演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZFXZNF926

zinc finger protein X-linked

ZFX(zinc finger protein X-linked)是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因,其產物可能具有轉錄活化功能。

Homo sapiensXp22.11UniProt P17010
OFFICIAL SYMBOL
ZFX
CHROMOSOME
X
UNIPROT
P17010
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZFX 的正式名稱為 zinc finger protein X-linked,是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因。其產物名稱為 Zinc finger X-chromosomal protein;資料將其功能描述為可能的轉錄活化因子。現有資料未提供更進一步的蛋白質性質或生物學角色細節。

Official symbol
ZFX
Gene name
zinc finger protein X-linked
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12869
UniProt
P17010
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZNF926

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXp22.11
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegZFXpq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chrX:24,148,970–24,216,255
Gene span
67,286 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000304543 ★24,149,729–24,216,25510
ENST0000086719224,148,970–24,216,25510
ENST0000092353524,148,970–24,216,2558
ENST0000094920824,148,970–24,216,25511
ENST0000094921124,148,970–24,216,2559
ENST0000094921224,148,970–24,216,2558
ENST0000037918824,149,288–24,216,2559
ENST0000037917724,149,288–24,216,25511
ENST0000086719024,149,288–24,216,25511
ENST0000086719124,149,288–24,216,25510
ENST0000086719324,149,288–24,216,25510
ENST0000086719424,149,288–24,216,25512

顯示 12/32 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZFX 的蛋白質產物被描述為可能的轉錄活化因子,表示其可能促進轉錄活動。現有資料未說明其作用的基因、分子作用方式、調控條件或參與的生物學過程,因此無法進一步界定其轉錄活化功能的具體範圍。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 24149729 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZFX ENST00000304543 GRCh38 chrX:24148729-24149829 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTTTAAAAAAAAAAAAATCCATACCCAATTGGGCTCCTCTCTATTAAGGAATGTGGAAAATTCATGATTT
ATGAAACGATGACACCAGTCTTACATTTCACAGGCTCCCAAGCTCTGAAACACGGGTACATAGGAAAATA
CACAGAAAATTCCTGTTCTTTGCAACGTGCGAAACGTTTCAAAATGCAACTTTGCTCATCTCCCTCCCCC
GTACAAACTAATAAAATCAGTTTGGCTCTGACTGCTTATTTTTAAAAAGTAGACGGCCTGGTAGGTGCTC
TAGGGATAACCCTTCTCCCCCCACTCCACCCCCCTTCCCGCACACCCATTTAGACTGGCAAGCCCGTTTT
CATTTTATTTCAAAGATTTTTTTTTTTTAAGCGAAGGCAGGGGACGGCGGGGGTTGCTAAATTTATCTTC
CTCCCCAGCCACGGGGATGAAGAAAACACATTTACTGCGGGCGGGGGTCTGAGGGCCTGCAAACAACTCG
AGCTGGAGCCTCGGCCAGGACCGGCGCGAGAGGCGGTAGGTCTCCAGGGAGGCCCCCGGGGGGCGGCCGC
GGCCCACGGGACATGGTGGGGGGCGGCCGGGCCGCCTGCCTCTCCGCGGGGTCGGCCGACCGCGGCCCCG
CGCGGGCTTTACGGCCGAGGCGGCGGCGGCAGCGGCGCGTGTGTGGCGGCGGCGGGCGGGAGCGCGGAGG
AGGTGGAAAGAAGGGGGGCGCTGTCACGGAGACTCCGGCCGCCGGAGACCCCGCCGCAGCGAGGCCACTG
GGCTCCCCGGTCGCGGGGCGGGAGCGGCGCCGACACGGGGTGCCAGGAGGACCCACCGGGCGGAGGAGGG
GGCCTGTCTACCCTTCCGCATTTTCCTGGGTCTCTCTCCCGGGCGGTGACGTGACGTGCTGACGGCGGGC
CCGTGCCGGGGAGCTGGGCCGCTTTTTGTCAGCTCCGAGCTCGGCCCCTCCTCCCTCCCTCCGCCCGCCC
CACCAGCCGGAGCCCGGCCCAGTGCTCCAGAGAAAGGCCGGCCTGCAGCACCCGCCACCGTCGCCGGCCG
CCCGCACGTCCGTCCGGTGAGTCCCGGGTGCCGCCGCGGCCGCGGGGCCTA
ZFX 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZFX_1 ↗X:24,149,729正股24,149,680–24,149,739

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:805 aa

1 aa805 aa鋅指
依 P17010 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Zinc finger X-chromosomal protein 長 805 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 的 ZFX/ZFY subfamily。序列註解列出 13 個 C2H2-type zinc finger,分布於胺基酸 425–798 區段。

鋅指C2H2-type 1425–447 aa
鋅指C2H2-type 2456–478 aa
鋅指C2H2-type 3488–510 aa
鋅指C2H2-type 4519–542 aa
鋅指C2H2-type 5548–570 aa
鋅指C2H2-type 6576–599 aa
鋅指C2H2-type 7605–627 aa
鋅指C2H2-type 8633–656 aa
鋅指C2H2-type 9662–684 aa
鋅指C2H2-type 10690–713 aa
鋅指C2H2-type 11719–741 aa
鋅指C2H2-type 12747–770 aa
鋅指C2H2-type 13776–798 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P17010…

AlphaFold · P17010

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZFX 的定位註解為細胞核;資料未提供定位變化條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF926ZFX
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

ZFX 與 X-linked syndromic intellectual developmental disorder 37(MRXS37)相關。此症候群性神經發育疾病可有發育遲緩、智能障礙、行為異常、肌張力低下、先天性異常及顏面特徵異常;資料指出,影響 ZFX 的變異會造成此病。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZFX 的蛋白質產物可能是轉錄活化因子;此描述屬於可能性判定,來源未提供其作用對象、機制或生物學情境。含實驗來源
證據與來源

Probable transcriptional activator

PMID 2512506 ↗ · PMID 38325380 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZFX 的細胞內定位註記為細胞核;此項資料未描述定位變化的條件或異構型差異。資料庫紀錄
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯X-linked syndromic intellectual developmental disorder 37(MRXS37)是症候群性神經發育疾病,特徵包括發育遲緩、智能障礙、行為異常、肌張力低下、先天性異常及顏面特徵異常;資料指出,影響 ZFX 的變異會造成此病。含實驗來源
證據與來源

Intellectual developmental disorder, X-linked, syndromic 37 MRXS37 A syndromic neurodevelopmental disorder characterized by developmental delay, intellectual disability, behavioral abnormalities, hypotonia, congenital anomalies, and facial dysmorphism. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 301118

PMID 38325380 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000304543 · 7,612 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTGCTCCAGAGAAAGGCCGGCCTGCAGCACCCGCCACCG40
41TCGCCGGCCGCCCGCACGTCCGTCCGGTTCTTGCTATATT80
81GCCCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGCCGTTCT120
121CCCGCCTCCCACTGCCCGCCTGTCACTGCCGTCTGTTCCC160
161TGAGCTGTGCTTTACGCTGGGAAAGACATAGAAGAACTAT200
201TAAGAAGATAGAATTGTTTTGCTGCGCAGTACAGCAACAG240
241TGGATGTTCAAGATTAAGATTAGAGTCAAGTTGTGTGATT280
281AAGACAGGAGCTGTGACTGATGAGAATTAAAGGCCATGGA320
321TGAAGATGGGCTTGAATTACAACAAGAGCCAAACTCATTT360
361TTTGATGCAACAGGAGCTGATGGTACACACATGGATGGTG400
401ATCAAATTGTTGTGGAAGTACAAGAAACTGTTTTTGTTTC440
441AGATGTTGTGGATTCAGACATAACTGTGCATAACTTTGTT480
481CCTGATGACCCAGATTCAGTTGTAATCCAAGATGTTATTG520
521AGGACGTTGTTATAGAAGATGTTCAGTGCCCAGATATCAT560
561GGAAGAAGCAGATGTGTCTGAAACGGTCATCATTCCTGAG600
601CAAGTGCTGGACTCAGATGTAACTGAAGAAGTTTCTTTAG640
641CACATTGCACAGTCCCAGATGATGTTTTAGCTTCTGACAT680
681TACTTCAGCCTCAATGTCTATGCCAGAACACGTCTTGACG720
721GGTGATTCTATACATGTGTCTGACGTTGGACATGTTGGAC760
761ATGTTGGACATGTTGAACATGTGGTTCATGATAGTGTAGT800
801GGAAGCAGAAATTGTCACTGATCCTCTGACTACCGACGTA840
841GTTTCAGAAGAAGTATTGGTAGCAGACTGTGCCTCTGAAG880
881CAGTCATAGATGCCAATGGGATCCCTGTGGACCAGCAGGA920
921TGATGACAAAGGCAACTGTGAGGACTACCTTATGATTTCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。