演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF133pHZ-13

zinc finger protein 133

ZNF133(zinc finger protein 133)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族的蛋白質,可能以抑制因子的身分參與轉錄調控。

Homo sapiens20p11.23UniProt P52736
OFFICIAL SYMBOL
ZNF133
CHROMOSOME
20
UNIPROT
P52736
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF133 的正式名稱為 zinc finger protein 133,屬於蛋白質編碼基因,其產物歸於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質序列具有 N 端 KRAB domain,以及多個 C2H2-type zinc finger;其中末端一個 zinc finger 被標註為非典型。序列另有兩段被註解為無序區。這些結構特徵界定了 ZNF133 的蛋白質組成;其可能參與的生物學角色,來源描述為轉錄調控中的抑制作用。

Official symbol
ZNF133
Gene name
zinc finger protein 133
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12917
UniProt
P52736
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
pHZ-13pHZ-66ZNF150

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2020p11.23
chr20 · 64,444,167 bp · GRCh38chr20p13 · 1–5100000 · gnegchr20p12.3 · 5100001–9200000 · gpos75chr20p12.2 · 9200001–12000000 · gnegchr20p12.1 · 12000001–17900000 · gpos75chr20p11.23 · 17900001–21300000 · gnegchr20p11.22 · 21300001–22300000 · gpos25chr20p11.21 · 22300001–25700000 · gnegchr20p11.1 · 25700001–28100000 · acenchr20q11.1 · 28100001–30400000 · acenchr20q11.21 · 30400001–33500000 · gnegchr20q11.22 · 33500001–35800000 · gpos25chr20q11.23 · 35800001–39000000 · gnegchr20q12 · 39000001–43100000 · gpos75chr20q13.11 · 43100001–43500000 · gnegchr20q13.12 · 43500001–47800000 · gpos25chr20q13.13 · 47800001–51200000 · gnegchr20q13.2 · 51200001–56400000 · gpos75chr20q13.31 · 56400001–57800000 · gnegchr20q13.32 · 57800001–59700000 · gpos50chr20q13.33 · 59700001–64444167 · gnegZNF133pq1 bp64,444,167 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr20:18,288,265–18,316,996
Gene span
28,732 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000425686 ★18,288,527–18,316,9967
ENST0000062821618,288,265–18,316,9965
ENST0000085406518,288,265–18,316,9966
ENST0000096348718,288,280–18,316,9964
ENST0000039602618,288,283–18,316,9966
ENST0000062260718,288,283–18,316,9965
ENST0000085406618,288,283–18,316,9964
ENST0000037767118,288,477–18,316,9967
ENST0000085406718,288,497–18,316,9967
ENST0000085406818,288,497–18,316,9964
ENST0000085406918,288,497–18,316,9965
ENST0000085407018,288,497–18,316,9965

顯示 12/76 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF133 可能參與轉錄調控,且被描述為可能以抑制因子的方式作用。這項功能敘述指出了其可能的調控方向,但並未提供特定受調控基因、作用步驟或細胞條件,因此無法據此進一步界定其影響範圍。

現有資料未說明 ZNF133 如何產生抑制作用,也沒有指出其作用所需的分子互作、辨識序列或下游變化。因而可支持的結論限於:ZNF133 可能是轉錄調控中的抑制因子;其具體分子機制及相關生物學過程尚無法由這些資料確定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 18288527 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF133 ENST00000425686 GRCh38 chr20:18287527-18288627 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GAGAGCTACAAAAGAATTTTAGGAAATTCTCATCTCCCTGGCCCTTCAGACAGTGGTCATTTTCTTGGTC
TTCCAAGAGAATGACAAAGTTTCAGAAAGCCTATCTGAGGAAGGTGAAGGGCAGTGAGAGGGTGCACGGG
TGGAAAAGCCCTCTCAAGAGTGACGTGGGCCTTCCCCTCGAGCTCCCCAGATGGGGCGTCCCAGATGGCA
CCAGCGCAATCTTGTTCTCAACCAGGATCCCGGACAAAGACCTAGAGATCCAAGCCGACGGCAGGCCAAG
CTCTGGCCCGAGACTGAGGCTTCTGCTTCTCAGGAGATGAGAGTTTAACAATAACTTCGTGGATTTCAAA
AAGAAGAAAAAGGTCTCAGGGCACCGGAAAAGGTGTATTCGGGTTGAGGGCGTGGGCTCAGAATCGGGTC
TACCTCGTACGGGATGTGAGACTTCAGGCAGACTGCTCGGCCTTTTCAAGGCTTTAAATGGAGCTAAAGG
GTATACGACATGACGTTCGCCCGGTGTTTAGGAATATGGGGCGTGACTTTCCAAGCAGGCGGCTGGAGCC
AGGGAGACCACAGGCCGCTGCAACACAAACCAGCACCTGAACAAGCTTGGTCAGCCAGCGGTACACCTCC
GCCAACCCCAGAAGCCGAACAGATGCGCCCCGAAACGTCATTTCCGCGCGCCAAGGGGCGGGGCCGGTAC
CGGGTGCGGAAGTCGCTCCAGGGGTCACTGGGAAGTGTAGTTTTCGAGACAGAGGCGCTCAGAAGGAGGG
TCACAGTAGGGCCAGGCACTCTTCTCGGGAGCTCCTACGTGTTTTATGCACGTGGTTAAGAAAAAAGAGG
GAGAATTCAGGTGCCACAGTGGCCATTCTCCGGTGACCGGAGCGTGTTACTCAGAAACGGATCCGTCAGA
GGCCAATGGGAGCTGCCGGCCTTCAGGGCGCGCCTGGTGGCGCCGAGCATCCTGGGAGGTGTGGTCCGGG
CGCTGTGCCGAGGATTCGGGGTAGTGTAGTCCTGGCGCCCCGCTGGAGGAGCTCCCCAGCTGGTGGCTGG
AGCGACCCCTTGTTCTTTGGTGGCGCTGGTGAGTGAGGCTCCCGCGGGACC
ZNF133 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF133_1 ↗20:18,288,527正股18,288,478–18,288,537
ZNF133_2 ↗20:18,298,064正股18,298,015–18,298,074

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR20_B5LZT · promoter · 18287793–18288561 · regulatory

ENSR20_B5LZZ · enhancer · 18288562–18289364 · regulatory

ENSR20_56B5WD · CTCF_binding_site · 18288575–18288596 · regulatory

· motif · 18284974–18284987 · motif

· motif · 18285003–18285016 · motif

· motif · 18286600–18286609 · motif

· motif · 18288091–18288106 · motif

· motif · 18288210–18288220 · motif

· motif · 18288229–18288240 · motif

· motif · 18288334–18288350 · motif

· motif · 18288334–18288350 · motif

· motif · 18288343–18288352 · motif

· motif · 18288343–18288352 · motif

· motif · 18288490–18288499 · motif

· motif · 18288491–18288501 · motif

· motif · 18288577–18288593 · motif

· motif · 18288712–18288725 · motif

· motif · 18288719–18288736 · motif

· motif · 18288786–18288799 · motif

· motif · 18288873–18288890 · motif

· motif · 18288959–18288970 · motif

· motif · 18288985–18288996 · motif

· motif · 18289071–18289084 · motif

· motif · 18289071–18289084 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:654 aa

1 aa654 aa結構域功能區域鋅指
依 P52736 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF133 是 654 個胺基酸的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其 N 端含 KRAB domain;序列中標註 15 個 zinc finger,前 14 個為 C2H2-type,末端一個為非典型 C2H2-type。另有兩段序列被註解為無序區。

結構域KRAB1–72 aa
鋅指C2H2-type 1214–236 aa
鋅指C2H2-type 2242–264 aa
鋅指C2H2-type 3270–292 aa
鋅指C2H2-type 4298–320 aa
鋅指C2H2-type 5326–348 aa
鋅指C2H2-type 6354–376 aa
鋅指C2H2-type 7382–404 aa
鋅指C2H2-type 8410–432 aa
鋅指C2H2-type 9438–460 aa
鋅指C2H2-type 10466–488 aa
鋅指C2H2-type 11494–516 aa
鋅指C2H2-type 12522–544 aa
鋅指C2H2-type 13550–572 aa
鋅指C2H2-type 14578–600 aa
鋅指C2H2-type 15; atypical606–631 aa
功能區域Disordered119–198 aa
功能區域Disordered622–654 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P52736…

AlphaFold · P52736

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF133 的定位資料指出其位於細胞核;來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
pHZ-13ZNF133FOSKRTAP10-7
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF133 可能參與轉錄調控,並可能以抑制因子的方式發揮作用;來源未指出特定標的或作用機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation as a repressor

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF133 位於細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000425686 · 2,654 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTAGTGTAGTCCTGGCGCCCCGCTGGAGGAGCTCCCCAGC40
41TGGTGGCTGGAGCGACCCCTTGTTCTTTGGTGGCGCTGAT80
81CTACCTTCTGAGATATCATCCTTCTTCAGGGAGATAAGGA120
121AAAAAAGCCACAGGGTCCCGGAGAGCCAGGGGAATGCTTC160
161AAAAGTTCTGCTGCCTGAGAGTAACGTCACAGTAATGGAA200
201CGGGAAGATTCTGGAATCTGTGTCCCCACCTAGACAACGA240
241TTATACTGGCAGGATCTATCAGGTGTACCTATTTTGGAAC280
281TCTGGAGTCTAGTTGAAGGCCTCCAGTTCCCAGGGGGAAG320
321GAAGCATGGAGGTGTGTCCTCCATTTGGAAGTAGTGCTAA360
361GAAAATTAAAAGAATAAAACTGGGCAGGGGCATGAGAATA400
401GGATGCAAAGATGAATTTTTGGACTGAGTGGCCAAGAAGC440
441TCCATGGTGAGCACTCACAGTCTAAGGCTGGAAGTTTAAT480
481GAACTGTTTTCTACATTTCACAGGCACACATGGCATTCAG520
521GGATGTGGCTGTGGATTTCACCCAGGATGAGTGGAGGCTG560
561CTGAGCCCTGCTCAAAGGACTCTGTACAGAGAGGTGATGC600
601TGGAGAACTACAGCAACCTGGTCTCACTGGGAATTTCATT640
641TTCTAAACCAGAACTCATCACCCAGCTGGAGCAAGGGAAA680
681GAGACCTGGAGAGAGGAAAAAAAATGTTCACCGGCAACCT720
721GTCCAGCAGATCCAGAGCCAGAGCTCTACCTCGATCCTTT760
761CTGCCCTCCGGGTTTCTCCAGTCAGAAATTCCCCATGCAG800
801CATGTGCTGTGTAATCATCCCCCCTGGATCTTCACATGCT840
841TGTGTGCAGAAGGTAACATCCAGCCTGGGGATCCGGGCCC880
881AGGGGACCAGGAGAAGCAGCAACAAGCCTCTGAGGGGAGA920
921CCCTGGAGTGATCAAGCAGAAGGTCCTGAGGGAGAAGGTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。