基因總覽
ZNF124(zinc finger protein 124)是人類的蛋白質編碼基因,其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質全長 351 個胺基酸,具有 N 端 KRAB 結構域,並含有八個 C2H2-type zinc finger。這些結構特徵界定了它的家族歸屬;來源將其可能角色概述為參與轉錄調控,但未提供更詳細的分子作用或調控對象資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000543802 ★ | 247,154,989–247,172,020 | 4 |
| ENST00000472531 | 247,121,975–247,172,063 | 4 |
| ENST00001095482 | 247,121,975–247,172,063 | 2 |
| ENST00000994554 | 247,123,377–247,172,063 | 5 |
| ENST00001095483 | 247,123,502–247,172,063 | 4 |
| ENST00000491356 | 247,138,145–247,172,063 | 4 |
| ENST00001129407 | 247,140,164–247,172,063 | 4 |
| ENST00000915841 | 247,154,985–247,172,063 | 4 |
| ENST00001077223 | 247,154,989–247,172,063 | 4 |
| ENST00001145377 | 247,154,989–247,172,063 | 4 |
| ENST00001040566 | 247,154,990–247,172,063 | 4 |
| ENST00001095485 | 247,155,474–247,172,063 | 4 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF124 可能參與轉錄調控。現有資料僅以概括方式指出這項可能功能,沒有說明它調控哪些基因、促進或抑制轉錄,也未交代其作用所需的分子互作、細胞條件或生物學情境。因此,目前可描述的功能範圍限於其可能涉入轉錄調控,不能據此判定具體的調控方向或作用機制。
Promoter 與基因調控
>ZNF124 ENST00000543802 GRCh38 chr1:247171920-247173020 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCTGAAGACATGGGTTTTCTTCTCCTGGGGCCCCTCATCTTTTTTTCACTGTCTTATCTATAGAAGAGGC TGGGCCCCTGGCAAGAGCAGGTGGGAAATAGTAGACTCCCTCTAGATACTTCTTTATTGCAGCCCACTTC TCTCTCTGGGCACTGTCTCTGCCACCCTTGGGCCTGAGGAGAGATGTTAGCAGAAGGAGGGCATTCCCTC ACCTCTAGCAGAAAAGAGGGGTTCGGGCCCTTCACTCCCTGAGGTCAGGGGAACCAGAGCCCTCAAAACT GCACTTCAGTGTGACAGTCATTGCCCACAGGGGTCTACTTAGCACCTAGAATGTGGCTGGTCTGAATCGG TACATGCTGGAAGTTTAAAACGCAGAGTGACTTTGAAAGATTTAGTACCAAAAAACAGAACAACAAAAAA TACTTCATTAATATTATATTTATCATATATTTAAATTATAATATTTTGTATATATTGAGTTAAATAAAGT ATTGCAATCAATTTTACCTGTTTATTCCTCGTTTCTGTTGCTACTAGAAATTTTAAAATGACACCTGTGG CTCACATGTGATTTCTGTGGAAATCGCAGCCTTGGAGGATTGCTTCCCTTTTCAAAACTCGGGCTCCTCA GACTGCTTCCTCAGAAGACCAGAGGCCATGAAGGTTAATAAGTCTGAAATTTTAAAAGAATTATTATTAT ATTGTTTCCTATTTTAAATATCATATATATTATTCACAAATGAATGTAACATTGTATACAAGGTTAAGTG TATATAAATGAATGTCCCCTAGGCAAGGCTGGGTCCCAACCCAGAGAGGAAACCCTCTTGGAGAAGAGCT GTAGCCAGAACGCTGCCTCATTCAGACACGCGCGGGAGCTGTCACCTGTCACTAAGAGTCTGAGGGGGCG GGGCCTGAGGCCCTACCCAATCAGGGGCACCGGGGCGGGGACTGCCTAATCCGGCGCTCCGCTAGAAAAC CCGAGGCGGCTTCCGGGTGTGCCCGGCCTTTGTCTCTCGTGCCCGCACGTGCGTGTCTCGGTCAGTAGCC CTGCGCTTCTCCTTCACTCTCGGCGGTTCAGGAGGCTCTGCCGCAGCCGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF124_1 ↗ | 1:247,172,018 | 負股 | 247,172,008–247,172,067 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:351 aa
ZNF124 長 351 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 KRAB 結構域位於第 13–106 位胺基酸;另有八個 C2H2-type zinc finger,依序分布於第 122–144、150–172、178–200、206–228、234–256、262–284、290–312 與 318–340 位胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
現有資料未提供定位變化的條件、不同異構型之間的差異,或其定位動態。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 54 個夥伴
- AMMECR1Q9Y4X0-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AXIN2Q9Y2T1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BACH2Q9BYV9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BLZF1Q9H2G9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCNDBP1O95273 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DISC1Q9NRI5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DMWDG5E9A7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FHL5Q5TD97 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FKBP1AQ0VDC6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRS3O43559 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FSD2A1L4K1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GLRX3O76003 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA2Q08379 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HAP1P54257 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSPA2P54652 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT31Q15323 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT34O76011 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP1-1Q07627 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-5P60370 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCCCGGCCTTTGTCTCTCGTGCCCGCACGTGCGTGTCTCG40GTCAGTAGCCCTGCGCTTCTCCTTCACTCTCGGCGGTTCA80GGAGGCTCTGCCGCAGCCGGGGCCCTCCTGTGACCTGCAT120GTACTGGGGGATTCGCAGGGAGGATGTCGGGACACCCCGG160AAGCTGGGAAATGAACTCGGTTGCCTTTGAGGATGTGGCT200GTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGTTGGATCCTT240CCCAGAAGAATCTCTATAGAGACGTGATGCAGGAAACCTT280CAGGAATCTGGCTTCCATAGGAAACAAAGGGGAAGACCAG320AGCATTGAAGATCAGTACAAAAATTCTTCAAGAAATCTAA360GGCACATCATATCTCATTCTGGAAACAACCCATATGGGTG400TGAGGAATGCGGAAAGAAGCCATGTACATGTAAACAATGT440CAGAAAACTTCCCTTTCTGTCACAAGGGTTCACAGAGACA480CAGTAATGCACACTGGAAATGGACATTATGGTTGTACAAT520ATGTGAGAAAGTTTTTAATATTCCCAGTTCATTTCAGATA560CATCAGAGAAATCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTA600TGGAATGTGGGAAAGCCTTAGGTTTTTCCCGTTCTCTTAA640TAGACATAAAAGGATTCACACTGGAGAAAAACGCTATGAA680TGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGTCGTTCCAGTCACC720TTCGTGACCATGAAAGAACTCATACTGGAGAGAAACCCTA760TGAATGTAAGCACTGTGGGAAAGCCTTCCGTTACTCCAAT800TGCCTTCATTACCATGAAAGAACTCACACTGGAGAGAAAC840CTTATGTGTGCATGGAATGTGGCAAAGCTTTCAGTTGTCT880CAGTTCCTTGCAAGGACATATAAAGGCTCATGCTGGTGAA920GAACCCTATCCATGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。