演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZFPL1D11S750

zinc finger protein like 1

ZFPL1(zinc finger protein like 1)是 ZFPL1 family 的單次穿膜蛋白,與 cis-Golgi 的完整性維持及 ER 至 Golgi 的運輸效率有關。

Homo sapiens11q13.1UniProt O95159
OFFICIAL SYMBOL
ZFPL1
CHROMOSOME
11
UNIPROT
O95159
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZFPL1(zinc finger protein like 1)是蛋白質編碼基因,產物屬於 ZFPL1 family。其蛋白質具有鋅指相關區域,並包含跨膜區段,整體拓樸顯示大部分序列位於細胞質側,末端一小段位於腔內。來源資料將它與 cis-Golgi 的結構完整性及 ER 至 Golgi 的運輸效率相連結,並指出可能透過與 GOLGA2/GM130 互作參與 cis-Golgi 的維持。

Official symbol
ZFPL1
Gene name
zinc finger protein like 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12868
UniProt
O95159
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
D11S750MCG4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q13.1
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegZFPL1pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:65,084,210–65,088,409
Gene span
4,200 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000294258 ★65,084,222–65,088,3988
ENST0000052550965,084,219–65,085,0122
ENST0000089049365,084,219–65,088,3986
ENST0000089049465,084,219–65,088,3985
ENST0000097337565,084,219–65,088,3946
ENST0000097337665,084,219–65,088,3958
ENST0000113752465,084,219–65,088,3988
ENST0000052633465,084,242–65,087,0116
ENST0000052679165,084,290–65,085,0032
ENST0000052694565,084,329–65,086,9826
ENST0000089049565,084,428–65,088,3988
ENST0000053220065,084,519–65,087,0685

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZFPL1 與 cis-Golgi 的完整性維持及 ER 至 Golgi 的有效運輸有關。來源將其描述為維持 cis-Golgi 完整性所必需的蛋白質,並指出它可能透過與 GOLGA2/GM130 的互作參與這項作用;因此,資料支持其在 Golgi 結構維持與細胞內運輸中的角色,但未進一步說明互作如何直接影響膜結構或運輸步驟。

在功能層次上,cis-Golgi 的完整性與 ER 至 Golgi 運輸效率是來源明確連結的兩項面向。ZFPL1 被認為有助於維持 cis-Golgi 的狀態,而其與 GOLGA2/GM130 的互作則被提出為可能的作用途徑。此機制具有不確定性,來源以「可能」描述,不能據此將互作視為已證實的唯一途徑,也無法推定其具體分子作用方式。

現有資料未交代 ZFPL1 對運輸效率的影響是否完全源自 cis-Golgi 完整性的改變,也未提供其他作用對象、調控條件或不同細胞情境的比較。因此,可據此概括其與 cis-Golgi 維持和 ER 至 Golgi 運輸效率相關,但不宜延伸為更廣泛的囊泡運輸功能或特定下游生理效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 65084222 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZFPL1 ENST00000294258 GRCh38 chr11:65083222-65084322 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AATGCATGCAGGTGCCCACAGGCAAACTGTTTTTGCAGTACTGCAAAACAGCTCCCTGGGCAGATGTGAG
GAGCCAATGTGTGCTGTCCAGCTCTAGAGTGACCCAGATTCTACTTAATTAAGTAGATGAAAGTGAACTC
ACCCTAGGGCTCCTGCGAGGTGATTGGACAGCTGGGACCTGCGGGGGACAATACCAATTGATCACATAGC
TGGTCCCCAGTTTTGCCCGCCTAACCACCCACAACACTCTCCTTAGCCTTTACCTCTACAGCATGGGCCA
CGATCCTCTTTAAGACGATGGGCTTTCTGACTGCAGCCGCACTGGGTGTCTGGAGAAGAGGGATGAACGT
GAGCTCAACATTAGGTGAGGGGCCACAAGGGGAGGAAGTGAGAAATCTGGGGCTCACCTTCGGCCAGATT
TCAGGGAGGATGCTCGGGAGTTCAGAGCCTGATTTCCGCTGGGACCTCCGCAGAGGCTTAGTAGGAGATG
GGGCCCTTGGCCCTGGAAAGAGAAAAAAGTTAAGTGGTAGAGGAGGACTCTAGACCTTAGAGTCCAGAGA
ACAGGTTCTAGAGACAGCGAGAAGATTCCCAAACAAGCCCTTTTAAGGGCGCCTCCTCCGGCGGCGGCAG
CGGGAGGGAAGAGGCCATCTTTCACCGGACTGCGTCCCCCAAACGGCTCGACCTCACGTCTCCCGCGCGC
CCTCCGCTCACCGGAGCGCTGAGCGGCTCCTCCGGACCGCGTTCGCCTCCCAGACATAACTTAGGCTCCG
TCTCGAGCTCCTCCAGCGCCGCCGCCCCGGGCGCGCGCCAACCGGGAAGGCCACTCGCTGCAAAAAACGT
TCGAATTACCCGCCCTGCGGGAAAGGAAGCGGAAGTGACGTAGGGCTAGCGGTCTGCGGCCCTCGGAACC
CCGAGTCTTTTCCACCCGTCTTCACCTCTAGCGGCAGCGGAGGCGTGGCCCAGGGGCGCGATGGCGTCAT
CAGCGCGCGCCGCACCCGGAAGAGACGTGGCAGCGGAGGGATAATCGGGGCGGCCGGGGCTGAAGGGAGA
GGCGCAGGAGCCCTGGGGAGAGTGGTCCCTGCCCTTCCGCGCCTCGAGCCA
ZFPL1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZFPL1_1 ↗11:65,084,222正股65,084,173–65,084,232

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:310 aa

1 aa310 aa功能區域鋅指跨膜區拓樸區域
依 O95159 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZFPL1 蛋白質長 310 個胺基酸,屬於 ZFPL1 family。序列含有退化型 B box-type zinc finger(胺基酸 1–43)與退化型 RING-type zinc finger(53–101);145–231 為無序區。拓樸註解顯示胺基酸 1–266 位於細胞質側,267–287 為螺旋型跨膜區,288–310 位於腔內。

拓樸區域Cytoplasmic1–266 aa
跨膜區Helical267–287 aa
拓樸區域Lumenal288–310 aa
鋅指B box-type; degenerate1–43 aa
鋅指RING-type; degenerate53–101 aa
功能區域Disordered145–231 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O95159…

AlphaFold · O95159

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Golgi apparatus, cis-Golgi network membrane

ZFPL1 位於 Golgi apparatus 的 cis-Golgi network membrane,並註記為單次穿膜蛋白。 拓樸資料指出其大部分序列朝向細胞質,跨膜區之後的末端則位於腔內;來源未提供定位改變條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
D11S750ZFPL1AHNAK2BIKBSNDCD3ECGRRF1CLEC10ACLEC7ACPLX4CREB3L1CYBRD1EBPELOVL4ERGIC3FAM209AFATE1FKBP7FKBP8FNDC9FRMD3GORABGPR42HIBADHKASH5KLRC1LDLRAD1LEUTXLIME1MFFMFSD14BMGST3MIPMRM3MRPS18BMS4A3MTERF3PGRMC2PLEKHO1PVRRELL2SCN3BSGMS2SHISAL1SLC10A6SLC19A3SLC7A14SMIM3SSMEM1STX1ASTX2STX4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 60 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ZFPL1 與 GOLGA2/GM130 有互作記錄。功能資料提出,ZFPL1 可能藉由此互作協助維持 cis-Golgi 完整性;這是可能的功能關係描述,來源未提供更細節的複合體組成或互作機制。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZFPL1 是維持 cis-Golgi 完整性及促進 ER 至 Golgi 有效運輸所需的蛋白質。資料並提出,它可能透過與 GOLGA2/GM130 互作,參與 cis-Golgi 完整性的維持;此處的作用途徑帶有可能性,並非已確定的機制。含實驗來源
證據與來源

Required for cis-Golgi integrity and efficient ER to Golgi transport. Involved in the maintenance of the integrity of the cis-Golgi, possibly via its interaction with GOLGA2/GM130

PMID 18323775 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ZFPL1 與 GOLGA2/GM130 有互作。含實驗來源
證據與來源

Interacts with GOLGA2/GM130

PMID 18323775 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZFPL1 位於 Golgi apparatus 的 cis-Golgi network membrane,並屬於單次穿膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Golgi apparatus, cis-Golgi network membrane / Single-pass membrane protein

PMID 18323775 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000294258 · 1,382 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGACGTGGCAGCGGAGGGATAATCGGGGCGGCCGGGGC40
41TGAAGGGAGAGGCGCAGGAGCCCTGGGGAGAGTGGTCCCT80
81GCCCTTCCGCGCCTCGAGCCATCGCTACCGCCCTTCGGAA120
121CCAGTGCAGCGGCCGATCAGTAAACACAGAGACTGGGGAT160
161CGATCATGGGGCTTTGTAAGTGCCCCAAGAGAAAGGTGAC200
201CAACCTGTTCTGCTTCGAACATCGGGTCAACGTCTGCGAG240
241CACTGCCTGGTAGCCAATCACGCCAAGTGCATCGTCCAGT280
281CCTACCTGCAATGGCTCCAAGATAGCGACTACAACCCCAA320
321TTGCCGCCTGTGCAACATACCCCTGGCCAGCCGAGAGACG360
361ACCCGCCTTGTCTGCTATGATCTCTTTCACTGGGCCTGCC400
401TCAATGAACGTGCTGCCCAGCTACCCCGAAACACGGCACC440
441TGCCGGCTATCAGTGCCCCAGCTGCAATGGCCCCATCTTC480
481CCCCCAACCAACCTGGCTGGCCCCGTGGCCTCCGCACTGA520
521GAGAGAAGCTGGCCACAGTCAACTGGGCCCGGGCAGGACT560
561GGGCCTCCCTCTGATCGATGAGGTGGTGAGCCCAGAGCCC600
601GAGCCCCTCAACACGTCTGACTTCTCTGACTGGTCTAGTT640
641TTAATGCCAGCAGTACCCCTGGACCAGAGGAGGTAGACAG680
681CGCCTCTGCTGCCCCAGCCTTCTACAGCCAGGCCCCCCGG720
721CCCCCAGCTTCCCCAGGCCGGCCCGAGCAGCACACAGTGA760
761TCCACATGGGCAATCCTGAGCCCTTGACTCACGCCCCTAG800
801GAAGGTGTATGATACGCGGGATGATGACCGGACACCAGGC840
841CTCCATGGAGACTGTGACGATGACAAGTACCGACGTCGGC880
881CGGCCTTGGGTTGGCTGGCCCGGCTGCTAAGGAGCCGGGC920
921TGGGTCTCGGAAGCGGCCGCTGACCCTGCTCCAGCGGGCG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。