演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF100

zinc finger protein 100

ZNF100(zinc finger protein 100)是蛋白質編碼基因,產物屬於 KRAB C2H2 型鋅指蛋白家族,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19p13.1UniProt Q8IYN0
OFFICIAL SYMBOL
ZNF100
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q8IYN0
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF100(zinc finger protein 100)是位於人類第 19 號染色體 19p13.1 的蛋白質編碼基因。其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,序列註解包含 KRAB 區域及多個 C2H2 型鋅指;其中第一個鋅指被標示為退化型。現有功能資料僅指出它可能參與轉錄調控,未進一步說明具體作用方式或調控對象。

Official symbol
ZNF100
Gene name
zinc finger protein 100
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12880
UniProt
Q8IYN0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.1
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF100pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:21,722,771–21,767,628
Gene span
44,858 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000358296 ★21,722,771–21,767,5795
ENST0000030557021,722,771–21,750,7834
ENST0000089745921,722,771–21,767,6284
ENST0000092541921,722,771–21,767,6285
ENST0000097936821,722,771–21,767,6285
ENST0000097936921,722,771–21,767,6283
ENST0000113690721,722,771–21,767,6285
ENST0000106963721,724,041–21,767,6286
ENST0000059440121,727,931–21,750,7125
ENST0000059802621,743,078–21,767,5495

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF100 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。這項描述屬於可能性陳述,並未提供其調控方向、作用靶點或具體分子機制,因此目前只能將其功能概括為可能涉及轉錄調節,不能據此判定它會促進或抑制特定基因的轉錄。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 21767579 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF100 ENST00000358296 GRCh38 chr19:21767479-21768579 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTTAATCTATTTTCTCCATCTCTAAATACTGGAGTTCAAGTGTGTGGACAGAACTGAAGACATAGTTGT
TTTTTCTCCTGTGGCCCCATCATCCTTTGTTCACTATCTGGTCTCTAAAAGAAAGGTGGGCAACAGGTGG
CCAGCAGTTGTTTATTACCTGTGGCTATTTTATTCCTACTGCCCTCAGCTCTTTCTATGGGAACTATCTG
GTCCACCCTAGGAACCAAAGAGAGATGTTTGTAGGGAGAGTCTCTTCTTTCACTCTCGCAGGAAAGAGAT
GTTCAGGCCCTTCACACCGCTGACATCAGAGCTGCACTTCAATGTGACAGCTATTGTCCATGTGTGGCTA
CTGGGTTCCCACAATGTGCCTGGTCTGAAATGCGATATGCTAGAAAGGTAAAATACAAAGTCAGCTTCAA
AGATTTAGTTCCAAATATTTATATATTTTATCAATAATTACATATTTCTCACACATTAAAATGATAATAT
TTTGAATATAATGGGTGAATTACATTGTTAACAATCAGTTCAACTTGTTTCTTTTTAAAGTTTGGCTACT
AGAAAATTTCAAATCCACATGTGGCTGACATTCATTTTAGATGATTTTCTCTTTTCTAAAATCTCAGGCT
GCCTGCTCAAAGGGCCAGAAGCCAGGAAGGTCATAAAAGCTGAAATTTTAAAATAATTGTTATATTCTTT
TCACTTGTGTATAGCTATATAATGTATTATTTATTTATACATATGACCTTATACACAAATTTAAAGGCAA
ATACTCTCTGGGATGGGCCTAGCTCAGCTGAGGGAGGAAGCCCTGTCAGAAGAGGGGGCAGTCTAGGCTG
TCACTCTTTCTTCATTGAACCCGCATCTGATCACATCTTCTGTCACTCAAAGCCTGACAGGGCGGGGATT
TAAGCATTATCCAACCAGGGACGCTGGGCTGGAAACCGTCCAATCAGGCATGCAGCTGGAGCGGACTGGA
CGGCTTCCGGGTTTGGCGGGGTCTTTGTCTCTCGCTGTAGCCGGAGCTCCAGGTTTTGCTCTCACTTCTC
TGTGTCTTCTGCTCCTAGGGGCCTAGCCTGTGTGGCCCTCTGACCTGCAGA
ZNF100 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF100_1 ↗19:21,767,573負股21,767,563–21,767,622

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:542 aa

1 aa542 aa結構域鋅指
依 Q8IYN0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF100 蛋白質長 542 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列註解列有位於第 35–107 個胺基酸的 KRAB 區域,以及 12 個 C2H2 型鋅指;第一個鋅指被註記為退化型,其餘 11 個未標示此特徵。

結構域KRAB35–107 aa
鋅指C2H2-type 1; degenerate177–199 aa
鋅指C2H2-type 2205–227 aa
鋅指C2H2-type 3233–255 aa
鋅指C2H2-type 4261–283 aa
鋅指C2H2-type 5289–311 aa
鋅指C2H2-type 6317–339 aa
鋅指C2H2-type 7345–367 aa
鋅指C2H2-type 8373–395 aa
鋅指C2H2-type 9401–423 aa
鋅指C2H2-type 10429–451 aa
鋅指C2H2-type 11457–479 aa
鋅指C2H2-type 12485–507 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8IYN0…

AlphaFold · Q8IYN0

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF100 的定位資料將其列於細胞核。 來源未提供定位變化的條件、動態或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF100ZNF100KRTAP12-2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF100 可能參與轉錄調控;資料以可能性描述其功能,未指出調控方向、特定靶點或作用機制,因此不能據此視為已確定的調控作用。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF100 的定位註記為細胞核。該資料未提供定位所依賴的條件、可能的動態變化,或不同異構型間的定位差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000358296 · 5,691 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTCTTTGTCTCTCGCTGTAGCCGGAGCTCCAGGTTTTGCT40
41CTCACTTCTCTGTGTCTTCTGCTCCTAGGGGCCTAGCCTG80
81TGTGGCCCTCTGACCTGCAGATATTGGGAGATCCACAGCT120
121AAGACGCCAGGACCCCCTAGAAGCCTAGAAATGGATGACC160
161CGAGGTATGGAATGTGTCCTCTCAAGGGAGCAAGTGGATG200
201CCCTGGGGCTGAGAGGAGTCTTCTGGTGCAGTCTTATTTT240
241GAAAAGGGGCCATTGACGTTTAGGGATGTGGCCATAGAAT280
281TCTCTCTGGAGGAGTGGCAATGCCTGGACAGTGCTCAGCA320
321GGGTTTGTATAGGAAAGTGATGTTAGAGAACTACAGAAAC360
361CTGGTCTTCTTGGCAGGTATTGCTCTCACTAAGCCAGACC400
401TGATCACCTGTCTGGAGCAAGGAAAAGAGCCCTGGAATAT440
441AAAGAGACATGAGATGGTAGCCAAACCCCCAGTTATATGT480
481TCTCATTTTCCCCAAGACCTTTGGGCAGAGCAGGACATTA520
521AAGATTCTTTTCAAGAAGCGATTCTGAAAAAATATGGAAA560
561ATATGGACATGACAATTTACAGTTACAAAAAGGCTGTAAA600
601AGTGTGGATGAGTGTAAAGTGCACAAAGAACATGATAACA640
641AATTAAACCAGTGTTTGATAACTACCCAGAGCAACATATT680
681TCAATGTGATCCATCTGCAAAAGTCTTTCATACATTTTCA720
721AATTCAAACAGACATAAGATAAGACATACTAGAAAGAAAC760
761CTTTCAAATGTAAAAAATGTGAAAAATCATTTTGCATGCT800
801TTTACACCTAACTCAACATAAAAGATTTCATATTACAGAG840
841AATTCCTACCAATGTAAAGATTGTGGCAAAGCCTTCAACT880
881GGTTCTCAACCCTTACTACACACAGGAGAATTCATACTGG920
921AGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGGAAAGCATTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。