基因總覽
ZNF134(zinc finger protein 134)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其序列含有多個 C2H2 型鋅指結構,為此蛋白質的主要結構特色。現有資料指出,ZNF134 可能參與轉錄調控;此功能描述保留可能性,尚不足以進一步界定其作用方式或調控對象。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000396161 ★ | 57,614,242–57,624,724 | 3 |
| ENST00000600344 | 57,614,238–57,619,628 | 2 |
| ENST00001135455 | 57,614,238–57,624,724 | 3 |
| ENST00000948622 | 57,614,242–57,624,724 | 3 |
| ENST00000600883 | 57,614,256–57,620,318 | 4 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF134 可能參與轉錄調控。這項描述指出其與基因轉錄調節有關,但來源未提供具體的調控方向、作用標的或分子機制,因此不能據此判定它會促進或抑制特定基因的表現。
現有資訊也未說明 ZNF134 在哪些生物學過程中發揮作用,或其轉錄調控可能受到哪些條件影響。其 C2H2 型鋅指結構是已知的蛋白質特徵,但來源沒有提供這些結構與 DNA、RNA 或其他分子的直接作用證據,故不宜將其推定為特定分子結合機制。
因此,目前可支持的功能結論限於 ZNF134 可能涉及轉錄調控;其實際調控方式與生物學意義仍未由所提供的資料進一步界定。
Promoter 與基因調控
>ZNF134 ENST00000396161 GRCh38 chr19:57613242-57614342 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGTTTTTGTCTTTCTTTCCCCATACACTCGCCCTTTTCTTTTTTAAAACCATAAATAAATCTCAATTCTC AATTCAGACACTGTCGGTGTAATTGCAGGTGAAATGAGAATCACCTCCCAGCCAAGAAATCTGATCCCAA TTTTCCAAATCTTTATTTCTGGGTTCAGACACCACATTTTCAGCCCCTGTCTTGGCATATAAAAGCATTT ATAATGGTTCTTCTTTTCAGATAAGAAACATCACCAAAAGGAAATAGATATATCTCAACTTTTGGGCTAG GAACTCTCATTTGGATAAAAGAATATTTCTCCTTTGGTTGGACATTAGTGACCATACAGGCAGGAAAGGT GCCTTCCTTGACCACCTTCTCTCGCCTGTCTTCCTCCTCATGGTTCTCTCAGGTATTTTTTTTCTGAGGA AACCAGAGGAAGAGCTCTATATTAGTCCACTTGCCTCAGGGAGCTCCAGCATCCCTCCATAGCCACTGTC TGGAGACCATTCTTCCACTCCATGGCCCTGCCTGGGGACAATTCTCTGTTAACTCTGACCCAACTGAGGC TCACAAAACTGACTCAAAGCTTCCCTCTACAGTACACATATTTTTTAAATGAAGGAAATTTGACTGAACT ATGAGTGGACTCAGAGTGACATTGGATGTTGTGTGTCCATTTGGTGGTGTGGCTTCAGGGAACATCTGTA AGAATATATCCCAATATTTCGGGGATCCCTGCAGACCTCACTACACAAGACCTGGTTGAGGGTCCTTTAA AAGGAGCGAAGCCACGCCCTGACCTCAGAGTCTCAGGGCATAATTTCTCAGCGCCCCTCGCAGTACCATT TGGCCTTTGCCCAGCGTGCAGGGGAGTTAGCCGTCACCACGGCCAAGTGCACATGAGAACTGCATTGCCC AGAAACCTGTGCGCCGCCCGGCGGCGGCACTCTTAGGGGCGTCTCCCTGCGGACGGAAGCTCTCTGGGCG GGACTTCCGGTATCTTCCTCGCGGTGGACATCTTGTCGGCTCTTAGGTGGAACCATCGGAGCAGAAGCTC GGGGTTGCTGGGCGGTTCCGAGGTGACGGAAGCGGGAGGGTGCGGGAGAAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF134_1 ↗ | 19:57,614,242 | 正股 | 57,614,193–57,614,252 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_9STFP · promoter · 57613748–57614252 · regulatory
ENSR19_5HJTZ9 · CTCF_binding_site · 57614159–57614180 · regulatory
ENSR19_BFFPG · enhancer · 57614253–57615013 · regulatory
· motif · 57613914–57613925 · motif
· motif · 57614161–57614177 · motif
· motif · 57614223–57614232 · motif
· motif · 57614223–57614234 · motif
· motif · 57614223–57614234 · motif
· motif · 57614469–57614479 · motif
· motif · 57614472–57614489 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:427 aa
ZNF134 蛋白質全長為 427 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。序列中註解有 11 個鋅指區域,其中第 2 個被標示為退化型;其餘區域均註記為 C2H2 型。這些區域分布於蛋白質序列的不同位置。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF134 的細胞內定位註記為細胞核。 現有資料未提供定位變化的條件、異構型差異或動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- MFAP1P55081 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TNS2Q63HR2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM41Q8WV44 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCGGTGGACATCTTGTCGGCTCTTAGGTGGAACCATCGGA40GCAGAAGCTCGGGGTTGCTGGGCGGTTCCGAGGTGACGGA80AGCGGGAGGGTGCGGGAGAAGTCGCTGTTCGCTCTGCGGA120GTGGCTCGCCAGCGAAGACCCCGCCTGCGCCCCCGGGGAC160GGACGACCGCGGTGCCAGGGTCCCGCGACCTGGGACCCCC200TCGCGGCTCCGGGTGGTCTACGAACTGTGATGGCGGCGGC240CGCGGTGATGGGCCCGGCGCAGATCCTCTGTGGTTGTTGA280ATTGTAACAAGAGAGAGAACTCTGGCTGCCTGAGAGGGCA320TGACTCTAGTCACAGCAGGAGGGGCTTGGACAGGCCCTGG360TTGTTGGCATGAAGTGAAGGATGAAGAGTCATCTTCTGAA400CAGAGCATTTCTATAGCAGTGTCACATGTTAATACTTCCA440AGGCAGGTTTGCCCGCACAGACGGCTCTCCCTTGTGACAT480ATGTGGCCCCATCTTGAAAGATATTTTGCACCTGGATGAA520CACCAGGGTACACACCATGGACTGAAACTTCACACATGTG560GGGCATGTGGGAGACAATTCTGGTTCAGTGCAAACCTTCA600TCAGTACCAGAAGTGTTACAGTATAGAGCAACCCTTAAGA640AGGGATAAAAGTGAGGCCTCAATTGTGAAGAACTGCACAG680TTAGCAAAGAACCTCATCCGTCAGAGAAGCCCTTTACGTG720TAAGGAGGAGCAGAAAAACTTCCAGGCTACTTTGGGTGGC760TGCCAACAAAAGGCCATCCACAGTAAGAGGAAGACACACA800GGAGCACTGAGAGTGGGGATGCATTTCATGGTGAACAAAT840GCATTACAAGTGCAGTGAATGTGGGAAAGCTTTCAGCCGC880AAAGACACACTTGTCCAGCACCAGAGAATTCATAGTGGAG920AGAAGCCTTATGAGTGCAGCGAATGTGGGAAAGCCTTCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。