基因總覽
ZNF117 是位於人類基因組中的蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 117。現有資料將其產物歸入 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,並指出它可能參與轉錄調控;這項功能描述仍帶有不確定性,不能視為已確認的作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000282869 ★ | 64,971,772–64,991,036 | 4 |
| ENST00000714026 | 64,970,663–65,006,721 | 4 |
| ENST00001104031 | 64,971,770–65,006,721 | 4 |
| ENST00000714027 | 64,971,772–65,006,721 | 5 |
| ENST00001138841 | 64,971,772–64,991,073 | 4 |
| ENST00001124214 | 64,974,564–64,991,892 | 4 |
| ENST00001124213 | 64,974,726–65,006,721 | 5 |
| ENST00000956145 | 64,977,906–64,985,970 | 3 |
| ENST00001109832 | 64,979,918–65,006,721 | 4 |
| ENST00001109833 | 64,979,920–65,006,721 | 4 |
| ENST00001109834 | 64,979,924–64,991,073 | 4 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF117 可能參與轉錄調控。現有資料只提供這項概括性描述,沒有進一步說明它如何調節轉錄,也未指出受影響的基因、分子作用方式或相關生物學過程。因此,目前可支持的功能說明限於其可能參與轉錄調控,不能據此判定具體調控方向或生物學結果。
Promoter 與基因調控
>ZNF117 ENST00000282869 GRCh38 chr7:64990936-64992036 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAGAGCATCTGGTTCTTAAAAACCTCCATTATTGGAAAATTCTGTATTGCTCGCTGGGGAAAGGCCTTTA CAGACCCAGTAGGAGAGTTAACTTGCCTAGGACAACAATATTACAACGAGACACTAGGAAAGACTTTATG GAGGGGCAAAAGCAATAATTCTGAATCACCACACCCAAGCCCATTCTCTCGTTTCCCATCTTTAAACCAT TCTTGGTACCAACTTGAAGCTCCAAATACCTGGCAGGCACCCTCTGGCCTCTACTGGATCTGTGGGCCAC AAGCATATCGACAACTGCCAGCTAAATGGTCAGGGGCCTGTGTACTGGGGACAATTAGGCCGTCCTTCTT CCTAATGCCCCTAAAACAGGGAGAAGCCTTAGGATACCCCATCTATGATGAAACTAAAAGGAAAAGCAAA AGAGGCATAACTATAGGAGATTGGAAGGACAATGAATGGCCTCCTGAAAGAATAATTCAATATTATGGCC CAGCCACCTGGGCAGAAGATGGAATGTGGGGATACCGCACCCCAGTTTACATGCTTAACCGCATTATAAG ATTGCAGGCAGTACTAGAAATCATTACCAATGAAACTGCAGGGGCCTTGAATCTGCTTGCCCAGCAAGCC ACAAAAATGAGAAATGTCATTTATCAAAATAGACTGGCCTTAGACTACCTCCTAGCCCAGGAAGAGGGAG TATGCGGAAAGTTCAACCTTACTAACTGCTGCCTGGAACTTGATGACGAAGGAAAGGTCATCAAAGAAAT AACTGCTAAAATCCAAAAGTTAGCTCACATCCCAGTTCAGACTTGGAAAGGATAGTCTCCAGATTCCCTT TTCAGAGGTTGGTTCTCATCCCTTGGAGGATTTAAAACCTTAGTACAAATAGTCCTAGCCATATTGGGAG TTTGCCTTATACTCCCTTGTCTCTTACCCCTCATTGTCAAAAATATCCAAACAGCCATAGAGGCTCTTGT GGACAGACGGACTACCACACGACTAATGGCCCTAACTAAGTATTAACCCCTGCCAAGAAAAGAGCTACTT CCTCTTGAAGTAAATGAAGATAGTGATGCTTTCTCTTAAACTTTACTTATA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF117_3 ↗ | 7:64,990,919 | 負股 | 64,990,909–64,990,968 |
| ZNF117_2 ↗ | 7:64,999,442 | 負股 | 64,999,432–64,999,491 |
| ZNF117_1 ↗ | 7:65,006,687 | 負股 | 65,006,677–65,006,736 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_83WKZ9 · enhancer · 64990484–64990631 · regulatory
· motif · 64990549–64990562 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:483 aa
ZNF117 蛋白質長 483 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。序列中註記有 13 個 C2H2-type zinc finger 區域,分布於胺基酸 109–467;其中第 1、2 與第 11 個區域標示為退化型,其餘 10 個未標示為退化型。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF117 的細胞內定位註記為細胞核。 現有資料未提供定位改變的條件、異構型差異或動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GACTAATGGCCCTAACTAAGTATTAACCCCTGCCAAGAAA40AGAGCTACTTCCTCTTGAAGTAAATGAAGATAGTGATGCT80TTCTCTTAAACTTTACTTATAAAAAGCATCAAAGGGGGGA120ATGAAGCAGGAAATATAAAAGGAAAAACAAGTAAAGGGAA160AACAAGTCCTTTCCTGACCAGTCTGACTCACTCCAAAGTC200CTGCTGGAGCTATGATAATTATCTGCAAGGCCAGGCAGGG240GCTCCGAAGGAGTGGGCTCCAGGAGCAGGGATGAGAAAAA280CAAGTTCTCCTTATCAGTTTCCCTGTTTGAAATTCTCTCC320CCATAACATTATTCTTTGTTCTGCTCTCACAACTATTTTT360GTAACTATTTCTGCAAGTCTGTAAAGATTTTGTAAGTTCT400TGTTTTTCTTTCTGTAGCATGGCAAGGTCACAAGACATGT440TTAAGTAAGGTAGGCTCATGTTGCAAATCCTGTTGTAAAA480CCTGTCACGGTATGATTAACTGCCTTTGTTCTGCTTCTGT520AAGACTGCTTTCTCACCTCGCAGGTTTTGCGCCAAAAACC560CGACTTGCCCCTGCCTGATGCATGTATAAAAGTCAAGCCC600TGTCTTTGTTCAGGGCTCAGCCTTTGGATGTTAATCCGCT640GGGCCAGTGGCCACCTAAATAAAACCTTCCTGTTGCACCC680AGTGATCTCTCCGGCCTCCTGATTCCCACAACATATAAGC720ATTCCTTTTTCTCTGCAACCTAGCCCGCATCTGTCATTGA760CTTTTTAACAATAGGCATTCTGACTGGATGAGATGGTATC800TCACTGTGGTTTTTCTCTGCATTTTTCTAATAATTAACAA840CGTGAATTTTGTTTTCATATGCTTGTCAGCCACATGTATG880TCTTCTTTTGAAAAGTATCTGTTCATGTTTTTGCTTACTT920TTTAATTAGGTTTTTGGTTTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。