演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZKSCAN1KOX18

zinc finger with KRAB and SCAN domains 1

ZKSCAN1 是一種含 KRAB、SCAN 與 C2H2 型鋅指區域的蛋白質,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens7q22.1UniProt P17029
OFFICIAL SYMBOL
ZKSCAN1
CHROMOSOME
7
UNIPROT
P17029
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZKSCAN1(zinc finger with KRAB and SCAN domains 1)是蛋白質編碼基因,產物屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其蛋白質具有 SCAN box、KRAB 區域及多個 C2H2 型鋅指,構成可辨識的結構特色。現有功能註釋指出它可能參與轉錄調控,但未提供更具體的作用機制。

Official symbol
ZKSCAN1
Gene name
zinc finger with KRAB and SCAN domains 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13101
UniProt
P17029
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KOX18PHZ-37ZSCAN33ZNF139ZNF36

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q22.1
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegZKSCAN1pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr7:100,015,570–100,047,430
Gene span
31,861 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000324306 ★100,015,596–100,041,6896
ENST00000426572100,015,570–100,034,2718
ENST00000875795100,015,570–100,036,7504
ENST00000875797100,015,570–100,035,0467
ENST00000931537100,015,570–100,039,3357
ENST00000966834100,015,570–100,034,2707
ENST00001102944100,015,570–100,041,6896
ENST00001117200100,015,570–100,046,2056
ENST00001117201100,015,570–100,038,8366
ENST00001125574100,015,570–100,034,2975
ENST00001139941100,015,570–100,041,6896
ENST00000535170100,015,572–100,041,6884

顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZKSCAN1 的功能註釋指出,它可能參與轉錄調控。這項描述保留了不確定性,並未明確界定其調控方向、作用標的或分子機制,因此不能據此判定它會促進或抑制特定基因的轉錄。

現有資料亦未說明 ZKSCAN1 在哪些生物學過程中發揮作用,或其轉錄調控可能帶來何種細胞層級結果。其含有 SCAN box、KRAB 區域及 C2H2 型鋅指等結構特徵,但僅憑這些結構註解,無法進一步推定具體的結合對象或調控方式。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 100015596 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZKSCAN1 ENST00000324306 GRCh38 chr7:100014596-100015696 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AATACAAAAATTAACCAGGCATGGTGGTGTGCGCCTGTAGTCCCAGGTACTCAGGAGGCTAAGGCAGGAG
AATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATGGTGCCACTGCACTGCAGGCTGGGTGA
CAGAGCGAGACTCCATCTAAAAAAAAAAAGTAAATCTCTCCAAGCAGTAAGAGTCATGCAACCAAGCTAC
TGAGTTTCTCCCATGAACTTGTCTCGGAACATAGTGGAAAGTCACAACCATTAAAGCCTGTAGTCCCCCC
CACCCTTGCACAACGTGGCCCCCTCTTATGCGTGCCTTACCCTGCAAGGCAAAGATGAAGGCTGTAACTG
TGGTAGGTTGTGAAAGCACTTTGAAGGTAAAAGTGTCTGTTGTTACTCTGAAAACTCCTTTTAAACGGCT
ATAATAGCATATGCCACATGAGCAAAGCACAGAACCTTATAACTATGCTTGCTTGTGGAAAGACATCCCT
TGTCCACGGGCCAAGTATTTGAAAATACCACTCCATATAGCTCCAGGGCCCTGAGAGAAGCTACCGTGGC
AGCTTTGGGAAACCAGCCACCCTTGGCTTCACTTTGATCTTCCTCAGTCTACATCCTTGTTTCAGTTCCT
TTGCCACAGACATACAATTACCAAGTACTATATTGCTTGATAATAACTATAATTACTACAAGGACTGCCT
GAGATGAAAAAGACAGGTGAAATCGAACTTTCACATGGACTGGTGTCTGAGCTGGAGAGTCTGTTTGAGT
TTGAGTAGGGGAAAGCCTGAAACCCCCCACCACCTGCTCCCGTTAGTCCCTGCATTAACTAGGGGCGGAC
TGGGACCTGATCCTCCAAGCTGGAGGCTTGAAAACTCAAGGGCAGGCGCCTGGTCCAGCGATTCGGAAAC
CGAGATGCAAAGTCCTCCCGCGCTCCTAGAGAGGACCCGGAAGCGCGGCGCGGTCCCGGAAGACGAGGTG
GTGACACGCTTCCGGCCTTTGTGACTCATTGTGTCTGTGTCGAGGCGTCGGGAGGGCCTAAGTCCGTGTG
CGGTGCCCTTCGGCCGGCCTGAGCCCCAGAGTCAGCTCCCCTTTCTCGCCC
ZKSCAN1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZKSCAN1_1 ↗7:100,015,603正股100,015,554–100,015,613

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_93GNRW · enhancer · 100012707–100013093 · regulatory

ENSR7_BPSWR · promoter · 100015082–100015609 · regulatory

ENSR7_CCWXZ · enhancer · 100015610–100016849 · regulatory

· motif · 100015319–100015332 · motif

· motif · 100015394–100015403 · motif

· motif · 100015508–100015523 · motif

· motif · 100015508–100015523 · motif

· motif · 100015539–100015550 · motif

· motif · 100015539–100015550 · motif

· motif · 100015541–100015550 · motif

· motif · 100015582–100015591 · motif

· motif · 100015596–100015604 · motif

· motif · 100015628–100015643 · motif

· motif · 100015687–100015698 · motif

· motif · 100016014–100016027 · motif

· motif · 100016014–100016027 · motif

· motif · 100016097–100016107 · motif

· motif · 100017334–100017348 · motif

· motif · 100020342–100020353 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:563 aa

1 aa563 aa結構域功能區域鋅指
依 P17029 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZKSCAN1 蛋白質長 563 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。序列包含 SCAN box(第 56–138 位)、KRAB 區域(第 227–300 位)及六個 C2H2 型鋅指(第 377–539 位)。另有兩段被註記為無序區,分別位於第 1–51 位與第 257–373 位。

結構域SCAN box56–138 aa
結構域KRAB227–300 aa
鋅指C2H2-type 1377–399 aa
鋅指C2H2-type 2405–427 aa
鋅指C2H2-type 3433–455 aa
鋅指C2H2-type 4461–483 aa
鋅指C2H2-type 5489–511 aa
鋅指C2H2-type 6517–539 aa
功能區域Disordered1–51 aa
功能區域Disordered257–373 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P17029…

AlphaFold · P17029

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZKSCAN1 的定位註記為細胞核;資料未提供其定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KOX18ZKSCAN1MAPK7OPTNZSCAN32
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZKSCAN1 可能參與轉錄調控;此註釋指出的是可能性,未具體說明調控方向、作用標的或分子機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZKSCAN1 的定位註記為細胞核;此資料未描述定位發生的條件或變化。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000324306 · 9,403 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTGACTCATTGTGTCTGTGTCGAGGCGTCGGGAGGGCCTA40
41AGTCCGTGTGCGGTGCCCTTCGGCCGGCCTGAGCCCCAGA80
81GTCAGCTCCCCTTTCTCGCCCAGCGCCCCCAGGCCGCTCC120
121CGGGGCTCACGGAATAGTAAAGAAACACATCATAAAACCT160
161CCCAGGACATAAAGGTGAGCACAGACCCTGTTTGGATCAA200
201GTCAGTTCCTGGAGCCTGAATGATGACTGCTGAATCACGG240
241GAAGCCACGGGTCTGTCCCCACAGGCTGCACAGGAGAAGG280
281ATGGTATCGTAATAGTGAAGGTGGAAGAGGAAGATGAGGA320
321AGACCACATGTGGGGGCAGGATTCCACCCTACAGGACACG360
361CCTCCTCCAGACCCAGAGATATTCCGCCAACGCTTCAGGC400
401GCTTCTGTTACCAGAACACTTTTGGGCCCCGAGAGGCTCT440
441CAGTCGGCTGAAGGAACTTTGTCATCAGTGGCTGCGGCCA480
481GAAATAAACACCAAGGAACAGATCCTGGAGCTTCTGGTGC520
521TAGAGCAGTTTCTTTCCATCCTGCCCAAGGAGCTCCAGGT560
561CTGGCTGCAGGAATACCGCCCCGATAGTGGAGAGGAGGCC600
601GTGACCCTTCTAGAAGACTTGGAGCTTGATTTATCAGGAC640
641AACAGGTCCCAGGTCAAGTTCATGGACCTGAGATGCTCGC680
681AAGGGGGATGGTGCCTCTGGATCCAGTTCAGGAGTCCTCG720
721AGCTTTGACCTTCATCACGAGGCCACCCAGTCCCACTTCA760
761AACATTCGTCTCGGAAACCCCGCCTCTTACAGTCACGAGC800
801TCTTCCTGCTGCCCACATTCCTGCACCCCCTCATGAGGGT840
841AGTCCCAGAGACCAGGCGATGGCATCTGCACTATTCACAG880
881CGGATTCCCAGGCAATGGTGAAGATCGAGGACATGGCTGT920
921GTCCCTCATTCTGGAGGAATGGGGATGTCAGAATCTGGCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。