基因總覽
ZNF121(zinc finger protein 121)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其序列包含多個 C2H2 型 zinc finger,構成此蛋白質的主要結構特色;其中部分區域被註記為退化型。現有資料提供了家族歸屬與結構域資訊,但未進一步說明其他結構區域或其在不同細胞條件下的變化。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000320451 ★ | 9,560,329–9,584,504 | 4 |
| ENST00000586602 | 9,560,329–9,584,497 | 6 |
| ENST00001008076 | 9,560,329–9,584,545 | 5 |
| ENST00001142702 | 9,560,329–9,584,545 | 4 |
| ENST00000591447 | 9,566,660–9,567,743 | 2 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF121 的功能註解指出,它可能參與轉錄調控。此描述保留了可能性,並未界定其調控方向、作用對象或具體分子步驟,因此不能據此判定它會促進或抑制特定基因的轉錄。
現有資料未提供 ZNF121 如何作用於轉錄調控的實驗細節,也未列出相關的生物學過程、細胞情境或功能後果。因此,目前可支持的功能範圍僅限於其可能參與轉錄調控;更具體的作用機制與生物學意義尚無法由這些資料說明。
Promoter 與基因調控
>ZNF121 ENST00000320451 GRCh38 chr19:9584404-9585504 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCATACCCAGCCAGAAATACATACTTGATGAAGACAAAAAAAAATCAAGATTTACAGAAAATATTATTAT ATTGAAAACGTGGCCGGGTGCGGTGGCTCATGTCTATAATTCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGGAGACAG ATCATTGGAGGTCAGGAGTTCGAGATCAGTCTGGCCATCATGGTGAAACTCTTCTCTACTAAAAGTACAA AAATTAGCTGGGCGTGGAGGCAGACATCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATCACT TGAACCCGGGGGGCAGAGGTTACAGTGAGCCGAGGTCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTG AGATCTGTCTCAAAAAAAAATAAAAAATGAAAAAGAAAAACGAAAAAAGAAAACGCAATGGAACCAGCAG GTTCTAAAAAATAAAGAATGAAGAAATAAAGGCCTACAGAAAGCCTGACTGAATAGAAGAGATAGACCAT GCCATTCACTGGCAGCTTTATCCATATGGAAGAATCATGGAAAGGCTCTAGGAACATGAGATGTATACAA ACAAGCTTTATATATATGTATACACACATATATATTTTAATAAAGGATGTTGCTATTTTGCCCACGCTGG TCTTGAACTCTTGGACTCAAGCTATCCACCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGTTGGACTTACAGGCCTTAGC CACTGTGCCCACCTGGGAAAAGCTCTGCAGGAGCATCCCCTGGGGTGCGTCCCATCCCCCACGCCCGCCC TTCCAGCAGGTCCGGCCACCTGAACCGCCGGCTAGCCGGGTCCCACCTCTAAACCGCCCCCAAGTAAGGG CCTGTCCGCGCCCACCCGGGAAGAAACTACAATTTCTGTGTTTGACTGGGTCCTATGTGGCTGAAACTCG AACCCAGGAGCCCCGCCCGGCCCGAGGCTCGGAGCGGAAGTGACGTCAGCGCACAATCGCCATCTTTTCC GGCGCTGGCTCCGCATGGTCAGTGCCATTTCGCCTTTATCGTGGTGGAGTCCACCCTGGCTGTGGTGAGT TCCGCCTGCTTGGGGATCCCGGAGATAGCGGGGGGCGGCAAAGGAACGATT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_B3WCK · enhancer · 9583533–9584486 · regulatory
ENSR19_95RPC · promoter · 9584487–9584994 · regulatory
ENSR19_95RQ2 · enhancer · 9586754–9587159 · regulatory
ENSR19_548TSQ · CTCF_binding_site · 9586882–9586903 · regulatory
ENSR19_548W42 · CTCF_binding_site · 9588236–9588257 · regulatory
· motif · 9583964–9583976 · motif
· motif · 9584064–9584073 · motif
· motif · 9584086–9584095 · motif
· motif · 9584108–9584119 · motif
· motif · 9584530–9584540 · motif
· motif · 9584544–9584557 · motif
· motif · 9584544–9584557 · motif
· motif · 9584553–9584562 · motif
· motif · 9584553–9584564 · motif
· motif · 9584705–9584722 · motif
· motif · 9586815–9586830 · motif
· motif · 9586861–9586875 · motif
· motif · 9586884–9586900 · motif
· motif · 9588238–9588254 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:390 aa
ZNF121 蛋白質長 390 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列註解列出 11 個 C2H2 型 zinc finger:前兩個標示為退化型,其餘九個標示為 C2H2 型。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF121 的定位註解為細胞核;現有資料未提供定位隨條件改變或異構型差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- CARD9Q9H257-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KEAP1Q14145 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RBAKQ9NYW8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM41Q8WV44 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF835Q9Y2P0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF837Q96EG3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGTGCCATTTCGCCTTTATCGTGGTGGAGTCCACCCTGGC40TGTGGACCTATTCAAACTCAGTCTGTCTCTTGACTGGAGG80AGGAGAAGGAAAAGTTGAGCACATTGCCAACCGGAGTTCC120CCAAGAATGGCAAGTTAAAACCAAAGTGTCAGCACCTCAA160CAACATTTTTTTTTGGCTTAACAAAACATCAAACGGCATA200CAAATGGCAGAAATCCACAATGGAGGGGAACTCTGTGACT240TTATGGAAAATGGAGAAATCTTCAGTGAACACTCATGCCT280TAATGCACACATGGGAACTGAAAATACAGGGGACACTTAT320GACTGTGATGAGTATGGAGAAAACTTTCCCATGTTACACA360ACAGTGCCCCTGCTGGAGAGACACTTTCTGTGTTGAATCA400GTGCAGAAAAGCCTTCAGCCTGCCACCAAATGTTCACCAG440AGAACGTGGATAGGAGACAAATCCTTTGAATACAGTGACT480GTGAGGAAGCCTTTGTTGATCAGTCACATCTTCAGGCAAA520TAGGATAACTCACAATGGAGAAACACTCTATGAACAGAAG560CAATGTGGGAGAGCTTTTACTTACTCCACAAGCCATGCTG600TGTCTGTTAAAATGCATACTGTAGAAAAACCCTACGAATG640TAAGGAATGTGGAAAATTCTTTAGATATTCTTCATATCTT680AATAGTCACATGCGAACCCATACTGGGGAGAAACCCTATG720AATGTAAGGAATGTGGGAAATGCTTCACTGTTTCTTCACA760CCTAGTTGAACATGTAAGAATTCATACTGGAGAGAAACCT800TATCAATGTAAGGAATGTGGAAGAGCCTTCGCTGGGCGCT840CAGGCCTTACTAAACATGTACGAATACACACTGGAGAGAA880GCCCTATGAATGTAACGAATGTGGGAAAGCCTACAATAGG920TTTTATCTACTAACTGAACATTTTAAAACTCACACAGAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。