基因總覽
ZNF114(zinc finger protein 114)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其序列包含 N 端 KRAB 結構域,以及位於蛋白質後段的四個 C2H2-type zinc finger;另有兩段被註記為無序區域。這些特徵構成此蛋白質的基本結構輪廓;現有資料未提供更詳細的結構或家族內比較資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000595607 ★ | 48,270,081–48,287,608 | 6 |
| ENST00000912946 | 48,270,041–48,289,292 | 6 |
| ENST00000912947 | 48,270,041–48,289,292 | 6 |
| ENST00001138912 | 48,270,041–48,289,292 | 6 |
| ENST00000912948 | 48,271,006–48,289,292 | 6 |
| ENST00000600687 | 48,271,056–48,289,292 | 5 |
| ENST00000315849 | 48,271,112–48,289,292 | 5 |
| ENST00000888399 | 48,271,112–48,289,292 | 5 |
| ENST00000594024 | 48,271,372–48,285,828 | 6 |
| ENST00000595408 | 48,271,382–48,285,881 | 6 |
| ENST00000912949 | 48,271,438–48,289,292 | 5 |
| ENST00000601320 | 48,271,623–48,282,405 | 4 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF114 可能參與轉錄調控。現有資料僅支持這項可能的角色,未進一步說明其調控方向、作用靶點,或是否直接接觸 DNA,因此不宜據此推定特定基因的表現會受到促進或抑制。
此蛋白質屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,並具有 KRAB 與 C2H2-type zinc finger 結構域。這些結構特徵提供理解其蛋白質性質的背景,但目前來源沒有描述各區域在 ZNF114 中的具體作用,也沒有指出轉錄調控是否依賴其中任何一個結構域。
來源未提供 ZNF114 參與哪些細胞或生物學過程、作用於何種調控複合體,或其功能在何種條件下發生。因此,對其生物學意義的說明應限於可能涉及轉錄調控,不延伸為已確立的分子機制或下游效應。
Promoter 與基因調控
>ZNF114 ENST00000595607 GRCh38 chr19:48269081-48270181 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCAAAATAAATAAATAAATAAATTATTTAATTGACCA GATAGGGACTCCCAGCCCTTCCTTCCTGGGGAGCTCCAGGAGCTGGCTGGGCTGGGCTTAATCTTTCCTC CCAAAGAACCAAAAGAAAAAGAGATGCACATCAAGGTTTGCTGGGGACCCTCAAAGGAAAAGAAACGATG TAACTCGAGTAGAGGATAAACGCTTTGTTCAGCTGATTTGCATCAGGGGCACCTGAAGATCAAGCGACTC CCCAGTTAAGCAGAGTCAGGGTGGGAAACTGAGTCTGTGTCCTAGAGGTCTGGGTTTAGGCAGTCATTTT GGGTTTTGTTTTGTTTTGTTTGTTTTGAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCG CTATCTCAGCTCACTGCAACCTCCTCCTCCCAGGTTCAAACGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGCAGC TGGGATTACAGGTATGCACCACCATGCCCAGCTCGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCGCCAT GTTGGCCTTGAACTCCTCGCCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAGGCCAGAGGATCACTTTAA GCCCAGTGTCAGGCCTCTGAGCCGAAGCTCAGCCATTGTAACCCCTGTGACCTACACATATACGTCCAGA TGGCCTGCAGGAGCCAAGAAGTCTGGAGCAGCCGAAAAACCACAAAAGAAGTGAAACAGCCAGTTCCTGC CTTAACTGATTAACCCACCTTATGACATTCCACCATTATGACTTGTTCCTGCCCTGCCCCAACTGATCAG TCGACCCTGTGACATTCTTCTCCTGGACAATGAGTCCCATGATCTCTCCACAATGCACCTTGTGAGCCCC TCCCCTGCTGACAACAAATAACCACCTTTAACTGTAACTTTCCACTGCCTACCCCAGCCCTATAAAGCTG CCCCTCTCCTATCTCCCTTCGCTGACTCTCTTTTCCAACTCAGCCCACTTGCACCCAAGTGAATAAACAG CCTTTGTTGCTTACACAAAGCCTGTTTAGGTGGTCTTCTATACGGACACGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF114_1 ↗ | 19:48,270,081 | 正股 | 48,270,032–48,270,091 |
| ZNF114_2 ↗ | 19:48,271,399 | 正股 | 48,271,350–48,271,409 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:417 aa
ZNF114 為 417 個胺基酸的蛋白質。其第 6–85 位胺基酸區段為 KRAB;第 304–326、332–354、361–382 與 388–410 位各有一個 C2H2-type zinc finger。第 95–116 與 280–301 位則被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
現有資料未說明其定位是否會隨細胞條件改變,也未提供異構型間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 10 個夥伴
- CENATACQ86UT8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLIP4Q8N3C7 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- KIAA0753Q2KHM9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KLHL2O95198 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- KRTAP10-6P60371 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAP7Q14244 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MYO15BQ96JP2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SUFUQ9UMX1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TPPPO94811 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF8P17098 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCTGACTCTCTTTTCCAACTCAGCCCACTTGCACCCAAGT40GAATAAACAGCCTTTGTTGCTTACACAAAGCCTGTTTAGG80TGGTCTTCTATACGGACACGCGTGACACCCAGGAGTTCGA120GACGAGTCTGGGCAGCATATACTGAGGGGAAAAAAAAGCC160TTCTTTCCTTGGGAAATGCAGGAAGCCAGCAAGCGGCCGG200AGTCTCCGGAGCCCGCAAGGAGGCGCGTTGGCTGCGCAGA240GAGCGCGCTTCCCAGCTGGAGAGCCTAGGAACGGTGGCGC280GGGCGGAGGCGACAGCGAGGACCCAAGGCTGGGGTTTCCT320GCTTGGATCAGGAGTGCCTGGGGATTTGATCCCCATCCTG360GTGCAGCTCCGAGACGCTCCTGGGCTGCGCGCGCTTTTGG400GCTGCGCCACCGACAGAGACATCTGGAAGCCGGAGCTAGT440GGAAGACTCTGCCTCACCTGCCTCCTTGAAGGAAACACGG480GGAAGCCAGGACTGGCCGTCACGTTGGTGACAAATATGTC520CCAGGACTCGGTGACCTTCGCAGACGTGGCTGTGAACTTC560ACCAAAGAGGAGTGGACCCTGCTGGACCCAGCTCAGAGGA600ATCTCTACAGAGACGTGATGCTGGAAAATTCTAGGAACTT640GGCATTCATAGATTGGGCAACTCCATGTAAAACCAAAGAC680GCAACCCCTCAGCCGGATATTCTTCCTAAAAGAACATTTC720CTGAAGCCAACAGAGTGTGTCTCACGAGCATCAGTTCCCA760GCACTCCACATTAAGAGAAGACTGGAGATGCCCCAAAACA800GAGGAACCACACAGGCAGGGGGTGAATAATGTGAAGCCAC840CTGCAGTTGCCCCTGAGAAAGATGAATCTCCTGTTAGCAT880TTGTGAAGATCATGAAATGAGGAACCACTCTAAACCTACC920TGCAGGCTTGTGCCTTCACAGGGAGATTCCATAAGACAAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。