基因總覽
ZNF101(zinc finger protein 101)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質由 436 個胺基酸組成,具 KRAB domain 與多個 C2H2-type zinc finger;其中一個 zinc finger 被註記為退化型,另有一段無序區域。這些資料勾勒出其家族與結構特徵;關於其生物學角色,現有描述僅指出可能參與轉錄調控。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000592502 ★ | 19,668,839–19,683,506 | 4 |
| ENST00000444249 | 19,668,781–19,680,032 | 4 |
| ENST00001092455 | 19,668,781–19,683,506 | 2 |
| ENST00001092456 | 19,668,781–19,683,506 | 3 |
| ENST00001092457 | 19,668,781–19,680,032 | 4 |
| ENST00001092458 | 19,668,781–19,680,035 | 3 |
| ENST00001143477 | 19,668,781–19,683,506 | 4 |
| ENST00000541458 | 19,668,796–19,679,523 | 3 |
| ENST00000415784 | 19,668,901–19,683,506 | 5 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有功能註記指出,ZNF101 可能參與轉錄調控。這表示它與基因轉錄活動的調節可能有關,但來源未說明其作用方向、調控哪些基因,或在何種細胞與生理條件下發揮作用,因此不能進一步判定其具體調控效果。
目前資料也未提供轉錄調控的分子機制、作用對象或實驗情境,故無法據此描述 ZNF101 如何影響轉錄,或推論其參與的下游生物過程。此處的功能定位應保留「可能參與」的限定,不能視為已確立的具體作用。
Promoter 與基因調控
>ZNF101 ENST00000592502 GRCh38 chr19:19667839-19668939 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CACTTTGAGAGGCCGAGGCCGGCGGATCACGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAA ACCCCATTTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGAGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCGCAGCTACCCG GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAAACCGGAAAGCGGAGGTTGCAGTTAGCTGAGATCGTGCCATTG CATTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAGCAGGAAGGACCC ACTGAGTACAGGAAGCCGACAGGGCCTGCTCCGGAAAACCAGGAGCTGTAAGGTCAGCCGAAAGGACGAA GAGACCTGAAGTCAGTCAAGTAAGTTTTATTAACCTGCTGGGCTGCTCCCCCACAGTTAGAGGAGGCAGC CCCGCTTACAGACTACAGCAGGGCTTTATAGGGCGAGGAACTGGGCTGGGGTGTGAGAACTGAGTCGGGG GTGCAGGTGTCCTGACCGCATCCTGGAGATGTTTTTGCCAGCTTTGTTATGCAAGGTGGGCAGGTGTTGT GACCGCATCCTGGAACTGTCTGCCGGTTCAGCTGAAGTCTTTTGAACAAACAGTTACTGGAAGGGTCAGT GGGGAGGAGGTCTACTTCTAGCCCGGGGGGAGTTGTGTGGCGGTCACAAAGGACTGTATTGTAAGACTGA TGGGGGAAGGAGGGGAACAGTCTGGTTGGGTTGACCCTAACGGGAGCAAGTTCTGCTTCCATGCAAGTCC AGGTCCAAGGTCCCAGCGAGGGGCTGTGGGTAGCACCTGTCAGTCACACCCCACACAGCGAGCGGATTAT TTGAGGATTCCGATCACCTCTCCTGTCGCTCAAGCCCCAGGGGCGGGACCTGGGGCACCAGCCAGTCAGA GGCGCTGTGCGGCAAACTGTCCAATCAGGTGCGCCGGGAGGAGGGGCAACTTCCAAAGCCCGAAGCGGTC TCATTTCCCGCCGGCCCCCCATTCGGGTCCGGGTTTTAGTTCCTCGGGGAGCCCCTGGTGCCCCGGATAC GGCTGATTTTGTCGTGTGGGACCTGTTCTGGCTGCTCCAGCCCCAGGAAGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF101_3 ↗ | 19:19,668,139 | 正股 | 19,668,090–19,668,149 |
| ZNF101_1 ↗ | 19:19,668,839 | 正股 | 19,668,790–19,668,849 |
| ZNF101_2 ↗ | 19:19,668,944 | 正股 | 19,668,895–19,668,954 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_B5WCX · enhancer · 19663726–19664724 · regulatory
ENSR19_99RQT · enhancer · 19667554–19667818 · regulatory
ENSR19_B5WDK · promoter · 19668349–19668911 · regulatory
ENSR19_C3XNT · enhancer · 19668912–19670359 · regulatory
· motif · 19664055–19664068 · motif
· motif · 19666254–19666266 · motif
· motif · 19668306–19668318 · motif
· motif · 19668330–19668339 · motif
· motif · 19668387–19668396 · motif
· motif · 19668458–19668470 · motif
· motif · 19668494–19668504 · motif
· motif · 19668569–19668576 · motif
· motif · 19668609–19668624 · motif
· motif · 19668640–19668649 · motif
· motif · 19668717–19668727 · motif
· motif · 19668785–19668795 · motif
· motif · 19668948–19668959 · motif
· motif · 19668955–19668966 · motif
· motif · 19668955–19668966 · motif
· motif · 19668957–19668966 · motif
· motif · 19669090–19669105 · motif
· motif · 19669393–19669415 · motif
· motif · 19669393–19669415 · motif
· motif · 19669580–19669591 · motif
· motif · 19669580–19669591 · motif
· motif · 19670799–19670810 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:436 aa
ZNF101 蛋白質長 436 個胺基酸,N 端含 KRAB domain(第 4–82 位)。另有 10 個 C2H2-type zinc finger,其中第 3 個標註為退化型;第 128–164 位則為無序區域。這些區域位置與分類依序列註解記載。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF101 的定位資料標示於細胞核;來源未提供定位變化的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP12-3P60328 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP17-1Q9BYP8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MDFIQ99750 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- ZNF16P17020 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ATTCGGGTCCGGGTTTTAGTTCCTCGGGGAGCCCCTGGTG40CCCCGGATACGGCTGATTTTGTCGTGTGGGACCTGTTCTG80GCTGCTCCAGCCCCAGGAAGGACCCAGGACACCCGGAAGC120CGGAAATGGACTCAGTGGCCTTTGAGGATGTGGCTGTGAA160CTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGAGTCCTTCCCAG200AAGAATCTCTACAGAGATGTGACGCTGGAAACCTTCAGGA240ACCTGGCCTCGGTCGGAATCCAATGGAAAGACCAGGACAT280TGAGAATCTGTACCAAAACCTGGGGATTAAGCTAAGAAGT320CTGGTGGAGAGACTCTGTGGACGTAAAGAAGGGAATGAAC360ACAGAGAAACTTTCAGCCAGATTCCTGATTGTCACCTGAA400CAAGAAAAGTCAAACTGGAGTGAAACCATGCAAATGCAGC440GTGTGTGGGAAAGTCTTCCTCCGTCATTCATTCCTGGACA480GGCACATGAGAGCTCATGCTGGACACAAACGATCTGAGTG520TGGTGGGGAATGGAGAGAGACGCCCCGTAAACAGAAACAA560CATGGGAAAGCCTCCATTTCCCCCAGTAGTGGTGCACGGC600GCACAGTAACACCAACTCGAAAGAGACCTTATGAATGCAA640GGTGTGCGGGAAAGCCTTTAATTCTCCCAATTTATTTCAA680ATCCATCAAAGAACTCACACTGGAAAGAGGTCCTATAAAT720GTAGGGAAATAGTGAGAGCCTTCACAGTTTCCAGTTTCTT760TCGAAAACATGGAAAAATGCATACTGGAGAAAAACGCTAT800GAATGTAAATACTGTGGAAAACCTATCGATTATCCCAGTT840TATTTCAAATTCATGTTAGAACTCACACTGGAGAAAAACC880TTACAAATGTAAACAATGTGGTAAAGCCTTCATTTCCGCA920GGTTACCTTCGGACACATGAAATCAGATCTCACGCGCTGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。