演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF121ZHC32

zinc finger protein 121

ZNF121(zinc finger protein 121)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 的蛋白質,可能參與轉錄調控,蛋白質定位於細胞核。

Homo sapiens19p13.2UniProt P58317
OFFICIAL SYMBOL
ZNF121
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P58317
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF121(zinc finger protein 121)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其序列包含多個 C2H2 型 zinc finger,構成此蛋白質的主要結構特色;其中部分區域被註記為退化型。現有資料提供了家族歸屬與結構域資訊,但未進一步說明其他結構區域或其在不同細胞條件下的變化。

Official symbol
ZNF121
Gene name
zinc finger protein 121
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12904
UniProt
P58317
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZHC32ZNF20D19S204

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.2
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF121pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:9,560,329–9,584,545
Gene span
24,217 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000320451 ★9,560,329–9,584,5044
ENST000005866029,560,329–9,584,4976
ENST000010080769,560,329–9,584,5455
ENST000011427029,560,329–9,584,5454
ENST000005914479,566,660–9,567,7432

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF121 的功能註解指出,它可能參與轉錄調控。此描述保留了可能性,並未界定其調控方向、作用對象或具體分子步驟,因此不能據此判定它會促進或抑制特定基因的轉錄。

現有資料未提供 ZNF121 如何作用於轉錄調控的實驗細節,也未列出相關的生物學過程、細胞情境或功能後果。因此,目前可支持的功能範圍僅限於其可能參與轉錄調控;更具體的作用機制與生物學意義尚無法由這些資料說明。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 9584504 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF121 ENST00000320451 GRCh38 chr19:9584404-9585504 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCATACCCAGCCAGAAATACATACTTGATGAAGACAAAAAAAAATCAAGATTTACAGAAAATATTATTAT
ATTGAAAACGTGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGTCTATAATTCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGGAGACAG
ATCATTGGAGGTCAGGAGTTCGAGATCAGTCTGGCCATCATGGTGAAACTCTTCTCTACTAAAAGTACAA
AAATTAGCTGGGCGTGGAGGCAGACATCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATCACT
TGAACCCGGGGGGCAGAGGTTACAGTGAGCCGAGGTCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTG
AGATCTGTCTCAAAAAAAAATAAAAAATGAAAAAGAAAAACGAAAAAAGAAAACGCAATGGAACCAGCAG
GTTCTAAAAAATAAAGAATGAAGAAATAAAGGCCTACAGAAAGCCTGACTGAATAGAAGAGATAGACCAT
GCCATTCACTGGCAGCTTTATCCATATGGAAGAATCATGGAAAGGCTCTAGGAACATGAGATGTATACAA
ACAAGCTTTATATATATGTATACACACATATATATTTTAATAAAGGATGTTGCTATTTTGCCCACGCTGG
TCTTGAACTCTTGGACTCAAGCTATCCACCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGTTGGACTTACAGGCCTTAGC
CACTGTGCCCACCTGGGAAAAGCTCTGCAGGAGCATCCCCTGGGGTGCGTCCCATCCCCCACGCCCGCCC
TTCCAGCAGGTCCGGCCACCTGAACCGCCGGCTAGCCGGGTCCCACCTCTAAACCGCCCCCAAGTAAGGG
CCTGTCCGCGCCCACCCGGGAAGAAACTACAATTTCTGTGTTTGACTGGGTCCTATGTGGCTGAAACTCG
AACCCAGGAGCCCCGCCCGGCCCGAGGCTCGGAGCGGAAGTGACGTCAGCGCACAATCGCCATCTTTTCC
GGCGCTGGCTCCGCATGGTCAGTGCCATTTCGCCTTTATCGTGGTGGAGTCCACCCTGGCTGTGGTGAGT
TCCGCCTGCTTGGGGATCCCGGAGATAGCGGGGGGCGGCAAAGGAACGATT
ZNF121 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_B3WCK · enhancer · 9583533–9584486 · regulatory

ENSR19_95RPC · promoter · 9584487–9584994 · regulatory

ENSR19_95RQ2 · enhancer · 9586754–9587159 · regulatory

ENSR19_548TSQ · CTCF_binding_site · 9586882–9586903 · regulatory

ENSR19_548W42 · CTCF_binding_site · 9588236–9588257 · regulatory

· motif · 9583964–9583976 · motif

· motif · 9584064–9584073 · motif

· motif · 9584086–9584095 · motif

· motif · 9584108–9584119 · motif

· motif · 9584530–9584540 · motif

· motif · 9584544–9584557 · motif

· motif · 9584544–9584557 · motif

· motif · 9584553–9584562 · motif

· motif · 9584553–9584564 · motif

· motif · 9584705–9584722 · motif

· motif · 9586815–9586830 · motif

· motif · 9586861–9586875 · motif

· motif · 9586884–9586900 · motif

· motif · 9588238–9588254 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:390 aa

1 aa390 aa鋅指
依 P58317 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF121 蛋白質長 390 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列註解列出 11 個 C2H2 型 zinc finger:前兩個標示為退化型,其餘九個標示為 C2H2 型。

鋅指C2H2-type 1; degenerate88–110 aa
鋅指C2H2-type 2; degenerate116–138 aa
鋅指C2H2-type 3144–166 aa
鋅指C2H2-type 4172–194 aa
鋅指C2H2-type 5200–222 aa
鋅指C2H2-type 6228–250 aa
鋅指C2H2-type 7256–278 aa
鋅指C2H2-type 8284–306 aa
鋅指C2H2-type 9312–334 aa
鋅指C2H2-type 10340–362 aa
鋅指C2H2-type 11368–390 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P58317…

AlphaFold · P58317

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF121 的定位註解為細胞核;現有資料未提供定位隨條件改變或異構型差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 7 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZHC32ZNF121CARD9KEAP1KRTAP10-8RBAKTRIM41ZNF835ZNF837
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF121 可能參與轉錄調控;此註解指出可能的功能方向,但未說明調控的方向、作用對象、機制或具體生物學情境。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF121 的定位註解為細胞核;此資料未說明定位是否會隨細胞條件改變,也未提供異構型之間的定位差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000320451 · 6,987 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTGCCATTTCGCCTTTATCGTGGTGGAGTCCACCCTGGC40
41TGTGGACCTATTCAAACTCAGTCTGTCTCTTGACTGGAGG80
81AGGAGAAGGAAAAGTTGAGCACATTGCCAACCGGAGTTCC120
121CCAAGAATGGCAAGTTAAAACCAAAGTGTCAGCACCTCAA160
161CAACATTTTTTTTTGGCTTAACAAAACATCAAACGGCATA200
201CAAATGGCAGAAATCCACAATGGAGGGGAACTCTGTGACT240
241TTATGGAAAATGGAGAAATCTTCAGTGAACACTCATGCCT280
281TAATGCACACATGGGAACTGAAAATACAGGGGACACTTAT320
321GACTGTGATGAGTATGGAGAAAACTTTCCCATGTTACACA360
361ACAGTGCCCCTGCTGGAGAGACACTTTCTGTGTTGAATCA400
401GTGCAGAAAAGCCTTCAGCCTGCCACCAAATGTTCACCAG440
441AGAACGTGGATAGGAGACAAATCCTTTGAATACAGTGACT480
481GTGAGGAAGCCTTTGTTGATCAGTCACATCTTCAGGCAAA520
521TAGGATAACTCACAATGGAGAAACACTCTATGAACAGAAG560
561CAATGTGGGAGAGCTTTTACTTACTCCACAAGCCATGCTG600
601TGTCTGTTAAAATGCATACTGTAGAAAAACCCTACGAATG640
641TAAGGAATGTGGAAAATTCTTTAGATATTCTTCATATCTT680
681AATAGTCACATGCGAACCCATACTGGGGAGAAACCCTATG720
721AATGTAAGGAATGTGGGAAATGCTTCACTGTTTCTTCACA760
761CCTAGTTGAACATGTAAGAATTCATACTGGAGAGAAACCT800
801TATCAATGTAAGGAATGTGGAAGAGCCTTCGCTGGGCGCT840
841CAGGCCTTACTAAACATGTACGAATACACACTGGAGAGAA880
881GCCCTATGAATGTAACGAATGTGGGAAAGCCTACAATAGG920
921TTTTATCTACTAACTGAACATTTTAAAACTCACACAGAGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。