演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF10KOX1

zinc finger protein 10

ZNF10(zinc finger protein 10)是人類蛋白質編碼基因,產物屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens12q24.33UniProt P21506
OFFICIAL SYMBOL
ZNF10
CHROMOSOME
12
UNIPROT
P21506
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF10(zinc finger protein 10)是人類蛋白質編碼基因,其產物 Zinc finger protein 10 屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。此蛋白質長 573 個胺基酸,具有一個 KRAB domain,以及 11 個 C2H2 型 zinc finger,其中第 1 與第 11 個被註記為 atypical。這些序列特徵構成其蛋白質的主要結構特色;目前提供的功能註解則指出,它可能參與轉錄調控。

Official symbol
ZNF10
Gene name
zinc finger protein 10
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12879
UniProt
P21506
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KOX1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212q24.33
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegZNF10pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr12:133,130,349–133,159,465
Gene span
29,117 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000248211 ★133,130,627–133,159,4655
ENST00000869334133,130,349–133,159,4656
ENST00000869335133,130,351–133,159,4657
ENST00000869336133,130,351–133,159,4657
ENST00000869337133,130,351–133,159,4657
ENST00000869338133,130,351–133,159,4656
ENST00000869339133,130,351–133,159,4657
ENST00000915347133,130,351–133,159,4656
ENST00000915348133,130,351–133,159,4656
ENST00000915349133,130,351–133,159,4657
ENST00000962635133,130,351–133,159,4657
ENST00000962636133,130,351–133,159,4657

顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF10 的蛋白質產物可能參與轉錄調控。此註解採用「可能」的表述,來源並未進一步說明其調控的基因、作用方向、細胞情境或具體分子機制,因此不能據此判定它會活化或抑制特定轉錄目標。

現有資料提供的是概括性的功能描述,未指出 ZNF10 參與哪些特定生物學過程,也未交代其轉錄調控作用如何發生。其 KRAB domain 與多個 zinc finger 的結構註解,以及與 TRIM28 的互作資料,分別描述蛋白質特徵和分子互作;但來源未直接說明這些資訊如何造成或調節轉錄效應。因此,對 ZNF10 功能的解讀應限於其可能參與轉錄調控,不延伸推定下游機制或生物學結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 133130627 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF10 ENST00000248211 GRCh38 chr12:133129627-133130727 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TAGAAGAGAGACTGTGCTGTCCAAATTATTCATGAAGCTTGTAAAATCTTGTTAGTATAACGGGCAAGGA
TAGTACACAAAAAGATTAAAACACAATCTTGTGAGCATAGGTGAAGTCAAAGGGAAACAGCCAATTGAAT
ACACCAGAGTATTAAAGAAATAAAACCATATCGCATTCAACCACAGTATAAGGCAATAGGTGAAAAAAAC
GATGGCTGTGATTCAACTCATTACTAGGTTTAGAGATTCAAGAGAGGCTGCTGGACAGAGGCGTGCACCC
TTTAGCCCTCCCGTGTTGCTTAGAGAAGGAGGCAAACGCGCATCCCCGGCCCCCCAGCGCTCCCTGCGTG
GCACCCGCAGCCAGCCCGGGACCCCTCCGCCCCGCGCGCCCCTGGTCCCCACTCGCTCCCCGCGCTCCAC
TCGCACCCGGTAAGTAGCCCCTCCTCCCTCAAGGGCCTCTCCCACCGCCGCCTCCCGGGCAGGCTCCCTG
CTGCTCAGACTCCCGTGAGGCGATCCCTGCACGCAGGAGAACTCAGCGGGCCAGGCTGATCCCACGAGGG
ACTTGTCCCGGGTGAACGAGCCACAGGCCCGCATGCTCACCCGTCCTCAGTGCCTGCCTCCAGGCGTCCG
CGGTCCCGCCCGAGGGGGACGCGAGGCCGAACTACGTTTCCCAGGAGCTCCTGCGCCGCCCCGCAGAGGG
GCCTGGTCTGTGCGTCACGGACGCGCTCTGGGCCGAAGGCCCGCAGGGTCCGGCACAGAGTGGCGGCTGC
GGCGCCGGCGACGAATCGCCGGCTCTAGGGTCCCGGGGCGCGCGGCTGACGGGCTGGGGGCGGAGCGTGG
CCTGAACGCCAGGCTGGGGCGCGTGCGTAACGGTGTGTGTTGTGGGTGCGTGTGCGTGCGTTCGCAGCAG
GGGCGGGCGTAGGACCAATGGGGGCGGGGCGCGTGCGCGTGCGTGACGTCAGGCCACGGGGAGGTGGCGC
CGCCGTGCCGAGCCGGCCTCAGACTCACCTCTGACGCCGCTCTTCGCGCTCCGCTGGTGAATGGAGTCGC
GTTCTCTGTTTTGCTGTTGCTGCTGCCTTTGTGACGGGATCGCTTTCTCCC
ZNF10 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF10_1 ↗12:133,130,627正股133,130,578–133,130,637
ZNF10_2 ↗12:133,140,080正股133,140,031–133,140,090

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_BZFCN · enhancer · 133129558–133130262 · regulatory

ENSR12_536BGJ3 · CTCF_binding_site · 133130088–133130109 · regulatory

ENSR12_BZFCR · promoter · 133130263–133130994 · regulatory

ENSR12_93XSPQ · enhancer · 133130995–133131437 · regulatory

· motif · 133130090–133130106 · motif

· motif · 133130190–133130206 · motif

· motif · 133130339–133130355 · motif

· motif · 133130484–133130495 · motif

· motif · 133130484–133130495 · motif

· motif · 133130564–133130575 · motif

· motif · 133130564–133130575 · motif

· motif · 133130568–133130584 · motif

· motif · 133130570–133130581 · motif

· motif · 133130570–133130581 · motif

· motif · 133130577–133130590 · motif

· motif · 133130577–133130590 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:573 aa

1 aa573 aa結構域鋅指
依 P21506 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Zinc finger protein 10 長 573 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 N 端有 KRAB domain(第 14–85 位),另有 11 個 C2H2 型 zinc finger,分布於第 206–539 位;第 1 個與第 11 個 zinc finger 標註為 atypical,其餘為 C2H2-type。

結構域KRAB14–85 aa
鋅指C2H2-type 1; atypical206–232 aa
鋅指C2H2-type 2265–287 aa
鋅指C2H2-type 3293–315 aa
鋅指C2H2-type 4321–343 aa
鋅指C2H2-type 5349–371 aa
鋅指C2H2-type 6377–399 aa
鋅指C2H2-type 7405–427 aa
鋅指C2H2-type 8433–455 aa
鋅指C2H2-type 9461–483 aa
鋅指C2H2-type 10489–511 aa
鋅指C2H2-type 11; atypical517–539 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P21506…

AlphaFold · P21506

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

Zinc finger protein 10 定位於細胞核。 來源未提供其定位隨條件變化或異構型而異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KOX1ZNF10CARD10TRIM28
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ZNF10 透過 KRAB domain 與 TRIM28 互作;TRIM28 參與互作的區域為 RBCC domain。此資料支持兩者存在分子互作,但未提供更完整的複合體組成或該互作所造成的功能結果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF10 的蛋白質產物可能參與轉錄調控;這項註解僅指出可能的功能,未說明調控方向、特定目標或作用機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ZNF10 透過 KRAB domain 與 TRIM28 互作,而 TRIM28 參與互作的區域為 RBCC domain。含實驗來源
證據與來源

Interacts (via the KRAB domain) with TRIM28 (via the RBCC domain)

PMID 23665872 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF10 蛋白質定位於細胞核。含實驗來源
證據與來源

Nucleus

PMID 23665872 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000248211 · 4,406 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACTCACCTCTGACGCCGCTCTTCGCGCTCCGCTGGTGA40
41ATGGAGTCGCGTTCTCTGTTTTGCTGTTGCTGCTGCCTTT80
81GTGACGGGATCGCTTTCTCCCATCGAACCTTCTAGTTGCT120
121TATTGCAGCTTTGTCTCCTCAGCACTCTGCTGTCACTCAA160
161GGAAGTATCATCAAGAACAAGGAGGGCATGGATGCTAAGT200
201CACTAACTGCCTGGTCCCGGACACTGGTGACCTTCAAGGA240
241TGTATTTGTGGACTTCACCAGGGAGGAGTGGAAGCTGCTG280
281GACACTGCTCAGCAGATCGTGTACAGAAATGTGATGCTGG320
321AGAACTATAAGAACCTGGTTTCCTTGGGTTATCAGCTTAC360
361TAAGCCAGATGTGATCCTCCGGTTGGAGAAGGGAGAAGAG400
401CCCTGGCTGGTGGAGAGAGAAATTCACCAAGAGACCCATC440
441CTGATTCAGAGACTGCATTTGAAATCAAATCATCAGTTTC480
481CAGCAGGAGCATTTTTAAAGATAAGCAATCCTGTGACATT520
521AAAATGGAAGGAATGGCAAGGAATGATCTCTGGTATTTGT560
561CATTAGAAGAAGTCTGGAAATGTAGAGACCAGTTAGACAA600
601GTATCAGGAAAACCCAGAGAGACATTTGAGGCAAGTGGCA640
641TTCACCCAAAAGAAAGTACTTACTCAGGAGAGAGTCTCTG680
681AAAGTGGTAAATATGGGGGAAACTGTCTTCTTCCTGCTCA720
721GCTAGTACTGAGAGAGTATTTCCATAAACGTGACTCACAT760
761ACTAAAAGTTTAAAACATGATTTAGTTCTTAATGGTCATC800
801AGGACAGTTGTGCAAGTAACAGTAATGAATGTGGTCAAAC840
841TTTCTGTCAAAACATTCACCTTATTCAGTTTGCAAGAACT880
881CACACAGGTGATAAATCCTACAAATGCCCTGATAATGACA920
921ACTCTCTTACTCATGGTTCATCTCTTGGTATATCAAAGGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。