演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF135pHZ-17

zinc finger protein 135

ZNF135(zinc finger protein 135)是蛋白質編碼基因,其產物具有 KRAB 與多個 C2H2-type zinc finger 結構,可能參與轉錄調控,並與細胞形態及細胞骨架組織的調節有關。

Homo sapiens19q13.43UniProt P52742
OFFICIAL SYMBOL
ZNF135
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P52742
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF135(zinc finger protein 135)是位於第 19 號染色體的蛋白質編碼基因,所屬蛋白質家族為 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其蛋白質長 658 個胺基酸,結構上具有位於 N 端的 KRAB 結構域,以及多個 C2H2-type zinc finger;另有一段被註記為無序區域。這些結構特色界定了 ZNF135 蛋白質的基本組成;來源並指出它可能參與轉錄調控。

Official symbol
ZNF135
Gene name
zinc finger protein 135
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12919
UniProt
P52742
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
pHZ-17ZNF61ZNF78L1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.43
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF135pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:58,059,238–58,086,310
Gene span
27,073 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000313434 ★58,059,282–58,069,7555
ENST0000035997858,059,238–58,069,4055
ENST0000040105358,059,238–58,069,7554
ENST0000089010158,059,244–58,069,4085
ENST0000112223358,059,259–58,074,0185
ENST0000051155658,059,269–58,068,6305
ENST0000104813458,059,269–58,064,7164
ENST0000113001858,059,269–58,074,0184
ENST0000098832058,059,276–58,064,7414
ENST0000112223458,059,277–58,074,0185
ENST0000050678658,059,280–58,069,4055
ENST0000089010258,059,282–58,069,4085

顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF135 可能參與轉錄調控;此項功能的證據標示為「Probable」,因此應視為可能的角色,而非已確立的結論。現有資料沒有進一步說明它調控哪些基因、作用於何種轉錄步驟,或透過何種分子機制影響轉錄,故不宜延伸推定其靶標或調控方向。

另一項研究指出,ZNF135 對細胞形態與細胞骨架組織的調節是必要的。這項描述將其功能連結至細胞形態維持及細胞骨架的組織調控,但來源未交代相關細胞類型、實驗條件,也未具體說明細胞骨架如何改變或此蛋白質如何介入。因此,能支持的結論限於其在上述調節中的必要性,不能據此指定更細緻的作用途徑。

綜合而言,來源支持的功能重點包括可能參與轉錄調控,以及對細胞形態和細胞骨架組織調節具有必要性;兩者的證據表述與細節並不相同,應分別理解。資料未提供足以進一步描述其分子作用方式或其他生物學效應的資訊。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 58059282 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF135 ENST00000313434 GRCh38 chr19:58058282-58059382 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTTGCCTTTGCTTTGTTTACATCAGTGCATTATGATTTTGAGCCATTATATCTCTTCATAATTGCCACTG
TTTTAGGGCTTATGAAATTTAAAGTCTTAACTTGTGTGTTAACCAGCCAAATCTTTGCAAGTGTCTGTGT
GTGGTACGAGAATTCGTATTGTGTTCTCTGCTGTTTTCAGAGTTGTTTCAGTCAAAGAAAAAAAAATGCC
CGTCTTAAAACTTTTCCTCTGCTTCAAATACAGCTCCCAAGCCCAGGCTGATTGGAATTAATCTGTCCTC
CCTTAAAAGGGCAAAAGCACAAGGCTCAGCCCTGGCTTTCCCAGCTCCTCTGGTCTCGCTGCTCCACGGA
CGTGTGACGTACGCTGGTGAAACGAAGCCCGCTTGAATGGGGGCTTCACTATTGTGTGCTGCTGAACCTA
GGCCTAGCGCCTGGCAGGCTTTGGTGAATGTTCAGAAAATGACAATTCATTTCGTGTCAGCGAGGGCACA
CCAGCTTTGAATATTTTGCTGCTGTTCAAATGCACAATTTTGACAATTACCTAGCAATGTCCAAAGTCGT
CATAATTGTTAGTGTCTTGCACGTGATGTTCCTTATAACCATGTAATAAATACAGTGTGAAGTCTCCATG
GCTGCCTCAGTGTGGAAAATGCAAAGACTCCCGTGTGTGCGATCTTGGTGAATGTTTTGGTTGAAAGTAT
GTGTTTTGAAAAAATCATTGCTTTGTTTGCAGCAGTAAAACTGACGGTAGAGTTTCCAACACGAAAGCCC
GTGTGGTCGCGCCGGGAGCTCACGGCGTTCCAAGCGGCACTTATCCCGCGTTGATGCCCAGGCACCCCGC
GCGCCCTGTTTCACCAGGCCCAGTCACTCCAGCTCCAGCAGCACTGAGAGCTCACGAACGCCAAGGGCGA
GAGCGAGGTGGGGGAGGGCGGCCGGAAATGCGCGCGCGGCTCTCTGGGAAATGGAGTTAGGCTCGCGCCG
GCGCAGTGTCGGCTGCCGGTGCCGCGGCCTTTGTCTCGCAGTCAGGAGGGTGAGCTAGGCCGGCGAGGAG
GGGGAGGGGAGGCCAGGCCGGGCCGGGCCGGGCCGGGTGCGGGGGGTCCGG
ZNF135 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF135_1 ↗19:58,059,282正股58,059,233–58,059,292

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9T36C · enhancer · 58054882–58055327 · regulatory

ENSR19_9T36H · promoter · 58055328–58055831 · regulatory

ENSR19_5HMNNK · CTCF_binding_site · 58055728–58055749 · regulatory

ENSR19_BFJ4Q · promoter · 58058749–58059292 · regulatory

ENSR19_BFJ4S · enhancer · 58059293–58060078 · regulatory

· motif · 58055730–58055746 · motif

· motif · 58059255–58059266 · motif

· motif · 58059255–58059266 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:658 aa

1 aa658 aa結構域功能區域鋅指
依 P52742 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF135 蛋白質長 658 個胺基酸,含有位於第 14–85 位的 KRAB 結構域;第 171–196 位被註記為無序區域。蛋白質序列另有 16 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 214–656 位。這些結構註解描述其區域組成,並不單獨確立各區域的具體功能。

結構域KRAB14–85 aa
鋅指C2H2-type 1214–236 aa
鋅指C2H2-type 2242–264 aa
鋅指C2H2-type 3270–292 aa
鋅指C2H2-type 4298–320 aa
鋅指C2H2-type 5326–348 aa
鋅指C2H2-type 6354–376 aa
鋅指C2H2-type 7382–404 aa
鋅指C2H2-type 8410–432 aa
鋅指C2H2-type 9438–460 aa
鋅指C2H2-type 10466–488 aa
鋅指C2H2-type 11494–516 aa
鋅指C2H2-type 12522–544 aa
鋅指C2H2-type 13550–572 aa
鋅指C2H2-type 14578–600 aa
鋅指C2H2-type 15606–628 aa
鋅指C2H2-type 16634–656 aa
功能區域Disordered171–196 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P52742…

AlphaFold · P52742

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF135 的定位資料指向細胞核;來源未提供定位改變的條件、異構型差異或動態變化資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
pHZ-17ZNF135ANKS1ALMO4SCNM1WWOX
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF135 可能參與轉錄調控,但此功能的證據屬於「Probable」,應保留其推論性。另有研究指出,ZNF135 對細胞形態與細胞骨架組織的調節是必要的;來源未進一步交代作用機制或實驗條件。含實驗來源
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation (Probable). Required for regulation of cell morphology and cytoskeletal organization

PMID 21834987 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF135 蛋白質定位於細胞核。這筆資料僅提供核內定位資訊,未描述定位變化的條件、異構型差異或細胞內動態。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000313434 · 3,334 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCCGCGGCCTTTGTCTCGCAGTCAGGAGGAGCAGGGCCAG40
41CCGTTCCTGCCAGAAGCCAGGGCATGACCCCTGGGGTGCG80
81CGTCTCCACAGACCCGGAGCAAGTGACGTTTGAGGACGTG120
121GTAGTGGGCTTCAGCCAGGAGGAGTGGGGGCAGCTGAAGC160
161CTGCCCAGAGGACCCTGTACCGTGATGTAATGCTGGACAC200
201CTTCAGGCTTCTGGTCTCTGTGGGACATTGGTTACCGAAG240
241CCGAATGTCATCTCCCTGCTGGAGCAAGAGGCAGAGCTGT280
281GGGCGGTGGAGTCTAGACTTCCCCAAGGCGTGTACCCAGA320
321CTTGGAAACTAGACCCAAAGTCAAACTGTCAGTTCTAAAG360
361CAAGGCATCTCTGAAGAAATATCCAACAGTGTCATCTTGG400
401TAGAAAGATTCCTGTGGGATGGTCTGTGGTACTGCAGGGG440
441TGAGGACACTGAGGGCCACTGGGAATGGAGTTGTGAGAGT480
481CTAGAGAGCCTGGCAGTGCCGGTGGCCTTCACGCCTGTGA520
521AGACGCCTGTTCTGGAGCAGTGGCAGAGGAATGGGTTTGG560
561GGAAAACATAAGTCTGAACCCTGATCTCCCACATCAACCA600
601ATGACTCCTGAAAGACAAAGCCCCCACACATGGGGAACAC640
641GTGGAAAAAGGGAGAAGCCAGACCTAAATGTTTTACAGAA680
681AACCTGTGTAAAAGAGAAACCCTACAAATGTCAGGAATGC720
721GGAAAGGCCTTTAGTCACAGCTCAGCACTTATCGAACACC760
761ACCGGACGCACACAGGAGAGAGACCTTACGAATGTCACGA800
801ATGCTTAAAAGGCTTCCGGAACAGCTCGGCACTTACCAAA840
841CACCAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCCTATAAATGCA880
881CTCAGTGTGGGAGGACCTTCAACCAAATTGCCCCACTGAT920
921CCAGCACCAGAGAACTCACACAGGTGAGAAGCCCTATGAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。