演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF117HPF9

zinc finger protein 117

ZNF117(zinc finger protein 117)是人類蛋白質編碼基因,其產物可能參與轉錄調控。

Homo sapiens7q11.21UniProt Q03924
OFFICIAL SYMBOL
ZNF117
CHROMOSOME
7
UNIPROT
Q03924
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF117 是位於人類基因組中的蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 117。現有資料將其產物歸入 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,並指出它可能參與轉錄調控;這項功能描述仍帶有不確定性,不能視為已確認的作用。

Official symbol
ZNF117
Gene name
zinc finger protein 117
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12897
UniProt
Q03924
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HPF9H-plk

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q11.21
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegZNF117pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr7:64,970,663–65,006,721
Gene span
36,059 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000282869 ★64,971,772–64,991,0364
ENST0000071402664,970,663–65,006,7214
ENST0000110403164,971,770–65,006,7214
ENST0000071402764,971,772–65,006,7215
ENST0000113884164,971,772–64,991,0734
ENST0000112421464,974,564–64,991,8924
ENST0000112421364,974,726–65,006,7215
ENST0000095614564,977,906–64,985,9703
ENST0000110983264,979,918–65,006,7214
ENST0000110983364,979,920–65,006,7214
ENST0000110983464,979,924–64,991,0734

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF117 可能參與轉錄調控。現有資料只提供這項概括性描述,沒有進一步說明它如何調節轉錄,也未指出受影響的基因、分子作用方式或相關生物學過程。因此,目前可支持的功能說明限於其可能參與轉錄調控,不能據此判定具體調控方向或生物學結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 64991036 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF117 ENST00000282869 GRCh38 chr7:64990936-64992036 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAGAGCATCTGGTTCTTAAAAACCTCCATTATTGGAAAATTCTGTATTGCTCGCTGGGGAAAGGCCTTTA
CAGACCCAGTAGGAGAGTTAACTTGCCTAGGACAACAATATTACAACGAGACACTAGGAAAGACTTTATG
GAGGGGCAAAAGCAATAATTCTGAATCACCACACCCAAGCCCATTCTCTCGTTTCCCATCTTTAAACCAT
TCTTGGTACCAACTTGAAGCTCCAAATACCTGGCAGGCACCCTCTGGCCTCTACTGGATCTGTGGGCCAC
AAGCATATCGACAACTGCCAGCTAAATGGTCAGGGGCCTGTGTACTGGGGACAATTAGGCCGTCCTTCTT
CCTAATGCCCCTAAAACAGGGAGAAGCCTTAGGATACCCCATCTATGATGAAACTAAAAGGAAAAGCAAA
AGAGGCATAACTATAGGAGATTGGAAGGACAATGAATGGCCTCCTGAAAGAATAATTCAATATTATGGCC
CAGCCACCTGGGCAGAAGATGGAATGTGGGGATACCGCACCCCAGTTTACATGCTTAACCGCATTATAAG
ATTGCAGGCAGTACTAGAAATCATTACCAATGAAACTGCAGGGGCCTTGAATCTGCTTGCCCAGCAAGCC
ACAAAAATGAGAAATGTCATTTATCAAAATAGACTGGCCTTAGACTACCTCCTAGCCCAGGAAGAGGGAG
TATGCGGAAAGTTCAACCTTACTAACTGCTGCCTGGAACTTGATGACGAAGGAAAGGTCATCAAAGAAAT
AACTGCTAAAATCCAAAAGTTAGCTCACATCCCAGTTCAGACTTGGAAAGGATAGTCTCCAGATTCCCTT
TTCAGAGGTTGGTTCTCATCCCTTGGAGGATTTAAAACCTTAGTACAAATAGTCCTAGCCATATTGGGAG
TTTGCCTTATACTCCCTTGTCTCTTACCCCTCATTGTCAAAAATATCCAAACAGCCATAGAGGCTCTTGT
GGACAGACGGACTACCACACGACTAATGGCCCTAACTAAGTATTAACCCCTGCCAAGAAAAGAGCTACTT
CCTCTTGAAGTAAATGAAGATAGTGATGCTTTCTCTTAAACTTTACTTATA
ZNF117 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF117_3 ↗7:64,990,919負股64,990,909–64,990,968
ZNF117_2 ↗7:64,999,442負股64,999,432–64,999,491
ZNF117_1 ↗7:65,006,687負股65,006,677–65,006,736

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_83WKZ9 · enhancer · 64990484–64990631 · regulatory

· motif · 64990549–64990562 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:483 aa

1 aa483 aa鋅指
依 Q03924 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF117 蛋白質長 483 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。序列中註記有 13 個 C2H2-type zinc finger 區域,分布於胺基酸 109–467;其中第 1、2 與第 11 個區域標示為退化型,其餘 10 個未標示為退化型。

鋅指C2H2-type 1; degenerate109–131 aa
鋅指C2H2-type 2; degenerate137–159 aa
鋅指C2H2-type 3165–187 aa
鋅指C2H2-type 4193–215 aa
鋅指C2H2-type 5221–243 aa
鋅指C2H2-type 6249–271 aa
鋅指C2H2-type 7277–299 aa
鋅指C2H2-type 8305–327 aa
鋅指C2H2-type 9333–355 aa
鋅指C2H2-type 10361–383 aa
鋅指C2H2-type 11; degenerate389–411 aa
鋅指C2H2-type 12417–439 aa
鋅指C2H2-type 13445–467 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q03924…

AlphaFold · Q03924

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF117 的細胞內定位註記為細胞核。 現有資料未提供定位改變的條件、異構型差異或動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HPF9ZNF117
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF117 可能參與轉錄調控;此描述保留可能性,現有資料未進一步說明調控方式、作用對象或其生物學結果。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF117 的定位資料標示其位於細胞核;這筆資料未提供定位變化的條件或其他相關細節。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000282869 · 9,084 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GACTAATGGCCCTAACTAAGTATTAACCCCTGCCAAGAAA40
41AGAGCTACTTCCTCTTGAAGTAAATGAAGATAGTGATGCT80
81TTCTCTTAAACTTTACTTATAAAAAGCATCAAAGGGGGGA120
121ATGAAGCAGGAAATATAAAAGGAAAAACAAGTAAAGGGAA160
161AACAAGTCCTTTCCTGACCAGTCTGACTCACTCCAAAGTC200
201CTGCTGGAGCTATGATAATTATCTGCAAGGCCAGGCAGGG240
241GCTCCGAAGGAGTGGGCTCCAGGAGCAGGGATGAGAAAAA280
281CAAGTTCTCCTTATCAGTTTCCCTGTTTGAAATTCTCTCC320
321CCATAACATTATTCTTTGTTCTGCTCTCACAACTATTTTT360
361GTAACTATTTCTGCAAGTCTGTAAAGATTTTGTAAGTTCT400
401TGTTTTTCTTTCTGTAGCATGGCAAGGTCACAAGACATGT440
441TTAAGTAAGGTAGGCTCATGTTGCAAATCCTGTTGTAAAA480
481CCTGTCACGGTATGATTAACTGCCTTTGTTCTGCTTCTGT520
521AAGACTGCTTTCTCACCTCGCAGGTTTTGCGCCAAAAACC560
561CGACTTGCCCCTGCCTGATGCATGTATAAAAGTCAAGCCC600
601TGTCTTTGTTCAGGGCTCAGCCTTTGGATGTTAATCCGCT640
641GGGCCAGTGGCCACCTAAATAAAACCTTCCTGTTGCACCC680
681AGTGATCTCTCCGGCCTCCTGATTCCCACAACATATAAGC720
721ATTCCTTTTTCTCTGCAACCTAGCCCGCATCTGTCATTGA760
761CTTTTTAACAATAGGCATTCTGACTGGATGAGATGGTATC800
801TCACTGTGGTTTTTCTCTGCATTTTTCTAATAATTAACAA840
841CGTGAATTTTGTTTTCATATGCTTGTCAGCCACATGTATG880
881TCTTCTTTTGAAAAGTATCTGTTCATGTTTTTGCTTACTT920
921TTTAATTAGGTTTTTGGTTTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。