基因總覽
ZMYM5（zinc finger MYM-type containing 5）是位於人類第 13 號染色體的蛋白質編碼基因。其產物 Zinc finger MYM-type protein 5 長 669 個胺基酸，含有四個 MYM-type zinc finger，分布於蛋白質序列中段。來源將其主要角色描述為轉錄調節因子；目前提供的資訊足以指出其蛋白質性質與結構特色，但未進一步說明其調節的特定基因或轉錄過程。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000337963 ★ | 19,823,482–19,863,649 | 8 |
| ENST00000854551 | 19,823,482–19,863,672 | 5 |
| ENST00000854552 | 19,823,482–19,863,672 | 7 |
| ENST00000854553 | 19,823,482–19,863,672 | 4 |
| ENST00000854554 | 19,823,482–19,863,447 | 8 |
| ENST00000923234 | 19,823,482–19,863,140 | 8 |
| ENST00000923235 | 19,823,482–19,863,096 | 8 |
| ENST00000954241 | 19,823,482–19,864,935 | 9 |
| ENST00000954242 | 19,823,482–19,863,456 | 8 |
| ENST00001028500 | 19,823,482–19,863,672 | 5 |
| ENST00001028501 | 19,823,482–19,863,672 | 6 |
| ENST00001131538 | 19,823,482–19,863,672 | 8 |
顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZMYM5 的產物被描述為轉錄調節因子，表示它參與調節轉錄活動。不過，現有資料沒有指出其作用的特定基因、調節方向或轉錄調控步驟，因此無法據此進一步界定它如何影響特定基因的表現。
來源也未說明 ZMYM5 是否透過直接結合 DNA、招募其他調節蛋白，或參與特定轉錄複合體來發揮作用；其生物學過程與功能影響範圍亦未有進一步描述。因而目前可確認的功能資訊限於「轉錄調節」這一層級，不宜延伸推定其分子機制或下游效應。
Promoter 與基因調控
>ZMYM5 ENST00000337963 GRCh38 chr13:19863549-19864649 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGGCCAGCGCCCCGGGCTGCTAGCACAGGACGGCGGCGCCCAGGGACGCCCCAGGGCAGGCCTCAGCCCC TCCAACCCGCGAGAGCCCAGCTCCAAGGGAGCCTGCAGCTCCCTCCATCTTGGTTGATGGAGGCGGGGAG CTGCGTCTGGGTGTCTCCACCGTCGCGCCCGACCAGTACTGCCCCGCGGACGCAGACGCCGGCAGCTGGG GCTGTTCCCTTGTCCGAATGGCAGAGCCCAGTCGGGGCTTCCGGGACAAGTCCTGGCCCCACGGGGTTTG GTTTTGAGGGGTCCCAAGTTCCCACAGTTGTCCCGACAAAATGGAGGACGTCGTCTCCTCCTGCTGCAGC CATGGCGGGAGGTGGGGGACTATTCCCCACGGGGCGCGGCGAGGGTGGAAGGGCCTCCACTGACCGCAGC GCACTCAAGACTCCAGTTCAACCGCGGCCCCGAAAGCTCACTTGGCCCCGCTCCAGCACCTCCCCGGCCT CGCCCCTCTTGGGGGCCTTCAAGGAACTGGACAGGGAGGGCGCTGGGGCATCCAGGCCGCCGCTCTCCTC GAGCAGAGGCGTTGGGAGCCGCTGCCGCAGCTTGGGCCCCCGGGCTCGGGCGAGGGCAGGCAGCCCCGCC GGAGTCTCCCGGGCTGTGTAGGTCCCGGAGAGCCCCGGGCCCCGAGGGGCCGAAGCGGGCCGCTACGACG GGCGGCGAATCTCGGGCTCCTGACCCTGGCGGACCCGGTAGCTGGGGGCGGGAGACCGGCGGGGAGACAA CCCGACCGGGAGTTGAGGGCTGGCAGGCGGGAGTGGAACTGCAGGGCCGCGGGTGTGGCCCGCACCTGAC GGACAGCTCTTCGGCCACCCCACCGAGGGGGCGCCCTGAAGGACGGCCGTCGGAGCCAATGGGCGTGCCC AAGGCGCCCAGGCTCGTCTCCCTCGCCAGCCAACGAGCGCACGGAGGGTGGGGCCTCCTCGGGCTCTGCT GCGCCGTCCCCTGCTTCTCCGCCTCCTCACCAGCGCGAAAAGCCGGGACTGGACCTCGCGGAGTTGTGCT TGTCGCCGAAGCGGGGTGGGCTTGTTCGTTCCGCGCAGCCGCAGCCAGAAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZMYM5_1 ↗ | 13:19,863,519 | 負股 | 19,863,509–19,863,568 |
| ZMYM5_2 ↗ | 13:19,863,647 | 負股 | 19,863,637–19,863,696 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR13_B5XFF · enhancer · 19860869–19861561 · regulatory
ENSR13_C3Z7S · enhancer · 19862162–19863497 · regulatory
ENSR13_56N5R6 · CTCF_binding_site · 19862525–19862546 · regulatory
ENSR13_99TTK · promoter · 19863498–19863796 · regulatory
ENSR13_C3Z7Z · enhancer · 19863797–19865433 · regulatory
· motif · 19861205–19861217 · motif
· motif · 19861255–19861277 · motif
· motif · 19862527–19862543 · motif
· motif · 19862543–19862558 · motif
· motif · 19862633–19862641 · motif
· motif · 19862860–19862877 · motif
· motif · 19862920–19862930 · motif
· motif · 19863433–19863446 · motif
· motif · 19863457–19863470 · motif
· motif · 19863491–19863501 · motif
· motif · 19863491–19863504 · motif
· motif · 19863557–19863568 · motif
· motif · 19863557–19863568 · motif
· motif · 19863574–19863584 · motif
· motif · 19863639–19863652 · motif
· motif · 19863686–19863696 · motif
· motif · 19863741–19863751 · motif
· motif · 19863775–19863788 · motif
· motif · 19863786–19863796 · motif
· motif · 19863821–19863831 · motif
· motif · 19863896–19863906 · motif
· motif · 19863921–19863933 · motif
· motif · 19864170–19864186 · motif
· motif · 19864231–19864246 · motif
· motif · 19864321–19864331 · motif
· motif · 19864372–19864385 · motif
· motif · 19864372–19864385 · motif
· motif · 19864393–19864404 · motif
· motif · 19864395–19864404 · motif
· motif · 19864755–19864772 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：669 aa
Zinc finger MYM-type protein 5 長 669 個胺基酸，序列中註記四個 MYM-type zinc finger：第 265–299、311–351、358–393 與 404–431 位胺基酸。資料未提供這些區域的額外功能或序列證據說明。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZMYM5 的定位資料為細胞核；來源未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 17 個夥伴
- SUMO1P63165 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CAMK2BQ13554-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CARD9Q9H257-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CBSP35520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DESP17661 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FADDQ13158 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HMBOX1Q6NT76 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOMER1Q86YM7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LCE3BQ5TA77 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PAX5Q02548 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TFGQ92734 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRAF2Q12933 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRAF4Q9BUZ4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIP13Q15645 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN1Q9UMX0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZBTB26Q9HCK0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNRD2O60232 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ZMYM5 與 ETV5 有蛋白質交互作用。此交互作用涉及 ZMYM5 的 N 端 120 個胺基酸區域，以及 ETV5 的 C 端；來源未進一步說明其複合體組成或功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZMYM5 的功能描述為轉錄調節因子，表示其產物與轉錄活動的調節有關；來源未提供特定作用標的、調節方向或更詳細的分子機制。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | ZMYM5 與 ETV5 交互作用；涉及 ZMYM5 的 N 端 120 個胺基酸區域，以及 ETV5 的 C 端。來源未說明此交互作用的功能後果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ZMYM5 的定位註記為細胞核；來源沒有提供其他定位條件或動態資訊。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GCCTCCTCACCAGCGCGAAAAGCCGGGACTGGACCTCGCG40GAGTTGTGCTTGTCGCCGAAGCGGGGTGGGCTTGTTCGTT80CCGCGCAGCCGCAGCCAGAACCGGGTGACGCTTATCCCCG120CTGTCTTTCCAGTCCAGGGCCGCTGAGAGTGGGGGTGGCT160GGGAGCAGCGCAGCCTCCGGAGGAGGAGGCGGAGGCCGAG200GACCAGGAATCACCTTCAAGCCTATGTCGTGAGGCTTTGG240CAGAAATTAAGAAGGAAATATCTCCATTGTTCATTGGCAT280GGAAAAATGTTCAGTGGGAGGATTAGAGTTGACTGAACAG320ACTCCTGCTTTATTAGGGAATATGGCCATGGCAACTAGTC360TCATGGACATAGGGGATTCATTTGGTCATCCAGCTTGTCC400TTTAGTCAGTAGATCTAGGAACTCACCAGTGGAAGATGAT440GATGATGATGATGATGTTGTGTTTATTGAATCTATACAAC480CTCCTTCAATTTCTGCTCCAGCAATAGCTGATCAAAGAAA520CTTCATATTTGCATCATCAAAAAATGAAAAGCCTCAAGGA560AATTATTCTGTAATTCCTCCTTCTTCAAGAGATTTGGCAT600CTCAGAAAGGAAATATAAGTGAGACAATTGTTATTGATGA640TGAAGAGGACATAGAAACAAATGGAGGAGCAGAGAAAAAG680TCTTCCTGTTTTATCGAATGGGGACTTCCTGGAACTAAAA720ACAAAACCAACGATTTGGATTTCTCCACTTCCAGTCTTTC760AAGAAGTAAGACCAAGACTGGAGTAAGACCTTTTAACCCT800GGTAGAATGAATGTGGCAGGAGACTTATTTCAGAATGGAG840AATTTGCAACTCATCATAGTCCTGATTCTTGGATCTCCCA880GTCAGCTTCATTTCCCAGTAATCAGAAACAGCCAGGGGTG920GATTCTTTATCACCAGTGGCCTTACTTCGTAAGCAGAATT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。