526 位;其中第一個(第 140–162 位)註記為退化型,其餘 13 個為 C2H2-type。

結構域KRAB4–90 aa
鋅指C2H2-type 1; degenerate140–162 aa
鋅指C2H2-type 2168–190 aa
鋅指C2H2-type 3196–218 aa
鋅指C2H2-type 4224–246 aa
鋅指C2H2-type 5252–274 aa
鋅指C2H2-type 6280–302 aa
鋅指C2H2-type 7308–330 aa
鋅指C2H2-type 8336–358 aa
鋅指C2H2-type 9364–386 aa
鋅指C2H2-type 10392–414 aa
鋅指C2H2-type 11420–442 aa
鋅指C2H2-type 12448–470 aa
鋅指C2H2-type 13476–498 aa
鋅指C2H2-type 14504–526 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P52737…

AlphaFold · P52737

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

現有資料未提供定位隨條件改變的資訊,也未指出異構型間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 7 個夥伴 · 最多顯示 50 個
pHZ-20ZNF136CCNDBP1CEP70CLK2MDFIMTUS2STX1ATRIM28
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF136 可能參與轉錄調控。單獨存在時,它可能是較弱的抑制因子;若與含有 KRAB B-domain 的異源蛋白融合,則可能形成較強的抑制因子,顯示其抑制作用與融合情境有關。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation as a weak repressor when alone, or a potent one when fused with a heterologous protein containing a KRAB B-domain

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF136 位於細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000343979 · 3,601 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCTAGTCCCAGAGGCCCAGAGTGGCTCGCCTGGAGTCTCT40
41GTGGCGCGGTTTCCTGTACCTGCCTTGGGATCCGGAGGGA80
81GGAAGCTGGGACACCCGGGAGTCAGGAAATGGACTCGGTG120
121GCTTTTGAGGATGTAGATGTGAACTTCACCCAGGAGGAGT160
161GGGCTTTGCTAGATCCTTCCCAGAAGAATCTCTACAGAGA200
201TGTGATGTGGGAAACCATGAGGAATCTGGCCTCTATAGGG240
241AAAAAATGGAAGGACCAGAACATTAAAGATCACTACAAAC280
281ACCGAGGGAGAAATCTAAGAAGTCATATGTTAGAAAGACT320
321CTATCAAACTAAGGATGGTAGTCAGCGTGGAGGAATTTTT360
361AGCCAGTTTGCAAATCAGAATCTGAGCAAGAAAATCCCTG400
401GAGTGAAACTCTGTGAAAGCATTGTATATGGAGAAGTCAG440
441CATGGGTCAGTCATCCCTTAATAGACACATCAAAGATCAC480
481AGTGGACATGAACCAAAGGAATATCAGGAATATGGAGAGA520
521AGCCAGATACACGTAACCAGTGTTGGAAACCCTTCAGTTC560
561TCACCACTCCTTTCGAACACATGAGATAATTCACACTGGA600
601GAGAAACTCTATGATTGTAAGGAATGTGGAAAAACCTTCT640
641TTTCTCTCAAAAGAATTAGAAGACACATCATCACACACAG680
681TGGATATACACCATATAAATGTAAGGTGTGTGGGAAAGCT720
721TTTGATTATCCCAGTAGATTTCGAACACATGAAAGAAGTC760
761ACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTCAGGAATGTGGAAA800
801AGCCTTCACTTGTATCACAAGTGTTCGAAGACACATGATA840
841AAGCACACTGGAGATGGACCTTATAAATGTAAGGTATGTG880
881GGAAACCCTTTCATTCTCTGAGTTCATTTCAAGTGCATGA920
921AAGAATTCACACTGGAGAAAAACCCTTTAAATGTAAGCAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。