演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF107ZFD25

zinc finger protein 107

ZNF107 是一種 krueppel C2H2-type zinc-finger protein,可能參與轉錄調控;其蛋白質含有多個 C2H2-type zinc finger,定位於細胞核。

Homo sapiens7q11.21UniProt Q9UII5
OFFICIAL SYMBOL
ZNF107
CHROMOSOME
7
UNIPROT
Q9UII5
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF107 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 107。其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,蛋白質序列含有多個 C2H2-type zinc finger,呈現此類鋅指蛋白的結構特色。現有功能註釋指出,ZNF107 可能參與轉錄調控;但目前提供的資料未進一步說明其調控對象、作用方式或具體生物學情境。

Official symbol
ZNF107
Gene name
zinc finger protein 107
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12887
UniProt
Q9UII5
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZFD25smap-7ZNF588

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q11.21
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegZNF107pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr7:64,666,099–64,736,981
Gene span
70,883 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000620827 ★64,666,133–64,711,5774
ENST0000092976264,666,105–64,713,6163
ENST0000110251464,666,105–64,706,5655
ENST0000110251664,666,105–64,679,6383
ENST0000111408464,666,105–64,692,7633
ENST0000112886364,666,105–64,699,2834
ENST0000113047764,666,105–64,691,5002
ENST0000042362764,666,133–64,713,6167
ENST0000114181664,666,133–64,713,6164
ENST0000061369064,666,134–64,708,6563
ENST0000034493064,666,198–64,713,6165

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有註釋將 ZNF107 的可能功能指向轉錄調控,但僅指出它可能參與此過程,並未確定其作用方向或調控的基因與轉錄事件。因此,這項資訊支持將 ZNF107 視為可能涉入轉錄調控的蛋白質,不能據此判定它是轉錄活化因子或抑制因子。

資料未提供 ZNF107 如何影響轉錄的分子機制,也沒有說明其是否直接辨識 DNA、與哪些分子作用,或其調控活動發生於何種細胞與生物學條件。因而,目前無法由這項註釋延伸出特定的靶序列、調控路徑或下游效應。

其 C2H2-type zinc finger 結構與已註釋的可能轉錄調控角色並存,但來源沒有明確建立兩者之間的作用關係。就現有資料而言,ZNF107 的功能描述應限於「可能參與轉錄調控」;更細節的功能意義與作用方式尚未由所提供的資料界定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 64666133 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF107 ENST00000620827 GRCh38 chr7:64665133-64666233 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCACTTTAATGTGACAGCTATTGGCCATGTATGGCTACTGGGTGTCCGGAATGTGGCTGGTCAGAACTGC
GATGTGCTAGAAAGGTAAAATACAGAGTTAAAGATTTAGTTCCAAAAATATACACACTTTATTAATAATT
ACATATTGCTCAGATATTAATATAATATTTTTGATATAGTGGGTTAATTAAATGGTTAGAATGAATTCCA
CCTGTTTCTTCTTCCTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCCGTCGTCCAGGCT
GGAGTGCAGTGGCACTATCTCGGTTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCA
GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCCCCCGCCACCGCGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAG
ACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCACGGCCTCC
CAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTTCTTCTTCCTTCTTGAAGTTTGACTGCT
AGAAAATTTAGAATACACATGTGGCTCACGTTTTATTTCAGAGGATTGCCTCCTTTTTAAACTCTCAATC
GGCCTGCTCAAAGGACCAGAATTCAGAAAGGGCATAAAATCTGGAATTTTAAAATAATTGTTATATTATT
TTCATGTGTGAATAGCCACATAATATATTATTTATAAATGCATATGACTTTATATACAGGTTAAATGCAA
ATGCCTTCTGGGGTGGACCTGGCTCAACTCAGGGAGGAGCCCTGCCTGAAAAGGCTGCAGCTTAGGTTTC
ACTTTATCTTCTTCCAGCCCAGCATCTGAGCACAGCTTCTGTCACTCAGGGCCTGAGGGAGCAGGGCAGC
AAACGTTATCCAATCAGGACTGCTGGGCTGGGAACCGTCCAATCAGGCACGCAGCTGGAGCGGACAGGAC
GGCTTCCGGGATTTGGCGGGGCCTTTGTCTCTGGCTGCAGCCGGAGCTCCTGCTCTCCTCCTCACTGCTC
AGTGTCCTCTGCTCCTAGAGGCCCAGCCTCTGTGTCCCTGTGACCTGCAGA
ZNF107 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF107_1 ↗7:64,666,133正股64,666,084–64,666,143

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_BGSHL · promoter · 64665643–64666208 · regulatory

ENSR7_BGSHN · enhancer · 64666209–64666992 · regulatory

ENSR7_5K7N7S · CTCF_binding_site · 64666468–64666489 · regulatory

· motif · 64666113–64666122 · motif

· motif · 64666113–64666124 · motif

· motif · 64666340–64666349 · motif

· motif · 64666470–64666486 · motif

· motif · 64666477–64666487 · motif

· motif · 64667094–64667106 · motif

· motif · 64667096–64667118 · motif

· motif · 64667096–64667118 · motif

· motif · 64667713–64667726 · motif

· motif · 64667713–64667726 · motif

· motif · 64668377–64668388 · motif

· motif · 64668912–64668925 · motif

· motif · 64669234–64669249 · motif

· motif · 64669239–64669251 · motif

· motif · 64669242–64669249 · motif

· motif · 64669270–64669283 · motif

· motif · 64669270–64669283 · motif

· motif · 64669576–64669588 · motif

· motif · 64669578–64669585 · motif

· motif · 64669578–64669593 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:783 aa

1 aa783 aa鋅指
依 Q9UII5 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF107 蛋白質長 783 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列註釋標出 25 個 zinc finger,其中部分標記為 atypical;這些結構區段分布於蛋白質前段至接近末端的位置。資料未提供其他功能區域的註釋。

鋅指C2H2-type 1; atypical76–98 aa
鋅指C2H2-type 2104–126 aa
鋅指C2H2-type 3132–154 aa
鋅指C2H2-type 4160–182 aa
鋅指C2H2-type 5188–210 aa
鋅指C2H2-type 6; atypical216–238 aa
鋅指C2H2-type 7244–266 aa
鋅指C2H2-type 8; atypical272–294 aa
鋅指C2H2-type 9; atypical300–322 aa
鋅指C2H2-type 10328–350 aa
鋅指C2H2-type 11356–378 aa
鋅指C2H2-type 12; atypical384–406 aa
鋅指C2H2-type 13412–434 aa
鋅指C2H2-type 14440–462 aa
鋅指C2H2-type 15468–490 aa
鋅指C2H2-type 16496–518 aa
鋅指C2H2-type 17; atypical524–546 aa
鋅指C2H2-type 18; atypical552–574 aa
鋅指C2H2-type 19; atypical580–602 aa
鋅指C2H2-type 20608–630 aa
鋅指C2H2-type 21636–658 aa
鋅指C2H2-type 22664–686 aa
鋅指C2H2-type 23692–714 aa
鋅指C2H2-type 24720–742 aa
鋅指C2H2-type 25; atypical748–770 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UII5…

AlphaFold · Q9UII5

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF107 的定位註釋為細胞核;現有資料未描述其定位是否會隨條件改變,也未提供異構型間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZFD25ZNF107HOOK2KRTAP10-8U2AF2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF107 可能參與轉錄調控;此註釋以可能性描述其功能,未指出調控方向、作用對象或具體機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF107 的定位註釋為細胞核;此資料未說明定位變化的條件或異構型差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000620827 · 5,630 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCCTTTGTCTCTGGCTGCAGCCGGAGCTCCTGCTCTCCTC40
41CTCACTGCTCAGTGTCCTCTGCTCCTAGAGGCCCAGCCTC80
81TGTGTCCCTGTGACCTGCAGATATTGGGAGATCCACAGCT120
121AAGACGCCGGGACTCCCTGGAAACCTAGAAATGGAACCAC160
161TGACATTTAAAGATGTCGCCATAGAATTCTCTCTGGAGGA200
201GTGGCAATGCCTGGATACTGCACAGCGGGATTTATATAGG240
241AATGTGTTGTTAGAGAACTACAGAAACCTGGTCTTTTTGG280
281GTATTGCTGTCTCTAAGCCATATCTGATCACCTGTCTGGA320
321GCAAAAAAAAGAGCCCTGGAATATAAAAAGACATGAGATG360
361GTAGCCAAACCCCCAGTAATGTCTTTTCATTTTGCCCAAG400
401ACCTTTGGCCAGAGCAGAACATAAAAGATTCTTTCCAGAA440
441AGTGACACTGAGAAGATACGGAAAATGTGAATATGAGAAT480
481TTACAGTTAAGAAAAGGCTGTAAACATGTGGATGAGTGTA520
521CGGGGCACAAAGGAGGTCATAATACAGTTAACCAATGTTT560
561GACAGCTACCCCAAGCAAAATATTCCAGTGTAATAAATAT600
601GTGAAAGTCTTTGATAAATTTTCAAATTCAAATAGATATA640
641AGAGAAGACATACAGGAAACAAACACTTCAAATGTAAAGA680
681ATGTAGCAAATCATTTTGCGTGCTTTCACAACTAACTCAG720
721CATAGAAGAATTCATACTAGAGTGAATTCCTACAAATGTG760
761AAGAATGTGGAAAAGCCTTTAACTGGTTCTCAACTCTTAC800
801TAAACATAAGAGAATTCATACTGGAGAAAAGCCCTACAAA840
841TGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTCCTCACAAC880
881TTACTAGGCATAAGATAATTCATACTGAAGAGAAACCCAA920
921CAAATGTGAAGAATGTGGCAAGGCCTTTAAACAGGCCTCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。