基因總覽
ZKSCAN4（zinc finger with KRAB and SCAN domains 4）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質具有 SCAN box、KRAB 區域及多個 C2H2-type zinc finger，並含有數段註解為無序的區域。現有功能資料指出，它可能參與 MDM2 與 EP300 基因的轉錄活化；這項描述未進一步說明其作用方式或調控條件。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000377294 ★ | 28,241,697–28,252,269 | 5 |
| ENST00000901698 | 28,241,011–28,252,924 | 6 |
| ENST00000901699 | 28,241,011–28,252,275 | 5 |
| ENST00000901700 | 28,241,011–28,252,296 | 5 |
| ENST00000901701 | 28,241,011–28,252,269 | 5 |
| ENST00000927145 | 28,241,011–28,252,924 | 6 |
| ENST00000927146 | 28,241,011–28,252,298 | 5 |
| ENST00000959508 | 28,241,011–28,252,924 | 6 |
| ENST00001070881 | 28,241,011–28,252,275 | 4 |
| ENST00001070882 | 28,241,011–28,252,298 | 4 |
| ENST00001126996 | 28,241,011–28,252,298 | 2 |
| ENST00001140593 | 28,241,011–28,252,298 | 5 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料指出，ZKSCAN4 可能參與 MDM2 與 EP300 基因的轉錄活化。這表示它與這兩個基因的轉錄調控有關，但來源僅描述其可能參與活化，未提供具體分子機制、作用條件或其他功能過程，因此不能據此推定它如何影響轉錄，也不能將此描述視為已確定的作用方式。
Promoter 與基因調控
>ZKSCAN4 ENST00000377294 GRCh38 chr6:28252169-28253269 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGGGCAGAAAGGGGCTTACTGAAGTGTCCAGTCAAATAACTTACAGTCAATTATGGCTTAAAATCGAGTC CCATCTAGTTCAAAGAATTCTCAGGGCTTTCTTCTATTATAGGATAGGCCTAGTTTATCACATGCCAGGC ACTGTTCTAAGCACTTTACACAAGAGTGCTCACAACATTATCTAATCCCTAGTAATGCCTACAACATCCC TATCTACTATTACTTTCCCTATTTACAGATTGGAAAAGTCGGGCACAGGGAGGGTAAGCCAGGATTACAC AGGTAACCTGGCTACCTGCGTATCTAGCCACTGTGCTTGACTGTGATTGGGGGCTGGGAAGAAACAGGAA GGAAGAAAGCAGAAGAGAATGGGGTCCCTGAAGCCAGAGACTAGAGAGTTTCTGGAGGTGGAGAGCAGCA TAAGCCTGATTGCCAGAGAAGCAGCCATGGAATGTGCAAAGTGGTGAGTGGGGGAGTGGGACAGTGTGTT GAGGATTAGTGGGAGGTGAGGGCTACAGTCAGGGTCGGGAGGAGTAGTCTGGCCTTAAGGAGGAGGAAAA AAAGTGACAGATTAAGGGGGTGAGTGGGGAAGGACCAAGGGCAGCCACTGCTCGCTCCAGGCAAGTGCCT GGTGATGTGTTCTGCTGCTTTGATGTTTCTGAGAGAGACTAAAGGTCCCCCTGCCAGGGTTCTTGGGGCT CTGGGGAACCCCTGCTTTCCAGCTCAATTTTAGTGTCAATTTTATGCCAGCTGCTTAAGCAAGCTTTACA TAGGAAAGAAATATGAGCCGCAGCGGCATCCTTCCAGGATTTAAAGGCTCAGTCCTATTTCTTATGATCC AAGGTCTGTCATCCTTTCCTTCTCTATCCCTTAACTGCCTTCCCTTGCGTGGAGGTAAGGACAGGGTAGC TAATGGGTTAATTCGGAGACAACCACCGAGAGAAGCTTCCTAGAGCGCCCAGGAAGTGGCCTTAGTTCCC ATCGAGACTTCCTGTGCCCCAGCCTCAACTTCCCTCCTATGTCTGGAGAGTGATCACTTTCACTCCCAAA GACATCCTTTGGTGATACTTACTGTGGGATTCAGAGTGGGGTGCAGAGGAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZKSCAN4_1 ↗ | 6:28,252,266 | 負股 | 28,252,256–28,252,315 |
| ZKSCAN4_2 ↗ | 6:28,259,208 | 負股 | 28,259,198–28,259,257 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_9F7QW · promoter · 28252259–28252759 · regulatory
· motif · 28252275–28252284 · motif
· motif · 28252302–28252311 · motif
· motif · 28252302–28252313 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：545 aa
ZKSCAN4 蛋白質長 545 個胺基酸，屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 SCAN box 位於第 53–135 個胺基酸，KRAB 區域位於第 221–317 個胺基酸；另註解有 7 個 C2H2-type zinc finger，分布於第 320–537 個胺基酸範圍內。第 1–22、34–55 與 455–480 個胺基酸區段被標示為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
現有定位資料未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 18 個夥伴
- CABP5Q9NP86 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- IL36RNQ9UBH0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LXNQ9BS40 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OSGIN1Q9UJX0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PGBD1Q96JS3 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- PSMA6P60900 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCAND1P57086 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- TRIM39Q9HCM9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZKSCAN7Q9P0L1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- ZNF24P17028 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- ZNF397Q8NF99-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF446Q9NWS9-2 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- ZNF496Q96IT1 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- ZSCAN21Q9Y5A6 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ZSCAN22P10073 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZSCAN30Q86W11 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZSCAN32Q9NX65 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZKSCAN4 可能參與 MDM2 與 EP300 基因的轉錄活化；來源未進一步說明其作用機制、發生條件或參與程度。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ZKSCAN4 的細胞內定位為細胞核；此資料未說明定位是否隨條件或異構型而改變。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGCCTCAACTTCCCTCCTATGTCTGGAGAGTGATCACTTT40CACTCCCAAAGACATCCTTTGGTGATACTTACTGTGGGAT80TCAGAGTGGGGTGCAGAGGACGACCCTGCAAAGGCACGGA120CTATAAGAGAGATCTGTGCAGCTGCGCCTCAGGGGGTGTC160CTGGGCCCCTGGGCATGACAGGAGGGGGACCACTTGCAGT200TCTACTGGAAAATTTACCACCCTTCCAGAATCCTCTGAAG240ATATACAGGTCGCAACTAGAGTGAGACCCGAGTACTGCCT280TGGGTCAGAATGGCTAGAGAACCGAGAAAAAACGCAGCCC320TGGACGCCCAGTCTGCAGAAGACCAGACGGGGCTCCTGAC360CGTGAAGGTGGAGAAGGAGGAAGCCTCCGCCTTGACGGCG400GAGGTGAGAGCACCCTGCAGCCCTGCTCGGGGCCCCGAAC440GCTCCCGCCAGCGCTTCCGAGGCTTCCGCTACCCGGAGGC480TGCGGGCCCCCGCGAGGCGTTGAGCCGGCTCCGAGAACTC520TGCGGACAATGGCTGCAGCCTGAGATGCACAGCAAGGAGC560AGATCCTGGAGCTGCTGGTGCTGGAGCAGTTCCTGACCAT600CCTGCCGGGGAATCTGCAGAGCTGGGTGCGGGAGCAGCAT640CCAGAGAGCGGGGAGGAGGTGGTGGTGCTATTGGAGTATT680TGGAGAGGCAGCTGGATGAGCCGGCGCCGCAGGTTCCCGT720TGGTGACCAGGGGCAAGAACTGCTCTGTTGCAAGATGGCA760CTATTGACACAAACTCAAGGGTCTCAAAGTAGCCAGTGCC800AGCCAATGAAGGCTCTGTTCAAGCATGAATCTCTGGGATC840CCAGCCCTTACACGATAGAGTTCTCCAGGTTCCTGGGCTT880GCCCAGGGAGGGTGCTGCAGAGAAGATGCAATGGTAGCTT920CCAGGCTCACTCCAGGGTCCCAGGGTTTGCTGAAAATGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。