演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZKSCAN5ZNF914

zinc finger with KRAB and SCAN domains 5

ZKSCAN5 是編碼 zinc finger with KRAB and SCAN domains 5 的人類基因;其產物可能參與轉錄調控。

Homo sapiens7q22.1UniProt Q9Y2L8
OFFICIAL SYMBOL
ZKSCAN5
CHROMOSOME
7
UNIPROT
Q9Y2L8
PDB / ALPHAFOLD
2EM5
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZKSCAN5 是人類的蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger with KRAB and SCAN domains 5。現有資料未提供其轉錄本或蛋白質的基本性質、家族歸屬與結構細節;目前僅有可能參與轉錄調控的概括性註記,不能據此進一步確定其調控方式或生物學作用。

Official symbol
ZKSCAN5
Gene name
zinc finger with KRAB and SCAN domains 5
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12867
UniProt
Q9Y2L8
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZNF914ZSCAN37ZFP95

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q22.1
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegZKSCAN5pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr7:99,504,634–99,535,360
Gene span
30,727 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000326775 ★99,504,662–99,534,7007
ENST0000045115899,504,634–99,535,3607
ENST0000086457699,504,634–99,535,3607
ENST0000086457799,504,634–99,535,3607
ENST0000092594099,504,634–99,535,3605
ENST0000092594199,504,634–99,535,3605
ENST0000092594299,504,634–99,535,3605
ENST0000092594399,504,634–99,535,3607
ENST0000097050699,504,634–99,535,3607
ENST0000101873299,504,634–99,535,3605
ENST0000110686799,504,634–99,527,3906
ENST0000113485199,504,634–99,535,3607

顯示 12/30 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZKSCAN5 的功能註記指出,它可能參與轉錄調控。這項描述帶有不確定性,表示目前資料僅提示其與轉錄調控相關,並未確認它在此過程中的具體作用,也未說明調控的基因、作用方向或分子機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 99504662 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZKSCAN5 ENST00000326775 GRCh38 chr7:99503662-99504762 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGGCTGGGGCCTGGAAACTATAAAGCACCATATGAAAAGGAGAGCACTGGGAGGTCGATGCGGGCGCATC
ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGGGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA
TAAGCCGGGCGTGGTGAGTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGAAAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCCCGAA
CCTGGGAGCAGAGGTTACAGTGAGCCGAGATCGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGGGACAACGAGACTCC
GTCTCAAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAACGGGAGATTATTACTAAGAGATGGGGTCTCACTATGTT
GCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCCCGGCTCACTGCATCCTCAGCCTCCCGGGTCCAAGTGATTCT
CCTGCCTCAGCCTCCCAAGTGGCTGAGATTACAGGCTCGCGCCACCACGCCCAGCTAAGTTTTTGTATTT
TTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGCCTCAGGTGATCCACCCA
CCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGCATTACAGGTGTGAGTCACCGAGCCCGGCCAAGGGAGGGTATTTCTAA
TAGACAGGGGTCTCGCTATGTTGCCCGAGCTGGTCTCGAACTCTTGGGCTCAAGCGATCCTGCTTCTTCA
GCCTGTCCACTAGCTAGGCTTACAAGCGTGGGACCCCGCGCCTGGCTGAAGAGAGGTATCATTAAGGACG
AGACCCCCTTGGCCAGGGAAGCCCTGCGTAAGCAACGCCCCTCTCTTCAAAGGGATGCCCCGCTCCCTCC
GCCCACTCCCAGCCTTCCAGCCTTGGCTCCCGAGGACACGACTCCGGGCCCTGCCACCTTCTGATAGGCT
CGCGAGACCGAGGCTGCAAAGAGAGCCGCCCCCCATTGGCCAACCGGCGAGTCCCGCGCGCCACCTCCTG
GGAGATGTAGTTCCGGGAACAGCTGGCCCCTGCGACTCGCGGGTGTGACGTTGAAGATGTCGGCCTTCTG
AGCCGACTGCGGTGGTCAAGAGGTGGGTTTGTTTGGAAAGTGGGTGGTGAG
ZKSCAN5 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZKSCAN5_4 ↗7:99,499,900正股99,499,851–99,499,910
ZKSCAN5_3 ↗7:99,504,675正股99,504,626–99,504,685
ZKSCAN5_1 ↗7:99,504,990正股99,504,941–99,505,000
ZKSCAN5_2 ↗7:99,505,260正股99,505,211–99,505,270

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:839 aa

1 aa839 aa結構域鋅指
依 Q9Y2L8 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZKSCAN5 蛋白長 839 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。序列註解包含 SCAN box(51–132)與 KRAB(218–291),另有 13 個 C2H2 型鋅指註解,其中第 11 個標示為 atypical。

結構域SCAN box51–132 aa
結構域KRAB218–291 aa
鋅指C2H2-type 1346–368 aa
鋅指C2H2-type 2374–396 aa
鋅指C2H2-type 3402–424 aa
鋅指C2H2-type 4430–452 aa
鋅指C2H2-type 5549–571 aa
鋅指C2H2-type 6577–599 aa
鋅指C2H2-type 7605–627 aa
鋅指C2H2-type 8633–655 aa
鋅指C2H2-type 9661–683 aa
鋅指C2H2-type 10717–739 aa
鋅指C2H2-type 11; atypical745–763 aa
鋅指C2H2-type 12773–795 aa
鋅指C2H2-type 13801–823 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2EM5…

PDB · 2EM5

NMR · - · A=768-800

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZKSCAN5 的定位註記為細胞核;資料未提供定位改變的條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF914ZKSCAN5ATXN10GFAPGLE1SPRED1SUV39H1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZKSCAN5 可能參與轉錄調控;此描述保留可能性,未指出具體調控對象、作用方向或分子機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZKSCAN5 的定位註記為細胞核;此資料未說明定位的條件、變化或異構型差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000326775 · 5,083 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCTGGCCCCTGCGACTCGCGGGTGTGACGTTGAAGATGT40
41CGGCCTTCTGAGCCGACTGCGGTGGTCAAGAGTGTAACAC80
81AGCCAGCCTCGAAGACTTCCCTCTGAGTTGGAATGATAAT120
121GACCGAATCCCGAGAAGTTATAGACTTAGACCCCCCAGCT160
161GAGACTTCCCAGGAGCAGGAAGACCTTTTCATAGTGAAGG200
201TGGAAGAAGAAGACTGCACCTGGATGCAGGAGTACAACCC240
241GCCAACGTTTGAGACTTTTTACCAGCGCTTCAGGCACTTC280
281CAGTACCATGAGGCTTCAGGACCCCGGGAGGCTCTCAGCC320
321AACTCCGGGTGCTCTGCTGTGAGTGGCTGAGGCCCGAGCT360
361GCACACGAAGGAGCAGATCCTGGAGCTGCTGGTGCTGGAG400
401CAGTTCCTGACCATCCTGCCTGAAGAGTTCCAGCCCTGGG440
441TGAGGGAACATCACCCTGAAAGTGGAGAAGAGGCGGTGGC480
481CGTGATAGAAAATATACAGCGAGAACTTGAGGAACGCAGA520
521CAGCAGATTGTTGCCTGCCCTGATGTGCTTCCTCGGAAGA560
561TGGCAACACCTGGAGCAGTGCAGGAGTCCTGCAGCCCCCA600
601TCCCCTGACCGTGGACACCCAGCCTGAGCAAGCGCCACAG640
641AAGCCTCGTCTCCTGGAGGAAAATGCCCTTCCTGTTCTCC680
681AAGTTCCTTCCCTTCCCCTGAAGGACAGCCAGGAGCTGAC720
721AGCTTCACTTCTCTCAACTGGGTCCCAGAAGTTGGTGAAA760
761ATTGAAGAGGTGGCTGATGTGGCTGTATCCTTCATCCTGG800
801AGGAATGGGGGCATTTGGACCAGTCCCAGAAGTCCCTTTA840
841TAGGGATGACAGGAAGGAGAACTATGGGAGTATTACTTCC880
881ATGGGTTATGAGTCCAGGGACAATATGGAGCTCATAGTGA920
921AGCAGATTTCTGATGACTCTGAATCACACTGGGTGGCGCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。