基因總覽
ZMYM6 是人類的蛋白質編碼基因,產物為 zinc finger MYM-type containing 6,也稱 Zinc finger MYM-type protein 6。其蛋白質長 1325 個胺基酸,具有多個 MYM-type zinc finger,屬於以此類鋅指結構為特色的蛋白質。來源將其功能定位於細胞形態與細胞骨架組織的調節,但未提供更細的分子作用方式或其他家族特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000357182 ★ | 34,986,165–35,031,945 | 16 |
| ENST00000859303 | 34,986,144–35,031,750 | 16 |
| ENST00000859306 | 34,986,144–35,031,750 | 17 |
| ENST00000929016 | 34,986,144–35,031,973 | 15 |
| ENST00000929017 | 34,986,144–35,031,973 | 17 |
| ENST00000929018 | 34,986,144–35,031,750 | 17 |
| ENST00000965365 | 34,986,144–35,031,733 | 15 |
| ENST00000965366 | 34,986,144–35,031,744 | 16 |
| ENST00000965367 | 34,986,144–35,031,750 | 17 |
| ENST00001145704 | 34,986,144–35,031,973 | 16 |
| ENST00000859304 | 34,986,165–35,031,750 | 16 |
| ENST00000859305 | 34,986,165–35,031,973 | 16 |
顯示 12/29 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZMYM6 的蛋白質產物參與細胞形態與細胞骨架組織的調節。這項功能描述指出其與維持或調整細胞形態及細胞骨架組織有關,但來源未進一步說明它直接作用於哪些分子、如何調控細胞骨架,或這些作用發生的具體條件。
因此,目前可據以描述的生物學角色限於上述調節功能;來源沒有提供特定細胞過程、實驗系統或形態變化方向等細節,也未界定其作用是促進或抑制細胞形態與細胞骨架組織的改變。
Promoter 與基因調控
>ZMYM6 ENST00000357182 GRCh38 chr1:35031845-35032945 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGGTTCTGCTTTACAAGGAAATTAACTTATTTATTTATTTTTTGGAAAGTTACTTTGAAATGAACCAATC TGTTTTTTGTTCTTTACTTCTGCTTTCTCCAGCCCTTCTCTGTCTATAAAACCTACCTCTTCTGCTCAGC TCATTGGAACACTTGTTCTATTTTATGGAATGAAGTGCTGCCAGATTCTAGAATCACAAATAAAGCTAAT TGAGATATTTAAATTAAATTTGTTGTAATTTTGTCTTTTAACATCACCAATGACAAGAATGTTCACAGAA GCATTATTCCTAATAGCCACAAATTGGAAACAACTCAAATGTCCATCAGTAGTAGATGATTAAAATTGTA TCATATTCATAAAATAGAATACTATACAGCAGTCAAAATGAATGAACAGTCACAAATCATACACGTATCT GTGAAACAATGTTGAATTAAAAAAACCAAATCTCAATTTTGAGCAAGTTTTTTCATTTATATCTCAAGAG ATTAAAAAATTATACCTCTTAGGGTTAAATGGTGAGGATTAAGTGGGATGGTGCATGTGAAGTGCTCAGC AAGCCAAGTATTATTTAATATCATGCTCTCTCAGTAGGCCACCTTTCAGGAAATGGGCACTAAAGGATGC TACAGATTAGCTAGGTGTGGTGGCACGTGCCTGTAAGCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATC GCTTCAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTTAGCCGAGATTGTGCCACTGCACCCCAGCCTGGGCAACACA GTGATACTCTGTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATGCTATAGA GCACTTACAGCGCCTTCTAACGCCATCTCCACCTTTTCACTATTGAGCCTCGGTCTCTTTAAGAAGTGAA CCATAATTGAGGAAAGAGGAATGCTGGGAAGTTCTACTCAGCTCAGGTCCGGAGCCTGACGGGAAAAGAG GGCGGAGACCAAGGCTGCGCAGGCGTGGTTGGCCGGTCGTTGCGTTGGGATGGATCAGGCGGAATTCCAG AAGAGAAAATAATCCCTGTCTAGATGCAGAGGACTTGGTTCCTATTCCAGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZMYM6_1 ↗ | 1:35,031,690 | 負股 | 35,031,680–35,031,739 |
| ZMYM6_2 ↗ | 1:35,031,945 | 負股 | 35,031,935–35,031,994 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_C5GT4 · enhancer · 35030411–35031679 · regulatory
ENSR1_9HWFJ · promoter · 35031680–35032182 · regulatory
ENSR1_5B8GTL · CTCF_binding_site · 35032079–35032100 · regulatory
ENSR1_832RTB · enhancer · 35032183–35032394 · regulatory
· motif · 35029600–35029622 · motif
· motif · 35029600–35029622 · motif
· motif · 35031377–35031388 · motif
· motif · 35031606–35031616 · motif
· motif · 35031713–35031730 · motif
· motif · 35031732–35031742 · motif
· motif · 35031756–35031765 · motif
· motif · 35031756–35031765 · motif
· motif · 35031783–35031793 · motif
· motif · 35031804–35031814 · motif
· motif · 35031939–35031950 · motif
· motif · 35031939–35031950 · motif
· motif · 35032081–35032097 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1325 aa
ZMYM6 蛋白質長 1325 個胺基酸,含有八個註記為 MYM-type 的 zinc finger,分布於第 113–572 位胺基酸區間。另有一段第 665–733 位胺基酸區域被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZMYM6 蛋白質的定位註記為細胞核;來源未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 17 個夥伴
- OPTNQ96CV9 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- BANPQ8N9N5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BEND2Q8NDZ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CTCFP49711 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FLNAP21333-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAT2AP31153 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NFYCQ13952-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NRF1Q16656-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PIAS4Q8N2W9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PMP22A0A6Q8PF08 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- POU2F1P14859-6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SOD1P00441 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TPH1P17752 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZBTB24O43167 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF76P36508 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZMYM6 對調節細胞形態與細胞骨架組織具有必要性;此描述未進一步交代具體作用機制、實驗條件或細胞形態變化的方向。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ZMYM6 的定位註記為細胞核;此定位資訊未提供其他細胞區室或定位變化條件。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGGCGTGGTTGGCCGGTCGTTGCGTTGGGATGGATCAGGC40GGAATTCCAGAAGAGAAAATAATCCCTGTCTAGATGCAGA80GGACTTGGTTCCTATTCCAGTGCTCCTCCGGTAGCAGGGA120GGCGACAGAAGGTGTCCAACTATCCATTACCAAGAAGAAA160TCTATTCGTTTGAGCCTGAGACACTCTTTGAGGTAAAAAA200TTAGAATGAAAGAACCTTTGGATGGTGAATGTGGCAAAGC240AGTGGTACCACAGCAGGAGCTTCTGGACAAAATTAAAGAA280GAACCAGACAATGCTCAAGAGTATGGATGTGTCCAACAGC320CAAAAACTCAAGAAAGTAAATTGAAAATTGGTGGTGTGTC360TTCAGTTAATGAGAGACCTATTGCCCAGCAGTTGAACCCA400GGCTTTCAGCTTTCTTTTGCATCATCTGGCCCAAGTGTGT440TGCTTCCTTCAGTTCCAGCTGTTGCTATTAAGGTTTTTTG480TTCTGGTTGTAAAAAAATGCTTTATAAGGGCCAAACTGCA520TATCATAAGACAGGATCTACTCAGCTCTTCTGCTCCACAC560GATGCATCACCAGACATTCTTCACCTGCCTGCCTGCCACC600TCCTCCCAAGAAAACCTGCACAAACTGCTCGAAAGACATT640TTAAATCCTAAGGATGTGATCACAACTCGCTTTGAGAATT680CCTATCCTAGCAAAGATTTCTGCAGCCAATCATGCTTGTC720ATCTTATGAGCTAAAGAAAAAACCTGTTGTTACCATATAT760ACCAAAAGCATTTCAACTAAGTGCAGTATGTGTCAGAAGA800ATGCTGATACTCGATTTGAAGTTAAATATCAAAATGTGGT840ACATGGTCTTTGTAGTGATGCCTGTTTTTCAAAATTTCAC880TCTACAAACAACCTCACCATGAACTGTTGTGAGAACTGTG920GGAGCTATTGCTATAGTAGCTCTGGTCCTTGCCAATCCCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。