01 / GENE OVERVIEW
基因總覽
ZIM2（zinc finger imprinted 2）是蛋白質編碼基因，產物屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。所提供的蛋白質序列註解長度為 527 個胺基酸，具有 KRAB 結構域及五個 C2H2 型鋅指區域；另有兩段被註記為無序區。這些資訊描繪了蛋白質的家族歸屬與結構組成；其可能的生物學角色則限於來源所述的轉錄調控參與可能性。
Official symbol
ZIM2
Gene name
zinc finger imprinted 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12875
UniProt
Q9NZV7
02 / NOMENCLATURE
基因異名與舊稱
Alternative gene names & synonyms
ZNF656
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
03 / GENOMIC CONTEXT
染色體位置與基因結構
Chromosome 1919q13.43
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:56,754,335–56,840,755
Gene span
86,421 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000629319 ★ | 56,774,547–56,840,726 | 13 |
| ENST00001111741 | 56,754,335–56,840,729 | 11 |
| ENST00001028397 | 56,774,536–56,840,727 | 11 |
| ENST00000593711 | 56,774,547–56,840,726 | 11 |
| ENST00000689654 | 56,774,547–56,840,729 | 12 |
| ENST00001028399 | 56,774,562–56,840,727 | 12 |
| ENST00001125403 | 56,774,562–56,839,025 | 11 |
| ENST00001028400 | 56,774,563–56,840,729 | 12 |
| ENST00001028402 | 56,774,563–56,840,729 | 11 |
| ENST00000715564 | 56,774,594–56,795,511 | 5 |
| ENST00000601070 | 56,774,594–56,836,078 | 11 |
| ENST00000599935 | 56,774,594–56,840,729 | 12 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
04 / BIOLOGICAL FUNCTION
分子功能與生物學過程
ZIM2 的功能註解指出，它可能參與轉錄調控。這項描述帶有可能性，來源未進一步界定其調控的基因、轉錄方向或作用條件，因此不能據此判定它會促進或抑制特定基因的表現。
現有資料也沒有提供 ZIM2 如何接觸 DNA、是否與其他分子協同作用，或其參與哪些細胞過程的細節。因此，能支持的功能性結論僅止於它可能涉及轉錄調控；更具體的分子作用方式與生物學後果，無法由這些來源確定。
05 / GENE REGULATION
Promoter 與基因調控
依所選 TSS 來源，取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算；調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZIM2 ENST00000629319 GRCh38 chr19:56840626-56841726 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CAGAAGGGAAAAATCCCTCTTCCACCCCACATTCCTTGTCCCTAGAAGTAACTCATCAACAATTTCTTGC CTACCTTTCCAACAGTTTTACCTATATTTGGGTTTATCCTTAAAAAACAAATAAATGAGAAAACACTTAC CAGTTCGTTTCTACAAACTTCAGTAACTTGTATATTTCACTAAATCTACTGAGAATTCAATCCTTAATAA TCCCATACAATTCTACCTCATTATTTTTCTCTCTCATTTTCTTGCTGTTTTATTAAATGGCAATGCAGTG GGCTTACGCAGTGGAAGGTCTGTATTGACGGCTGCTGGGAAACAACTCAGTAGTGTGTGAGACTGCCCGC TCCCCTAAACCGCACGTGCCCGGTGTTTCAGGTTTGCATTTCTTTATGCAAACAGGTCGTGATGTTTCCT TCGCAGGTCGGCCAGCCGTTTGGATTTTCTTGCGAATTGCCAGTTTTATCCCTTTTGCCCATTTTTCTGT CTTGGTTTGGTCTTTATCTCGTTGGTTTCCAAGAGCTCTTCATTTATTAAGGAAATTAGCTCGATGTCTT TCATGTGTCCCAGGCGGAAAAGTCTTGTCTTCCCTGCAGGTCTTTAGACGTTAATGTATGTGTTTTTGCG GCCAGGATTTTCATTTTTTTCATTTAGACAGATGTGTACATTTGTCCCTTTATTCTTCAGCGGTTTTACA TTTGAGCATCTCAGTGGGGTTTCCTCCATTTCGACCCCCATTTCTTTGGGGGCTGCACCCCCACCACCCA ACCCACCCCCCTTTTCCAGACCTGGCTTTGGGGTCCCTCACGGCCACTCCCTGACGTCAGCCCCCAGCCT TCGCGCCAAACTGTTGCTGTGGCAACCGCAGCCTGATTGGCACGTCACAGGGCTGTGGTGAGGGGGCCCG GAGAGGGCGGTGAGGCTGCTGATTGGCTAGCACAGAAGCCCCGCCTCTGCGGAGAAGCCCTGACAAGGAG GCGTCGAGCTGCACCTCGGTGCAGAAGTCTGGGCAGCTGCGGGAGGAGAGGTTTGGGAGGCGCGGGAGAT GTCCACCCTGGGCTGGTGGCGCCGCCGGGCGCCGGGCGCCATGAGGGTGCG
ZIM2 位於負股。上下游依轉錄方向計算，序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示；負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZIM2_1 ↗ | 19:56,840,726 | 負股 | 56,840,716–56,840,775 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算；該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：527 aa
ZIM2 蛋白長 527 個胺基酸，屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。序列註解包含一個 KRAB 結構域，以及五個 C2H2 型鋅指區域；第 1–104 與 247–322 位胺基酸則被註記為無序區。
結構域KRAB176–246 aa
鋅指C2H2-type 1328–350 aa
鋅指C2H2-type 2356–378 aa
鋅指C2H2-type 3412–434 aa
鋅指C2H2-type 4466–488 aa
鋅指C2H2-type 5494–516 aa
功能區域Disordered1–104 aa
功能區域Disordered247–322 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY
蛋白質三維結構
自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9NZV7…
08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION
細胞內定位
定位：Nucleus
ZIM2 的定位註解為細胞核。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
UniProtKB
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
09 / PROTEIN NETWORK
交互作用與訊號網絡
圖中 32 個夥伴 · 最多顯示 50 個
來源支持的結構／直接結合關係其他來源關係紀錄
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 32 個夥伴
32 個夥伴
- AQP1P29972 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BAG4O95429 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BLZF1Q9H2G9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CATSPER1Q8NEC5 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- CCDC120Q96HB5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EPM2AIP1Q7L775 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- FAM161AQ3B820 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GLYCTKQ8IVS8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GMCL1Q96IK5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOXA1P49639 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IL16Q14005-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-6P60371 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP12-2P59991 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP2-4Q9BYR9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP3-2Q9BYR7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LIMS1P48059-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MDFIQ99750 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MID2Q9UJV3-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MKRN3Q13064 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PATZ1Q9HBE1-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PHF1O43189 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- POLR1CO15160 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- POU6F2P78424 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCNM1Q9BWG6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
第 1 頁
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
10 / HUMAN HEALTH
疾病與遺傳關聯
目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據；基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX
Contextual Functional Evidence Matrix
功能證據與細胞情境矩陣
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
2 筆功能證據／註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預／量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」，空白實驗欄位不以推測補齊。
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀，不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識；未逐篇核對原始方法的紀錄，不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER
核酸與蛋白質序列
完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列，保留非編碼區。
1
GCAGAAGTCTGGGCAGCTGCGGGAGGAGAGGTTTGGGAGG4041
CGCGGGAGATGTCCACCCTGGGCTGGTGGCGCCGCCGGGC8081
GCCGGGCGCCATGAGGGTGCGCTAGGCGGCTGTTCGTGCC120121
CGAGGCTGCGCAGCACTGAGGTGAGCTTTGCCTTCTTGAT160161
CTTCCGTCCTTCTTGGAGACGACTGGCGAGAGGAAGAGGG200201
ACTAGGTCCAAACGCTAGGTGGCTGGGTCCAGATACCTGT240241
GTTTTGACTCTGTTCCTGTGGATAGCTGCTTGGTCTGAAG280281
TTCCAGAAAGGATCCTGTTCCCAGACAGCCGGAGACCCGC320321
ACCAAGGAGGAGATCATCGAGCTCTTGGTCCTTGAGCAGT360361
ACCTGACCATCATCCCTGAAAAGCTCAAGCCTTGGGTGCG400401
AGCAAAAAAGCCGGAGAACTGTGAGAAGCTCGTCACTCTG440441
CTGGAGAATTACAAGGAGATGTACCAACCAGAAGACGACA480481
ACAACAGTGACGTGACCAGCGACGACGACATGACCCGGAA520521
CAGAAGAGAGTCCTCACCACCTCACTCAGTCCATTCTTTC560561
AGTGGTGACCGGGACTGGGACCGGAGGGGCAGAAGCAGAG600601
ACATGGAGCCACGAGACCGCTGGTCCCACACCAGGAACCC640641
AAGAAGCAGGATGCCTCCGCGGGATCTTTCCCTTCCTGTG680681
GTGGCGAAAACAAGCTTTGAAATGGACAGAGAGGACGACA720721
GGGACTCCAGGGCTTATGAGTCCCGATCTCAGGATGCTGA760761
ATCATACCAAAATGTGGTGGACCTCGCTGAGGACAGGAAA800801
CCTCACAACACAATCCAGGACAACATGGAAAACTACAGGA840841
AGCTGCTCTCCCTCGGAGTGCAGCTTGCTGAAGACGATGG880881
CCACTCCCACATGACGCAGGGCCACTCATCAAGATCCAAG920921
AGAAGTGCCTACCCAAGCACCAGTCGAGGTTTCCTTGCTC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。
13 / DATA PROVENANCE