基因總覽
ZFYVE1 是蛋白質編碼基因，產物為 zinc finger FYVE-type containing 1。其蛋白質含有兩個 FYVE-type zinc finger，屬於具有 FYVE 結構特色的蛋白質；這類結構使 ZFYVE1 能與 phosphatidylinositol 3-phosphate（PtdIns3P）結合。來源指出，ZFYVE1 與細胞脂質儲存相關的脂滴形成有關，也參與內質網與脂滴之間的接觸。蛋白質序列另有一段與其定位至脂滴有關的區域。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000556143 ★ | 72,969,451–73,027,106 | 12 |
| ENST00000553891 | 72,969,451–73,027,131 | 13 |
| ENST00000864216 | 72,969,451–73,027,131 | 10 |
| ENST00000864217 | 72,969,451–73,027,131 | 11 |
| ENST00000983966 | 72,969,451–73,027,131 | 12 |
| ENST00001134845 | 72,969,451–73,027,131 | 12 |
| ENST00000318876 | 72,969,452–73,027,131 | 12 |
| ENST00001027613 | 72,969,452–73,027,131 | 10 |
| ENST00000864218 | 72,969,823–73,027,131 | 12 |
| ENST00000864219 | 72,970,877–73,027,131 | 12 |
| ENST00000864220 | 72,970,877–73,027,131 | 12 |
| ENST00000394207 | 72,970,878–72,986,944 | 9 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZFYVE1 參與脂滴（lipid droplets, LDs）的形成。脂滴是脂質與能量恆定的重要儲存胞器；ZFYVE1 也與調節脂滴的形態、大小及分布有關，顯示其作用不只涉及脂滴的生成，也關聯到脂滴在細胞中的特徵與配置。
在分子作用方面，ZFYVE1 透過 FYVE-type zinc finger 結合 PtdIns3P。它與 RAB18 及 ZW10 形成複合體，藉此促成內質網（ER）與脂滴之間的接觸。這項 ER-LD 接觸關係將脂滴與內質網連結，並構成 ZFYVE1 參與脂滴相關過程的具體方式。來源並指出，ZFYVE1 與 GTP 結合型 RAB18 互作，且與 BSCL2 的互作依賴 RAB18。
在感染情境中，SARS-CoV-2 的非結構蛋白 nsp6 會與 ZFYVE1 結合。此互作促成病毒複製胞器與脂滴的關聯，而該關聯是維持病毒複製所需。另有資料指出，nsp6 與 ZFYVE1 的互作不依賴 ZFYVE1 對 PtdIns3P 的結合，並會使內質網及雙層膜囊泡與脂滴結合。這些感染相關觀察描述的是特定病毒情境下的功能，與 ZFYVE1 在脂滴形成及 ER-LD 接觸中的作用相區別。
Promoter 與基因調控
>ZFYVE1 ENST00000556143 GRCh38 chr14:73027006-73028106 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATAAGGACAGCCAGTTTCCCAAACAGGCTTGTTTTAATGTTGCATGATAATGAAGCTCCCTCTGTTGTAA TCCTTACACAAAAGAAGTAGCCTGAAGTAACTGATGTCAACTAATCAGTTATTTTTCTATTGTTCTGTCT CTCTGTCCTCACCTTCCAAGGAAAGTAGCTTAGAAGTGACCAATATGTCAAGGTCCCATGAGAAGACTGA AAAAAAGAGAAGAAAGAGGAAAGAAAAGAATGACAAGAAAGAGAAAGAAAGAAACCAATATGCTCTTTGT TCTTTGCTTTTGCTTCCTCAAGCTTTTCTCTGTCTACAAAGCCAACCTCTCCTGCTCAGCTCATCAGAAC ATTCACTCCACTTTCTGGAATGAAGTGTTGCCTGATCCTAGAGTCGCAATAAAGCCAACTGAGATCTTAA AACTAAATTCGTTGTAATTTTGTCCTTTGCCAAGGGGGGAAAAACAACAAAAACTTCCCAAGAGTACCTA TATCCTCTTATCACTTTTTCTGGTCTTTTCCTTAGTTTTTGCGAAGTGAAATTGGGAAGGTGGAGACTGT CTGTGCTCACACGTTTCTGAGGGAATGGTGTGCAAGAGGTTACTTGAATCCAAATTAATTGACTCACCAT TTCCCACTTATACTAGACATTATTACATCAGTTCTCTAATGTAGCACCATGCCTTCCCCAGTTACAACCC AAAAGAACGTGCTGAAACCTGCGGACACCACACTCAATGCAAAAACTCCAAGTCCCGAAATCCTCCGTAG CCTGTCCCCACCGCCTCCTCGCAAGAGCAGCCTCTTCAGTACTGGGAGTTGTAGTCATTCAGAGTCTTCC TTTCCGGGATGAGGGGCGAGAGCGCGCCTCGAGGAGCTACATCTCCCAGGAGGCAGTGCGCACTACGCCC TTGCTGGCGCCGGGATCCTCCCTCTCTCGCTCCTCCCTTTCTGGGCTGCACCGCTCACGCCTTCCTGTTA GTCCGAGCTGGGAGAAGTTCACTCCGATCAGCTGATCCCAACTGACAACAGGAGAGGAGGAAGCCCGGGA GGCAACGAAGGAGGAGGGTGGCGGAGATGGAGATGAGGATGGATCTGCCGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZFYVE1_1 ↗ | 14:73,027,106 | 負股 | 73,027,096–73,027,155 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_845Z7B · enhancer · 73025706–73025887 · regulatory
ENSR14_5M6QK8 · CTCF_binding_site · 73025753–73025774 · regulatory
ENSR14_BJHB7 · enhancer · 73026324–73027095 · regulatory
ENSR14_5M6QQP · CTCF_binding_site · 73026940–73026961 · regulatory
ENSR14_BJHBB · promoter · 73027096–73027621 · regulatory
· motif · 73023560–73023573 · motif
· motif · 73023560–73023573 · motif
· motif · 73023679–73023690 · motif
· motif · 73025755–73025771 · motif
· motif · 73026516–73026536 · motif
· motif · 73026635–73026648 · motif
· motif · 73026942–73026958 · motif
· motif · 73026980–73026993 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：777 aa
zinc finger FYVE-type containing 1 長 777 個胺基酸，含兩個 FYVE-type zinc finger，分別位於第 598–659 與第 715–775 位胺基酸。第 416–777 位胺基酸區域被註記為脂滴定位所需。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZFYVE1 主要位於高基氏體池狀堆疊，也可見於核周內質網；飢餓條件下會定位至與內質網相連、位於自噬前結構起始處的 omegasomes。 存在油酸時，ZFYVE1 會定位至脂滴。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Lipid droplet；Preautophagosomal structure。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- MAGOHBQ96A72 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PPP1CAP62136 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
ZFYVE1 與 GTP 結合型 RAB18 互作，並以 RAB18 依賴方式與 BSCL2 互作；也與 ZW10 互作。ZFYVE1、RAB18 與 ZW10 形成複合體，參與 ER-LD 接觸。SARS-CoV-2 nsp6 則在感染情境下與 ZFYVE1 結合；該互作不依賴 PtdIns3P 結合，並促進內質網及雙層膜囊泡與脂滴結合。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZFYVE1 參與脂滴（LDs）形成；脂滴是脂質與能量恆定的重要儲存胞器。它也調節脂滴的形態、大小及分布，並與 RAB18、ZW10 形成複合體，以促成內質網與脂滴接觸。此外，ZFYVE1 透過 FYVE-type zinc finger 結合 phosphatidylinositol 3-phosphate（PtdIns3P）。 | 含實驗來源 | 證據與來源Plays a role in the formation of lipid droplets (LDs) which are storage organelles at the center of lipid and energy homeostasis. Regulates the morphology, size and distribution of LDs. Mediates the formation of endoplasmic reticulum-lipid droplets (ER-LD) contacts by forming a complex with RAB18 and ZW10. Binds to phosphatidylinositol 3-phosphate (PtdIns3P) through FYVE-type zinc finger PMID 11256955 ↗ · PMID 11739631 ↗ · PMID 30970241 ↗ · PMID 31293035 ↗ |
| 功能 | 在 SARS-CoV-2 感染時，ZFYVE1 透過與非結構蛋白 nsp6 結合，促成病毒複製胞器與脂滴之間的關聯；此關聯是維持病毒複製所需。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Upon SARS coronavirus-2/SARS-CoV-2 infection, mediates through binding with non-structural protein 6 (nsp6) the replication organelle-lipid droplet association required to sustain viral replication PMID 35551511 ↗ |
| 交互作用 | ZFYVE1 與 GTP 結合型 RAB18 互作，並以 RAB18 依賴方式與 BSCL2 互作；此外，ZFYVE1 也與 ZW10 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with RAB18 (in GTP-bound form). Interacts with BSCL2 in a RAB18-dependent manner. Interacts with ZW10 PMID 30970241 ↗ · PMID 31293035 ↗ |
| 交互作用 | 在 SARS-CoV-2 感染情境下，ZFYVE1 與病毒非結構蛋白 nsp6 互作。此互作不依賴 ZFYVE1 對 PtdIns3P 的結合，並使內質網（ER）及雙層膜囊泡（DMVs）與脂滴結合。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with SARS coronavirus-2/SARS-CoV-2 non-structural protein 6 (nsp6); the interaction is independent of PtdIns3P-binding and leads to endoplasmic reticulum (ER) and double membrane vesicles (DMVs) binding to lipid droplets PMID 35551511 ↗ |
| 細胞定位 | ZFYVE1 主要位於高基氏體池狀堆疊，也與核周內質網上的 TRIM13 共定位。飢餓時，它會定位至與內質網相連、位於自噬前結構起始處的 omegasomes；有油酸時則定位至脂滴。 | 含實驗來源 | 證據與來源Golgi apparatus, Golgi stack; Golgi apparatus; Endoplasmic reticulum; Lipid droplet; Preautophagosomal structure; Mitochondrion; Resides predominantly in the cisternal stacks of the Golgi. Colocalizes with TRIM13 on the perinuclear endoplasmic reticulum. During starvation conditions, localizes to omegasomes which are endoplasmic reticulum connected strutures at the origin of preautophagosomal structures. Localizes to lipid droplets in the presence of oleic acid PMID 11256955 ↗ · PMID 11024279 ↗ · PMID 11739631 ↗ · PMID 25876663 ↗ · PMID 22178386 ↗ · PMID 30970241 ↗ · PMID 31293035 ↗ · PMID 33499712 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACTCCGATCAGCTGATCCCAACTGACAACAGGAGAGGAGG40AAGCCCGGGAGGCAACGAAGGAGGAGGGTGGCGGAGATGG80AGATGAGGATGGATCTGCCGGTGTCCTGAGGAATAGCCTC120TGCCCCCACTGGCGCCCTGCGGCCCCCCGACGCCGCCTTG160CTGCGGCCGAGCTTCTCAGTGGTATCCCCTGAAATACTGA200CTTCAGGTCGAATTATATTGAAAAGCTCCTGACCACTTTC240TTTCATTACCAAAACTTTGTAGCTGATGTCCAACCGATGA280ACCCACCACCGTGAACCCATCAGACCTCTCTCAGATAGCC320ATAAAAGACCCTTCCAAGTCAATTTTGACCACATCTTTGC360TTGCACTTTATGGAGGATGAAACCATCAAACCAAATCAAC400GTTGCTGCTAATACAAGAGTCTTAGAGGCAGCAAATTAAA440AATTTGAACATTTGTTTGTGAAGAACTATAACAGGACATG480AAAGGTGTTCTTTTTTAAAGTGTTCAGAACCCTGTGGAAG520TTTCGTGCAGTCTTCAGACTCAAATCTTCGTCTTCACCCC560CGGGGCAAGCTCAGTGACTATTATATGGTGGGTGTGTTTC600CTTACCAGCGTGAGTATGAGTGCCCAGACTTCCCCAGCAG640AGAAGGGCCTGAATCCGGGGCTGATGTGCCAGGAAAGTTA680CGCTTGCAGCGGGACTGATGAAGCTATCTTTGAGTGTGAT720GAGTGCTGCAGTCTGCAGTGTCTCCGCTGCGAGGAGGAGC760TCCATCGGCAGGAGCGCCTGAGAAACCATGAGCGGATAAG800ACTCAAACCTGGCCATGTCCCTTACTGTGACCTCTGCAAG840GGTCTCAGTGGGCATTTACCAGGTGTTAGGCAGAGGGCAA880TAGTGAGGTGCCAGACCTGCAAAATTAACTTGTGCCTGGA920GTGCCAGAAGAGGACTCATTCTGGGGGTAACAAAAGGAGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。