基因總覽
zinc fingers and homeoboxes 1（ZHX1）是由蛋白質編碼基因產生的 ZHX 家族成員。其蛋白質含有鋅指與多個 homeobox DNA 結合區域，具備轉錄調控相關的結構特徵。ZHX1 的主要角色是參與轉錄抑制；其功能可與 DNMT3B 及其他共抑制蛋白的作用相連。這些基本特徵使 ZHX1 成為具有多個 DNA 結合區域、並能參與蛋白質互作的轉錄調節蛋白。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000395571 ★ | 123,248,456–123,274,286 | 4 |
| ENST00000297857 | 123,246,669–123,274,620 | 4 |
| ENST00000522655 | 123,246,669–123,275,541 | 4 |
| ENST00000863173 | 123,246,669–123,275,371 | 4 |
| ENST00000863174 | 123,246,669–123,274,622 | 4 |
| ENST00000863175 | 123,246,669–123,274,774 | 4 |
| ENST00000863176 | 123,246,669–123,274,774 | 5 |
| ENST00000863177 | 123,246,669–123,274,774 | 5 |
| ENST00000863178 | 123,246,669–123,274,620 | 4 |
| ENST00000863179 | 123,246,669–123,274,774 | 5 |
| ENST00000863180 | 123,246,669–123,274,620 | 5 |
| ENST00000863181 | 123,246,669–123,274,012 | 4 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZHX1 可抑制轉錄，並能增強 DNMT3B 介導的轉錄抑制活性；此增強作用有一項條件：DNMT3B 必須先被繫留於 DNA。換言之，來源描述的是 ZHX1 在 DNMT3B 已定位至 DNA 時加強其抑制性轉錄作用，而非無條件提升 DNMT3B 活性。
ZHX1 也可能在 DNMT3B 與其他共抑制蛋白之間充當連結分子。這項描述保留「可能」的限定，指出 ZHX1 或可將 DNMT3B 的抑制作用與其他共抑制因子聯繫起來，但未進一步界定該連結所涉及的分子步驟或其適用情境。
因此，來源支持的功能重點是 ZHX1 具有轉錄抑制作用，並在 DNMT3B 繫留 DNA 的條件下增強其抑制性轉錄活性；此外，ZHX1 可能協助 DNMT3B 與其他共抑制蛋白形成作用上的連結。來源未提供更廣泛的生物過程或特定生物學結果，故不延伸推論其下游效應。
Promoter 與基因調控
>ZHX1 ENST00000395571 GRCh38 chr8:123274186-123275286 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CGGGGGAAAGGGAAAGTGAGTAGGGAGGGGCGGAGACGCCGGGCAGTGTTCCCGAAACCCCTGGCCCTCG CTGGCCCCGCTGCGGGGCTGGTTCCCTGAAAGCCGACGGGATGTGAAGCCCTCGACTCGGACAGAAGCCT CTGGAAGAGCGAGTGGCGGTTCGCAGGGAGGAGGGCGGCTGAGGGGCAGAGGGCGGCTCCGCCTTGCCCG GCGGTTCTGAGTGCAGCTGAACTGAACTTTCGGTGTCAGCGGGTGGAGCTGCGGCCCGCGGAGGAGCGGG GTCCGAAGCGAGGAGAGGTGGAGCTGCCGCTGACAAGGGGCGCGGCGACTTCTGTCAGGGCGCTGGGCTC CCGGCCGGACTCGCAGCAGCCCCCCGAGGGGCGGGGCCTGGGTCGTGTCGCCCCAGGGGATGGGCGTGTG ATGACAAGGGGCGTTTCAGTAGAAGCCAGCATGCTTACCTCTCACGATCCAGCAGTGACATTAGGAAGGC GGAGCGCAAGGAAGGCGGGGCTGCCTTCTGTGCTGACCCGAGAGAAGACCAGGCTTCAGTCCACAGCGGG CGGAGCGGTCGCAGGCAAAGGGCGGGGCCATTTCGAGCCCTGGGAAGGCGGGGCGTCTCCTGACAGGGGG CGGAGCTTCCGCAGTCTGGGGCGGGGCTTCTGTTGACAGGGGGGCGGGGCGCCTCCCTACCTCCCGCGGT GCGCCAATCCCCGGACTAGGGGCCGGGGTCGGACCCCAGTGGAGTAGCAGGGTCTGGGCGTGGAGAGCTC GGCGCCGCACGGGGTGGGGGCGCGCGGAGGACGCGCGCGCGGGAGGGCCCCGCCTTGGCCGGCTCTCTCC CTTCCCCCTCCGCCCCCGGACGGCCGCTGGGGCGCGCGCCTCTCCTCGCACCCCCACCCTGAGTCCCCAC ACTCCGCGGGGCCACCGAGCTGCTGAGGCCCCTTTGCGGGCCCGCCGAGCGGTTCCGGGTTTAGGGTTCA CAGGTCAGAGTTGACTCCCTGAAAAGTGCAGCCGGTTTGAAATGCAAGATGGCGGCGGCGTGGCGCTGAG AGGCGCGGCGGCCCCTGCAGGTAGTGGCGCGAGCCGGCTCCGCGACCAGCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZHX1_4 ↗ | 8:123,250,012 | 負股 | 123,250,002–123,250,061 |
| ZHX1_3 ↗ | 8:123,253,854 | 負股 | 123,253,844–123,253,903 |
| ZHX1_1 ↗ | 8:123,274,277 | 負股 | 123,274,267–123,274,326 |
| ZHX1_2 ↗ | 8:123,274,569 | 負股 | 123,274,559–123,274,618 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_93RX36 · enhancer · 123268990–123269442 · regulatory
ENSR8_BWGJH · enhancer · 123271879–123272487 · regulatory
ENSR8_CG89C · enhancer · 123272612–123274275 · regulatory
ENSR8_6JHFQ2 · CTCF_binding_site · 123273777–123273811 · regulatory
ENSR8_533ZTJZ · CTCF_binding_site · 123274212–123274233 · regulatory
ENSR8_93RX4P · promoter · 123274276–123274721 · regulatory
ENSR8_BWGJX · enhancer · 123274722–123275530 · regulatory
ENSR8_93RX53 · promoter · 123275531–123275830 · regulatory
ENSR8_BWGK8 · enhancer · 123276683–123277545 · regulatory
· motif · 123269829–123269842 · motif
· motif · 123271085–123271096 · motif
· motif · 123273423–123273436 · motif
· motif · 123273423–123273436 · motif
· motif · 123273779–123273795 · motif
· motif · 123273792–123273808 · motif
· motif · 123274063–123274076 · motif
· motif · 123274063–123274076 · motif
· motif · 123274214–123274230 · motif
· motif · 123274250–123274260 · motif
· motif · 123274293–123274306 · motif
· motif · 123274299–123274313 · motif
· motif · 123274299–123274314 · motif
· motif · 123274300–123274313 · motif
· motif · 123274307–123274320 · motif
· motif · 123274316–123274327 · motif
· motif · 123274430–123274440 · motif
· motif · 123274480–123274496 · motif
· motif · 123274480–123274496 · motif
· motif · 123274607–123274617 · motif
· motif · 123274630–123274640 · motif
· motif · 123274651–123274661 · motif
· motif · 123274699–123274709 · motif
· motif · 123274850–123274860 · motif
· motif · 123274867–123274877 · motif
· motif · 123274872–123274882 · motif
· motif · 123274875–123274888 · motif
· motif · 123274875–123274888 · motif
· motif · 123274900–123274910 · motif
· motif · 123274961–123274971 · motif
· motif · 123275032–123275049 · motif
· motif · 123275092–123275105 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：873 aa
ZHX1 蛋白質長 873 個胺基酸，屬於 ZHX 家族。序列包含兩個 C2H2 型鋅指，以及五個 homeobox DNA 結合區域；另有多段被註記為無序區。部分區域與特定功能相關：胺基酸 272–564 為 NFYA 互作所需，272–432 與二聚化相關，734–768 與核定位相關，而 831–873 為抑制活性所需。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZHX1 位於細胞核，並與 DNMT3B 在細胞核內共定位。 來源未描述定位隨條件改變或異構型間差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- DNMT3BQ9UBC3-1 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- ZHX2Q9Y6X8 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ZMYND11Q15326 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
ZHX1 可形成同源二聚體，也能透過 HD1 domain 與 ZHX2 形成異源二聚體；與 ZHX3 形成異源二聚體則是其抑制活性的必要條件。ZHX1 另與 ATF7IP、NFYA 及 DNMT3B 互作，其中 ZHX1 透過 homeobox domains 與 DNMT3B 的 PWWP domain 互作。來源並未將所有互作一概描述為同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZHX1 具有轉錄抑制作用；當 DNMT3B 被繫留於 DNA 時，ZHX1 會增強 DNMT3B 介導的轉錄抑制活性。ZHX1 也可能在 DNMT3B 與其他共抑制蛋白之間形成連結，但此連結作用以可能性表述。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as a transcriptional repressor. Increases DNMT3B-mediated repressive transcriptional activity when DNMT3B is tethered to DNA. May link molecule between DNMT3B and other co-repressor proteins PMID 12237128 ↗ |
| 交互作用 | ZHX1 可形成同源二聚體，並透過 HD1 domain 與 ZHX2 形成異源二聚體。ZHX1 與 ZHX3 形成異源二聚體是抑制活性的必要條件；此外，它與 ATF7IP、NFYA 互作，並透過 homeobox domains 與 DNMT3B 的 PWWP domain 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms homodimers. Heterodimer (via HD1 domain) with ZHX2 (via HD1 domain). Also forms a heterodimer with ZHX3 which is a prerequisite for repressor activity. Interacts with ATF7IP and NFYA. Interacts (via homeobox domains) with DNMT3B (via PWWP domain) PMID 10441475 ↗ · PMID 10571058 ↗ · PMID 12659632 ↗ · PMID 17303076 ↗ |
| 細胞定位 | ZHX1 位於細胞核，並與 DNMT3B 在細胞核內共定位。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAAAAGTGCAGCCGGTTTGAAATGCAAGATGGCGGCGGCG40TGGCGCTGAGAGGCGCGGCGGCCCCTGCAGGAGAAGACAG80ACTGCTGCTTTGGACCTGTTGGTAATGATGGCCTGAGCTA120AACATCTAACTAGAAGGGATACCCTTCCATTTCAAAGAAC160AGAATGCTAAGGAAGCTGTGGCAAGTGATTGGAGTTGTGC200TTCAAAAATTTCAGAAATTCAGCAGTATTTTATCTGCCAA240CAATAAGCTCTTTACTTGATTGCACCATGAGAAAGCTGCT280AATGAGACTTGTTGAGCACAAAAATGGACTTGAAGAACCA320AAAGCCATTGTTTTCAAATGAAGAACACTGAACAGTTTTA360AGCCTCGATGCTTTTTAATCACCACTGAGCTTTTCCTCAT400AACATCAGAATGGCAAGCAGGCGAAAATCAACAACACCTT440GCATGGTCCTTGCCAGTGAACAAGATCCAGACCTTGAGTT480GATATCAGATTTGGATGAAGGTCCTCCTGTGCTTACACCT520GTAGAAAACACCAGAGCAGAGAGTATCTCAAGTGATGAAG560AGGTTCATGAATCTGTGGATTCAGACAATCAGCAAAATAA600AAAAGTTGAAGGTGGATATGAATGTAAATATTGTACTTTT640CAAACTCCAGATCTAAATATGTTTACTTTTCATGTGGATT680CGGAACATCCCAATGTAGTGCTAAATTCATCCTATGTTTG720TGTCGAATGCAATTTTCTTACCAAAAGGTATGATGCACTT760TCTGAGCATAATCTGAAATATCACCCAGGAGAAGAGAATT800TTAAGTTGACTATGGTGAAACGTAATAACCAGACAATCTT840TGAACAAACAATAAATGATCTGACTTTTGATGGTAGTTTT880GTTAAAGAGGAGAATGCAGAGCAAGCAGAATCTACAGAAG920TTTCTTCTTCGGGAATATCTATCAGTAAAACTCCTATCAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。