基因總覽
ZNF132 是人類的蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 132。其產物屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,具有 KRAB 結構域及多個 C2H2 型 zinc finger。現有功能註解指出,這種蛋白質可能參與轉錄調控;此描述保留了「可能」的限定,並未指定調控對象或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000254166 ★ | 58,432,814–58,440,153 | 3 |
| ENST00000950417 | 58,432,814–58,440,172 | 3 |
| ENST00001141156 | 58,432,814–58,440,172 | 3 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF132 的功能註解指出,它可能參與轉錄調控。這項描述屬於概括性的可能功能,來源未進一步說明它調控哪些基因或轉錄事件,也未提供可據以確定調控方向的資訊。因此,目前可支持的功能性理解僅限於其可能涉入轉錄調控,不能據此推定特定靶標、分子機制或生物學結果。
Promoter 與基因調控
>ZNF132 ENST00000254166 GRCh38 chr19:58440053-58441153 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCTCTTACGCTCTCCACTCGCTGCCAAGGGGGCATGAGAGCCTGCCTGAACGCTCAGGTCAGGGTCAAGT CCAAGTCTTCGCATATGCAGATCCCTCCTCCTGTACCCTCCACGTCTCAACAAACTGGATTCTGAAATGG TGACCCCCAACCTGTGAACGCTCCACACTGTTCAGTGGGGCCCGCAGAGGACCTGGGGCAGATACTTCTC AATCGGAGACTTAGGACAATGGTGCTGAGTCCAGCGGAGTGGGTGCCAGGAGACCTTTGGCGCACGTTCC ATGCCTACAGCCGGGCGCACACTGGGTCAAGACCTCCCAATGCGTAGCTTTTCTTGGCCTCGGCCTCGCG CTCCCTAAAGCCAACATAACGCCAAGGGCGACGACTCCCGAGAGCCGCGGACACCTCCGCGCGGTGCAAC CTGAGGGTCCCACTGGGCCGGCTTTATCTAAGGCACAGGGTGGGGAAGGGGGGTGCGGTGTTGTGGGGGG CGAACACTGGGCTCAGGGGCGATATTCGCCGCGGTGGGGGCGCTTGTATGTCAAGAAGGCGGAACTTCCC CGACTCTCGTGCCTTCCTCGCTCCTGTTTCCATGGGCCCAGGGAGCCTCCAAGATTCCGTCCCTCGCCTG ACAACGCGGTCCCTTCAGAAGCAGACAAAATCGAGAAATGCCAAAGTGATGGTCCGAGGACGACGACGGA AGTCCCGCTGCCAGGCTGTGATTGGCCAGCGTCTTACACTCCGCCCGGAAGTGCCTGTCTCCTCGGCTGC CAATGGCCAGCCCTGAGGCACCGCGAGGGTCCTTCTGGATAATGTAGTTTGCGTTGCCTGAGCAGCGACG CAATAAACGCCATTCCTCAATCACCTTGGCAACGACCTAGCAGTAGCGTGACGGGCATAGGGAAATAGCG TCATAGACGGCGGGGATCCTTGAGCCAATGAAAGCTCGGACCAGTGGCAAGTCCGAGCTGTCATTGAGAG GCGGGACTTCCGGCGCCGCCATTGCGGTCCTCATTTTGCTGCTGGTGGGTTGGGCTACAGCAGGCCTCTG GAGCCACACCAGGGCACGGGAGTGGGTGCAGGGACCGTCACCGCGCCTTCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF132_1 ↗ | 19:58,440,153 | 負股 | 58,440,143–58,440,202 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_BFL5S · enhancer · 58439450–58440142 · regulatory
ENSR19_9T79R · promoter · 58440143–58440458 · regulatory
ENSR19_BFL5Z · enhancer · 58440459–58441049 · regulatory
· motif · 58440144–58440161 · motif
· motif · 58440150–58440160 · motif
· motif · 58440160–58440169 · motif
· motif · 58440401–58440410 · motif
· motif · 58440401–58440412 · motif
· motif · 58440401–58440412 · motif
· motif · 58440597–58440608 · motif
· motif · 58443408–58443422 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:706 aa
ZNF132 蛋白質長 706 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列註解包括第 38–121 位的 KRAB 結構域,以及 18 個 C2H2 型 zinc finger;其中第一個標示為退化型,其餘標示為 C2H2-type。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF132 的定位註解為細胞核;來源未描述定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ATTGCGGTCCTCATTTTGCTGCTGGTGGGTTGGGCTACAG40CAGGCCTCTGGAGCCACACCAGGGCACGGGAGTGGGTGCA80GGGACCGTCACCGCGCCTTCACACGCACCATAGTGCCCGG120CTAATTACTCTGCTTTTATGAGCCAAGGTGTTCCCGAAAG160TGGAGCCAGCGCCACGCGTCTCCAGGGTCTCCATACCCAG200CCTTCGTCCCTGCGGTGCCCAGAGGCCTTGCGCGCATTTT240GCATTTGGGAAGACAGGTCCTGAGTGCGACCGTCACCCAG280CGGAAGTGTGAGGGTTCGGCCCAGCGGCAGGGCTAGCCCT320GGGCCTCCTGTTATGGCCCTGCCCAGCCCACAGGTTCTAA360TGGGGTTGCCAGCGTTGCTGATGGGCCCGGCGCAGCATAC400TTCTTGGCCCTGTGGCTCAGCTGTCCCCACATTGAAGAGC440ATGGTAACCTTTGAAGATGTGGCTGTATACTTCTCCCAAG480AGGAGTGGGAGCTCCTTGATGCAGCCCAGAGGCACCTGTA520CCACAGTGTGATGCTGGAAAACCTTGAGCTTGTGACCTCA560CTTGGTTCTTGGCATGGAGTAGAGGGTGAGGGGGCCCATC600CCAAGCAGAATGTTTCTGTAGAAGTGTTACAGGTCAGGAT640CCCTAATGCAGATCCTTCCACCAAGAAAGCTAACTCCTGT680GACATGTGTGGGCCATTCTTGAAAGACATTTTGCACCTGG720CTGAGCATCAGGGAACACAGTCTGAGGAGAAACCCTACAC760ATGTGGAGCATGTGGGAGAGACTTTTGGTTGAATGCAAAC800CTTCACCAGCACCAGAAGGAGCACAGTGGAGGGAAGCCCT840TTAGATGGTACAAGGACAGGGACGCACTTATGAAGAGCTC880TAAAGTCCACCTGTCAGAGAACCCCTTCACTTGCAGGGAA920GGTGGGAAGGTCATCCTGGGCAGCTGTGACCTCCTCCAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。